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相似文献
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1.
用PCR技术从同一兔出血症病料扩增和检出2种病毒核酸   总被引:1,自引:0,他引:1  
应用 P C R 和 R T P C R 技术,对兔出血症病毒核酸作了鉴定。分别设计合成 2 对 P C R 扩增特异性引物,即按兔出血症病毒中国分离的 N J株核酸序列合成 1 对引物( N J引物),按德国分离的 F R G 株核酸序列合成另 1 对引物( F R G 引物),进行 P C R 和 R T P C R。从纯化的病毒核酸样品和感染 D J R K 细胞的病毒核酸样品中,均扩增出 2 对引物范围内的特异性核酸片段, N J引物扩增产物为 364 bp, F R G 引物扩增产物为 513bp。模板用 R Nase 消化后,仍出现 364 bp 带,用 D Nase S1 消化,则此带消失;反之,用 D Nase S1 消化,出现513 bp 带,用 R Nase 消化,则此带消失,证实前者模板为 D N A,后者为 R N A。 Southern 杂交试验证实, P C R扩增出的核酸片段与各自的地高辛标记特异性探针发生强阳性杂交反应。由此认为,在兔出血症病毒感染中,同时存在着 2 种不同核酸型的病毒。  相似文献   

2.
RT-PCR快速诊断禽流感   总被引:18,自引:0,他引:18  
根据禽流感病毒NP基因的序列分析结果,设计了一对NP基因特异的引物。采用该对引物,不经病毒分离,直接从禽流感病毒感染鸡的气管、泄殖腔棉拭子和组织样品中提取核酸, RT~PCR可以扩增出 326bp的 NP基因片段。采用该技术对14个亚型禽流感病毒标准参考株,4个亚型12株国内分离野毒株,RT-PCR检测的结果都呈阳性;对新城疫病毒、传染性法氏囊病毒、传染性支气管炎病毒、传染性喉气管炎病毒以及减蛋综合症病毒,RT-PCR扩增结果都呈阴性。禽流感病毒 A/Goose/Guangdong(H5N1)和 A/African Starling/England(H7N1)实验感染鸡样品 RT-PCR检测与鸡胚病毒分离阳性率分别为34/42、32/42; 24/55、24/55, 二者符合率大于95%。 RT-PCR最少可检测到10pg的病毒核酸。对山东某地发病鸡场样品进行RT-PCR检测,只用6个小时就可得出准确的诊断结果,证明RT-PCR检测方法敏感特异,可用于禽流感的快速诊断。  相似文献   

3.
应用反转录—聚合酶链反应检测鸽Ⅰ型副粘病毒的研究   总被引:3,自引:0,他引:3  
根据鸡新城疫病毒(NDV)和鸽副粘病毒F基因的保守序列,设计合成1对引物XZ9、XZ10,用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)对3种株鸽Ⅰ型副粘病毒均扩增出与预期大小相符的RT-PCR产物,而对鸡传染性支气管炎病毒、禽传染性喉气管炎病毒、大肠埃希氏菌、禽腺病毒、禽巴氏杆菌扩增结果均为阴性;RT-PCR最低能检出1pg的鸽Ⅰ型副粘病毒的核酸模板。  相似文献   

4.
根据GenBank中美洲型猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的核酸序列,设计合成1对引物,用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)从病毒猪肺中扩增出编码核衣壳蛋白(NP)基因,克隆入T-载体后,利用双脱氧链末端终止法测定序列,所获得的序列经Bankit投放到GenBank,并利用DNASIS、Dnastar等软件进行了分析。  相似文献   

5.
应用反转录—聚合酶链技术快速检测猪瘟病毒RNA的研究   总被引:3,自引:0,他引:3  
依据猪瘟病毒(CSFV)5′端非编码区休守序列设计一对PCR引物,建立了检测CSFV的反转录-聚合酶链(RT-PCR)技术,应用该技术从猪瘟免兔化毒感染兔的脾淋巴结,肾与肌肉等以及石门株强毒感染猪的脾与肌肉和湖北分离毒株感染猪组织匀浆液中均特异扩增出1条预期大小为194bp的片段,从实验感染兔和猪的血液中也特异扩增出了该片段,但对牛病毒性腹泻病毒(BVDV)和健康兔脾总RNA以及健康猪的血液RNA  相似文献   

6.
根据国外已发表的鸡传染性支气管炎病毒(IBV)核蛋白基因序列,设计并合成1对引物。应用这对引物,以RT-PCR特异性扩增出华南分离株(HN株)的核蛋白基因,基因产物大小为1.5kb,与设计相符。对HN株部分核蛋白基因进行序列测定,并与标准毒株H52,M41,Beau和Gray的核蛋白基因进行同源性比较,结果表明,HN株与H52、M41、Beau和Gray株的核酸同源性分别为85%、84%84%和8  相似文献   

7.
参考禽副粘病毒的融合蛋白基因(F基因)cDNA序列,设计并合成了1对引物,以他离到对鹅有致病力的Ⅰ型禽副粘病毒GPMV/QY97-1株的核酸(RNA)为模板,用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)对其融合蛋白基因3'端进行扩增,获得了预计的884bp左右的片段。将该片段克隆进pGEM-T Easy质粒载体,获得重组质料T-GPMVF3',采用限制性内切酶和PCR方法对该重组质粒进行鉴定,证明所克隆的  相似文献   

8.
以鸡胚尿囊液繁殖的新城疫病毒(昌黎株),经差速离心浓缩后,提取RNA,参考国外发表新城疫病毒F基因序列,设计并合成了一对长度皆为26bp特异性引物,经RT-PCR扩增出NDV昌黎株部分F基因序列,将其插入本室构建的FpKS(-),进行序列测定。序列分析表明该部分F基因长度为810bp,编码267个氨基酸,有4个半胱氨酸残基和2个糖基化位点,裂解位点区(112-117)氨基酸序列为R-R-Q-K-R-F,与所有强毒株在这一区域的序列(R/K-R-Q-R/K-R-F)相符,证明NDV昌黎株为强毒株。  相似文献   

9.
将北京地区猪系列与呼吸综合征病毒(PRRSV)分离BJ-2和BJ04的ORF7及部分3端编码区(UTR)的RT_PCR扩增产物克隆连接于pGEM-Teasy质粒载体上,重组质粒经EcoRⅠ酶切鉴定后进行了双链测序。测定垢基因序列与欧已知序列比较发现,BJ-2和BJ-4株与美洲VR-2332株非常接近,在其长度为555bp的cDNA序列中,仅与VR-2332株分别相差1和2个核苷酸,其中ORF7的核  相似文献   

10.
用RT—PCR检测新城疫病毒的研究   总被引:3,自引:1,他引:2  
用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)检测新城疫病毒(NDV)。研究结果表明RT-PCR可检测出F48E9株、Lasota株、Ⅰ系疫苗株、L株、SY1株等5株NDV尿囊液为阳性,其敏感性可测至10-3倍稀释尿囊液病毒。RT-PCR还能直接检测出发病鸡气管中的NDV。  相似文献   

11.
新城疫病毒弱毒株分子生物学特性的研究   总被引:3,自引:0,他引:3  
于1996年从长春地区一养鸡场分离到一株新城疫病毒(NDV长春株),经过病毒生物学特性的研究表明该NDV毒株为弱毒株。将NDV长春株纯化培养后,提取病毒RNA,经RT-PCR扩增F基因,并测定出F基因的全部核苷酸序列为1758bp,编码有553个氨基酸残基。与国内外发表的部分NDV病毒的强毒株和弱毒株的相同序列进行比较,其核苷酸同源性在88.2% ̄96.7%之间,氨基酸同源性在90.1% ̄98.1%之间,并与所有弱毒株F蛋白裂解位点区(112 ̄117)氨基酸序列Gly-Arg/Lys-Gln-Gly/Ser-Arg-Leu相同,从基因和分子水平上进一步证明NDV长春株为NDV弱毒株。  相似文献   

12.
根据已发表的PRRSVIAF-exp91株的核酸序列,设计了一对特异性引物,用RT-PCR扩增了PRRSVCH-1a株的N基因,经补平和磷酸化后,克隆到pUC18SmaI位点上,经电泳分析,酶切和PCR鉴定证实后,进行序列测定,序列分析表明CH-1a株与IAF-exp91株(美洲型)N基因核苷酸同一性为93.2%,氨基酸同一性高达96.7%,而与LV株(欧洲株)核苷酸同一性为63%,氨基酸同一性仅  相似文献   

13.
RT-PCR检测禽传染性支气管炎病毒   总被引:2,自引:0,他引:2  
用2对已发表的引物和1对自行设计的引物对同一禽传染性支气管炎病毒(IBV)H120株进行RT-PCR,分别获得了S1基因上与引物设计相一致的1720、228、602bp的扩增片段。用自行设计的引物对7个毒株(H120、H52、M41、Conn、Gray、T、Holte)和5个分离株(宜毒、上毒、云毒、HK、118)的含毒尿囊液或纯化病毒进行RT-PCR,结果除Holte株和2个分离株(宜毒、云毒)外,其余均成功地扩增出600bp的片段。用1.7、0.2、0.6kb3对引物对6个IBV毒株和6个分离株的含毒尿囊液在相同和不同条件下进行RT-PCR,结果3对引物分别扩增出3、5、9株IBV,同时可将不同血清型的12个IBV株分成6种基因型。将IBV分离株HK与标准株M41经PCR扩增、HaeⅢ和Hind酶切、RFLP分析,表明属同一马萨诸塞血清型。3株IBV(H120,HK,M41)在鸡胚中繁殖,PCR最早检出的时间为20~24h。RT-PCR提供了直接从尿囊液和感染鸡组织中快速检测病毒的新方法。  相似文献   

14.
根据已发表的犬γ干扰素(Ca-IFN-r)cDNA序列设计引物,用植物血凝素(PHA)有机锗(Ge-132)刺激体外培养的犬脾细胞产生IFN,提取IFNmRNA,并以其为模板进行返转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增出480bp基因片段。经酶切鉴定后将其克隆到pUC19的SmaⅠ,构建重组质粒pUC.IFN。经酶切、PCR及序列分析鉴定,可证明克隆的基因为犬γ干扰素,与所发表的核苷酸序列同源率为9  相似文献   

15.
猪繁殖—呼吸道综合征病毒(PRRSV)CH—1a株基因型鉴定   总被引:29,自引:4,他引:25  
根据猪繁殖-呼吸道综合征病毒(PRRSV)美洲型毒株和欧洲型毒株的基因组序列设计合成了2对引物,即1008PS/1009PR和1010PLS/1011PLR。我国分离的CH-1a株用这2对引物均能扩增出与预期大小相符的RT-PCR产物,分别与美洲型代表株(VR-2332)的RT-PCR产物大小相当。特异性试验表明,这2对引物均不能扩增其他常见的繁殖障碍相关病毒的RNA或DNA以及未感染的MARC-145细胞RNA。间接免疫荧光试验也证明,CH-1a株与PRRSV核衣壳蛋白特异性单克隆抗体以及美洲型毒株抗血清均呈阳性反应。因此初步证实CH-1a株为美洲型PRRSV。  相似文献   

16.
RT—PCR一步法检测鸡传染性支气管炎病毒的研究   总被引:2,自引:0,他引:2  
根据已发表的IBVS基因核苷酸序列,自行设计合成了一对跨幅约0.9kb的引物。该区段包括了S1基因C末端的400bp和S2基因N末端的500bp。用该引物对5株IBV参考毒株Gray、M41、H120、H52和MA5进行RT-PCR一步法扩增均获得预期的PCR产物,该引物的RT-PCR灵敏度检测结果表明,可以检测出0.112pg/μL的模板。用该引物对30个地方分离株进行检测,18株呈阳性,与鸡胚传代及电镜观察结果一致。  相似文献   

17.
采用RT-PCR技术,以A/Goose/Guangdong/3/96(H5N1)RNA为模板,扩增了1.73kd的HA全基因cDNA。将HAcD-NA克隆后进行了序列测定,测序结果表明所扩增的1728个苷酸片段包含了完整的HA基因的开放阅读框架和上下游引物序列、蛋白质合成的起始密 码子和终止密码子。核苷酸序列比较分析结果表明:A/Goangdong/3/96(H5N1)与A/Goose/Guangdkng/1/96(H5N1)有11个核苷核苷  相似文献   

18.
鸡传染性支气管炎腺胃病变型毒株免疫原基因的分离鉴定   总被引:1,自引:0,他引:1  
以腺胃病变型鸡传染性支气管炎病毒分离株H95提取的RNA为模板,按IBVBeaudete株S1基因两侧对应序列,设计一对27bp引物,引物间跨幅为17Kb。用反转录聚梧酶链反应(RTPCR)获得与预期大小一致的核酸片段。RTPCR产物凝胶电泳后,Southern印迹,经S1探针检测呈阳性,表明获得分离株H95S1基因。从核酸水平说明以腺胃病变为特征的分离毒H95为传支新出现的变异株。此结果与我们血清学鉴定结果一致。  相似文献   

19.
根据猪繁殖与呼吸综合征病毒美洲型标准毒株的ORF6及部分ORF7的序列,设计合成了一对引物26374 PS/26375PR,用反转录-聚合酶链反应技术对6株PRRSV北京分离株进行了检测。结果该引物对6株病毒均能扩增出与预期大小相符的RT-PCR产物,并与ATCC VR-2332株扩增产物的大小相当,而欧洲型标准毒株未获扩增片段。  相似文献   

20.
猪生殖与呼吸综合征病毒ORF6片段的cDNA克隆及鉴定   总被引:1,自引:0,他引:1  
根据已发表的PRRSV基因组序列,设计并合成了1对特异扩增ATCC VR-2332株的ORF6的基因的引物,以ATCC VR-2332基因组为模板,通过RT-PCR扩增出586bp的cDNA产物。将该cDNA片段经T-A连接插入pGEM-Teasy载体中,用重组质粒转化大肠埃希氏菌JM109,获得重组质粒转化菌。对重南粒DNA进行PCR及酶切鉴定,证明插入的DNA片段与PCR扩增的DNA片段大小相  相似文献   

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