不同方法提取土壤、活性污泥中总DNA的比较研究     

魏斐  杨丽荣  吴坤  薛保国 《河南农业科学》2012,41(5):74-77,95

试验目的在于研究土壤和活性污泥的最适DNA提取方法。采用9种不同的提取方法,对所提取DNA的浓度、纯度、提取率、片段大小、16SrDNA PCR结果进行了比较,结果表明,在土壤中,液氮研磨法提取DNA最优:DNA质量浓度为800mg/L,OD260/OD280为1.7。提取率为320μg/g;在活性污泥中,液氮浸泡法提取DNA最优:DNA质量浓度为1 485mg/L,OD260/OD280为1.59,提取率为594μg/g。  相似文献   

雷公藤叶片基因组DNA不同提取方法比较     

邢建宏  刘希华  庞铄权  梁一池 《安徽农业科学》2010,38(11):5553-5555

[目的]比较雷公藤叶片中基因组DNA的提取方法。[方法]采用常规CTAB法、改良CTAB法、常规SDS法、高盐低pH值法和一步法分别提取雷公藤叶片基因组DNA,利用琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度法测定样品OD260与OD280的比值以及RAPD扩增结果,判断所得DNA样品的纯度,并根据OD260值计算不同提取方法的DNA得率。[结果]改良CTAB法提取效果最佳,所提DNA的平均得率为219.3μg/g,OD260/OD280比值在1.869～1.903,用于RAPD-PCR均有较好的扩增结果。[结论]改良CTAB法是雷公藤叶片基因组DNA提取的最佳方法。  相似文献   

一种高纯度提取草地土壤微生物DNA方法的建立     

《吉林农业科学》2015,(3):26-29

本文研究建立一套高效、简便的草地土壤微生物DNA的提取和纯化方法。提取的微生物总DNA片段大小在23 kb左右,纯化后的DNA产量为(7.76±1.53)μg·g-1,OD260/OD280为1.78±0.04,OD260/OD230为1.76±0.02。  相似文献   

菠萝DNA提取方法的研究   总被引：4，自引：0，他引：4  

张如莲  洪彩香  傅小霞  漆智平  陈业渊  许桂莺 《热带农业科学》2006,26(1):8-10

采用石英沙代替液氮,用SDS法和CTAB法提取菠萝的DNA。结果表明,SDS法所提取DNA的平均OD值为1.704,提取率为2.098μg/g;CTAB法所提取DNA的平均OD值为1.498,提取率为1.412μg/g。SDS法和CTAB法所提取的DNA都可用作RAPD分析。  相似文献   

桉树人工林根际土壤DNA提取的优化     

胡凯  愈霞  王微 《湖北农业科学》2016,(12):3207-3211

通过优化土壤微生物总DNA的提取方法,获得高纯度、高得率和完整性好的总DNA,为桉树种植地土壤微生物群落多样性的分析奠定基础。综合比较已报道的土壤微生物DNA提取方法的优缺点,设计了7种从巨桉(Eucalyptus grandis Hill ex Maiden)人工林根际土壤中直接提取微生物DNA的方法,并通过PCR扩增、DGGE电泳及荧光定量PCR分析比较了不同方法所提取DNA的质量以及对后期分子生物学研究的适用性。结果表明,使用PVPP和硫酸铝铵联用吸附腐殖酸杂质后,采用PEG 8 000沉淀能够有效地提取桉树根际土壤DNA。该方法提取的DNA纯度最高,OD260 nm/OD230 nm达到2.45,OD260 nm/OD280 nm达到1.78,DNA得率为5.56μg/g土壤,适用于PCR扩增和荧光定量分析,并且通过DGGE电泳分离出最丰富的条带,是一种高效的提取土壤微生物DNA方法。  相似文献   

一种高质量天门冬基因组DNA提取方法     

韦荣昌  韦树根  付金娥  柯芳  潘丽梅  董青松  唐其 《湖北农业科学》2014,(7):1678-1681

针对天门冬[Asparagus cochinchinensis(Lour.)Merr.]成熟叶片富含多糖、多酚、蛋白质及其他次生代谢物质的特点,采用改良CTAB法对其基因组总DNA进行提取,并对DNA进行质量检测。结果表明,改良CTAB法可从天门冬成熟叶片中获得纯度高、完整性好的总DNA,其OD260 nm/OD280 nm为1.86,OD260 nm/OD230 nm为2.36,浓度为390μg/mL,产率达11.7μg/g,多糖、多酚和RNA杂质被去除干净,无降解现象,说明该方法提取的天门冬基因组总DNA质量较高。  相似文献   

革兰氏阳性与阴性细菌基因组DNA提取方法的优化     

云飞  梁林  鲍彦彬  石雅丽  孙亚超  李永丽  兰辉 《安徽农业科学》2021,49(10):98-100

在分析现有提取微生物基因组DNA的原理和方法基础上,对SDS-NaCl法进行了改良,以商品化微生物基因组提取试剂盒提取的基因组结果为对照,利用改良的SDS-NaCl法,分别提取大肠杆菌(Escherichia coli)、枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)和金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)的基因组DNA.结果表明,改良的SDS-NaCl法提取的大肠杆菌、枯草芽孢杆菌和金黄色葡萄球菌基因组DNA的OD260/OD280分别为1.88、1.89、1.81,浓度分别为61.67、64.32、53.22μg/mL;而商品化试剂盒提取大肠杆菌、枯草芽孢杆菌和金黄色葡萄球菌基因组DNA OD260/OD280分别为1.85、1.87、1.83,浓度分别为64.07、58.43、52.34μg/mL.结果证明改良SDS-NaCl法提取的革兰氏阳性和阴性细菌的基因组DNA可用于后续试验如全基因组测序和PCR等,同时可快速获得大量的高质量微生物基因组.  相似文献   

优化醋酸钾(KAC)法提取蚜虫基因组DNA   总被引：1，自引：0，他引：1  

赵丽娟  漆永红  刘永刚  张正英 《安徽农业科学》2009,37(10):4394-4395

[目的]探索一种简便、有效的单头蚜虫基因组DNA提取方法。[方法]以从不同地区采集的桃蚜为试材,采用改进的KAC法和优化的KAC法提取单头桃蚜的基因组DNA,用紫外分光光度计测定所提DNA的浓度（以OD260/280表示）,用0.8%琼脂糖凝胶电泳检测所提DNA的纯度,比较2种方法的提取效果;对优化KAC法所提DNA进行PCR扩增和电泳检测。[结果]优化KAC法提取的单头蚜虫基因组DNA的OD260/280为1.6-1.9,浓度为20-50 ng/g;改进KAC法提取的单头蚜虫基因组DNA的OD260/280为1.4-1.7,浓度为8-25 ng/g;来自同一地方桃蚜的基因组DNA PCR扩增产物的电泳条带基本相同。[结论]优化改进的KAC法提取的桃蚜基因组DNA浓度和纯度均较高。  相似文献   

槟榔基因组DNA的高效提取方法   总被引：3，自引：0，他引：3  

曾莉娟  李涛  张雨良  刘志昕 《江西农业学报》2010,22(2):58-59,63

以槟榔叶片为植物材料,采用改良的SDS-CTAB方法提取其基因组DNA。结果表明,以水饱和酚代替Tris饱和酚对样品进行抽提的SDS-CTAB法可以获得纯度高(OD260/OD280在1.7~1.9、OD260/OD230大于2)、一级结构完整、分子量大于23 kb的DNA,产率在50~120μg/g。该法所提DNA成功用于后续的分子生物学研究,并在花生、香蕉等植物上得到应用。  相似文献   

菠萝果实不同部位总RNA提取方法比较   总被引：2，自引：0，他引：2  

袁晓丽  王蔚  孙光明  杜丽清  张秀梅 《广东农业科学》2011,38(10):132-134

以不同发育时期和不同部位的菠萝果实为材料,比较了改良SDS法、改良CTAB法和Trizol试剂盒法提取RNA的效果。结果表明:3种方法提取的RNA差异明显,其中改良SDS法的效果最佳,其提取的RNA质量较好,无DNA污染,OD260/OD280和OD260/OD230接近2.0,产量达到464.3μg/g.FW以上,该方法提取的RNA能满足RT-PCR、Northern blot和cDNA文库建立等分子生物学研究的需要。  相似文献   

简易快速从微量羊血中提取高质量基因组的方法   总被引：1，自引：0，他引：1  

陈冰  王富强  刘德稳  高腾云 《江西农业学报》2008,20(1):103-104,107

以碘化钾法为基础,建立了一种简单快速从微量羊血中提取高质量基因组DNA的改进方法。该方法提取的基因组DNA经0．6％琼脂糖凝胶电泳检测,DNA带整齐,无拖尾。OD260／OD280为1．81±O．13,浓度为（234±36．4）μg／mL,PCR扩增得到了满意的扩增效果。  相似文献   

风信子DNA不同提取方法的效果比较   总被引：1，自引：0，他引：1  

胡凤荣  任翠  鲍仁蕾  罗凤霞 《沈阳农业大学学报》2011,42(5):570-573

采用简易CTAB法、改良CTAB法、SDS-CTAB法、高盐法和CTAB-硅珠法等5种方法对风信子花蕾、叶片和鳞片基因组DNA进行提取.比较DNA纯度、电泳、得率等指标,结果表明:CTAB-硅珠法没有获得DNA,其他方法均可提出DNA;在纯度方面,简易CTAB法＞SDS-CTAB法＞改良CTAB法＞高盐法;在得率方面,简易CTAB法＞改良CTAB法＞高盐法＞SDS-CTAB法.简易CTAB法提取的DNA纯度较高,OD260/OD280为2.01,OD260/OD230为2.33,浓度为406.8ng·μL-1,得率为175.95ng· μL-1.花蕾、叶片适合风信子基因组DNA的提取.  相似文献   

腰果叶片DNA的提取     

黄伟坚  黄海杰  张中润  王金辉  吴家和  梁李宏 《广东农业科学》2010,37(2):175-176,191

以CTAB法为基础,设计了一种快速分离和纯化腰果叶片总DNA的方法。研究结果表明,该改良方法简便、快速、经济、有效。分光光度法测定与电泳检测分析表明,采用该方法提取腰果叶片总DNA的纯度和完整性良好,OD260/OD230平均值为1.91、OD260/OD280平均值为1.86,可以进行PCR扩增、Southern杂交等分子生物学研究。  相似文献   

基于改进CTAB法提取空间诱变柱花草总DNA研究   总被引：2，自引：0，他引：2  

严琳玲  赵琼玲  白昌军  刘国道 《安徽农业科学》2009,37(8):3465-3467

[目的]用改进CTAB法提取空间诱变柱花草的总DNA。[方法]以柱花草幼苗叶片为材料,采用改良CTAB法提取柱花草总DNA。[结果]所提的DNA凝胶条带清晰,无拖尾现象,浓度在406．6～857．3ng／μl,0D260／DD230检测值在1．96—2．18,OD260／0D280检测值在1．76—1．98。所提DNA适用于ISSR-PCR。[结论]该方法具有简便、快速、高效的特点。  相似文献   

改良CTAB法提取益智基因组DNA   总被引：3，自引：0，他引：3  

刘晓静  王海燕  张根良  夏志强  王文泉 《江西农业学报》2007,19(8):111-112,114

益智叶片中多酚和多糖等杂质的含量较高,为获得高质量的益智基因组DNA,试验在传统CTAB法的基础上加以改良,提取益智基因组DNA,并对所得DNA的质量和浓度进行了检测。结果表明,改良后的方法较之传统方法简单高效,所获得的基因组DNA质量较好,OD260/OD280在1.7~2.0之间,RNA消化彻底,DNA无明显降解,进行ISSR分析条带清晰,多态性好。适合于进行以PCR为基础的DNA多态性的研究。  相似文献   

一种快速微量提取柑橘早期胚基因组DNA的方法   总被引：2，自引：2，他引：0  

范达  雷天刚  王军政  宋二玲  彭爱红  谭洪泉  王金萍  李政利  李凤龙  陈勇  陈善春 《安徽农业科学》2011,39(9):5089-5090

[目的]建立一种快速微量提取柑橘基因组DNA的方法。[方法]采用优化的CTAB微量提取法,以20.0、10.0、5.0、2.5 mg早期杂种胚为材料进行基因组DNA的提取,并对其DNA进行质量检测和SSR验证。[结果]该方法简单易行,所需材料少,提取的DNA纯度较高,OD260nm/OD280nm在1.800～2.000,可满足SSR等以PCR扩增为基础的试验需要。[结论]建立的方法可以用于快速微量提取柑橘基因组DNA。  相似文献   

刺桫椤DNA的简便快速提取方法   总被引：8，自引：0，他引：8  

王经源  黄儒珠 《福建林学院学报》2001,21(4):376-379

采用 SDS高盐提取介质简便快速提取刺桫椤 ( Alsophila spinulosa)叶片 DNA,整个提取过程可在 1 0 0 min内完成 ,且对鲜叶或用硅胶快速干燥的干叶均适用 .提取的 DNA相对分子量为48kb,OD2 60 /OD2 80 =1 .84± 0 .0 3;DNA 得率分别为 :60 0～ 1 2 0 0 μg/( g·鲜叶 ) ,35 0～ 5 5 0 μg/( g·干叶 ) ;提取的 DNA无需经 RNase消化等后处理 ,即可用于限制性内切酶酶切和 RAPD反应  相似文献   

一种快速微量提取柑橘早期胚基因组DNA的方法（英文）     

范达  雷天刚  王军政  宋二玲  彭爱红  谭洪泉  王金萍  李政利  李凤龙  陈勇  陈善春 《农业科学与技术》2010,(11):95-97

[目的]建立一种快速微量提取柑橘基因组DNA的方法。[方法]采用优化的CTAB微量提取法,以20.0,10.0,5.0,2.5mg的早期杂种胚为材料进行基因组DNA的提取,并对其DNA进行质量检测和SSR验证。[结果]该方法简单易行,所需材料少,提取的DNA纯度较高,OD260nm/OD280nm在1.800～2.000,可满足SSR等以PCR扩增为基础的试验需要。[结论]建立的方法可以用于快速微量提取柑橘基因组DNA。  相似文献