全基因组关联分析鉴定大白猪生长性状遗传变异及候选基因 |
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引用本文: | 窦腾飞,吴姿仪,白利瑶,吴嘉浩,韩明阳,徐曼,杨峰,王克君,乔瑞敏,韩雪蕾,李新建,李秀领,王献伟.全基因组关联分析鉴定大白猪生长性状遗传变异及候选基因[J].中国畜牧杂志,2023(8):264-272. |
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作者姓名: | 窦腾飞 吴姿仪 白利瑶 吴嘉浩 韩明阳 徐曼 杨峰 王克君 乔瑞敏 韩雪蕾 李新建 李秀领 王献伟 |
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作者单位: | 1. 河南农业大学动物科技学院;2. 河南省畜牧技术推广总站;3. 海南农业科学院三亚研究院 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(31902138); |
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摘 要: | 生长性状是猪重要的经济性状之一,提升生长性状是生猪遗传改良的主要目标。为鉴定与猪生长性状显著相关的位点,筛选与猪生长性状相关的功能基因,本研究利用GeneSeek Genomic Profiler(GGP)猪50K SNP芯片对1 805头大白猪百公斤日龄(Age to 100 kg,AGE)、百公斤背膘厚(Backfat Thickness to100kg,BF)、眼肌深度(LoinMuscleDepth,LMD)3个性状进行全基因组关联分析。结果显示,AIREMLF90软件计算AGE、BF和LMD遗传力分别是0.17、0.53和0.28,属于中高遗传力性状。AGE与BF遗传相关为-0.08,表型相关为-0.16,均为负相关关系。AGE与LMD遗传相关为-0.11,表型相关为-0.36,均为负相关关系。BF与LMD遗传相关为0.04,表型相关为0.12,均为正相关关系。AGE筛选到6个全基因组水平显著SNPs和10个染色体水平显著SNPs,BF筛选到11个全基因组水平显著SNPs和10个染色体水平显著SNPs,LMD筛选到3个全基因组水平显著SNPs和11个染色体水平显著SNPs。利...
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关 键 词: | 猪 生长性状 全基因组关联分析 候选基因 |
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