蜜蜂中肠一株耐氯霉素细菌的筛选与鉴定     

陈大福  陈梅强  李江红  梁勤 《中国蜂业》2012,(Z4):39-43

细菌的16S核糖体RNA(ribosome RNA,rRNA)基因以其在进化上的特征性序列,现已被广泛用于细菌分类和鉴定的分子指标。本研究用终浓度为20μg/mL的氯霉素从蜜蜂中肠筛选得到耐氯霉素的菌株,经对其16S rRNA基因片段克隆测序,再与NCBI数据库中已知细菌的16S rRNA基因片段序列相比对,结果表明经氯霉素筛选菌株的16S rRNA基因片段序列与克雷伯氏菌(Klebsiella pneumoniae)的相关序列相似度为100%,因此可将该菌株初步鉴定为克雷伯氏菌。该菌株在供试蜜蜂中肠内对氯霉素具有一定的耐药性。  相似文献   

狐源绿脓杆菌的分离鉴定及药敏试验     

李巧玲  庞洪泽  张文举  张召兴  吉志新  张志强  吴同垒  李蕴玉  史秋梅  贾青辉  李佩国 《畜牧与兽医》2018,(1):99-102

为了鉴定引起狐狸肺炎的病原菌,采用常规鉴定法和16S rRNA PCR方法从肺炎的狐狸肺脏病料组织中进行分离培养与鉴定,确定该菌为绿脓杆菌(Pseudomonas aeruginosa)。该菌的16S rRNA基因的系统发育树分析表明,分离菌与绿脓杆菌同源性达100%。动物致病性试验结果表明该分离菌株有致病性。药敏试验显示分离菌株对头孢曲松、阿米卡星、左氧氟沙星、阿奇霉素等药物敏感。  相似文献   

禽源大肠埃希菌Biolog鉴定和系统发育分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

李伟杰  赵耘  杜昕波  康凯  陈敏 《中国家禽》2008,30(15)

采用Biolog和16S rRNA基因序列分析法对中国兽医药品监察所菌种室收集保藏的18株大肠埃希菌(Escherichia coli)进行了鉴定.菌株经纯化培养,用Biolog微生物鉴定系统进行了鉴定,结果表明18株菌株为大肠埃希菌.提取基因组DNA,采用16S rRNA通用引物,用PCR进行16S rRNA基因序列扩增,扩增产物纯化后进行测序.序列经人工校对后用Clustal X 1.83软件进行比对分析,采用Mega 3.1软件构建系统发育树,结果表明18株菌株为大肠埃希菌.  相似文献   

上海地区屠宰场猪红斑丹毒丝菌的分离鉴定     

徐锋  王晓旭  张维谊  宁昆  齐新永  沈莉萍 《中国畜牧兽医》2017,44(1):227-235

为了解上海地区猪红斑丹毒丝菌在健康猪群中的带菌状况,本试验选择上海地区标准化屠宰场的上市猪为研究对象,采集鼻拭子、肺脏、扁桃体和下颌淋巴结等样本,进行猪红斑丹毒丝菌的分离,采用VITEK 2 Compact系统和VITEK MS快速鉴定系统进行鉴定,并设计1对16S rRNA基因引物,对分离菌株进行PCR扩增,随机选取16株分离菌进行测序及16S rRNA同源性分析。结果显示,49.07%（105/214）的样本中分离到猪红斑丹毒丝菌,分离菌株同参考菌株及疫苗株之间16S rRNA同源性为99.6%~100.0%。本试验结果表明上海地区猪群中确实存在猪红斑丹毒丝菌的健康带菌状况。  相似文献   

鸽源ST443肺炎克雷伯菌的分离鉴定和生物学特性分析     

陈瑞格  李赟辉  项维  汪厚强  樊大艳  李华明  雷连成  张付贤 《中国兽医杂志》2024,(5):46-55

为查明引起江苏省某养殖场赛鸽肺炎的病原及其生物学特性,本试验从患有呼吸道疾病的赛鸽肺组织中分离到1株肺炎克雷伯菌,通过形态学、生化鉴定、PCR扩增和16S rRNA基因测序对分离菌株进行鉴定,并采用多位点序列分型(MLST)、毒力基因检测、荚膜血清型分型、wzi基因测序、致病性分析、生物被膜形成能力测定、耐药基因检测、药敏试验和中药体外抑菌试验对分离菌株的生物学特性进行分析。结果显示,分离菌株为革兰阴性杆菌,显微镜下可见两端钝圆、杆状菌体,生化鉴定、khe基因PCR扩增和16S rRNA基因进化发育树分析确定其为肺炎克雷伯菌;MLST分型为ST443型;该菌株携带fimH、uge和wabG三种毒力基因;wzi基因测序鉴定分离菌株荚膜血清型为K16型;该菌株人工感染健康雏鸡可导致雏鸡多个器官出现不同程度的病变,半数致死量(LD₅₀)为4.68×10⁹ CFU/mL;分离菌株具有中等生物被膜形成能力,携带bla_SHV、bla_TEM、tetM和sul1四种耐药基因,对头孢曲松、头孢美唑、丁胺卡那、复方新诺...  相似文献   

多位点序列分型技术在凝结芽孢杆菌菌株分类中的应用     

冯海霞  王金龙  吕伟  刘胜利  马艳艳 《中国饲料》2022,1(3):39-42

本文通过16S rRNA基因和多位点序列分型(MLST)技术,对凝结芽孢杆菌不同菌株进行亲缘关系分析.试验选取国内具有代表性的15株凝结芽孢杆菌菌株,菌株纯化后提取基因组DNA,采用传统的16S rRNA基因分子鉴定和MLST技术相结合进行分析.其中MLST采用5个管家基因:adk、recF、sucC、rpoB和spo...  相似文献   

羊源脲酶产生菌的分离及NS-3菌株的鉴定     

高双喜  王萱  张志儒  付玉  冯雅铭  郝庆红  郭云霞 《黑龙江畜牧兽医》2019,(6)

为了从羊瘤胃液中筛选出可高效利用尿素的菌株,试验采用平板涂布法以尿素为唯一氮源对健康小尾寒羊瘤胃液进行初筛,对得到的变色圈较大的菌株进行脲酶活性检测和菌株形态特征、生理生化试验鉴定,结合16S rDNA序列分析并与相应种属的标准菌株进行比对,利用MEGA 5. 0构建系统发育树。结果表明:在羊瘤胃液中共分离得到83株具有变色圈的菌株,经纯化后得到9株变色圈较大的菌株,其中脲酶活性较高的菌株命名为NS-3,经鉴定和比对,NS-3菌株与解鸟氨酸拉乌尔菌(Raoultella Ornithinolytica)的相似性达到100%,二者在所构建的系统发育树上处于同一个分支,因此最终鉴定NS-3菌株为解鸟氨酸拉乌尔菌。  相似文献   

猪源粪肠球菌和屎肠球菌多重PCR快速鉴定方法的建立   总被引：2，自引：0，他引：2  

王亚宾  陈丽颖  胡慧  段志刚  崔保安 《动物医学进展》2010,31(Z1)

粪肠球菌和屎肠球菌是引起猪感染发病的优势肠球菌种,以肠球菌的16 S rRNA基因设计属特异性引物,利用SodA基因多态性设计种特异性引物,同时优化反应条件,建立了能同时测定猪源粪肠球菌和屎肠球菌多重PCR方法。通过对来源于猪的临床菌株、粪便菌株和鲜猪肉菌株进行测定,均能成功扩增出属特异性片段和种特异性片段。经过与快速生化鉴定试剂盒(Vitek-32)和16 S rRNA测序方法比较,多重PCR与16 S rRNA测序方法对猪的临床菌株、粪便菌株和鲜猪肉菌株的鉴定符合率100%;与Vitek-32鉴定符合率为62.3%,其中,与分离于感染猪的临床菌株符合率仅有46.7%,特别是感染猪的屎肠球菌,符合率仅为22.3%。  相似文献   

袋鼠摩根氏菌生物特性鉴定及系统发育分析   总被引：3，自引：1，他引：2  

赵耘  李伟杰  杜昕波  陈敏  康凯  陈永林 《中国畜牧兽医》2010,37(3):48-51

本研究利用Biolog快速鉴定系统、16S rRNA序列分析及传统细菌鉴定方法对3株分离自北京动物园袋鼠肺脏的菌株进行形态学、培养特性、生化特性、小鼠致病性等生物特性的鉴定及系统发育分析。结果表明,3株菌株均为摩根氏菌,对昆明小鼠有强致病性;3株袋鼠摩根氏菌16S rRNA序列与LMG7874模式株同源性均为99.8%,且位于系统发育树的同一分支。  相似文献   

黑颈鹤源大肠杆菌的快速鉴定及致病特性的初步研究     

余绍华  陈武  莫卓东 《野生动物》2011,32(4):224-227

对黑颈鹤病原菌进行快速鉴定及毒力因子分析。采用16S rRNA序列分析法鉴定黑颈鹤病原菌,其毒力基因分别用大肠杆菌的irp2、papC、iucD、tsh、iss毒力基因的特异性引物进行PCR检测,并将扩增出来的irp2基因序列与Genbank~（TM）相应序列进行同源性分析。分离菌株鉴定为大肠埃希氏菌,鉴定结果与生化检测结果一致,分离菌携带irp2毒力基因,这从毒力试验得到证实,其序列与与Genbank~（TM）上发表的HPI irp2基因序列同源性高达98%以上。采用16S rRNA序列分析法可以对黑颈鹤大肠埃希氏菌感染进行快速鉴定,黑颈鹤源性大肠杆菌携带有irp2毒力基因。  相似文献