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番茄遗传图谱构建和抗晚疫病基因Ph-2的QTL分析 总被引：2，自引：2，他引：0
以含有抗番茄晚疫病（Phytophthora infestans）基因Ph-2的樱桃番茄（Solanum lycopersicum var. cerasiforme）W.Va.700为父本,感病的普通番茄（Solanum lycopersicum）优良品系04957为母本,构建的260个F2单株为图谱构建群体,通过接种番茄晚疫病病原菌生理小种T1,对Ph-2基因进行了抗病性鉴定和遗传分析。结果表明,抗性基因Ph-2对生理小种T1的抗性呈正态分布,属于数量性状遗传。进一步应用RAPD、SSR和AFLP的方法构建了包含12个连锁群,长度1 154.85 cM,平均图距9.47 cM的分子遗传图谱。检测到5个与抗性基因Ph-2相关的QTL（quantitative trait loci）位点,其中QPh2-1、QPh2-2、QPh2-3和QPh2-4,位于第3连锁群上,表型变异分别为26.95%、16.63%、16.24%和6.69%;QPh2-5位于第1染色体上,与OPK14的距离为0.76 cM,表型变异为33.87%;QPh2-2、QPh2-3和QPh2-4为减效QTL,QPh2-1和QPh2-5为增效和显性QTL 相似文献
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为了挖掘调控番茄果实柠檬酸含量的关键基因，以栽培番茄(Solanum lycopersicum‘Moneymaker’)和野生醋栗番茄(Solanum pim pinellifolium ‘PI365967’)为亲本构建的重组自交系群体为材料，利用混池重测序技术挖掘到6个控制柠檬酸含量的QTL。其中位于6号染色体末端的主效QTL qCA6.1表型贡献率高达19.28%。为对该位点进行定位，从重组自交系群体中挑选出2份柠檬酸含量差异较大，且只在主效位点存在基因型差异的株系作为亲本，构建BC2F2定位群体，通过交换单株后代鉴定，将定位区间缩小到342kb区间内，并开发了连锁分子标记，为后续克隆基因奠定了基础，也为改良番茄果实柠檬酸含量提供了重要选择标记。 相似文献
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测定了301份番茄（Solanum lycopersicum L.）种质的叶片在离体24 h后的相对失水率,以鉴定其抗旱能力,并进行了全基因组关联分析（genome-wide association study,GWAS）。共检测到3个与番茄抗旱性显著关联的SNP位点,分别为S02.1158758、S02.1160893和S05.1426646,单个位点可以解释4.08%～18.97%的表型变异。挖掘到3个与番茄抗旱性显著关联的主效SNP位点和7个候选基因,有助于解析番茄抗旱性的遗传基础及其调控机制,为番茄抗逆遗传改良奠定了基础。 相似文献
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(一) 一个优良的番茄品种,首先要高产,而高产的基础是抗病,尤其是抗病毒病。根据有关文献记载,抗TMV基因来自野生番茄秘鲁,醋栗和多毛。这些野生番茄与栽培番茄多次回交,育成各种抗TMV番茄品种。秘鲁番茄对TMV具有生理抗性,醋栗番茄可延缓病毒病感染,多毛番茄因茎叶有浓密的茸毛,可避免病毒传播者蚜虫的接触。因此,都可作为杭TMV的育种材料,或作为引入抗病基因材料进行转育。 相似文献
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利用高代回交群体定位野生醋栗番茄发芽期耐盐QTL 总被引：3，自引：1，他引：2
以野生醋栗番茄( Solanum pimpinellifolium ) LA722和栽培番茄( Solanum lycopersicum ) 9706为材料, 结合发芽期大规模盐胁迫筛选方法和AB-QTL 技术进行耐盐QTL 定位和转育研究, 建立了包括280个BC3 S1单株的高代回交群体, 利用26个CAPS、66个SSR和39个SRAP多态性标记构建了分子遗传图谱并进行了耐盐性QTL定位。利用发芽20、24、28 d的发芽指数分别检测耐盐相关的QTL, 确定发芽24 d时的指数为检测QTL的最优指标, 共检测出11个与耐盐相关的QTL, 8个来自于野生醋栗番茄LA722。研究获得了58个极耐盐株系, 对部分耐盐株系进行QTL qST-8-1 和qST-9-2 的基因型分析, 其中230-1和230-3株系含QTL qST-8-1, 228-4株系含主效QTL qST-9-2, 231-6, 210-7, 226-1, 226-6, 226-7和204-7株系同时含有2个主效QTL, 这些株系的农艺性状接近栽培番茄9706, 可作为耐盐育种种质。 相似文献
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20S蛋白酶体能够通过自身或泛素—蛋白酶体系统特异性降解细胞质和细胞核中的蛋白质,维持细胞蛋白质稳态。本研究中鉴定出21个番茄（Solanum lycopersicum L.）20S蛋白酶体基因家族成员,并对其进行生物信息分析。结果表明,番茄20S蛋白酶体大多数基因含有相似的启动子和内含子,其中,编码α亚基的基因保守性较好,而编码β亚基的基因保守性较差;亚细胞定位发现,绝大多数基因在细胞质中发挥功能;染色体定位和基因复制分析发现,21个20S蛋白酶体基因不均匀地分布在12条染色体上,存在2对片段复制基因对;进化分析表明,编码α亚基和编码β亚基的基因被划分在不同的类群或亚群;多物种共线性分析发现,番茄与辣椒（Capsicum annuum L.）和马铃薯（Solanum tuberosum L.）之间的同源基因对较多,而与拟南芥[Arabidopsis thaliana(L.)Heynh.]、水稻（Oryza sativa L.）和玉米（Zea mays L.）同源的基因对较少。SlPRA1-01、SlPRA10-04、SlPRA11-05和SlPRA16-09这4个基因在3个物种中均形... 相似文献
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利用高代回交群体定位醋栗番茄发芽期与幼苗期耐冷QTL 总被引：1，自引：0，他引：1
以醋栗番茄LA722和普通番茄9706为材料,利用发芽期大规模低温胁迫筛选方法和AB-QTL方法对野生醋栗番茄发芽期和幼苗期的耐冷性QTL进行了定位研究,构建了包括273个BC3S1株系的高代回交作图群体,以种子相对发芽指数和苗期耐冷指数作为耐冷指标,检测到5个与发芽期耐冷性相关的QTLs,分别位于第1、2、5、11染色体上,2个与幼苗期耐冷性相关的QTLs,分别位于第2和第8染色体上。其中,控制发芽期耐冷性的qRGI-2-1和qRGI-5-1贡献率分别为12.8%和32.9%。有12个单株的自交后代（BC3S2）在发芽期和幼苗期的耐冷性都达到或优于LA722的水平,且果实质量等农艺性状均接近或优于普通番茄9706,可作为番茄耐冷育种材料。 相似文献
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采用高效液相色谱- 串联质谱技术（HPLC-MS/MS），对不同类型番茄果实的叶酸及其衍生物含量进行初步分析。
结果表明，栽培种和野生种不同基因型番茄果实中总叶酸含量均差异显著，栽培种番茄总叶酸含量为1 532.79～4 530.72
μg · kg-1，野生种番茄总叶酸含量为2 587.85～4 035.93 μg · kg-1。基于全基因组数据选取的17 份醋栗番茄总叶酸含量为
1 934.81～5 050.13 μg · kg-1。栽培种M82 和野生种LA0443 的叶酸含量较高，分别为4 530.72 μg · kg-1 和5 050.13 μg · kg-1。
对12 种叶酸衍生物的分析结果表明，不同基因型番茄的叶酸衍生物种类也存在一定差异，大部分资源至少含有9 种叶酸衍
生物。其中醋栗番茄资源叶酸变异更为丰富：5 份资源具有12 种叶酸衍生物，而四氢叶酸（THF）、四谷氨酸5- 甲酰四氢叶
酸（5-F-THFGlu4）、叶酸（FA）、10- 甲酰叶酸（10-F-FA）等在一些资源中含量较低或未能检测到。总体而言，番茄与大
多数作物类似，5- 甲基四氢叶酸（5-M-THF）是果实中的主要叶酸形式，其次是5- 甲酰四氢叶酸（5-F-THF），二者呈现
显著负相关。 相似文献
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利用从世界各地收集的182份野生种醋栗番茄(Solanum pimpinellifolium L.),采用喷雾接种法接种我国晚疫病主流生理小种T_(0,1)和T_(1,2),旨在筛选出抗晚疫病的遗传资源。结果表明,182份种质资源中有25份种质对T_(0,1)小种表现稳定抗性,占总数的13.74%,其中免疫(I)1份,高抗(HR)5份,中抗(MR)19份;对T_(1,2)小种表现抗性的种质资源为22份,占12.09%,其中高抗种质3份,中抗19份。通过分析抗性种质的地理位置,发现抗性种质分布相对集中,主要来源于秘鲁首都利马。利用18个SNP分子标记对抗性种质进行聚类分析,将抗性种质分为两大类群,其中第Ⅰ类群包含13份种质,地理分布相对集中,抗性水平差异较小;第Ⅱ类群包含9份种质,地理分布相对分散,抗性水平差异较大。试验获得的抗晚疫病种质资源,尤其是高抗种质PI390730、LA1604、L03707,可作为优异抗源应用于番茄抗晚疫病育种。 相似文献
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多毛番茄‘LA2329’对烟粉虱具有很高的抗性。利用‘LA2329’与普通番茄‘9706’得到
的BC1 群体构建了一张包含180 个分子标记,总长度为1 166.6 cM 的番茄分子连锁图谱。采用离体鉴定
的方法对BC1 群体进行抗烟粉虱鉴定,鉴定指标为叶片烟粉虱成虫附着量、叶片烟粉虱卵量,叶片正、
背面Ⅵ型腺毛密度。共定位到33 个与4 个指标相关的QTL。其中叶片烟粉虱成虫附着量和卵量显著正相
关,二者定位到8 个相同的QTL,其中2 个主效QTL 定位在2 号染色体,分别介于标记InDel_FT45 ~ SSR57
之间和SSR57 ~ InDel_FT49 之间,解释的表型变异率分别为33.2%和39.8%。叶片背面Ⅵ型腺毛密度相关
的QTL 在6 号染色体具有集群分布的现象,其中4 个显著性QTL 定位在C2_At3g11210 ~ C2_At1g24360
标记之间,解释的总变异率为56%。叶片正面Ⅵ型腺毛密度相关的4 个QTL 和叶片烟粉虱成虫附着量及
卵量相关的4 个QTL 定位在2 号和12 号染色体的相同位点,增效基因来源相反。以上结果说明叶片烟粉
虱成虫附着量和卵量指标具有相同的抗性鉴定效果,可以认为是同一个鉴定指标;此外,番茄中Ⅵ型腺
毛密度不是影响叶片烟粉虱成虫附着量和卵量的性状。 相似文献
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亚洲部分茄子品种资源数量分类 总被引：9，自引：1，他引：8
观测了部分亚洲国家及地区的 10 2份茄子种质资源的 50个性状 ,采用数量分类学的方法对观测群体进行分类。Q型分析结果表明 ,在 3个分类水平下 ,可将群体分别划分为野生种及栽培种 ;栽培种又可进一步分为半栽培类群、栽培短茄类群和栽培长茄类群 ;类群还可进一步分为 6组。在R型分析的基础上探讨了各性状的相关性以及类群间的进化次序 相似文献
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喀西茄（Solanum khasianum C. B. Clarke）是茄子近缘野生种，具有珍贵的抵抗生物胁迫及非生物胁迫的基因。以
10 份栽培茄材料作母本与喀西茄进行杂交，并采用一次授粉、重复授粉、花柱短截、混合授粉及嫁接后授粉等授粉方式，
研究获得栽培茄与喀西茄种间杂交种的最佳方法。结果表明：采用嫁接后授粉可以提高杂交结果率，并且得到了L81 与喀西
茄的F1；对F1 苗期植株进行SSR 分子鉴定，证实了F1 种子为栽培茄与喀西茄种间杂交种。 相似文献
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Chingakham Premabati Devi Anilabha D. Munshi Tusar Kanti Behera Harshwardhan Choudhary Partha Saha 《The Journal of Horticultural Science and Biotechnology》2016,91(1):87-92
Immature fruit of cultivated species of eggplant (Solanum melongena L.) are commonly used as a summer vegetable in India. Rich morphological variation exists among the cultivated species of eggplant in different growing regions of the country. We have characterised 24 breeding lines of Solanum spp., including 20 eggplant cultivars and four wild species of eggplant, based on 13 morphological characters using Mahalonabis D2 statistics. All 24 breeding lines of Solanum spp., including the 20 eggplant cultivars and four wild species, were grouped into four clusters by agglomerative clustering. Cluster II and Cluster IV contained the most accessions (eight each), while Cluster I and Cluster III had four accessions each. The highest inter-cluster (D2) distance (158.33) was observed between Cluster I and Cluster II, followed by Cluster I and Cluster III (108.48), and Cluster II and Cluster IV (102.96), which indicated that accessions in Cluster I and Cluster II were more divergent than those in the other clusters. The highest intra-cluster distance (5.80) was observed in Cluster IV, with eight genotypes, and the lowest intra-cluster distance (2.21) was observed in Cluster II, also with eight genotypes. The intra-cluster distances in all four clusters were lower than the inter-cluster distances, which indicated that genotypes within the same cluster were closely related. Genotypes in Cluster IV had the maximum number of flowers per cluster (3.63), the highest number of fruit per cluster (3.25), and number of fruit per plant (208.63), which revealed that genotypes could be selected from Cluster IV for these characters. The first three principal components (PC1, PC2, and PC3) accounted 73.99% of the total variation among the 24 genotypes. These phenotypic data increase the feasibility of prioritising breeding lines in a crossing programme based on the uniqueness of their desirable morphological traits. 相似文献