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犬瘟热病毒TN野毒株核蛋白基因的克隆与序列分析
引用本文:孟庆玲,乔军,陈创夫.犬瘟热病毒TN野毒株核蛋白基因的克隆与序列分析[J].中国兽医科技,2004,34(4):24-28.
作者姓名:孟庆玲  乔军  陈创夫
作者单位:[1]塔里木农垦大学动物科技学院,新疆阿拉尔843300 [2]石河子大学动物科技学院,新疆石河子833200
摘    要:根据GenBank中收录的犬瘟热病毒(CDV)Onolerstepoort株核蛋白基因(N)序列,设计了1对特异性引物,用该引物对分离的TN野毒株进行了RT-PCR扩增;将扩增得到的PCR片段纯化后与pGEM-T质粒连接,得到重组质粒pTN。经核苷酸序列测定,CDVTN株N基因的ORF全长1569bp,编码523个氨基酸;将TN野毒株与GenBank中收录的其他CDV毒株进行比较,N基因核苷酸序列的同源性为94%~99%,推导的N蛋白氨基酸序列的同源性为97%~99%。TN株与Onderstepoort疫苗株氨基酸序列的差异主要集中在N端(17~159位)和C端(408~519位)。中间的区域则高度保守。此外,在CDVN蛋白N端281~289位上也发现存在与麻疹病毒(MV)N蛋白完全相同的Y-P-A-L-G-L-H-E-F9肽序列,推测可能是诱导CTL活性的靶蛋白的抗原表位之一。氨基酸组成分析发现,推导的N蛋白氨基酸序列中亮氨酸、丝氨酸和异亮氨酸所占比例很高,提示该蛋白具有高度螺旋和缠绕的分子结构。

关 键 词:犬瘟热病毒  TN野毒株  核蛋白基因  克隆  序列分析  分子结构  氨基酸  CDV
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