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赣南地区柑橘黄龙病菌遗传多样性分析
引用本文:谢昌平,易龙,姚林建,夏宜林,黄爱军.赣南地区柑橘黄龙病菌遗传多样性分析[J].中国果业信息,2017,46(2).
作者姓名:谢昌平  易龙  姚林建  夏宜林  黄爱军
作者单位:赣南师范大学,赣南师范大学,赣南师范大学生命与环境科学学院,赣南师范大学生命与环境科学学院,赣南师范大学生命与环境科学学院
基金项目:江西省高等学校科技落地项目;江西省重点研发计划项目;江西省教育厅科技项目;赣州市科技计划项目
摘    要:为探究赣南地区柑橘黄龙病菌的遗传多样性。从赣南16个县市区采集32个具典型柑橘黄龙病症状的脐橙样品,运用PCR-RFLP(聚合酶链式反应-限制性长度多态性分析)技术研究了柑橘黄龙病菌16S rDNA序列、16S/23S rDNA间隔区序列和核糖体蛋白基因的遗传多态性;并对三个基因片段进行测序,分析其序列的碱基含量、转换与颠换、同源性、核苷酸遗传距离和系统进化特征。RFLP结果表明:赣南16个县市区柑橘黄龙病菌XbaⅠ酶切图谱均与亚洲韧皮部杆菌(Candidatus Liberibacter asiaticus, CLas)的一致;进一步分析显示,三个基因片段各自之间的RFLP指纹图谱一致,并未表现多态性。序列分析结果表明:32个分离物三个基因片段各自的同源性均在98%~100%,与CLas的同源性最大,且与CLas的遗传距离最小。系统进化树展示赣南地区柑橘黄龙病菌与CLas处于同一分支,结合酶切图谱、序列同源性及系统进化分析结果表明: 赣南地区柑橘黄龙病菌均为CLas。结论:赣南地区柑橘黄龙病菌的16S rDNA序列、16S/23S rDNA间隔区序列和核糖体蛋白基因未表现遗传多样性,表明赣南地区柑橘黄龙病菌间遗传多样性不显著。 关键词:柑橘黄龙病;16S rDNA序列;核糖体蛋白基因;16S/23S rDNA间隔区;RFLP;序列分析

关 键 词:柑橘黄龙病  16S  rDNA序列  核糖体蛋白基因  16S/23S  rDNA间隔区  RFLP  序列分析
收稿时间:2017/2/9 0:00:00
修稿时间:2017/2/20 0:00:00
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