| 山羊MMP-9基因cDNA的克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 沈新改,陈巧玲,马韶阳,于倩,郑惠玲.山羊MMP-9基因cDNA的克隆及生物信息学分析[J].黑龙江畜牧兽医,2013(5):35-37,166,167. |
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| 作者姓名： | 沈新改 陈巧玲 马韶阳 于倩 郑惠玲 |
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| 作者单位： | 西北农林科技大学动物科技学院 |
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| 基金项目： | 公益性行业(农业)科研专项经费项目(201103038) |
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| 摘 要： | 为了克隆山羊基质金属蛋白酶-9(MMP-9)基因的cDNA片段,分析其基因序列,试验于无菌条件下采集泌乳期奶山羊乳腺组织并提取总RNA。根据已知其他物种的MMP-9基因保守性区域设计特异性引物,采用RT-PCR方法扩增MMP-9基因的CDS区,测序后对核苷酸和推导的氨基酸序列进行分析,并对8个物种进行聚类分析。结果表明:得到长度为2 245 bp的MMP-9基因cD-NA片段(GenBank登录号为JQ670877),其中包含2 130 bp的CDS全长;核酸序列分析结果显示,该基因编码709个氨基酸,与人、小鼠和牛的核苷酸序列进行比对,相似性分别为84%、80%、96%,氨基酸相似性分别为79%、73%、94%。
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| 关 键 词： | 奶山羊 基质金属蛋白酶-9(MMP-9)基因 生物信息学 |
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