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运用微卫星标记对淮南麻黄鸡、皖南三黄鸡和五华鸡3个地方品种遗传多样性进行了分析。在5个座位中,共检测到23个等位基因数,平均有效等位基因数为1.5396,杂合度为0.2920,多态信息含量为0.4156。3个地方品种中,淮南麻黄鸡遗传多样性最低,五华鸡遗传多样性最高。根据5个微卫星座位等位基因频率计算群体遗传一致度和标准遗传距离并构建系统发生树,五华鸡与皖南三黄鸡遗传关系最近,皖南三黄鸡与淮南麻黄鸡最远。研究结果与这些地方品种的地理分布、育成历史相一致,同时也佐证了微卫星标记是研究鸡群体遗传关系的一个有用工具。 相似文献
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：用8个微卫星标记对闽南黄牛的等位基因频率、多态信息含量、杂合度和有效等位基因数等指标进行统计分析,并在此基础上对其进行聚类分析和分类研究。结果：8个微卫星标记在所检测的闽南黄牛群体中都表现出较丰富的多态性,在4个群体8个微卫星座位共有58个等位基因,每个微卫星标记平均检测到7．2个等位基因（3～11）;8个微卫星标记的平均多态信息含量（PIC）为0．6471,各群体的平均多态信息含量（PIC）差并不显著;全部群体平均杂合度为0．2930;各群体平均有效等位基因数为3．37。此表明闽南黄牛在微卫星位点上具有丰富的遗传多样性;根据奈氏标准遗传距离进行UPGMA聚类分析,结果表明4个群体间的遗传变异不大。 相似文献
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为在长毛兔群体中实施标记辅助选择,试验检测了200只长毛兔的Sat13、Sol33、Sat4、So144、Sat2、Sat5、Sat7与Sat12 8个微卫星座位,结果表明:8个微卫星座位在长毛兔群体中共检测到61个等位基因,平均每个座位的等位基因数是7.63个。等位基因数最多的座位是Sat4和So133,具有10个等位基因,等位基因数最少的座位是Sat12,只有5个等位基因;长毛兔群体内的平均多态性信息含量和平均杂合度的值分别为0.798和0.826,大小顺序依次为Sat4>So133>Sat5>Sat13>So144>Sat2>Sat7>Sat12,说明长毛兔群体内在这8个微卫星座位上基因型纯合度较低,遗传变异较大。同时分析了微卫星座位对长毛兔产毛量、体重性状的效应,本研究结果表明8个微卫星座位与不同日龄产毛量、不同日龄体重之间存在相应的显著相关性。 相似文献
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《中国养兔杂志》2015,(6)
为了从DNA分子水平揭示苏系长毛兔遗传多态性和遗传结构,选用6个多态性较好的微卫星标记,对96只宜兴拉必得种兔场发育良好的苏系长毛兔群体进行了检测分析。利用等位基因频率计算苏系长毛兔群体的期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)、等位基因数、有效等位基因数。6个微卫星座位全部呈现出高度多态性(PIC0.5),共检测到36个等位基因,每个座位的等位基因数在5~7个之间,平均等位基因数6.00±0.8944个,平均有效等位基因数为3.74±0.8159,该长毛兔群体期望杂合度(He)和多态信息含量(PIC)分别为0.7257±0.0589和0.6758±0.0721。研究结果表明:苏系长毛兔的微卫星座位有丰富的遗传多样性。通过选育可以使该苏系长毛兔群体进一步纯化,从而使其生产性能稳定。 相似文献
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选取10个微卫星位点,结合荧光标记(FAM) PCR扩增技术,运用毛细管电泳检测扩增产物,利用Microsatellite Toolkit、PopGene软件计算遗传相关指标,探讨广西树鼩群体的遗传多态性。结果发现,在10个微卫星基因座中,共检测到64个等位基因,平均等位基因数为6.4个,平均有效等位基因数为3.7892,平均观察杂合度和平均期望杂合度为0.6156和0.6963,平均多态信息含量为0.6367,其中7个是高度多态位点,3个属中度多态位点。此外,在10个微卫星基因座中,有5个位点偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.01)。结果表明广西树鼩遗传多态性较丰富,所选微卫星位点基本可用于评估广西树鼩群体遗传多样性。 相似文献
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旨在对中国地方鸡品种的遗传多样性与种群结构进行分析。本研究使用Affymetrix Axiom 600K高密度鸡基因分型芯片对来自8个品种的157只地方鸡及233只商品鸡进行基因分型,以品种作为分组来计算各分组的观测杂合度、期望杂合度、次等位基因频率、近交系数及核苷酸多样性分析地方鸡群体的遗传多样性,利用进化树、主成分分析、群体结构、MDS等方法分析鸡群体的群体结构,基于状态同源(IBS)和群体分化系数(Fst)分析种群内部与种群之间的亲缘关系,利用长纯合片段(runs of homozygosity, ROH)估算得到基于ROH的近交系数。结果表明,各群体的观测杂合度均高于期望杂合度,次等位基因频率在0.175～0.236之间,近交系数在0.018～0.205之间,核苷酸多样性在0～6×10-4之间,进化树与主成分分析表明品种间出现了明显的群体分化,地方鸡群体与商品鸡群的MDS分析发现我国地方鸡与商业肉鸡品种的遗传距离较近;IBS遗传距离在0.092 9～0.319 9之间;各品种成对Fst分析表明,群体间呈现中高分化程度(0.09～0.22);此次分析共得到了... 相似文献
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本研究设计PCR-RFLP方法,检测了农大隐性白C系、白来航、北京油鸡、三黄鸡、丝羽乌骨鸡、寿光鸡、菊花鸡、茶花鸡8个品种的BCDO2基因多态性,其中农大C系、白来航、北京油鸡均为GG纯合型,茶花鸡表现为AA纯合型;而丝羽乌骨鸡、寿光鸡和菊花鸡等品种的BCDO2基因的杂合度分别为0.5、0.4、0.13;本试验所用的三黄鸡品系为培育品系,也存在一定的杂合度,研究结果说明黄皮肤基因在我国多个地方品种还没有进行过选择。本研究还检测了BCDO2基因在三黄鸡和农大隐性白C系鸡种背部皮肤的表达量,结果显示,三黄鸡的BCDO2基因表达量高于农大C系,推测BCDO2基因的表达对背部皮肤的颜色仍起着重要的作用,并认为鸡躯干部皮肤与胫部皮肤色素的不对称分布主要由不同部位皮肤的组织特点和类胡萝卜素的化学性质决定。 相似文献
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《中国畜牧杂志》2019,(9)
为探究散养对皖南三黄鸡生长性能和肉品质的影响,试验选择80羽4周龄、体重相近、健康无病的的皖南三黄鸡,随机分为笼养组和散养组,笼养组每只鸡单笼,每组40个重复。试验期9周。结果表明:6周龄时散养组体重高于笼养组(P<0.05),试验期散养组胫围高于笼养组(P<0.05);笼养组的肌肉滴水损失率、蒸煮损失率和失水率以及腿肌水分、粗脂肪含量和pH高于散养组(P<0.05);与散养鸡相比,笼养鸡生长速度较快,但散养鸡肌肉系水力高于笼养鸡(P<0.05),表明散养鸡肉品质优于笼养鸡。综上,生产者应该根据自身情况以及不同市场对鸡肉产品的不同要求选用适宜的饲养方式。 相似文献
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Mtileni BJ Muchadeyi FC Maiwashe A Groeneveld E Groeneveld LF Dzama K Weigend S 《Zeitschrift für Tierzüchtung und Züchtungsbiologie》2011,128(3):209-218
In this study, we compare the level and distribution of genetic variation between South African conserved and village chicken populations using microsatellite markers. In addition, diversity in South African chickens was compared to that of a reference data set consisting of other African and purebred commercial lines. Three chicken populations Venda, Ovambo and Eastern Cape and four conserved flocks of the Venda, Ovambo, Naked Neck and Potchefstroom Koekoek from the Poultry Breeding Resource Unit of the Agricultural Research Council were genotyped at 29 autosomal microsatellite loci. All markers were polymorphic. Village chicken populations were more diverse than conservation flocks. structure software was used to cluster individuals to a predefined number of 2 ≤ K ≤ 6 clusters. The most probable clustering was found at K = 5 (95% identical runs). At this level of differentiation, the four conservation flocks separated as four independent clusters, while the three village chicken populations together formed another cluster. Thus, cluster analysis indicated a clear subdivision of each of the conservation flocks that were different from the three village chicken populations. The contribution of each South African chicken populations to the total diversity of the chickens studied was determined by calculating the optimal core set contributions based on Marker estimated kinship. Safe set analysis was carried out using bootstrapped kinship values calculated to relate the added genetic diversity of seven South African chicken populations to a set of reference populations consisting of other African and purebred commercial broiler and layer chickens. In both core set and the safe set analyses, village chicken populations scored slightly higher to the reference set compared to conservation flocks. Overall, the present study demonstrated that the conservation flocks of South African chickens displayed considerable genetic variability that is different from that of the assumed founder populations (village chickens). 相似文献
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边鸡微卫星DNA标记遗传多样性的研究 总被引：4，自引：0，他引：4
利用鸡基因组中5个微卫星标记,检测了边鸡群体的遗传多样性,并以大骨鸡做了比较分析。同时探讨了边鸡在国内5个地方鸡种中的系统地位。结果表明,5个微卫星位点共检测到38个等位基因,其中ADL0146位点的等位基因数最少(5个),而ADL0136和ADL0185两个位点的等位基因数最多(9个),平均等位基因数为7.6个.边鸡群体内比大骨鸡群体有更丰富的遗传多样性。聚类分析结果显示,边鸡与大骨鸡亲缘关系最近。而与鲁西斗鸡亲缘关系最远。 相似文献
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选取210只皖南三黄鸡,根据该系列商品代鸡的生产指标设计了低、中、高3种能量水平的日粮配方,能量值分别为12.81 MJ/kg、13.1 MJ/kg和13.38 MJ/kg,在常温下进行饲喂,每日称重,观察鸡群健康状况,试验持续6周。研究结果表明:高能量组生长性能都显著高于低、中能量组,尤其4周末和6周末时,高能量组平均体重显著高于其他2组。但是,高能量组腹水综合征的发病率和死亡率显著高于中、低能量水平组,分别为85.29%和6.90%。取腹水、肝脏、心脏等病料,显微镜检查未发现细菌,细菌培养呈阴性。有腹水症状鸡的红细胞压积(PCV)、血红蛋白(Hb)、红细胞计数(RBC)、乳酸脱氢酶(LDH)、谷丙转氨酶(GPT)及心脏指数(AHI)等指标均显著增高。以上结果显示:在肉鸡生产过程中,应协调好生长和腹水综合征发生之间关系,从而有利于发展皖南三黄鸡生产和减少腹水综合征所造成的经济损失。 相似文献
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为了研究略阳乌鸡线粒体DNA控制区（mtDNA D-loop）的遗传多样性和起源,本研究对30只略阳乌鸡样品的mtDNA D-loop全序列进行了PCR扩增和测序,结合GenBank中公布的其他鸡的D-loop区序列,分析略阳乌鸡线粒体多态性及其起源。结果表明,略阳乌鸡mtDNA D-loop区全序列中,A、C、G、T平均含量分别为26.6%、26.6%、13.4%和33.4%,26个核苷酸多态位点均为转换位点,核苷酸多样度（Pi）为0.00705,单倍型变异度（Hd）为1.000,中性检验Tajima's D值为-0.47272。通过群体构建的系统进化树发现,略阳乌鸡样品在系统进化树上聚为4大分支。研究结果表明,略阳乌鸡群体内个体序列变异程度较大,遗传多样性丰富,揭示略阳乌鸡在遗传组成上具有4个母系来源。 相似文献