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从具有新的流行病学特征的传染性法氏囊病(IBD)发病鸡群中分离到2株传染性法氏囊病病毒(IBDV),分别命名为QL和ZZ-11,对4周龄SPF鸡的致死率分别为94%和86%。为分析该毒株的分子生物学特征,对其全基因组序列进行了测定,2个病毒株基因组A节段长度为3 260bp、B节段长度2 827bp。病毒演化分析结果显示2个病毒基因组A节段的核苷酸序列与已发表的强毒株序列的同源性分别为96.8%98.1%和96.9%98.1%和96.9%98.4%,处在IBDV超强毒株分支上;而B节段与已发表的弱毒株序列的同源性分别为89.7%98.4%,处在IBDV超强毒株分支上;而B节段与已发表的弱毒株序列的同源性分别为89.7%90.4%和90.0%90.4%和90.0%90.7%,位于弱毒株分支上。IBDV超强毒株和弱毒株序列特征氨基酸残基与基序分析表明,QL和ZZ-11两个病毒株的A节段VP2基因的氨基酸残基为222A、249Q、253Q、254G、256I、294I和299S,七肽基序为SWSASGS,均符合超强毒株的分子特征;而B节段77790.7%,位于弱毒株分支上。IBDV超强毒株和弱毒株序列特征氨基酸残基与基序分析表明,QL和ZZ-11两个病毒株的A节段VP2基因的氨基酸残基为222A、249Q、253Q、254G、256I、294I和299S,七肽基序为SWSASGS,均符合超强毒株的分子特征;而B节段777782位核苷酸序列为GGTGCC,没有KpnⅠ酶切位点,具有弱毒株的序列特点。以上分析结果表明,QL和ZZ-11为IBDV自然重配株,A节段源于超强毒株,而B节段源于弱毒株。 相似文献
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以传染性法氏囊病病毒（IBDV）BC6／85株基因组RNA为模板,采用RT—PCR方法扩增并克隆了IBDVBC6／85株基因组全长eDNA。序列测定结果表明：A节段全长共3260个核苷酸,与IM株的同源性最高为97．4％,与其他血清I型毒株的核苷酸同源性介于91．2％～97．1％;B节段有2827个核苷酸,与IM株同源性最高为98．6％,与其他毒株的核苷酸同源性为88．7％～98．6％。通过对编码的氨基酸序列进行分析,发现BC6／85株有21个特有氨基酸,其中15个位于多聚蛋白VP2—4—3。系统进化树分析表明,BC6／85株与经典毒株、弱毒株和变异株的关系较近,而与超强毒株相对较远。 相似文献
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为了对鸡传染性法氏囊病病毒(IBDV)的13个地方分离株与3个商品疫苗株的VP1-b基因(756 bp～1 522 bp)进行同源性和遗传进化分析,本研究对其进行RT-PCR扩增和序列测定.结果表明,获得的VP1-b基因长度均为767 bp; 13个分离株VP1-b节段核苷酸和氨基酸同源性分别为90.7 ％～100％和72.9％～100％,其中10株超强毒分离株与经典株、弱毒株、疫苗株的同源性较高,核苷酸和氨基酸同源性分别为95.7％～100％和94.5％～100％,所有12个超强毒分离株与超强毒参考病毒株的同源性均较低,核苷酸同源性仅为68.2％～79.2％;在遗传进化分析中,所有病毒株被分为3个分支,与相应病毒株的基于IBDV-VP2高变区(vVP2)序列的遗传进化树比较并结合同源性分析结果表明,除了弱毒株HUN0804之外,其它12个分离株可能均为重组病毒.据此推测,基因重组可能是目前IBDV流行的新趋势. 相似文献
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为了对某鸡群疑似传染性法氏囊病(IBD)的病例进行分子诊断、病毒分离和分子特征分析，本试验通过核酸检测调查该鸡群法氏囊组织和病毒分离物中传染性法氏囊病病毒(IBDV)的感染情况，将分离得到的毒株命名为GL1906,继而对该病毒基因组双节段的VP2高变区(vVP2)序列和VP1-b序列进行分析。结果显示，GL1906 vVP2基因的特征性氨基酸位点在222A、256I、284A、294I和299S上均符合超强毒株(vvIBDV)的特征，但279N符合致弱毒株的特征；VP1-b基因在242D、390L、393E与弱毒株一致，287A与vvIBDV一致，此外第777～782位核苷酸序列为GGTGCC,与弱毒株一致；GL1906 vVP2的核苷酸、氨基酸序列与vvIBDV的同源性最高，在系统进化树中与vvIBDV同为A3分支；GL1906 VP1-b的核苷酸、氨基酸序列与B节段属于独特来源的NN1172同源性最高，在系统进化树中同属于B3独特分支。结果表明，本试验分离株GL1906的基因组双节段vVP2和VP1-b具有不同的来源，是基因型为A3B3的基因自然重排毒株。 相似文献
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传染性法氏囊病病毒Gt株基因组A节段的克隆和序列分析 总被引：1，自引：0，他引：1
利用SPF鸡胚对鸡传染性法氏囊病超强毒vvIBDV-Gx株进行培育,通过鸡胚成纤维细胞对病毒进行传代致弱,使其成为弱毒株IBDV-Gt.从细胞适应毒中提取病毒dsRNA,通过反转录,使用Long-accurate PCR(LA-PCR)用一对引物一步直接扩增IBDV-Gt基因组A节段全长cDNA的方法,得到一约3.30kb的片段.测序结果证明已获得3255bp的A节段全长,对vvIBDV-Gx株和IBDV-Gt株的全部核苷酸及推导的氨基酸序列进行分析,结果表明IBDV-Gt株与国内外数株IBDV弱毒株的同源性在99%以上. 相似文献
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三株鸡传染性法氏囊病毒弱毒株的分离与分子鉴定 总被引：1，自引：0，他引：1
本试验在江苏省鸡场分离获得3株鸡传染性法氏囊病病毒（IBDV）,采用RT—PCR法扩增VP2基因,将产物克隆入pMD18T载体,经测序,并与IBDV代表株VP2基因的高变区序列进行分析比较。结果显示,3个分离株与超强毒株、强毒株、突变株及弱毒株的核苷酸同源性在89．5％～98．9％之间,与弱毒株Cu-1和疫苗株PBG-98同源性最高,为98．9％;推导出的氨基酸序列与代表性毒株的同源性在98．2％～99．5％之间。其中,七肽区的第三个丝氨酸残基突变为精氨酸或苏氨酸,279和284位氨基酸残基突变为天冬氨酸和苏氨酸,222、294和299位氨基酸残基分别突变为脯氨酸、亮氨酸和天冬氨酸。上述试验表明3株分离株均为临床弱毒株。 相似文献
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采用快速扩增cDNA末端 (RACE)方法测定了我国超强毒株Harbin 1和经典弱毒株CJ80 1的非编码区。在两株病毒基因组A节段中 ,Harbin 1的 5′非编码区包括 10 0个核苷酸 ,CJ80 1包括 96个核苷酸 ;两个毒株B节段的 5′非编码区均含有 111个核苷酸。Harbin 1毒株A节段的 3′非编码区含 95个核苷酸 ,CJ80 1含 94个核苷酸。Harbin 1毒株B片段的 3′非编码区含 79个核苷酸 ,CJ80 1含 82个核苷酸。结构分析表明 :超强毒株Harbin 1与细胞适应株CJ80 1的 5′和 3′端非编码区在一级和二级结构上均存在差异。Harbin 1与欧洲超强毒株的关系最近 ,CJ80 1与欧洲细胞适应株同源性最高。IBDV非编码区结构特征的研究为进一步研究IBDV非编码区的功能 ,阐明其与病毒复制调控和毒力的关系奠定了基础。 相似文献
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采用快速扩增cDNA末端（RACE）方法测定了我国超强毒株Harbin-1和经典弱毒株CJ801的非编码区。在两株病毒基因组A节段中，Harbin-1的5‘非编码区包括100个核苷酸，CJ801包括96个核苷酸；两个毒株B节段的5‘非编码区均含有111个核苷酸。Harbin-1毒株A节段的3‘非编码区含95个核苷酸，CJ801含94个核苷酸。Harbin-1毒株B片段的3‘非编码区含79个核苷酸，CJ801含82个核苷酸。结构分析表明：超强毒株Harbin-1与细胞适应株CJ801的5‘和3‘端非编码区在一级和二级结构上均存在差异。Harbin-1与欧洲超强毒株的关系最近，CJ801与欧洲细胞适应株同源性最高。IBDV非编码区结构特征的研究为进一步研究IBDV非编码区的功能，阐明其与病毒复制调控和毒力的关系奠定了基础。 相似文献
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传染性法氏囊病病毒超强毒株HLJ-0504全基因组克隆及其新特征分析 总被引：1，自引：0，他引：1
为了解传染性法氏囊病病毒(IBDV)HLJ-0504株的分子生物学特征,本研究利用融合PCR技术获得HLJ-0504株全基因组序列。核苷酸和推导氨基酸序列遗传演化分析发现,HLJ-0504A节段位于IBDV超强毒的分枝上,而B节段则介于超强毒株和减毒株之间,形成一个独立分枝,属于一株新的自然重组病毒。VP2抗原性预测分析表明,HLJ-0504株VP2第Ⅰ亲水区中的氨基酸发生突变(D212N),该突变可能导致了HLJ-0504株抗原性发生漂变。本实验结果为深入研究IBDV的分子特征奠定了基础。 相似文献
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Tiwari AK Kataria RS Indervesh Prasad N Gupta R 《Comparative immunology, microbiology and infectious diseases》2003,26(1):47-53
In order to differentiate infectious bursal disease virus (IBDV) isolates/strains, a quick method of RT-PCR followed by restriction enzyme analysis of VP1 gene sequence is being reported for the first time. A 480 bp fragment, comprising one of the RNA dependent RNA polymerase motifs of VP1 gene sequence of an Indian classical virus, an attenuated vaccine strain, Georgia and two Indian field isolates, genetically similar to reported very virulent strains of IBDV, was amplified by RT-PCR. Restriction enzyme digestion of PCR products with Taq1 enzyme generated distinct profile for field isolates, different from the classical and attenuated viruses, whereas restriction profile with BstNI restriction enzyme was similar in all the viruses, irrespective of the pathotype. Therefore, the present results suggest that Taq1 digestion can be taken up for the differentiation of field isolates from the classical and vaccine strains. The sequence analysis of VPI gene of reported very virulent IBD viruses from Europe and Japan, using 'MapDraw' programme of Lasergene software, revealed similar restriction enzyme profile as in Indian field isolates. 相似文献
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为了解传染性法氏囊病病毒（IBDV）的抗原变异分子基础,采用Mab—basedAC—ELISA方法,利用11株单抗对2株河北IBDV分离株进行了抗原特性分析,并比较了超强毒株和弱毒株的VP2高变区序列的分子特征。结果显示：强弱毒株的抗原位点结合单抗的能力明显不同,除了Mab3、Mab9外,其余9个单抗的结合能力,超强毒株要高于弱毒株。超强毒株HeB-If缺少了Mab3结合位点,弱毒株HeB-bdjz缺少了Mab3、Mab6结合住点,这说明强弱毒株不仅在序列上有差异,而且在抗原位点的缺失上也存在差异。本试验为控制IBD和疫苗改进具有重要意义。 相似文献
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为了解近10年来广西梧州地区鸡传染性法氏囊病病毒(IBDV)分子进化情况,对2013年—2014年间来自该地区传染性法氏囊病(Infectious bursal disease,IBD)的法氏囊样品进行IBDV的分离鉴定,并对分离株以及课题组2006年—2013年间分离的毒株,共24株的VP2高变区(vVP2)进行序列分析和遗传进化分析。结果表明,QX0601等23个分离株在关键氨基酸位点上具有256I、284A、294I等超强毒株(vvIBDV)的分子特征,遗传进化分析表明,这23株分离株与UK661、HK46等超强毒参考株同处一个分支中,亲缘关系较近;QX110603在关键性氨基酸位点上则具有256V、284T、294L等弱毒株的特征,遗传进化分析显示,其与BJ836等致弱株处于同一分支,亲缘关系较近。对所有分离株进行氨基酸位点分析发现,该地区IBDV进化出现了新的特点,212D-212N符合国内近年来的分离株的变化趋势,209T-209A、338R-338H、359T-359R则表现出地域特点,未曾见过相似报道。研究结果表明,具有vvIBDV分子特征的分离株是该地区近10年来主要流行毒株,该地区IBDV毒株在vVP2序列上仍处于不断进化中,且带有地域特点。 相似文献
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2011年8月,从河南省疑似传染性法氏囊病鸡群采集病料,通过鸡胚接种、琼脂扩散试验和RT-PCR等方法,证实分离的病毒为传染性法氏囊病病毒（Infectiousbursaldiseasevirus,IBDV）,命名为HB／11株。序列分析表明,HB／11株VP2基因的核苷酸序列与GenBank中发表的部分国内外IBDV超强毒株VP2基因序列相似性在99％左右;HB／11株VP2高变区基因含有七肽基序为SWSASGS,在222、253、256、279、284、294和299位上的氨基酸残基分别是A、Q、I、D、A、I和S,具有IBDV强毒的分子特征。动物回归试验表明,30日龄鸡群接种该毒株后引起鸡群发病率为100％,死亡率为70％,剖检可见鸡传染性法氏囊病典型病变。因此该病毒为IBDV强毒株。 相似文献
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传染性法氏囊病病毒VP2基因高变区序列分析 总被引：3，自引：0，他引：3
根据传染性法氏囊病病毒（ＩＢＤＶ）ＶＰ２基因ＣＤＮＡ序列,在ＶＰ２基因高变区设计一对引物,用ＲＴ－ＰＣＲ方法扩增ＩＢＤＶ分离株ＪＳ３和ＪＳ４。将扩增片段克隆后以双脱氧链末端终止法测定核苷酸旬。ＪＳ３和ＪＳ４的同源性最高达９８％。与已发表的ｖｖＩＢＤＶ,ＩＢＤＶ变异要ＢＤＶ经典株为ＩＢＤＶ弱毒株核苷酸序列的同尖拨天９２￣９８％之间,根据ＩＢＤＶ的大ＯＲＦ推导出该片段蛋白的氨基酸序更,ＪＳ３和ＪＳ４的 相似文献
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Comparisons between sequences of very virulent, virulent, and attenuated strains of the infectious bursal disease virus (IBDV) may indicate sites on the genome co-inciding with virulence. In an attempt to detect if such sites exist on the coding region of segment B, viral protein 1 (VP1) (encoded for by segment B) of a very virulent Israeli virus, IL3; its attenuated strain, IL4; and the attenuated Winterfield vaccine 2512 were cloned and sequenced. A comparison was made among them and with six other published sequences of segment B. Six nucleic acids distinguished between IL3 and IL4, three of which were predicted to be expressed as amino acids. A striking similarity between the VP1 sequences of 2512 and P2 (an attenuated German strain) was discovered. Although conclusions could not be drawn concerning attenuation sites on VP1, the analysis performed on the VP1 sequences of the two Israeli strains and the Winterfield 2512 strain sheds light on the phylogeny of IBDV and contributes to the accumulating information that may lead to the identification of virulence-related sites of this virus. 相似文献
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将两株鸡传染性法氏囊病病毒（IBDV）弱毒株在SPF鸡体内连续传代至第5、第6代时,出现明显的法氏囊萎缩和B：B指数下降,表明IBDV弱毒株在鸡体内连续传代后毒力增强。为进一步阐释哪些基因位点导致了上述毒力的变化,本试验测定了基础弱毒株及其在鸡体内传代后各个代次毒的基因组序列,比对分析后发现VP2蛋白253位氨基酸发生了由H到Q或N的变异,表明VP2蛋白253位氨基酸的替换可能会增强传染性法氏囊病病毒在鸡体内的致病性。 相似文献
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Infectious bursal disease viruses (IBDVs) in 26 IBDV-positive bursa samples collected in Croatia during the period 1996-2000 and in two commercially available vaccines were differentiated by the presence or absence of the CfoI, SacI, SspI, StuI, and TaqI restriction sites in the 422-bp fragment of segment A of the VP2 gene (nt 732-1153). The fragments from 14 (54%) field isolates were TaqI+ StuI+ SspI+ and SacI- CfoI-, indicating their very virulent (vv) character. The presence of CfoI restriction site in 10 (38%) field isolates is uncommon for vvIBDV strains. It was detected in only the 88180 vvIBDV strain. Nevertheless, these isolates can be classified as vv strains according to TaqI+ StuI+ SspI+ SacI- restrictions. Two SacI+ StuI+ CfoI+ TaqI- SspI- field isolates (8%) could be classified as non-vvIBDVs. The StuI+ restriction is common to vvIBDV strains. However, the StuI recognition sequence is present in the F52/70 classic European and 002-73 attenuated strains as well. The SacI+ CfoI+ StuI- SspI- restrictions and the lack of the TaqI restriction at nt position 832 show that the IBDV in GUMBOKAL IM-SPF vaccine corresponds to the attenuated and/or vaccine strains. The TaqI restriction at nt position 875 suggests that the IBDV in GUMBOKAL SPF vaccine could belong to the mild strains. 相似文献