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为了揭示罗非鱼"粤闽1号"母本——尼罗罗非鱼Oreochromis niloticus的遗传背景及其选育群体世代间的遗传变异,采用13对荧光标记微卫星引物分析了罗非鱼"粤闽1号"母本3个不同选育世代(F2、F4和F6世代)的遗传多样性和遗传结构,并进一步分析了它们与高要(GY)、惠州(HZ)、茂名(MM)和无锡(WX)4个尼罗罗非鱼地理群体之间的遗传关系.结果表明:F2、F4和F6 3个选育世代的等位基因数、有效等位基因数、期望杂合度、Shannon指数和多态性信息含量等遗传多样性参数均呈现出随着选育世代增加而降低的趋势,但仍表现为高度多态性(PIC>0.5);4个尼罗罗非鱼地理群体的遗传多样性依次为GY群体>MM群体>HZ群体>WX群体,其中GY群体、MM群体和HZ群体的遗传多样性显著高于3个选育世代;随着罗非鱼"粤闽1号"母本的选育世代增加,世代间遗传距离(Da)逐渐增大(F2～F4的Da = 0.155 6,F4～F6的Da=0.375 7),遗传分化系数(FST)也逐渐升高(F2～F4的FST = 0.036 4,F4～F6的FST= 0.111 1);在UPGMA系统进化树中,3个选育世代群体与HZ群体、GY群体聚为一支,说明它们的遗传背景相近;罗非鱼"粤闽1号"3个选育世代母本的与4个地理群体中的GY、HZ和MM群体之间遗传分化中等,与WX群体之间遗传分化较大.研究表明:罗非鱼"粤闽1号"母本的选育群体在选育过程中遗传多样性出现下降趋势,遗传分化不断加剧,F6与F2、F4遗传分化中等,但仍保持着较高遗传多样性,具有进一步选育潜力;4个尼罗罗非鱼地理群体中GY群体的遗传多样性最高,与选育群体F6的遗传距离适中(Da<0.54),可作为潜在的引种群体与罗非鱼"粤闽1号"母本的选育群体进行杂交,从而提高其遗传多样性. 相似文献
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用(V9112 89A/ /济南13/ 97美斯6 )三交F1代分离群体的极端不育株和极端可育株分别建立保持池和恢复池,利用1BS和1DS上的SSR引物对两池和亲本进行了多态性分析研究,发现1BS上的4个引物GWM11、GWM18、GWM2 6 4和GWM2 73在两亲本间有稳定差异,但1DS上没有找到有差异的引物。通过在分离群体上验证,发现这4个1BS上的引物与育性恢复基因间的交换值均大于5 0 %。推测,V型不育系不适于用三交F1代分离群体进行遗传距离分析。 相似文献
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为提高三桠乌药种质资源保护与利用成效,以河南、山东天然分布的7个三桠乌药群体的种子为材料,对其5个表型性状进行方差分析、相关分析及聚类分析。方差分析结果表明,三桠乌药种子表型性状在群体间和群体内均存在丰富变异,MP1天然群体种子的长度、宽度、体积和表面积与其它6个天然群体的相应性状均存在差异,且达到极显著水平;LS群体与MP1、MP2群体,MP1群体与其它6个群体的种子体积也均存在极显著差异。相关性分析结果表明,7个三桠乌药天然群体种子的5个表型性状与其采集地的海拔、经纬度、年均温和年降水量均存在一定相关性。聚类分析结果表明,在距离为2时,可以明显将7个群体分成4组:第一组包括MP1,第二组包括LS,第三组包括QX、MP2和MP3,第四组包括ZY和LC。昆嵛山MP1和崂山LS天然群体资源对整个三桠乌药种质资源的保护和创新利用具有重要价值。 相似文献
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4个暗纹东方鲀群体的遗传多样性分析 总被引：2，自引：0，他引：2
采用10对暗纹东方鲀(Takifugu obscurus)和16对红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)微卫星引物对4个暗纹东方鲀群体(1个长江常熟江段捕捞群体,1个江苏扬中放流群体和2个养殖群体)的遗传多样性进行分析。结果显示,20个微卫星位点能成功扩增出片段并且具有一定的多态性,在4个群体中共检测到113个等位基因。每个群体的平均等位基因数为4.95～5.50,平均观测杂合度为0.686 7～0.761 7,平均期望杂合度为0.653 0～0.700 0,平均多态信息含量为0.601 3～0.638 4。各个群体都有一些微卫星位点偏离Hardy-Wein-berg平衡(P<0.05),主要表现为杂合子不足。群体间遗传分化系数为0.040 6,基因流值为5.905 6,群体间遗传分化程度较小,群体间基因流水平较高。4个群体间的遗传相似系数为0.859 0～0.915 8,遗传距离为0.088 0～0.151 9,采用UPGMA法对4个群体进行聚类,可分2类:上海养殖群体单独为一类,扬中放流群体、常熟江段捕捞群体和南通养殖群体为另一类。 相似文献
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为探究江浙地区不同罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)群体的遗传多样性和遗传结构,利用16个微卫星标记对潮丰(CF)、蓝天(LT)、源泉A(YQA)、源泉B(YQB)、嘉丰(JF)、南太湖(NTH)等6个江浙地区养殖群体和1个泰国正大(ZD)引进群体进行遗传变异分析.结果显示,16个微卫星位点均为高度多态位点;7个群体均为较高的遗传多样性,期望杂合度(He)和多态信息含量(PIC)均大于0.7,遗传多样性大小排序为ZD>YQA>YQB>JF>LT>NTH>CF;遗传分化指数(Fst)分析结果显示,泰国正大与江浙地区各群体间存在中等程度的遗传分化,Fst介于0.10145～0.12348之间;江浙地区群体除NTH与CF群体间为中等程度遗传分化(Fst=0.05098)外,其余群体间的遗传分化程度较低,Fst介于0.01571～0.04099之间.AMOVA分析结果显示,遗传变异主要发生在个体内和群体内个体间,群体间遗传变异仅占2.10％.依据Nei's遗传距离构建的非加权组平均法(UPGMA)系统进化树显示,泰国正大群体独占一支,江浙地区6个群体聚为另一支.Structure分析结果显示,所有样本被划分为2个理论群,江浙地区6个群体为一个集群,泰国正大群体为一个集群.该研究不但揭示了江浙地区罗氏沼虾养殖群体的遗传多样性现状,而且也为罗氏沼虾种质资源的保护、利用以及优良品种的选育提供了参考信息. 相似文献
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利用SSR和ISSR两种分子标记技术,对菊黄东方鲀的人工选育群体(SH)和野生群体(YS)的遗传变异和遗传结构进行了联合分析。SSR分析的结果显示,14个微卫星位点总共获得了146个等位基因,选育和野生群体的平均期望杂合度(He)分别为0.730 0和0.832 3,平均多态信息含量(PIC)分别为0.705 1和0.813 6;ISSR结果显示,选育和野生群体的平均Nei’s基因多样性指数(H)分别为0.267 2和0.282 3,平均Shannon信息指数(I)为0.407 2和0.425 6,表明菊黄东方鲀选育群体的遗传变异程度低于野生群体。此外,两种分子标记遗传分化的结果显示,两个群体的遗传分化指数分别为0.061 9(SSR)和0.061 5(ISSR),表明两个群体已经产生了中等程度的遗传分化。综上,本单位菊黄东方鲀的人工选育群体仍然具有相对较丰富的遗传变异以供进一步的遗传改良。 相似文献
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日本沼虾4个地理群体遗传变异的RAPD分析 总被引：1，自引：0，他引：1
采用随机扩增多态DNA(RAPD)技术对取自六安、龙感湖、淮南和高淳等4个地理群体的日本沼虾(Macrobrachium nipponense)各30个个体进行遗传多样性分析。在事先优化的反应条件下,所使用的OPP、OPX2个系列40个随机引物中,有16个引物扩增出清晰稳定的片断,共产生173个位点,大小在250~2 000 bp,利用PopGen 1.32进行分析,日本沼虾多态位点为75个(多态性片断的比例为43.4%),Shan-non信息指数为0.177 1~0.246 6。遗传距离显示日本沼虾群体间有一定遗传分化,其中高淳群体和龙感湖群体之间遗传距离最大(0.171 2),六安群体和淮南群体之间最小(0.114 6)。用UPGMA对4个地理群体进行聚类分析,六安和淮南群体首先聚在一起,高淳和龙感湖群体最后。 相似文献
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[目的]探讨青蛤种群遗传多样性水平和遗传分化特征。[方法]采用AFLP技术对我国山东潍坊(WF)、江苏南通(NT)、浙江宁波(NB)、浙江温州(WZ)沿海共4个青蛤地理群体的遗传结构差异进行了分析。[结果]5对引物共得到261个位点,4个群体的多态位点比例平均为82.95%,其中WZ群体最高(86.97%),NT群体最低(78.93%);4个群体Nei’s基因多样性指数分别为0.258 1、0.252 6、0.271 3和0.277 6,香农多样性指数分别为0.394 7、0.383 0、0.412 0和0.421 4;群体遗传变异主要来自于群体内,占96.39%;WF和NT群体、NB和WZ群体遗传关系较近,聚类分析分别先聚在一起。[结论]研究的青蛤4个群体遗传基础较好,且尚未有明显的遗传分化。 相似文献
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石羊河下游天然与人工柠条种群分布格局和数量特征研究 总被引：1，自引：1，他引：0
以地处典型干旱地区的石羊河下游天然(红敖包、阿拉古山天然林)和人工(扎子沟人工林)柠条种群为研究对象,通过调查柠条种群分布、密度、盖度及其个体大小等指标,分析研究区柠条种群空间分布格局、数量结构特征.结果表明:石羊河下游天然与人工柠条种群空间分布均为聚集分布类型,但聚集度存在一定差异;红敖包和阿拉古山天然林柠条种群密度接近,均略小于扎子沟人工柠条林;扎子沟人工柠条林盖度是红敖包和阿拉古山天然柠条种群的2～3倍;2个天然柠条林的平均地径与扎子沟人工林间未见显著差异(P<0.05),不同柠条种群分枝数和新梢长度差异显著,红敖包天然林柠条的新梢长度明显大于阿拉古山和扎子沟柠条林,而分枝数相反;种群结构大小的调查显示,2个天然林都处于增长阶段,而扎子沟人工林暂无法确定. 相似文献
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利用PCR-RFLP方法对3个地理居群泥蚶的核糖体DNAITS区进行分析,从分子水平探讨三者的遗传多样性及亲缘关系。结果表明：在选用的6种限制性内切酶中,BstHHI、HaeIII和Sse9I为多态性的限制性内切酶,MspI、RsaI和TaqI为单态性限制性内切酶。对酶切图谱进行数理统计后发现宁波海区泥蚶群体内核苷酸多样性指数π值为0.0017,温州海区泥蚶π值为0.0016,而莆田海区泥蚶π值为0.0011,说明宁波海区泥蚶群体内遗传多样性最大,温州海区群体内遗传多样性次之,莆田海区群体内遗传多样性最小。依据3个地理居群泥蚶间的净遗传距离Pnet值及聚类分析结果可知,莆田与温州海区泥蚶间亲缘关系最远,宁波与温州海区泥蚶间亲缘关系最近,宁波与莆田海区泥蚶间亲缘关系介于以上二者之间。 相似文献
13.
本试验采用聚丙烯酰胺凝胶垂直板电泳法测定了淮南麻黄鸡三个群体T多态性,统计各群体的基因型频率与基因频率,并计算各群体的纯合系数与群体间的遗传距离。结果表明：三个群体的基因型频率与基因频率各不相同,皆以B基因频率最高,Ⅰ群体中BC型个体最多,C基因频率大地A基因频率;Ⅱ群体中BB型个体最多,Ⅲ群体中AB型个体最多,Ⅱ、Ⅲ群体皆A基因频率大于C基因频,从Tf位点来看,淮南麻黄鸡各群体纯度还有待于进一步选育提高。 相似文献
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依据林下多年生草本植物山酢浆草Oxalis griffithii的形态学特征,将其生活史划分为4个阶段,并根据3种生境下山酢浆草种群的野外调查资料建立了不同种群的Lefkovitch结构矩阵模型,在此基础上预测了山酢浆草种群的动态及其阶段结构的变化;同时,运用敏感度、贡献率指标分析了影响种群动态的关键生活史阶段。结果表明：不同生境下山酢浆草种群的动态发展趋势不尽相同,常绿阔叶林下的种群（MD）呈稳定发展状态,其他2种生境下种群表现出衰退的发展趋势;种群的动态变化过程受个体的生长、残存、萎缩和繁殖等的综合影响;不同生活史阶段对种群动态的影响差异显著,种群动态过程及其发展趋势主要受种群内较大阶段个体的影响。图2表5参19 相似文献
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缢蛏六群体16S rRNA基因片段序列的差异分析 总被引：11，自引：0，他引：11
采用PCR技术扩增了缢蛏线粒体DNA的16SrRNA基因片段，PCR产物经纯化、测序、同源序列比对获得长度为440bp的核苷酸序列。利用16SrRNA基因片段分析了江浙沪地区三个野生群体（江苏射阳、上海崇明、浙江象山）和三个养殖群体（江苏射阳、上海奉贤、浙江象山）的遗传多样性，共检测到了19个单倍型和41个核苷酸多态位点。序列分析结果显示，三个野生群体之间出现了明显的遗传分化，其中崇明群体遗传多样性最高，其次为射阳群体，象山群体遗传多样性最低，表明崇明群体未受到养殖群体基因的污染。在养殖群体之间则没有达到遗传分化，且单倍型混杂，聚类结果显示与象山野生群体亲缘关系最近，这表明长期的养殖过程在一定程度上对野生群体产生了影响，降低了种质资源的丰富度。 相似文献
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缢蛏六群体16S rRNA基因片段序列的差异分析 总被引：1，自引：0，他引：1
采用PCR技术扩增了缢蛏线粒体DNA的16SrRNA基因片段,PCR产物经纯化、测序、同源序列比对获得长度为440bp的核苷酸序列。利用16SrRNA基因片段分析了江浙沪地区三个野生群体（江苏射阳、上海崇明、浙江象山）和三个养殖群体（江苏射阳、上海奉贤、浙江象山）的遗传多样性,共检测到了19个单倍型和41个核苷酸多态位点。序列分析结果显示,三个野生群体之间出现了明显的遗传分化,其中崇明群体遗传多样性最高,其次为射阳群体,象山群体遗传多样性最低,表明崇明群体未受到养殖群体基因的污染。在养殖群体之间则没有达到遗传分化,且单倍型混杂,聚类结果显示与象山野生群体亲缘关系最近,这表明长期的养殖过程在一定程度上对野生群体产生了影响,降低了种质资源的丰富度。 相似文献
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新疆野巴旦杏天然居群叶片性状表型多样性研究 总被引：2，自引：3，他引：2
对中国新疆野巴旦杏分布的5个自然群系区采集的野巴旦杏叶片进行取样测定,分别测定叶片3项形态指标,结果表明:各指标在同一群系不同株间差异显著, 野巴旦杏叶片形态在群系间和群系内存在广泛差异, 其中:群系内叶片长、叶片宽及叶片长宽比等3个性状差异均达极显著水平F值分别为19.163 7、14.337 1及6.542 6群系间叶片长、叶片宽及叶片长宽比3个性状差异均达极显著水平,F值分别为11.840 0、3.693 2和7.704 9.根据 3个性状的平均,群系间的方差分析占总变异的11.18;.群系内的占46.17;,机误占42.65;.野巴旦杏叶片3个性状群系间的表型分化系数平均为19.14;,而群系内的平均表型变异占80.86;,表明群系内变异是野巴旦杏叶片表型变异的主要来源. 相似文献
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作者于2009年在青岛农业大学昆虫实验室内,利用引物C1-J-1718和2195扩增线粒体DNA的COⅠ基因并对所得到的片段进行序列分析,研究了苹果小卷叶蛾Adoxophyes orana Fischer von Roslerstamm胶东、北京、陕西3个地理种群的遗传分化,并比较了上述两个片段在种群水平系统发育研究中的应用价值。研究结果表明,C1-J-1718扩增序列更适合苹果小卷叶蛾的系统发育研究。胶东种群与北京种群的遗传距离为0.059,与陕西种群为0.049,北京种群与陕西种群为0.047,不同的地理种群遗传分化明显;胶东种群内青岛、威海、烟台地理种群间不存在遗传分化。研究结果还表明:北京种群与A.orana的遗传距离为0;陕西种群的与A.orana like的遗传距离仅为0.007。 相似文献