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1.
基于SSR标记的花生品种遗传多样性分析 总被引：2，自引：0，他引：2
本研究从212对SSR标记引物中筛选出48对引物对63份花生品种进行遗传多样性分析,共得到251个等位变异,变异范围为2~13个,平均每个标记位点有5.23个变异;48个SSR标记的多态性信息含量为0.252~0.873,平均为0.647;63份材料的遗传多样性指数为0.508~2.243,平均值为1.272;品种间的遗传相似系数在0.657~0.960之间,不同类型的花生品种间的遗传相似性较小,不同来源花生品种间的亲缘关系也较远;聚类分析结果表明,63个花生品种在遗传相似系数为0.74处分为4大类,聚类分析结果与传统的花生分类结果吻合。 相似文献
2.
部分旱地小麦品种(系)遗传多样性的SSR分析 总被引：2，自引：0，他引：2
为明确旱地小麦品种(系)间的遗传关系,利用SSR标记技术对50份旱地小麦品种(系)进行遗传差异分析.结果表明,27对引物共检测出127个等位位点,每对引物可检测到的等位位点在2～8个之间,平均4.7个.品种间的遗传相似系数变幅为0.46～0.89,平均为0.68,其中西农811与西农928间的遗传相似性最高,遗传相似系数高达0.89;山农16与西农961问的遗传相似性最低,遗传相似系数为0.46.所选引物可以将全部品种区分开来,50个品种可分为8个类群,分类结果与品种系谱比较吻合. 相似文献
3.
中国西南地区小麦品种(系)遗传多样性的SSR分析 总被引：3，自引：1，他引：3
为了给中国西南地区小麦新品种选育以及杂种优势研究提供依据,采用微卫星分子标记(SSR)对2005～2006年西南地区参加国家小麦区试及预试的33个小麦品种(系)进行了遗传多样性分析,筛选出24对扩增谱带稳定的引物,共检测到126个等位基因变异,每对引物检测等位基因3～11个,平均5.25个.33个品种(系)之间的遗传相似系数为0.373～0.794,平均为0.597.品种间遗传相似系数变幅较大,表明西南麦区小麦品种(系)间存在着不同程度的遗传多样性差异.用UPGMA法可将33个品种(系)分为6个类群,聚类结果在一定程度上反映了它们之间的亲缘关系. 相似文献
4.
为了给中国西南地区小麦新品种选育以及杂种优势研究提供依据,采用微卫星分子标记（SSR）对2005～2006年西南地区参加国家小麦区试及预试的33个小麦品种（系）进行了遗传多样性分析,筛选出24对扩增谱带稳定的引物,共检测到126个等位基因变异,每对引物检测等位基因3～11个,平均5．25个。33个品种（系）之间的遗传相似系数为0．373～0．794,平均为0．597。品种间遗传相似系数变幅较大,表明西南麦区小麦品种（系）间存在着不同程度的遗传多样性差异。用UPGMA法可将33个品种（系）分为6个类群,聚类结果在一定程度上反映了它们之间的亲缘关系。 相似文献
5.
为明确中国优质小麦品种(系)间的遗传关系,利用21对SSR引物对75份优质小麦品种(系)进行了遗传多样性分析.结果表明,21对引物共检测到135个等位位点,每对引物等位位点数在2～13之间,平均为6.4个.位点多态性信息含量(PIC)变幅为0.49～0.90,平均为0.76.品种间遗传相似系数(GS)变幅为0.46～0.96,平均为0.66.SSR标记能将75份优质小麦品种(系)分成五大类.聚类分析结果与品种系谱来源及地域比较吻合. 相似文献
6.
为了从分子水平探讨黑龙江省春小麦种质资源的遗传多样性,对黑龙江省34份不同年代主栽春小麦品种进行SSR标记分析,计算遗传相似系数(GS)和位点多态性信息含量(PIC),并利用SSR标记的数据结果对供试品种进行聚类分析.14对SSR引物共扩增出73个等位变异,平均每对引物扩增出5.2个等位变异.遗传相似系数的变化范围为0.32～0.88,总体平均值为0.64.位点多态性信息含量(PIC)变幅为0.16～0.87,平均0.56.聚类分析表明,SSR标记将34个品种相互区分开并分为五大类,分类结果与品种系谱比较吻合.据此认为,SSR标记揭示出黑龙江省主栽小麦品种具有较高的遗传多样性. 相似文献
7.
小麦育种亲本材料遗传多样性的SSR分析 总被引：1，自引：0，他引：1
为了明确目前中国小麦育种亲本材料间的遗传关系,为育种工作提供有益信息,利用74对SSR引物对103份小麦主要亲本材料进行了遗传多样性分析,共检测出298个等位位点,每对引物等位位点数在2～14之间,平均为4.03个.位点多态信息含量(PIC)变幅为0.020～0.899,平均为0.429.品种(系)间遗传相似系数(GS)变幅为0.369～0.948,平均值为0.636.74对SSR标记能将103份小麦品种(系)分为五大类.聚类分析结果与品种系谱来源及地域比较吻合. 相似文献
8.
利用分布在玉米10条染色体上的83对SSR引物,分析30份玉米地方品种和2份玉米骨干自交系的遗传多样性。结果表明,有47对引物在32份玉米品种间表现稳定多态性,共检测到475个等位位点,每条引物检测到3～24个,平均为10.1个。32份材料间的遗传相似系数在0.487～0.752之间,平均为0.626。采用UPGMA法进行聚类分析,以遗传相似系数0.63为阈值,可以将30份地方品种划分为4个大类群,该结果与地理来源和表型分类的结果基本一致。 相似文献
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11.
西北地区糯玉米自交系遗传多样性研究 总被引：1，自引：0，他引：1
采用32对SSR引物对西北地区的40份糯玉米的遗传多样性进行分析,研究西北地区糯玉米种质资源的遗传多样性。结果表明,供试材料中检测出152个等位基因变异,每对引物可检测等位基因2～9个,平均4.75个。SSR的引物的PIC值介于0.303～0.862之间,平均多态性信息量为0.632。聚类分析表明,在遗传相似性系数（GS）0.662水平上40个自交系可聚成5类,主坐标分析将其分为4类9组。2种分类方法获得的结果基本吻合,主坐标分析能更为真实反映40个糯玉米自交系间的亲缘关系。 相似文献
12.
利用SSR标记分析栽培种花生多态性及亲缘关系 总被引：11，自引：1，他引：11
利用11对SSR引物对24个栽培种花生品种(包括四大类型)进行PCR扩增分析,其中4对检测到明显的多态性,共检测到33个等位基因变异,每一个位点上检测到的等位变异数为5～13个,平均为8.25个.根据扩增结果可以将24个品种中的21个相互区分.供试品种间的遗传相似系数值在0.2～1.0之间,平均为0.4788.根据UPGMA聚类分析结果显示供试品种大多数按亚种聚为两大类群(Ⅰ、Ⅱ);在两大类群下,大多数品种也基本上按类型分类.本研究结果表明,SSR在分析栽培种花生DNA多态性和遗传关系方面非常有用. 相似文献
13.
应用SSR标记技术,对33个香蕉引进品种(系)和1个国内品种的遗传关系进行了检测.40对SSR引物在34个品种(系)中扩增带数在4～17个之间,平均每个SSR座位可检测3.05个多态性带;引物的多态信息量(PIC)在0.21～0.91之间,平均0.78.依据SSR数据计算的品种问遗传距离在0～45.53%之间,平均28.19%,说明引进的香蕉品种之间存在较为丰富的遗传变异.UPGMA聚类分析将34个品种分为A基因组和AB基因组为主的2大品种类群.检测出多个与我国早期引进的主栽品种巴西蕉和Williams遗传差异突出的引进品种,这为筛选鉴定出新的替代品种,以及进一步在不同类群品种之间进行杂交选育新的品种奠定了基础.洪都拉斯3号与M931之间,洪都拉斯1号和洪都拉斯2号之间没有区分开来,它们可能分别是同一克隆,或者是同一克隆的突变体. 相似文献
14.
为了给大麦育种亲本组配提供理论依据,对44个大麦亲本进行SSR标记分析并鉴定其农艺性状,结果表明,44个大麦材料的农艺性状存在不同程度差异,株高最高的为苏盐3号,最矮的为E14;SCAR-LETT的穗型较理想。SSR分析结果表明,分布于大麦1H～7H染色体的32个SSR位点有23个位点(71.88%)具有多态性。这32个位点共检测到127个等位变异,每个SSR位点能检测到1～6个,平均为3.9个。品种间遗传相似系数(GS)变幅为0.457～0.984,平均值为0.720。聚类分析表明,这32个SSR标记能将44个亲本材料相互区分开,在GS值0.610水平上可以聚为2个大类。 相似文献
15.
甘啤系列啤酒大麦品种(系)与国外引进品种间遗传多样性的SSR分析 总被引：2，自引：1，他引：1
为了解甘啤系列啤酒大麦品种(系)与国外引进品种间的遗传关系,利用SSR标记技术对10个甘啤系列啤酒大麦品种(系)和25个国外引进品种的遗传背景进行了遗传多样性分析.结果表明,所用49对SSR引物中,有32对有多态性.这些品种遗传相似系数(GS)的分布范围较小,处于0.0500～0.6667之间.通过聚类分析,在GS值为0.26的水平上,这些品种被聚为4大类,大多数甘啤系列品种(系)分在同一类中,表明其遗传距离较近,遗传基础较狭窄;国外引进品种的分布范围相对较宽,表明其遗传基础较广泛. 相似文献
16.
为了合理评价北方地区白菜型油菜种质资源,为抗寒育种及组合配制提供依据,从252对标记中筛选出9对SSR和36对In Del标记对感温性、抗寒性、品质等性状差异明显的19份白菜型油菜品种的遗传多样性和亲缘关系进行了分析。结果表明,共检测到95个等位变异,平均每个标记2.15个;有效等位基因变幅为1.05~3.27个,平均为1.70个。Shannon指数的变幅范围在0.121 7~1.269 5间,平均值为0.580 3;多态性信息量PIC变幅范围为0.049 9~0.637 7,平均值为0.308 1。通过NTSYS计算遗传相似系数GS并按加权配对法(UPGMA)聚类,结果表明19份材料的GS变异在0.52~0.86之间。在GS为0.605水平上可将19份材料按两室与多室性划分为I-1和I-2两大类群,I-1类群在GS为0.655水平上可按冬春性分为II-1、II-2两个亚类群。在GS为0.71水平上,可将冬性材料划分为4个小群。聚类结果表明北方地区白菜型油菜的遗传多样性丰富,冬、春性品种间及春性品种间亲缘关系较远,存在较大遗传差异。 相似文献
17.
Genetic diversity of 299 inbred indica rice varieties, including 33 introduced varieties, applied in Guangdong Province of China were assessed using 20 ILP(intron length polymorphism) and 34 SSR(simple sequence repeat) markers. Totally, 154 loci were screened for the 299 varieties, with the average number of alleles(Na), rare alleles(Nr), and polymorphism information content(PIC) scored at 3.4, 0.7and 0.32, respectively. The Nei’s genetic distance(GD) was estimated ranging from 0 to 0.7529 with an average of 0.4797. There was no significant difference of Na, Nr, PIC or GDs between the introduced and local varieties. Neighbor-joining(NJ) analysis showed that the 299 varieties failed into three main distinct groups, and the 33 introduced varieties were distributed over all the groups or subgroups. Model-based cluster analysis demonstrated that only 73(24.4%) of the 299 varieties and 7(21.2%) of the 33 introduced varieties could be distinctly classified into the three groups. Analysis of molecular variance showed that within the groups divided by NJ analysis, the genetic variations revealed by ILP, SSR and these two combined were 7.7%, 5.6% and 6.6%, and within the groups divided by region(Guangdong local and the introduced varieties), the genetic variables were 2.1%, 4.6%, 5.4%, respectively. These results suggested that the genetic diversity of the 299 inbred rice varieties in Guangdong Province was low, simultaneously relationship among varieties was poor and close in all kind of groups. Hence, it is very necessary to extend the genetic diversity during the breeding and selection practical procedure. 相似文献