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山羊脂肪酸合酶基因(FASN)启动子结构与功能的初步分析 总被引：1，自引：0，他引：1
本研究旨在对山羊脂肪酸合酶基因(Fatty acid synthase,FASN)启动子进行结构与功能的初步分析,进而对其转录调控机制进行探讨。采用PCR技术从西农萨能羊基因组DNA中克隆FASN基因启动子,通过缺失分析,构建7个包含不同缺失片段的荧光素酶报告基因载体,转染山羊乳腺上皮细胞和MCF-7细胞,利用双荧光素酶系统检测不同片段的启动活性。结果表明,克隆得到FASN基因的启动调控序列2 589bp,生物信息学分析发现,该启动子序列含有典型的启动转录元件TATA-box和E-box,分别位于转录起始位点(+1)上游-41和-74bp处。报告基因分析表明,启动子核心区域定位在-293～-79bp,在线软件预测发现,该区域含有Sp1、NF-Y、USF和SREBP等转录因子结合位点。结果显示,FASN基因启动子前端存在负调控元件,Sp1、NF-Y、USF和SREBP等转录因子可能参与FASN基因的转录调控。 相似文献
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为了探讨绵羊甘露聚糖结合凝集素（mannan-binding lectin,MBL）基因启动子区活性及转录调控机制,本试验根据已提交的绵羊MBL序列设计3条特异性引物,采用热不对称交错PCR(thermal asymmetric interlaced PCR,TAIL-PCR)技术扩增获得绵羊MBL基因的启动子区序列。经生物信息学分析,确定了其转录活性区域,发现绵羊MBL基因启动子无TATA框,但其存在多个PEA3和Spi-1/PU.1转录因子结合位点,二者同属Ets家族,且参与绵羊MBL基因转录起始复合体的形成。此外,该序列还包含Sp1、GATA-1、TCF/LEF等其他转录因子结合位点。结果表明,试验成功克隆获得了绵羊MBL基因的启动子区序列,为后期MBL基因启动子区活性及其表达调控机制和甲基化研究奠定基础 相似文献
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旨在构建稳定表达非洲猪瘟病毒(African swine fever virus, ASFV)E165R蛋白的PK 15细胞系。ASFV E165R基因经PCR扩增连接到p3×FLAG-CMV-10载体，再由同源重组连接克隆到慢病毒载体得到重组质粒V2-FLAG-E165R。在HEK 293T细胞中进行慢病毒包装得到慢病毒颗粒并转导至PK 15细胞中，经嘌呤霉素初筛得到的多克隆细胞，接着以终点稀释法筛选获得稳定表达E165R蛋白的单克隆PK 15细胞系。通过PCR扩增、Western blot和间接免疫荧光鉴定构建的PK 15细胞系，进一步利用RT-qPCR技术检测NF-κB及炎症相关基因P65、IKBa、IL-6、IL-8和TNF-α的mRNA表达水平。结果表明，稳定过表达ASFV E165R蛋白的PK 15稳定细胞系构建成功，与对照细胞系相比，E165R蛋白显著增强NF-κB以及炎症相关基因IL-6、IL-8和TNF-α的基因表达。本结果为后续研究ASFV E165R对先天免疫信号通路的影响提供生物材料。 相似文献
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《中国兽医学报》2018,(12)
通过分析调控北极狐毛色基因TYRP1启动子核心区域及转录因子,为探究该基因的表达调控机制提供理论依据,并为狐狸毛皮品质分子育种和彩色毛皮新材料的创制提供思路。通过基因组测序技术获得了北极狐TYRP1基因启动子序列,并利用生物信息学方法对北极狐TYRP1基因核心启动子区域和转录因子结合位点进行预测;以北极狐基因组DNA为模板,PCR扩增北极狐TYRP1基因不同长度的启动子缺失片段克隆至pGL3-Basic载体,将重组质粒瞬时转染到A375和293T细胞,利用双荧光素酶基因检测仪进行活性验证。结果表明,成功构建了9个含有不同长度启动子片段的重组质粒,经双荧光素酶活性检测发现北极狐TYRP1基因-699/+35区域为核心启动子区域,-699/-93区域存在着TYRP1基因正调控元件。生物信息学预测分析发现该区域存在4个转录因子结合位点;利用重叠延伸PCR技术成功构建了4个突变载体,经双荧光素酶活性检测发现4个突变载体活性均显著下降(P0.05),表明这4个转录因子是北极狐TYRP1基因转录调控的正调控元件。本研究确定了北极狐TYRP1基因启动子核心区域-699/+35,Sp1(-656/-646)、CREB(-598/-589)、Sp1(-539/-530)和Sp1(-163/-154)为北极狐TYRP1基因转录的正调控元件。 相似文献
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《畜牧兽医学报》2017,(5)
旨在筛选调控山羊毛色基因PMEL的启动子活性区域及转录因子,为探究该基因的表达调控机制提供理论依据,并为彩色山羊的育种和改良提供思路。以山羊基因组DNA为模板,PCR扩增PMEL基因不同长度的启动子缺失片段,定向克隆至pGL3-basic载体,将重组质粒转染到293T和A375细胞,通过双荧光素酶检测系统测定相对荧光素酶活性值;利用生物信息学方法对PMEL基因核心启动子区的转录因子结合位点进行预测,随后利用重叠延伸PCR分别对pGL3-327质粒上预测的转录因子结合位点进行点突变并构建突变载体,利用双荧光素酶检测系统进行活性验证。结果显示,本研究成功构建了7个不同长度的启动子片段,其中6个片段具有明显的启动子活性。经过双荧光素酶活性检测发现山羊PMEL基因-251/+76区域为核心启动子区域。通过不同长度的启动子片段的活性比较发现,-251/-62区域的缺失造成启动子活性从最高到消失,表明该区域对山羊PMEL基因转录调控有重要影响,生物信息学分析发现该区域存在5个转录因子结合位点,利用点突变构建了5个突变载体,经过双荧光素酶检测发现5个突变载体的活性均显著下降。提示这5个转录因子是山羊PMEL基因转录的正调控元件。本研究确定了山羊PMEL基因启动子核心区域为-251/+76,NF-1(-206/-197)、Sp1(-186/-174)、Sp1(-151/-139)、CREB(-91/-82)和Sp1(-82/-71)结合位点为山羊PMEL基因转录的正调控元件。 相似文献
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非洲猪瘟(African swine fever,ASF)是由非洲猪瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)引起猪的一种急性、烈性传染病。ASFV是非洲猪瘟病毒科、非洲猪瘟病毒属的唯一成员,是目前唯一已知的虫媒DNA病毒[1]。ASFV基因组为线性的双链DNA分子,根据病毒株的不同其大小约为170~190kb,包含151~167个开放阅读框,可编码150~200种蛋白[2]。 相似文献
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非洲猪瘟(ASF)是由非洲猪瘟病毒(ASFV)感染引起的一种高致病性病毒性传染病.为制备兔抗ASFV A137R蛋白多克隆抗体,本研究以ASFV Pig/HLJ/2018分离株基因组DNA为模板扩增ASFV A137R基因,将其克隆至原核表达载体pET-21a(+)中,构建重组表达质粒pET-21a-A137R,转化大... 相似文献
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为阐明更多非洲猪瘟病毒(African swine fever virus, ASFV)未知基因的功能，深入探究ASFV的致病机制，为研制针对ASFV流行毒株的疫苗提供候选毒株。采用同源重组的方法构建E184L基因缺失的非洲猪瘟单基因缺失毒株，在猪肺泡巨噬细胞(porcine alveolar macrophages, PAMs)中评价其复制特性，并在猪体内比较ASFVΔE184L与亲本毒株ASFV CN/GS/2018对猪的致病力以及在动物体内诱导免疫应答的差异。成功获得了E184L单基因缺失突变毒株ASFVΔE184L,经PCR鉴定、荧光观察及测序鉴定，证实该毒株E184L基因被成功缺失。复制特性研究发现，E184L基因的缺失削弱了ASFV在PAMs中的复制能力。动物体内试验显示，ASFVΔE184L接种猪在观察期内死亡1头，其余全部存活，而ASFV WT接种猪全部死亡，说明E184L的缺失导致ASFV的毒力显著下降。此外，与亲本毒株相比，ASFVΔE184L可诱导机体ASFV特异性抗体的产生及抗病毒因子干扰素β(interferon-β,IFN-β)的分泌。E184L为ASFV毒... 相似文献
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《中国畜牧兽医》2020,(4)
为探究骨形态发生蛋白受体ⅠB(bone morphogenetic protein receptorⅠB,BMPR-ⅠB)基因启动子区多态性及其与繁殖性状的相关性,本试验以贵州3个地方山羊品种(黔北麻羊、贵州黑山羊及贵州白山羊)为研究对象,通过构建混合DNA池PCR产物直接测序技术筛选SNPs位点,并采用多种生物信息学软件预测SNPs位点对核心启动子区、CpG岛和转录因子结合位点的影响。结果显示,BMPR-ⅠB基因启动子区存在4个SNPs位点:g.29893005 TC、g.29893016 CT、g.29893729 CG和g.29894370 CT。生物信息学软件预测得到BMPR-ⅠB基因核心启动子区和CpG岛,SNPs位点导致转录因子结合位点发生改变,g.29893005 TC和g.29893016 CT突变使原来的转录因子结合位点Sp1消失;g.29893729 CG突变使原来转录因子结合位点AP-1消失,从而产生新的转录因子结合位点USF;g.29894370 CT突变产生新的转录因子结合位点C/EBPalp,使原来的转录因子结合位点Sp1改变为C/EBPalp和Sp1。由此推测,SNPs位点对调控启动子功能元件可能存在重要影响。 相似文献
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为了找到水貂多巴色素异构酶(DCT)基因启动子活性区域及转录因子结合位点,试验采用PCR扩增与克隆,构建双荧光素酶报告基因重组质粒,分别转染到293T细胞和A375细胞,测定其活性,并利用在线软件对序列进行生物信息学分析,预测水貂DCT基因核心启动子区域的转录因子结合位点。结果表明:得到的6个不同长度的启动子片段均具有明显的启动子活性,且-1 292～+113 bp区域活性最高,提示其为水貂DCT基因核心启动子区域;成功筛选出337 bp水貂DCT基因活性较高的启动子片段,发现转录因子特异性蛋白1(Sp1)可能是调控启动子活性的重要转录因子。 相似文献
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为探究骨形态发生蛋白受体ⅠB（bone morphogenetic protein receptor ⅠB，BMPR-ⅠB）基因启动子区多态性及其与繁殖性状的相关性，本试验以贵州3个地方山羊品种（黔北麻羊、贵州黑山羊及贵州白山羊）为研究对象，通过构建混合DNA池PCR产物直接测序技术筛选SNPs位点，并采用多种生物信息学软件预测SNPs位点对核心启动子区、CpG岛和转录因子结合位点的影响。结果显示，BMPR-ⅠB基因启动子区存在4个SNPs位点：g.29893005 T > C、g.29893016 C > T、g.29893729 C > G和g.29894370 C > T。生物信息学软件预测得到BMPR-ⅠB基因核心启动子区和CpG岛，SNPs位点导致转录因子结合位点发生改变，g.29893005 T > C和g.29893016 C > T突变使原来的转录因子结合位点Sp1消失；g.29893729 C > G突变使原来转录因子结合位点AP-1消失，从而产生新的转录因子结合位点USF；g.29894370 C > T突变产生新的转录因子结合位点C/EBPalp，使原来的转录因子结合位点Sp1改变为C/EBPalp和Sp1。由此推测，SNPs位点对调控启动子功能元件可能存在重要影响。 相似文献
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旨在探究雌二醇(β-estradiol,E2)和孕酮(progesterone,P4)对非洲猪瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)体外复制的影响。采集空怀猪血清(non-pregnant swine serum,NPSS)和怀孕猪血清(pregnant swine serum,PSS)处理后,用添加胎牛血清(fetal bovine serum,FBS)、NPSS和PSS的培养液分别培养猪肺泡巨噬细胞(porcine alveolar macrophages,PAMs)和骨髓巨噬细胞(bone marrow-derived macrophages,BMDM)并感染ASFV,利用绝对定量PCR和Western blot检测ASFV复制差异;用E2和P4 ELISA试剂盒检测各组血清中E2和P4含量;并在FBS组中单独或者混合添加E2和P4后感染ASFV,检测ASFV复制差异;用NPSS和PSS培养BMDM 24 h后,相对定量检测β-干扰素及下游抗病毒因子转录差异。PSS培养组ASFV复制高于NPSS培养组;PSS中E2和P4的含量均高于NPSS,且FBS中E2和P4的含量很低;在FBS组中单独或者混合添加E2和P4后ASFV复制量增加;PSS培养BMDM后会抑制β-干扰素及下游抗病毒因子的转录。PSS中高含量的E2和P4促进ASFV复制,本研究为解释临床上猪群感染非洲猪瘟(African swine fever,ASF)后母猪首先发病且怀孕母猪病情较重的现象提供一定的科学依据。 相似文献
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环介导恒温扩增技术快速检测非洲猪瘟病毒 总被引：1，自引：0，他引：1
以人工合成的非洲猪瘟病毒(ASFV)P72全长基因为模板,利用在线软件Primer Explorer4设计环介导恒温扩增(LAMP)的内、外引物,通过对反应体系和反应条件进行优化,建立了ASFV的LAMP检测方法,同时进行了敏感性和特异性试验。结果表明,所建立的LAMP检测方法最低检测限可达10拷贝质粒DNA,且具有良好的特异性,LAMP产物的酶切鉴定也验证了反应的特异性。对凝胶电泳后紫外观察、肉眼观察颜色变化、生成沉淀观察以及实时荧光PCR扩增曲线Ct值判定等不同判定方法进行比较表明,以上结果判定方法各有其优缺点,其中荧光PCR的敏感性最高,染色法相对较方便直观,电泳法敏感性稍低。 相似文献
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An African Swine Fever virus (ASFV) isolated in an 1983 outbreak of the disease in Piemonte, Italy, was related by restriction endonuclease analysis of the viral genome to ASFV strains isolated in the Dominican Republic (1978), Haiti (1981) and Cameroon (1982). 相似文献
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Molecular characterization of African swine fever virus from domestic pigs in northern Tanzania during an outbreak in 2013 总被引：1，自引：1，他引：0
Gerald Misinzo David E. Kwavi Christopher D. Sikombe Mariam Makange Emma Peter Amandus P. Muhairwa Michael J. Madege 《Tropical animal health and production》2014,46(7):1199-1207
African swine fever (ASF) is an acute, highly contagious and deadly viral hemorrhagic fever of domestic pigs caused by African swine fever virus (ASFV), a double-stranded DNA virus of the family Asfarviridae. In this study, molecular diagnosis and characterization of outbreak ASFV in northern Tanzania, was performed on spleen, lymph node, kidney, and heart samples collected in June and July 2013 from domestic pigs that died during a hemorrhagic disease outbreak. Confirmatory diagnosis of ASF was performed using polymerase chain reaction (PCR) by partial amplification of B646L gene of ASFV encoding the major capsid protein p72 using PPA1/PPA2 primers. PCR using PPA1/PPA2 primers produced an expected PCR product size, confirming ASF outbreak in northern Tanzania. In addition, nucleotide amplification and sequencing, and phylogenetic reconstruction of the variable 3′-end of the B646L gene and complete E183L gene encoding the inner envelope transmembrane protein p54 showed that the 2013 outbreak ASFV from northern Tanzania were 100 % identical and clustered into ASFV B646L (p72) and E183L (p54) genotype X. Furthermore, the tetrameric amino acid repeats within the central variable region (CVR) of the B602L gene coding for the J9L protein had the signature BNBA(BN)5NA with a single novel tetramer NVDI (repeat code N). The results of the present study confirm an ASF outbreak in northern Tanzania in the year 2013 and show that the present outbreak ASFV is closely related to other ASFV from ticks, warthogs, and domestic pigs previously reported from Tanzania. 相似文献
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A Fernandez J Perez L Carrasco M J Bautista J M Sanchez-Vizcaino M A Sierra 《Zentralblatt für Veterin?rmedizin. Reihe B. Journal of veterinary medicine. Series B》1992,39(6):393-402
Lymph nodes, spleen, liver, lung and kidney obtained from pigs experimentally infected with two African Swine Fever Virus (ASFV) isolates of differing virulence were fixed by perfusion with glutaraldehyde and embedded in paraffin. An immunoperoxidase technique using a polyclonal anti-ASFV serum was performed on tissue sections in order to detect ASFV antigen. The distribution of ASFV antigen in such infected organs is shown and the differences between both infections compared and discussed. Monocytes, macrophages, hepatocytes, endothelial cells, neutrophils and epithelial cells were found to contain ASFV antigens. 相似文献
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非洲猪瘟(African swine fever，ASF)是由非洲猪瘟病毒(African swine fever virus，ASFV)感染猪引起的一种急性、烈性、高度接触性传染病，至今没有研发出安全有效的疫苗，一旦暴发会造成重大经济损失。ASFV在和宿主长期作用过程中，通过抑制干扰素和炎症反应，调节凋亡、自噬及细胞免疫等多种途径逃逸机体免疫反应促进自身复制，但具体的机制仍不完全清楚。ASFV复杂的免疫逃逸机制可能是阻碍有效疫苗研发的关键因素之一。借助生物信息学技术对ASFV的基因组和蛋白质组深入分析，筛选病毒的免疫调控关键基因和保护性抗原表位，将在ASFV免疫逃逸分子机制的研究与疫苗研发中发挥重要作用。本文主要对ASFV感染引起的免疫应答反应及可能的免疫逃逸机制研究进行概述，以期为ASF疫苗研制及综合防控提供思路。 相似文献
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OU Yun-wen YAN Chuan-zhong ZHANG Jie MA Bing DAI Jun-fei ZHANG Yong-guang JIA Ning 《中国畜牧兽医》2017,44(7):2139-2146
African swine fever (ASF) is a devastating disease caused by African swine fever virus (ASFV), characterized by acute feature, high fever, high mortality and other characteristics. ASF mainly outbreaks in African, Eastern Europe countries, Russia and Caucasus region. At present, there are no vaccine available and effective control strategies against ASFV spread, therefore, ASF has a serious impact on the pig industry in the affected countries. The major target cells of the virus are swine reticuloendothelial cells and monocyte-macrophage cells. ASFV can result in apoptosis and affect the host's immune system, and then show the characteristics of the corresponding disease. ASFV has the characteristics of large genome, more genotype and more variability. In this paper, the molecular etiology and pathogenesis of ASFV are reviewed, so as to provide theoretical basis for prevention and control of ASF. 相似文献