| 2017年冬季上海地区犬流感病毒的检测与HA、NA序列的遗传进化分析 |
| |
| 引用本文： | 范玉凤,高婷婷,毛曌,李叶,刘广锦,姚火春.2017年冬季上海地区犬流感病毒的检测与HA、NA序列的遗传进化分析[J].畜牧与兽医,2019(2):89-96. |
| |
| 作者姓名： | 范玉凤 高婷婷 毛曌 李叶 刘广锦 姚火春 |
| |
| 作者单位： | 1.南京农业大学动物医学院/教育部动物健康与食品安全国际合作联合实验室/农业部动物细菌学重点实验室;2.上海鹏峰宠物医院 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金青年科学基金(31502085);江苏省自然科学基金青年科学基金(BK20140703);江苏省优势学科项目(PAPD) |
| |
| 摘 要： | 为了解2017年冬季上海临床接诊犬的流感病毒感染情况和病毒变异趋势,收集上海某动物医院疑似犬流感样品进行RT-PCR检测,构建HA、NA的重组载体并测序,对获得的序列进行进化分析、氨基酸变异分析,综合我国同亚型犬流感病毒HA序列进行进化率分析。结果显示:23份疑似样品中检出5份阳性样品,获得5个H3亚型的HA序列、2个N2亚型的NA序列,上述序列在进化树中已经形成独立的进化分支,与韩国、广东毒株亲缘关系最近;氨基酸比对表明,HA和NA在重要位点发生许多一致的突变,如抗原位点区域、糖基化位点等,NA茎部未见氨基酸插入;对2007年至2017年中国南方地区分离的H3N2犬流感病毒HA片段进行进化率、变异率分析显示,年平均进化率呈逐年增高趋势,变异不断积累。研究表明,开展犬流感病毒变异监测,掌握病毒变异和进化方向,对防控该病、防止病毒向人群传播有重要意义。
|
| 关 键 词： | 犬流感病毒 H3N2 进化率 系统进化分析 |
Detection of canine influenza virus in the Shanghai area in the winter of 2017 and phylogenetic analysis of HA and NA segments |
| |
| FAN Yufeng,GAO Tingting,MAO Zhao,LI Ye,LIU Guangjin,YAO Huochun.Detection of canine influenza virus in the Shanghai area in the winter of 2017 and phylogenetic analysis of HA and NA segments[J].Animal Husbandry & Veterinary Medicine,2019(2):89-96. |
| |
| Authors: | FAN Yufeng GAO Tingting MAO Zhao LI Ye LIU Guangjin YAO Huochun |
| |
| Institution: | (College of Veterinary Medicine,Nanjing Agricultural University/MOE Joint International Research Laboratory of Animal Health and Food Safety/Key Lab of Animal Bacteriology, Ministry of Agriculture,Nanjing 210095,China;Pengfeng Small Animal Hospital,Shanghai 200235,China) |
| |
| Abstract: | FAN Yufeng;GAO Tingting;MAO Zhao;LI Ye;LIU Guangjin;YAO Huochun(College of Veterinary Medicine,Nanjing Agricultural University/MOE Joint International Research Laboratory of Animal Health and Food Safety/Key Lab of Animal Bacteriology, Ministry of Agriculture,Nanjing 210095,China;Pengfeng Small Animal Hospital,Shanghai 200235,China) |
| |
| Keywords: | canine influenza virus H3N2 evolution rate phylogenetic analysis |
| 本文献已被 维普 等数据库收录！ |
|
