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本研究以砂藓(Racomitrium canescens)为材料,从砂藓干旱处理转录组数据库中筛选获得小G结合蛋白基因Rab的mRNA序列,通过RT-PCR法扩增,得到RcRab基因的CDS序列,并对其进行了生物信息学分析。结果表明,该基因c DNA全长为1171 bp,包含636 bp的开放阅读框,编码211个氨基酸。预测该基因有Rab家族的保守结构域-G结构域。RcRab蛋白分子质量为23.29 kD,理论等电点为5.76,具有亲水性,不属于跨膜蛋白且不存在信号肽。进化树分析表明,RcRab蛋白质与小立碗藓(Physcomitrella patens)Rab蛋白质亲缘关系最近。本研究可为进一步探索RcRab基因在苔藓植物中的抗旱机制提供数据基础。 相似文献
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本研究以红掌‘Alabama’幼苗为材料,克隆了2个b ZIP转录因子基因Aab ZIP1和Aab ZIP2。Aab ZIP1片段长度462 bp,Aab ZIP2片段长度为369 bp,两基因核苷酸序列的相似度为46.97%,推定的氨基酸序列相似性为31.17%。Blastx发现两个基因均具有亮氨酸拉链的保守结构域,具备b ZIP转录因子家族的基本特征。RT-PCR分析检测表明,低温处理后,Aab ZIP1基因为组成型表达,不响应低温胁迫;Aab ZIP2基因表达受低温诱导,其表达强度随着低温处理时间的延长而增强,Aab ZIP2可能在红掌的低温胁迫响应过程中起重要作用。 相似文献
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磷脂酶D是广泛存在于植物中的一种磷脂酶,在细胞结构组成和生理功能的变化中具有非常重要的作用。在本研究中,以在砂藓(Racomitrium canescens)转录组数据库中获得的一条与抗旱相关的磷脂酶D基因为基础,采用RT-PCR技术克隆得到该基因的全长CDS序列,命名为Rc PLD。生物信息学分析结果表明,Rc PLD基因c DNA全长1 420 bp,含有894 bp的开放阅读框,能够编码长度为297个氨基酸的多肽链。Rc PLD蛋白质的生物信息学分析结果表明,Rc PLD相对分子质量为33.192 k D,理论等电点p I为6.60,不含有跨膜结构,存在信号肽,具有磷脂酶D的保守结构域,属于不稳定的疏水性蛋白质。实时荧光定量PCR分析表明,在砂藓的复水过程和脱水处理条件下Rc PLD基因均有差异表达,说明该基因可能参与砂藓中响应干旱胁迫的某些生理代谢途径。本研究可为苔藓植物中抗旱机制的研究提供理论基础。 相似文献
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TIFY是植物特有的转录因子,可以调控植物分生组织的分裂,控制果实成熟度,也能提高植物抗旱性,并且减少机械损伤造成的伤害。本研究以砂藓(Racomitrium canescens)为材料,从砂藓干旱胁迫转录组数据库中筛选获得1个在干旱胁迫处理中具有显著差异表达的TIFY基因的m RNA序列,将该序列命名为RcTIFY1。我们对RcTIFY1基因全长CDS序列进行了克隆,并对RcTIFY1基因进行生物信息学分析,同时分析了砂藓在干旱和高温胁迫处理下RcTIFY1基因的表达变化。结果表明,该基因cDNA全长为1 326 bp,包含1 287 bp的开放阅读框,编码含有428个氨基酸残基的多肽片段。预测RcTIFY1基因编码的蛋白质有TIFY家族的保守结构域。预测RcTIFY蛋白质分子质量为46.14 kD,理论等电点为9.31,具有亲水性,不属于跨膜蛋白且不存在信号肽。本研究可为进一步探索RcTIFY1基因在苔藓植物中的抗逆机制提供数据基础。 相似文献
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在植物抵御和适应干旱胁迫的过程中,细胞中的氧化还原水平的调节十分重要,过氧化氢酶(catalase,CAT)是细胞氧化还原调控系统中的一个关键酶。砂藓(Racomitrium canescens)是一种具有强抗旱和旱后复水能力的藓类植物,其中能够响应干旱处理的基因和蛋白质可能与其抗旱特性功能相关。在本研究中,我们发现了一个在砂藓干旱处理转录组数据中呈上调表达的过氧化氢酶基因,将其命名为RcCAT,我们对这个基因的CDS序列进行了克隆和相关的生物信息学分析,并对砂藓复水和快速脱水过程中RcCAT具体的表达变化进行了检测。RcCAT的CDS全长1560 bp,编码含有519个氨基酸残基的多肽序列。对RcCAT蛋白质的氨基酸序列进行生物信息学预测,结果显示RcCAT相对分子质量为58.6 kD,理论等电点为6.52,不含有跨膜结构和信号肽,具有过氧化氢酶的保守结构域,与其它苔藓植物中的一些过氧化氢酶序列同源性较高,属于不稳定的亲水性蛋白质。在砂藓的复水和快速脱水过程中,RcCAT的表达水平均呈现快速大幅度的变化趋势,具有表达变化峰值,说明该基因具有能够快速响应干旱胁迫的可能性。本研究为从基因表达水平研究过氧化氢酶生物学功能提供理论依据,为进一步挖掘砂藓抗旱机制提供基础资源。 相似文献
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为进一步了解植物抗逆境胁迫的机理,本研究以中间锦鸡儿为试验材料,从实验室已建立的转录组数据库中选取转录因子CiMYB185编码基因作为研究对象。利用PCR技术分别以cDNA与g DNA为模板对CiMYB185基因进行全长克隆。测序结果表明:CiMYB185基因的开放阅读框为909 bp,编码303个氨基酸,其基因组DNA序列长度为1 592 bp,含有1个内含子和2个外显子。序列分析发现该基因所编码蛋白的N端包含2个MYB结构域,属于典型的R2R3-MYB类蛋白;利用染色体步移技术克隆得到908 bp的ATG上游启动子序列,序列中包含一些与光反应和激素相关的元件。该研究为进一步了解植物抗逆境胁迫的机理奠定了基础。 相似文献
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《分子植物育种》2021,19(15):4887-4895
b ZIP (Basic region/leucine zipper motif)蛋白是真核生物中普遍存在的一类转录因子,对植物应答胁迫具有重要作用。为了鉴定bZIP家族转录因子基因是否参与小麦盐胁迫响应的调控过程,获得更多与盐胁迫相关的b ZIP转录因子,本研究以‘科农199’(KN199)为实验材料,利用Illumina HiSeq平台进行150 bp双端测序,从转录组水平检测了bZIP家族转录因子基因在小麦盐胁迫条件下的差异表达情况。结果显示,每个处理的生物学重复之间的相关系数都在0.97以上,说明本实验中样品重复性较好,在处理不同时间点样品间的差异非常显著。根据中国春(Chinese spring, CS)参考基因组筛选到的156个小麦bZIP家族转录因子中,有14个bZIP转录因子位于5B染色体上;经盐处理1 h后,鉴定出14 544个差异表达基因(DEGs),包括49个b ZIP转录因子基因;在处理6 h后,鉴定出25 546个DEGs,包括59个bZIP转录因子基因,并且b ZIP转录因子基因在两组样品之间有35个共同的DEGs,其中有25个基因上调表达,10个基因下调表达。小麦响应盐胁迫b ZIP转录因子基因进行聚类分析结果与基因表达差异的结果一致。研究发现不论是总的DEGs还是差异表达的bZIP转录因子基因的数目,均随着处理时间的延长而增加,推测这些基因可能参与调控小麦盐胁迫反应。 相似文献
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《分子植物育种》2016,(11)
b HLH属于转录调控因子中的一个大家族,广泛存在于真核生物界,因具有保守性较高的b HLH结构域而得名。b HLH以二聚体形式特异性结合于DNA靶位点,调控多样化的生物过程,对真核生物的生长发育和次生代谢必不可少。植物中,b HLH转录因子通过与其他转录因子互作激活胁迫基因的表达,从而使植物免受非生物胁迫带来的伤害。本研究从实验室干旱转录组数据库中,得到一条中间锦鸡儿b HLH基因全长序列。序列分析显示该基因的开放阅读框为999 bp,编码332个氨基酸。比对分析结果发现其推导的氨基酸序列具有b HLH保守结构域,与拟南芥b HLH93蛋白一致性为68%,将其命名为Cib HLH93。实时荧光定量PCR结果显示,Cib HLH93受到Na Cl、冷、热和脱水的诱导,表达量随处理时间延长呈下降趋势,推测该基因在响应非生物胁迫过程中是一个下调基因。拟南芥叶肉原生质体瞬时表达实验表明,Cib HLH93主要定位于细胞核。以上结果,为进一步揭示Cib HLH93功能的研究提供了基础。 相似文献
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《分子植物育种》2017,(9)
以耐受低温萌发停滞期的种子为实验组,以低温萌发停滞期的种子为对照组,对独行菜(Lepidium apetalum Willd.)种子转录组进行了高通量测序。基于测序数据库资源,本研究对独行菜GRAS类转录因子进行了分析,除去冗余,发现独行菜种子共有GRAS家族270个成员。其中138个成员相对于低温萌发停滞组,在耐受低温萌发的独行菜种子中上调表达,128个下调表达,4个表达水平无差异。进一步选择了一个极显著上调表达的GRAS基因片段,通过Blastn同源序列比对分析表明,该基因片段与拟南芥GRAS基因家族SCL18全长基因一致性最高,达到96%,故本研究将其命名为La SCL18(Gen Bank登录号KY466159)。结合同源序列克隆法、采用RT-PCR技术克隆获得该GRAS基因c DNA序列,全长1 633 bp,编码一个完整的开放阅读框。生物信息学分析表明,该c DNA序列编码435个氨基酸、具有GRAS转录因子家族特有的保守结构域、亲水性较高、是一个水溶性较好的球状蛋白。编码蛋白分子质量139.883 k D、理论等电点为4.97、不具有跨膜区和DNA结合位点,表明其在调控相关基因转录时可能不直接与DNA序列结合,而是与其它转录因子相互作用后发挥功能。实时荧光定量PCR分析表明,独行菜幼苗在低温胁迫处理后La SCL18基因表达量迅速显著升高,初步推测La SCL18基因表达与独行菜幼苗耐受低温有关。 相似文献
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氮肥水平对强筋小麦产量和氮素利用的影响 总被引：1，自引：1，他引：0
为明确强筋小麦产量与效率相协同的最优施氮量,试验选用‘济麦20’和‘洲元9369’ 2个优质强筋小麦品种为试验材料,设置0、120、180、240、300 kg N/hm 2等5个施氮水平,用烘干法和凯氏定氮法分别测定小麦成熟期干物质量积累和含氮量,用以计算小麦氮素积累及氮素利用相关指标。结果表明,随氮肥投入量的增加,小麦产量呈现先升高后降低的变化趋势,其中‘济麦20’在N180和N240下达最高产量7.28 t/hm 2和7.26 t/hm 2,其较高的产量主要源于相对平衡的产量构成因素以及较高的干物质积累量（平均18.54 t/hm 2）;‘洲元9369’在N180下产量最高达7.75 t/hm 2,其较高的产量主要源于较高的单位面积穗数(970.65万/hm 2)、穗粒数（30.83粒）、较高的干物质积累量(20.77 t/hm 2)和收获指数(37.33%)。虽然氮肥偏生产力随着氮肥施用量的增加逐渐下降,但两品种的氮肥回收效率、氮肥农学利用率和氮肥生理利用效率均可在N180条件下达到最高值,其中,‘济麦20’最高值分别为62.67%、5.71 kg/kg、9.11 kg/kg,‘洲元9369’的最高值分别为63.65%、7.33 kg/kg、11.55 kg/kg。综合产量水平和氮素利用相关指标,本区域强筋小麦生产中产量与氮素利用效率相协同的施氮量为180 kg/hm 2。 相似文献
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辽宁春季界限温度发生日期的预报方法研究 总被引：1，自引：1，他引：0
为了在春季气候预测工作中,尽可能准确地预测辽宁春季稳定通过5℃的日期,采用1961—2010年辽宁省53站逐日气温资料和NCEP/NCAR再分析的月平均位势高度场、海平面气压场资料以及由NOAA重构的月平均海温场资料,通过相关分析方法并开展物理因子的普查工作,寻找辽宁春季稳定通过5℃日期的影响因子,并利用多元线性回归方法建立预报方程。结果表明：1961—2010年辽宁春季气温稳定通过5℃日期随时间有提前出现的趋势;稳定通过5℃日期与2月北大西洋海温、1月西北太平洋海温、2月北极涛动、1月印度洋海温、10月阿留申低压强度和1月北大西洋涛动关系密切;建立的预报稳定通过5℃日期的多元线性回归方程具有显著意义。 相似文献
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Fouad M. Basiouny 《Journal of Agronomy and Crop Science》1986,157(1):31-35
Sensitivity of different agronomic crops to UV-B radiation was studied under environmentally controlled conditions. UV-B radiation reduced plant height, fresh weight, dry weight and ash contents. The reduction varied among the different species tested. Narrow-leaved plants (mainly C4 ) were less sensitive to UV-B than broad-leaved plants (mainly C3 ). 相似文献
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David Stuligross 《Asia Pacific viewpoint》2008,49(1):83-97
Abstract: Jharkhand is at the centre of India's struggles to define ‘the environment’ and ‘economically relevant natural resources’. Although cultural labels are applied by leaders who seek influence in these struggles as well as by many of those people who listen, an ethnonational analytic frame does not help answer the questions: How, why and when has the political idea of environment changed in India? When and why has the Jharkhand movement chosen violent tactics? When and why has the Jharkhand statehood movement realised electoral success? Or, why was Jharkhand state formed? To address such questions, a long range historical‐institutional approach is much more fruitful. 相似文献
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YUAN Zheng-qiang 《保鲜与加工》2000,(5):107-110
This paper presents the class of high effective locations and its addition, subtraction, multiplication, division, involution and factorial by the object-oriented programming. 相似文献
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The origin,evolution, cultivation,dissemination, and diversification of Asian and African rices 总被引：28，自引：0，他引：28
Te-Tzu Chang 《Euphytica》1976,25(1):425-441
Summary Available evidences drawn from biosystematics, evolutionary biology, biogeography, archaeology, history, anthropology, paleo-geology and paleo-meteorology are pooled to reconstruct the series of events that led to the cosmopolitan cultivation of the Asian cultivated rice (O. sativa) and the regionalized planting of the African cultigen (O. glaberrima) in West Africa. The genus Oryza originated in the Gondwanaland continents and, following the fracture of the supercontinent, became widely distributed in the humid tropics of Africa, South America, South and Southeast Asia, and Oceania. The two cultivated species have had a common progenitor in the distant past. Parallel and independent evolutionary processes occurred in Africa and in Asia, following the sequence of: wild perennialwild annualcultivated annual. The weed races also contributed to the differentiation of the cultivated annuals. The corresponding members of the above series are O. longistaminata
Chev. et Roehr., O. barthii
A. Chev., O. glaberrima
Steud., and the stapfii forms of O. glaberrima in Africa; O. rufipogon
Griff., O. nivara
Sharma et Shastry, O. sativa L., and the spontanea forms of O. sativa in Asia.The differentiation and diversification of the annuals in South Asia were accelerated by marked climatic changes following the last glacial age, dispersal of plants over latitude or altitude, human selection, and manipulation of the cultural environment.Cultivation of rice began in many parts of South and Southeast Asia, probably first in Ancient India. Cultural techniques such as puddling and transplanting were first developed in north and central China and later transmitted to Southeast Asia. Wetland culture preceded dryland culture in China, but in hilly areas of Southeast Asia, dryland cultivation is older than lowland culture. The planting method progressed from shifting cultivation to direct sowing in permanent fields, then to transplanting in bunded fields.Widespread dispersal of the Asian cultigen led to the formation of three eco-geographic races (Indica. Sinica or Japonica, and Javanica) and distinct cultural types in monsoon Asia (upland, lowland, and deep water). Varietal types changed readily within the span of a millenium, largely due to cultivators' preferences, socio-religious traditions, and population pressure. Genetic differentiation developed parallel to the ecologic diversification process.The African cultigen developed later than the Asian cultigen and has undergone less diversification. The wild races in South America and Oceania retain their primitive features mainly due to lack of cultivation pressure or dispersal.Both the African and Asian rices are still undergoing evolutionary changes at habitats where the wild, weed, and cultivated races co-exist. 相似文献