共查询到19条相似文献，搜索用时 203 毫秒
1.
《中国畜牧兽医》2020,(4)
试验旨在对转座酶Tn3的酶活力提高和进化进行初步探索。采用PCR扩增、限制性酶切、DNA连接、重组质粒的转化、易错PCR的优化及构建、D值的测定、酶切鉴定方法对转座酶Tn3进行体外定向进化研究。结果表明,用SacⅠ和XbaⅠ对重组质粒进行酶切,得到了450 bp的酶切产物;在含有卡那霉素的LB培养基培养菌体24 h,测量其D值,经过3轮重复性的研究,其D值和增殖能力从开始的0上升至0.18、0.42、0.60,说明Tn3活性有了明显的提高;将筛选得到的进化型重组质粒进行质粒抽提,用内切酶XhoⅠ和XbaⅠ进行双酶切鉴定,发现进化型重组质粒酶切产物条带相对较小;之后对进化型重组质粒进行基因测序分析,发现Tn3基因序列的多个位点发生了突变以及Tn3-Gal4靶向序列中间的CCR5-delta32基因被切除。说明成功完成了转座酶Tn3基因的克隆;确立了易错PCR的最优反应体系;选择卡那霉素作为筛选标记对进化型Tn3进行筛选,初步验证利用含有卡那霉素的LB培养基和对菌液D值的测定来进行筛选是可行的;Tn3基因序列突变和基因敲除,说明不论是在功能上还是在基因序列上Tn3都发生了改变,这种变化正是向着需要的方向进行的。 相似文献
2.
试验旨在对转座酶Tn3的酶活力提高和进化进行初步探索。采用PCR扩增、限制性酶切、DNA连接、重组质粒的转化、易错PCR的优化及构建、D值的测定、酶切鉴定方法对转座酶Tn3进行体外定向进化研究。结果表明,用SacⅠ和XbaⅠ对重组质粒进行酶切,得到了450 bp的酶切产物;在含有卡那霉素的LB培养基培养菌体24 h,测量其D值,经过3轮重复性的研究,其D值和增殖能力从开始的0上升至0.18、0.42、0.60,说明Tn3活性有了明显的提高;将筛选得到的进化型重组质粒进行质粒抽提,用内切酶XhoⅠ和XbaⅠ进行双酶切鉴定,发现进化型重组质粒酶切产物条带相对较小;之后对进化型重组质粒进行基因测序分析,发现Tn3基因序列的多个位点发生了突变以及Tn3-Gal4靶向序列中间的CCR5-delta32基因被切除。说明成功完成了转座酶Tn3基因的克隆;确立了易错PCR的最优反应体系;选择卡那霉素作为筛选标记对进化型Tn3进行筛选,初步验证利用含有卡那霉素的LB培养基和对菌液D值的测定来进行筛选是可行的;Tn3基因序列突变和基因敲除,说明不论是在功能上还是在基因序列上Tn3都发生了改变,这种变化正是向着需要的方向进行的。 相似文献
3.
本研究旨在通过CRISPR/Cas9体外酶切法及细胞水平上的PCR扩增测序筛选出靶向食蟹猴NTCP基因具有高敲除活性的gRNA。首先通过比对食蟹猴与人类NTCP氨基酸序列,选择差异位点,即第84-87位和第157-165位氨基酸作为基因靶点序列区;利用gRNA软件设计针对上述基因靶点序列的gRNA,每个靶点设计3~4条候选gRNA序列;然后利用gRNA体外检测试剂盒,筛选出靶向NTCP基因的体外敲除活性较高的两条gRNA序列：gRNA1.2和gRNA2.1。将gRNA1.2和gRNA2.1分别插入pLV hUbC-Cas9-T2A-GFP载体中,转染食蟹猴原代肝细胞。提取转染后细胞基因组DNA,通过PCR扩增NTCP基因并将其克隆到T载体中进行测序分析。结果表明,gRNA1.2和gRNA2.1均可使NTCP基因产生移码突变,但gRNA2.1比gRNA1.2具有更高的敲除活性。本研究为下一步编辑食蟹猴NTCP基因及研究其在乙型肝炎病毒（HBV）感染中的功能奠定了基础。 相似文献
4.
转座子可以由染色体的一个位置移动到另外位置,改变原有基因的结构和排序,从而导致基因改变。转座子可分为2大类,第1类转座子又有多种类型,这类转座子能以染色体DNA转录形成的RNA为模板,经反转录酶作用合成DNA并插入到基因组中;第2类转座子则直接在基因组中来回移动,不形成RNA,也与反转录酶的作用无关。用于昆虫重组的转座子几乎都是第2类转座子,其末端具有反向重复序列,中间部分为转座酶基因,此基因可产生转座酶,使末端重复序列与其内侧的目标序列移动,即将目标序列部分切出,并重组到染色体的其它部位上。因此,可利用这类转座子进行转… 相似文献
5.
《中国预防兽医学报》2017,(1)
由干扰素诱导细胞产生的GTP蛋白酶M(IRGMs)在抵御病原微生物中发挥着核心作用。为建立IRGMs基因缺失的MDCK细胞系,本研究利用CRISPR/Cas9技术根据MDCK中IRGM4、IRGM5和IRGM6的基因序列设计并合成正链和负链引导RNA(gRNA)的靶DNA序列,以本实验室构建的含有单链引导RNA(sgRNA)骨架转录序列的通用质粒(p Gen-sgRNA)为模板,将U6启动子与合成的相关基因gRNA靶序列经PCR融合扩增,其产物再与sgRNA的骨架转录序列进行重叠延伸PCR扩增,并将扩增产物克隆于p GEM-T载体中,分别构建了具有靶向不同目的基因ORF的gRNA重组质粒。将这些重组质粒分别与pMJ920质粒共转染于MDCK细胞中,通过G418筛选和流式细胞仪分选,并以终点稀释法纯化培养筛选出的单细胞克隆株。经gRNA靶序列片段的测序鉴定,获得了目的基因敲除的MDCK细胞系,并分别命名为MDCK-IRGM4-、MDCK-IRGM5-和MDCKIRGM6-。通过western blot检测经γ干扰素诱导条件下的这3种IRGMs基因在敲除细胞系中相应的蛋白表达均为阴性。这3种MDCK细胞IRGMs敲除的细胞系的建立,为进一步研究IRGMs基因在抗细胞内病原微生物感染中的功能奠定了基础。 相似文献
6.
转座子是自然发生的 ,能够从一个位点转移到另一个位点的遗传因子 ,它存在于染色体 DNA上。转座子的基本成分是一个基因 ,该基因编码转座作用所需要的酶—转座酶 ,以及供转座酶识别的侧翼序列。自主的因子编码转座酶的功能拷贝 ,拥有介导转座的识别序列。非自主的因子通常含有转座酶的变异拷贝 ,却又保留识别序列 ,因此 ,其它来源的转座酶能够移动非自主因子。转座子被频繁用作基因突变的手段 ,转座子标签在基因克隆中极其有效 ,是通过变异表型和特定的转座子的相关来克隆基因的 ,转座子插入到特定的基因 ,或插入到由转座子切除引起的缺失… 相似文献
7.
本研究旨在对三黄鸡ST3Gal6基因进行组织表达谱和生物信息学分析。参考三黄鸡ST3Gal6基因序列设计引物,采用PCR技术克隆三黄鸡ST3Gal6基因序列,并利用半定量RT-PCR进行组织表达谱分析;同时对其进行生物信息学分析。结果表明,克隆的三黄鸡ST3Gal6基因全长1169 bp,含有1059 bp的完整CDS编码区,编码352个氨基酸。其CDS编码区的核苷酸序列与人、黑猩猩、牛、大鼠、蟾ST3Gal6基因对应序列的同源性分别为62%、62%、61.9%、59%、54.4%。组织表达谱分析表明,ST3Gal6基因在各组织均不同程度地表达,其中在大脑表达量很高,肺脏中最低。生物信息学预测ST3Gal6蛋白结构发现,三黄鸡的ST3Gal6蛋白存在2个跨膜螺旋结构域,同时预测ST3Gal6存在22个磷酸化位点和1个特异性蛋白激酶磷酸化位点。 相似文献
8.
细胞内DNA通常以B型右手双螺旋结构的形式存在.但当一段DNA富含连续出现的鸟嘌呤(G)时,这段DNA序列有可能折叠为四链体(G-quadruplex,G4)结构.G4结构广泛分布于生物的基因组中,参与基因的转录调控、DNA复制、端粒保护和蛋白质翻译等重要的生物学过程.我们前期在家蚕转录因子BmPOUM2基因的启动子区鉴定到一个G4结构,并筛选到一个与该结构特异结合的蛋白BmLARK.在本研究中,为了分析BmLARK与G4结构结合的分子机制,我们首先对编码BmLARK全长及其多个截短的DNA序列进行了分子克隆,利用原核表达系统对BmLARK和截短蛋白进行了重组表达和纯化,获得的重组蛋白在体外可与BmPOUM2-G4结构结合;然后运用悬滴蒸汽扩散法对该蛋白质-DNA结合复合物进行结晶,初步获得了晶体.试验结果为进一步探索获得和解析BmLARK-G4复合物的晶体结构提供了线索. 相似文献
9.
10.
《畜牧兽医学报》2019,(11)
研究干扰素基因刺激因子(STING)基因敲除对猪伪狂犬病病毒(PRV)复制的影响。用CRISPR/Cas9技术敲除猪肺巨噬细胞系(3D4/21)的STING基因,用T7核酸酶检测靶基因敲除效率,用细胞计数试剂盒检测基因敲除细胞的活力,用表达绿色荧光蛋白(GFP)的重组病毒PRV-GFP感染基因敲除细胞,用流式细胞术检测感染细胞的荧光强度,用定量RT-PCR检测PRV的gB、TK基因表达及其感染细胞的IL-1β、IFN-β、ISG15基因转录,用Western blot检测PRV gE蛋白表达水平,用病毒滴定法测定子代病毒滴度。结果显示:设计的3个STING基因外显子2特异sgRNA均能切割3D4/21细胞的靶序列,其中sgRNA3的基因编辑效率最高;对sgRNA1介导STING基因敲除系进行克隆化,获得基因敲除细胞系3株,基因敲除对细胞活力无影响;亲本细胞培养的PRV-GFP感染阳性细胞占80.77%,STING基因敲除细胞培养的PRV-GFP感染阳性细胞占95.55%;STING基因敲除对PRV基因表达具有促进作用,亲本3D4/21细胞的病毒滴度为10~(6.2) TCID_(50)·0.1 mL~(-1),STING基因敲除细胞的病毒滴度为10~(8.3)TCID_(50)·0.1 mL~(-1),病毒感染细胞的IL-1β、IFN-β和ISG15转录下调明显。STING基因敲除能促进PRV在3D4/21细胞中复制,可能与感染细胞的IL-β、IFN-β和ISG15表达抑制有关。 相似文献
11.
The immediate-early (IE) protein BICP0 of bovine herpesvirus-1 (BHV-1) may have other functions besides transactivation of viral promoters. Recently, we observed that BICP0, delivered to cultured cells by a helpervirus-free amplicon system, forms spherical or doughnut-like structures in which the tumor suppressor protein p53 is sequestered. The objective was to determine whether BICP0 and p53 interact physically, we used both yeast and mammalian two-hybrid systems. As a bait plasmid, pVA3 which encodes a hybrid protein consisting of the Gal4 DNA binding domain fused to murine p53 was used. The BICP0 gene or its truncated versions were inserted into the prey plasmid pGAD424. Bait and prey plasmids were cotransformed into yeast strain Y153, which has LacZ and HIS3 reporter genes under the control of Gal4 upstream activating sequence. After 4-6 days, colonies were stained for beta-galactosidase activity. In the mammalian two-hybrid system, pM-53 was used as a bait where truncated p53 fused to Gal4 DNA binding domain is expressed. The BICP0 gene was cloned into prey plasmid pVP16. The interaction between p53 and SV40 T-antigen was evaluated as a positive control in both systems. Neither full-length BICP0 nor its truncated derivatives induced beta-galactosidase activity in yeast whereas the positive control turned blue under the same conditions. The mammalian two-hybrid system, in which chloramphenicol acetyltransferase (CAT) activity was used as a reporter, also failed to show an interaction between these two proteins. Co-localization of p53 with BICP0 in spherical structures is unlikely to result from a direct physical interaction between these two proteins. Mediation by additional cellular proteins may be required. 相似文献
12.
Keisuke SASAKI Saaya TAKAOKA Yayoi OBATA 《The Journal of reproduction and development》2021,67(3):229
Conditional knockout technology is a powerful tool for investigating the spatiotemporal functions of target genes. However, generation of conditional knockout mice involves complicated breeding programs and considerable time. A recent study has shown that artificially designed microRNAs (amiRNAs), inserted into an intron of the constitutively expressed gene, induce knockdown of the targeted gene in mice, thus creating a simpler method to analyze the functions of target genes in oocytes. Here, to establish an oocyte-specific knockdown system, amiRNA sequences against enhanced green fluorescent protein (EGFP) were knocked into the intronic sites of the Zp3 gene. Knock-in mice were then bred with EGFP transgenic mice. Our results showed that Zp3-derived amiRNA successfully reduced EGFP fluorescence in the oocytes in a size-dependent manner. Importantly, knockdown of EGFP did not occur in somatic cells. Thus, we present our knockdown system as a tool for screening gene functions in mouse oocytes. 相似文献
13.
本研究旨在调查猪场中肠球菌对氟苯尼考的耐药性,检测氟苯尼考耐药基因,并测定肠球菌中氟苯尼考耐药基因fexA的基因环境,从而分析其可能的传播机理。以四川某猪场分离鉴定的50株肠球菌为研究材料,开展分离株对氟苯尼考的药物敏感性试验。运用PCR技术检测分离株中氟苯尼考耐药基因cfr、fexB、fexA、floR和estDL136。运用热不对称性PCR（TAIL-PCR）技术获得fexA基因周围序列信息,分析其基因环境。运用反向PCR技术验证序列中环化结构的存在,同时运用交叉PCR技术检测20株猪源肠球菌fexA基因的基因环境。结果显示,在分离出的50株肠球菌中,有34株对氟苯尼考耐药（MIC ≥ 16 mg/L）,耐药率为68%。PCR结果显示,20株含有fexA基因,28株含有fexB基因,14株同时含有这两种基因。TAIL-PCR和测序结果显示,分离株DKC5中fexA基因存在于12 945 bp的Tn554转座子中。Tn554转座子可形成环化结构,其中的重复序列可形成含有2 395 bp的环化结构。本试验结果表明,猪源肠球菌对氟苯尼考耐药率较高,主要由fexA和fexB基因介导,fexA基因存在于Tn554结构中。预测fexA基因是经两次插入整合后进入DKC5分离株基因组序列的,这为fexA基因的水平传播提供了遗传依据。 相似文献
14.
DNA聚合酶β(DNA polymerase beta,POLB) 属于DNA聚合酶X家族中的一员,主要参与真核生物DNA的复制、DNA损伤修复、基因重组以及细胞周期调控等多种生物代谢过程。POLB所在的DNA修复基因与癌基因、抑癌基因、细胞周期调节基因以及细胞凋亡基因共同维持着细胞基因组的稳定性和完整性。若特异性敲除POLB会导致胚胎致死。近年来研究发现,POLB与细胞的生长发育、周期调控等息息相关。POLB表达下降使得上述的癌基因、抑癌基因受到损伤后却不能得到正确修复,从而导致细胞周期的紊乱、增殖失控。因此,本文将从POLB的基因结构、生物学功能、POLB在动物方面的研究等几个方面的相关研究进展进行综述,重点阐述其生物学功能,以期更深入了解 POLB,为畜禽品种的改良奠定理论基础。 相似文献
15.
Nucleotide sequences of the genes for Escherichia coli heat-stable enterotoxin I of bovine, avian, and porcine origins 总被引：4，自引：0，他引：4
The nucleotide sequences of cloned Escherichia coli heat-stable toxin 1 (STI) genes isolated from bovine, avian, and porcine origins were determined. They were found to be almost identical to that of Tn1681. The nucleotide sequences were completely preserved in bovine and avian genes, whereas the porcine gene had different sequences at 3 positions in the external region of STI structural genes, as compared with Tn1681. The amino acid sequences of the STI genes of the 3 animal origins corresponded to STIa, which had initially been found in a bovine strain. 相似文献
16.
Mikiko FUKUDA Mayuko INOUE Daisuke MURAMATSU Hitoshi MIYACHI Yoichi SHINKAI 《The Journal of reproduction and development》2016,62(1):121-125
Production of knockout mice using targeted embryonic stem cells (ESCs) is a powerful approach for
investigating the function of specific genes in vivo. Although the protocol for gene
targeting via homologous recombination (HR) in ESCs is already well established, the targeting efficiency
varies at different target loci and is sometimes too low. It is known that knockdown of the Bloom syndrome
gene, BLM, enhances HR-mediated gene targeting efficiencies in various cell lines. However,
it has not yet been investigated whether this approach in ESCs is applicable for successful knockout mouse
production. Therefore, we attempted to answer this question. Consistent with previous reports,
Blm knockdown enhanced gene targeting efficiencies for three gene loci that we examined by
2.3–4.1-fold. Furthermore, the targeted ESC clones generated good chimeras and were successful in germline
transmission. These data suggest that Blm knockdown provides a general benefit for efficient
ESC-based and HR-mediated knockout mouse production. 相似文献
17.
试验旨在研究伪狂犬病病毒(PRV)在NF-κB家族p65基因敲除细胞系中的复制规律。利用慢病毒介导的CRISPR/Cas9基因定点修饰技术构建猪肺泡巨噬细胞(3D4/21)p65基因稳定敲除细胞系。通过构建p65-sgRNA重组质粒,转染至HEK293T/17细胞,收取慢病毒,感染3D4/21细胞后利用嘌呤霉素筛选获得多克隆细胞系,T7核酸酶检测敲除效率,再通过有限稀释法获得3D4/21-p65^-/-的稳定细胞系。CCK-8试剂盒检测3D4/21细胞中敲除p65基因后对细胞增殖的影响;流式细胞术检测PRV-GFP感染3D4/21及3D4/21-p65^-/-细胞后病毒增殖的差异;实时定量PCR检测PRV感染3D4/21及3D4/21-p65^-/-细胞后PRV gB、TK基因mRNA表达水平及PRV感染细胞诱导的IL-1β和IL-6基因mRNA水平表达的变化;Western blotting检测PRV-QXX感染3D4/21及3D4/21-p65^-/-细胞后PRV gB、gE蛋白的表达;滴度测定检测PRV-QXX感染3D4/21及3D4/21-p65^-/-细胞后子代病毒滴度。结果表明,sgRNA2和sgRNA3的基因编辑效率较高,对其进行克隆化培养进而获得敲除p65基因的稳定表达细胞系;CCK-8试剂盒检测细胞活力表明,p65基因敲除对细胞活力无影响;流式细胞仪检测表明,同一时间点PRV-GFP在3D4/21-p65^-/-中的增殖显著高于对照细胞;实时荧光定量PCR表明在3D4/21细胞中敲除p65基因促进了PRV gB、TK基因的mRNA表达水平,而抑制了IL-1β、IL-6基因的mRNA表达;Western blotting结果表明,在3D4/21细胞中敲除p65基因促进了PRV gB、gE蛋白的表达;滴度测定结果表明,同一时间点PRV-QXX在3D4/21-p65^-/-细胞中子代病毒的复制显著高于对照细胞。以上结果均表明,p65基因敲除可促进PRV在3D4/21细胞中复制。 相似文献
18.
试验旨在研究伪狂犬病病毒（PRV）在NF-κB家族p65基因敲除细胞系中的复制规律。利用慢病毒介导的CRISPR/Cas9基因定点修饰技术构建猪肺泡巨噬细胞（3D4/21）p65基因稳定敲除细胞系。通过构建p65-sgRNA重组质粒,转染至HEK293T/17细胞,收取慢病毒,感染3D4/21细胞后利用嘌呤霉素筛选获得多克隆细胞系,T7核酸酶检测敲除效率,再通过有限稀释法获得3D4/21-p65-/-的稳定细胞系。CCK-8试剂盒检测3D4/21细胞中敲除p65基因后对细胞增殖的影响;流式细胞术检测PRV-GFP感染3D4/21及3D4/21-p65-/-细胞后病毒增殖的差异;实时定量PCR检测PRV感染3D4/21及3D4/21-p65-/-细胞后PRV gB、TK基因mRNA表达水平及PRV感染细胞诱导的IL-1β和IL-6基因mRNA水平表达的变化;Western blotting检测PRV-QXX感染3D4/21及3D4/21-p65-/-细胞后PRV gB、gE蛋白的表达;滴度测定检测PRV-QXX感染3D4/21及3D4/21-p65-/-细胞后子代病毒滴度。结果表明,sgRNA2和sgRNA3的基因编辑效率较高,对其进行克隆化培养进而获得敲除p65基因的稳定表达细胞系;CCK-8试剂盒检测细胞活力表明,p65基因敲除对细胞活力无影响;流式细胞仪检测表明,同一时间点PRV-GFP在3D4/21-p65-/-中的增殖显著高于对照细胞;实时荧光定量PCR表明在3D4/21细胞中敲除p65基因促进了PRV gB、TK基因的mRNA表达水平,而抑制了IL-1β、IL-6基因的mRNA表达;Western blotting结果表明,在3D4/21细胞中敲除p65基因促进了PRV gB、gE蛋白的表达;滴度测定结果表明,同一时间点PRV-QXX在3D4/21-p65-/-细胞中子代病毒的复制显著高于对照细胞。以上结果均表明,p65基因敲除可促进PRV在3D4/21细胞中复制。 相似文献
19.
Plasmid transfer and plasmid-mediated genetic exchange in Brucella abortus. 总被引：2，自引：0，他引：2 
下载免费PDF全文
下载免费PDF全文 Naturally-occurring plasmids and gene transfer mechanisms have not yet been reported in brucellae. Here we show that Brucella abortus is capable of maintaining and transferring the broad-host-range plasmids pTH10 (IncP), pSa (IncW) and R751 (IncP), and describe pTH10-mediated transfer of B. abortus chromosomal genes to Escherichia coli. All three plasmids transferred by conjugation from E. coli to B. abortus S19, and from B. abortus S19 to B. abortus 292 (biovar 4). They were stably maintained with no effect on biotyping characteristics. Plasmid pTH10 is a Tn1-containing derivative of RP4. It confers temperature-sensitive resistance to kanamycin, tetracycline and ampicillin to E. coli, but its tetracycline resistance and temperature sensitivity were poorly expressed in B. abortus. Plasmids pTH10 and pSa both transferred from B. abortus to E. coli DP50, a strain that is auxotrophic for diaminopimelic acid (DAP) Plasmid pTH10 (but not pSa) mobilized Brucella chromosomal gene(s) for DAP synthesis to DP50, yielding non-DAP-requiring (NDR) transconjugants. Neither plasmid transferred the NDR marker from their original E. coli host strains, nor did pTH10 transfer it from NDR transconjugants. Escherichia coli NDR transconjugant EP8.11 was cured of pTH10 by passage at the nonpermissive temperature, but retained the NDR marker and the Tn1-encoded resistance to ampicillin, indicating Tn1-mediated integration of Brucella chromosomal DNA into the E. coli chromosome. 相似文献