江苏地区猪流行性腹泻流行病学调查及病原S基因序列分析 |
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引用本文: | 李云锋,段滢,梁淳,李昱辰,姜瑜琦,李建达,刘朋,王文骞,杨诚洁,杨倩.江苏地区猪流行性腹泻流行病学调查及病原S基因序列分析[J].畜牧与兽医,2022(5):90-97. |
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作者姓名: | 李云锋 段滢 梁淳 李昱辰 姜瑜琦 李建达 刘朋 王文骞 杨诚洁 杨倩 |
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作者单位: | 南京农业大学 |
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基金项目: | 江苏省自然科学基金-青年项目(BK20200536); |
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摘 要: | 为探究江苏省内猪场猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus, PEDV)的流行和遗传变异情况,采集江苏省13个地级市规模猪场和屠宰场健康猪群的鼻拭子和肛拭子样品,通过RT-PCR方法检测PEDV,并对部分阳性样品进行S基因序列扩增、测序及遗传进化分析。结果显示:259份猪鼻拭子样品中,PEDV阳性检出率为10.42%(27/259);178份猪肛拭子样品中,PEDV阳性检出率为9.55%(17/178)。选取的8株PEDV代表株的核苷酸序列同源性在99.2%~100%之间,氨基酸序列同源性在95.2%~97.1%之间,与国内流行毒株SD-M、JS2008的同源性最高,核苷酸序列同源性达到97%以上;遗传进化分析显示,8株PEDV代表株属于同一群,与经典毒株CV777、DR13亲缘关系较近。本研究初步明确了江苏地区健康猪群中猪流行性腹泻流行状况和PEDV遗传演化特点,为有效防控猪流行性腹泻提供参考。
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关 键 词: | 猪流行性腹泻病毒 S基因 流行病学调查 RT-PCR |
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