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相似文献
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1.
本研究以广泛种植的甜瓜杂交种‘金蜜6号’和杂交新品种‘南疆蜜1号’及其亲本为试验材料,采用简单重复序列分子标记(SSR)检测技术,选取18对甜瓜多态性丰富的SSR核心引物进行纯度和真实性鉴定。结果表明,‘金蜜六号’和‘南疆蜜1号’在18对SSR核心引物筛选中均获得多对特异性引物,表现出多态性条带,可以用来鉴定种子纯度,‘金蜜六号’种子的纯度为97.87%,特异性引物:SSR12833(A)、CMBR052(C)、ECM147(I)、CMBR002(K)、CM26(L)、MU9175-1(M)、MU5554-1(N)、SSR00398(O)、TJ10(Q)、CMBR154(R),其中,编号C、I、K、N、O引物条带清晰,特异性强;‘南疆蜜1号’的种子纯度为97.56%,特异性引物:SR12833(A)、CMBR097(F)、MU4104-1(G)、NR38(H)、ECM147(I)、CMBR002(K)、MU9175-1(M)、MU5554-1(N)、CMBR154(R),其中,编号F、G、H、I、N、R引物条带清晰,特异性强。SSR分子标记鉴定结果与田间鉴定结果一致。SSR分子标记方法...  相似文献   

2.
7个柱花草品种的AFLP和SSR遗传多样性分析   总被引:2,自引:1,他引:1  
韩蓉蓉 《中国农学通报》2014,30(18):271-276
旨在阐明不同柱花草品种的遗传差异。利用AFLP、SSR两种分子标记技术对7个柱花草品种进行遗传多样性分析。12对AFLP引物组合共扩出966个条带,其中多态性条带有850条,平均每对引物的多态性条带为70.8条,多态性比率为87.99%。10对SSR引物共扩出26个条带,其中多态性条带有23个,多态性比率为88.46%;10对引物的观察杂合度(Ho)的范围是0~0.7143,平均为0.1857,Shannon’s遗传多样性指数(I)平均值为0.6545,平均多态性含量(PIC)为0.727。根据非加权成对平均数法(UPGMA)进行聚类分析,获得品种聚类树形图,AFLP与SSR分析的聚类图相似性显著,7个品种明显分成两类。‘矮柱花草’与‘西卡柱花草’的遗传关系最为疏远,‘奥克雷柱花草’与‘爱德华柱花草’、‘格拉姆柱花草’与‘热研5号柱花草’关系最为密切。  相似文献   

3.
食用羽衣甘蓝新品种‘沪羽甘1号’是利用羽衣甘蓝胞质雄性不育系与高代自交系通过常规育种技术选育而成的F1代杂交种,2019年通过上海市农作物品种审定委员会认定。为进一步推广和保护该品种,以‘沃特斯’品种为对照,比较研究了‘沪羽甘1号’的特征特性,并利用ISSR分子标记技术构建了‘沪羽甘1号’亲本的DNA指纹图谱。与对照‘沃特斯’相比,‘沪羽甘1号’具有较高的营养价值,且具有早熟、抗黑腐病的特点。‘沪羽甘1号’蛋白质、VC、纤维素、水分和可溶性固形物的含量分别为20.7%、95.1 (100 mg/kg)、10.8%、76.1%和8.8%。从80个ISSR引物中筛选出8条核心引物在‘沪羽甘1号’父本‘HL2250-8’和母本‘CMS-015-319’中分别扩增出10和13条多态性条带,分别选择其中的5和7条谱带构建‘HL2250-8’和‘CMS-015-319’的DNA指纹图谱。该研究结果为‘沪羽甘1号’推广和品种保护提供了科学依据。  相似文献   

4.
15份葡萄种质遗传多样性的SSR分析   总被引:6,自引:0,他引:6  
本研究利用SSR标记对15份葡萄种质进行了遗传多样性分析。从30对SSR引物中筛选出11对多态性引物,共扩增出107条带。每对引物可检测到等位位点数为4~22,多态率为75%~100%。根据SSR扩增结果,利用NTSYSpc2.10e软件进行Jaccard相似性系数分析,15份葡萄种质的遗传相似系数在0.20~0.98,平均遗传相似系数为0.398。UPGMA聚类分析结果表明,在遗传相似系数0.29处,15份葡萄材料可分为2大类群。第一类包含7份山葡萄资源,2个山欧杂交品种,第二类包含3个欧亚种品种、2个欧美杂种品种和1个美洲杂种品种。由此可见,山葡萄与欧亚种、美洲杂种的亲缘关系较远,欧亚种与美洲种之间亲缘关系较近。此外,引物Vmc9a2.1、VMC4F3、VMC4A1、Scu14vv分别在欧亚种‘无核白’、‘山葡萄雄株’(雄1-2,雄1-3)、山葡萄‘左山二’、山葡萄‘双丰’扩增出一条特性条带,这为利用SSR标记鉴定葡萄品种或品系提供了基础数据。  相似文献   

5.
揭示不同香椿无性系在自然高温干旱胁迫下的叶片解剖特征和光合生理响应机制,为香椿栽培和种质资源利用提供参考。以‘XC34-2’‘、XC12-10’‘、XC9-9’‘、XC18-4’‘、XC6-6’等5个香椿无性系2年生截干苗为研究对象,以‘黑油椿’、‘红油椿’2个乡土品种为对照,测定自然高温干旱胁迫下香椿叶片解剖结构、叶绿素含量、叶绿素荧光参数特征,采用单因素方差分析比较所有指标在无性系间的差异。结果表明,5个无性系的中脉比‘黑油椿’、‘红油椿’薄,除海绵组织外,其他各项解剖结构均比‘黑油椿’、‘红油椿’厚,其中‘XC18-4’的叶片最厚,栅栏组织和海绵组织最发达,角质层最厚的‘XC34-2’(2.01μm)是角质层最薄的‘红油椿’的1.63倍。7个无性系在相同的干热环境中受到的光抑制程度存在极显著差异,Fv/Fm为0.67~0.79。高温干旱胁迫影响香椿无性系PSⅡ吸收的激发能的能量分配,‘XC34-2’的Y(Ⅱ)更高,Y(NO)、Y(NPQ)均较低,‘红油椿’大致与之相反。此外,不同的无性系在高温干旱环境中采取了不同的光保护策略,‘XC9-9’和‘XC18-4’的过剩激发能主要由关闭...  相似文献   

6.
为建立甜瓜杂交种纯度快速鉴定的方法,以杂交新品种‘川蜜脆玉’及其亲本为试验材料,利用改良的胚根DNA速提法和SSR (Simple sequence repeats)分子标记技术检测种子纯度及真实性,并结合大田的形态学鉴定结果进行验证。结果表明,在18对SSR引物中,有7对引物在‘川蜜脆玉’F1代及父母本中呈现多态性。其中SSR00398与MU4104-1引物特异性好、条带清晰、父母本条带间隔明显,作为纯度鉴定的引物,鉴定纯度为98.1%,与田间鉴定结合符合率在99%以上,说明这2对引物能够作为‘川蜜脆玉’杂交种纯度鉴定的特异引物进行纯度检测。新方法的建立大大缩短了甜瓜杂交种的鉴定周期,提高鉴定效率,为甜瓜新品种的杂交种快速鉴定提供重要技术支撑。  相似文献   

7.
为获得理想的方法鉴定‘如玉5号’苦瓜杂交种子的纯度,以苦瓜杂交一代品种‘如玉5号’及其父母本为材料,利用RAPD(随机扩增多态性DNA)及SRAP(相关序列扩增多态性)2种技术进行其基因组总DNA指纹分析,以获得F1代杂交种与其亲本差异目的基因条带。经过对3种苦瓜新鲜幼嫩叶片总DNA提取,RAPD-PCR和SRAP-PCR扩增以及扩增产物的琼脂糖凝胶电泳分析,在供试的52条RAPD引物及144对SRAP引物中,共筛选出2对SRAP引物(Me2-Em9、Me3-Em8)能区分杂交种与其母本种子,1条RAPD引物(R10)能区分杂交种与其父本种子,通过SRAP(引物Me3-Em8)及RAPD(引物R10)2种分子标记技术对来自于河西走廊3地‘如玉5号’苦瓜种子进行检测,结合田间观察,结果表明,该方法成本低,操作简单,能很好地对‘如玉5号’苦瓜杂交种子的纯度鉴定。  相似文献   

8.
为进一步鉴定分析抗褐斑病性较好的国内外甜菜品种,为日后筛选、繁育优良抗病品种提供依据,本研究采用田间调查与分子标记相结合的方法,利用筛选出的12对SRAP引物组合对25份国内外品种进行分子标记检测,通过SRAP-PCR扩增,共产生扩增带104条,67条多态性条带,平均多态性比为64.4%。遗传距离平均为0.4670,遗传相似系数平均为0.6269。田间调查结果显示:褐斑病级数为2的品种有9个,褐斑病级数小于2的品种有3个。聚类分析结果显示:在遗传距离0.20处,可将25份供试材料分为3个类群,其中第一类群又分为2个亚类。聚类结果与田间调查结果相一致。结果表明,‘TY305’(国内)、‘TY309’(国内)、‘w5-1’(国内)抗褐斑病性较好,SRAP分子标记用于划分甜菜抗褐斑病性的品种有一定参考价值。  相似文献   

9.
为研究罗田迟熟板栗品种种质资源遗传信息,采用ISSR分子标记技术,对‘桂花香’、‘九月寒’等8个板栗品种分类鉴定及亲缘关系进行分析。(1)ISSR-PCR反应体系及引物筛选。选择了条带的数量多和清晰度高的反应体系,应用‘九月寒3号’筛选前期设计的21条ISSR引物,淘汰扩增效果差、带型不易辨认的引物,最终选定7条引物用于迟熟板栗品系的分析;选取的7条ISSR引物总共扩增出140条清晰、重复性较好条带,其中,多态性条带有106条,多态性条带比率达75.7%。(2)应用NTSYS 2.10e软件进行UPGMA法聚类分析,在相似系数0.45处将8个板栗品种大致分为2类。结果显示,‘羊毛栗’、‘桂花香2号’与其他板栗品种在遗传上有较大差异。  相似文献   

10.
为了评价云南文山州主栽辣椒品种在干旱胁迫下的抗氧化能力及其与品种紫化程度的关联性,用分光光度法研究了云南文山州主栽辣椒品种‘ZSZ75-1’、‘ZSZ49-1-1’、‘12WS-18-1’、‘12ZH01’和‘ZS130’叶片在PEG-6000模拟干旱胁迫下抗氧化酶比活力和丙二醛(MDA)含量,并用隶属函数法分析了各品种叶片的综合抗氧化能力。结果表明:在PEG-6000模拟干旱胁迫下,5个辣椒品种叶片可溶性蛋白质含量特征为:‘ZSZ75-1’‘12ZH01’‘ZSZ49-1-1’‘12WS-18-1’‘ZS130’,过氧化氢酶(CAT)比活力为:‘ZSZ75-1’‘ZSZ49-1-1’‘ZS130’‘12WS-18-1’‘12ZH01’,过氧化物酶(POD)比活力为:‘ZSZ75-1’‘ZS130’‘ZSZ49-1-1’‘12WS-18-1’‘12ZH01’,超氧化物歧化酶(SOD)比活力为:‘12WS-18-1’‘ZS130’‘12ZH01’‘ZSZ49-1-1’‘ZSZ75-1’,MDA含量为:‘ZSZ75-1’‘12WS-18-1’‘12ZH01’‘ZS130’‘ZSZ49-1-1’。但是,5个品种叶片可溶性蛋白质和MDA含量及CAT和SOD比活力之间的差异均未达到显著水平,而POD比活力间的差异均仅达到显著水平。5个品种叶片的综合抗氧化能力为:‘ZS130’‘ZSZ49-1-1’‘ZSZ75-1’‘12WS-18-1’‘12ZH01’。因此,文山州主栽辣椒品种特定器官积累花色苷并不贡献于叶片在干旱胁迫下抗氧化能力的强化。本研究可为文山州辣椒品种抗旱能力的评价、花色苷积累和抗旱性关系的探究和抗旱新品种的选育提供参考。  相似文献   

11.
玉米杂交种DNA指纹图谱及其在亲子鉴定中的应用   总被引:33,自引:0,他引:33  
采用79对SSR引物分析了86个玉米杂交种的72份亲本自交系的遗传多态性,从中筛选出扩增带型清晰、稳定的50对引物用于构建86个杂交种的DNA指纹图谱数据库;进而确定10对核心引物和判别标准用于亲子鉴定研究。结合玉米SSR分子标记检测技术和单籽粒DNA快速提取方法,DNA指纹数据库和判别标准可有效地用于玉米杂交种的亲子鉴定。  相似文献   

12.
用微卫星标记定位小麦耐盐突变体的耐盐相关基因   总被引:7,自引:0,他引:7  
以小麦耐盐突变体RH8706-49×敏盐突变体H8706-34(两者为“一粒传”后代)的F2群体作为基因定位群体,结合BSA法(Bulked segregant analysis,群分法),对小麦耐盐突变体的耐盐相关基因进行了微卫星分子标记定位,在246对微卫星引物中,微卫星标记Xgwm299与耐盐相关基因连锁,遗传距离为5.8 cM,定位于3B染色体的长臂。  相似文献   

13.
Anthurium andraeanum is one of the most economically important floral crops and potted flowers marketed worldwide. Microsatellite markers are currently the preferred molecular marker owing to the many desirable attributes, including hypervariability, codominance, and amenability to high-throughput genotyping; however, there are few polymorphic molecular markers available for Anthurium. The object of this study was to develop and characterize novel microsatellite markers using the Araceae sequences in GenBank of the National Center for Biotechnology Information (NCBI) to contribute to molecular identification for cultivar protection. Using 1,579 Araceae expressed sequence tags (ESTs) and the related nucleotide sequences, 100 candidates contained simple sequence repeat (SSR) motifs that were suitable for primer design. Furthermore, 100 pairs of SSR primers were screened against a set of 28 diverse genotypes representing 24 cultivars that included four registration cultivars which were bred from the Taiwan Agricultural Research Institute (TARI) and 20 commercial cultivars, appended with three hybrid progeny and a mutant line. From the selected six polymorphic SSR loci, 52 alleles were amplified and 27 distinct genotypes were found, except for ‘Tropical’ and its mutant, with a mean number of eight alleles per locus. The polymorphism information content (PIC) ranged from 0.86 to 0.93. Based on these results, we proposed a key identification set using four microsatellite markers that is sufficient to discriminate among 24 cultivars. Because the Anthurium microsatellite markers developed in this study are primarily from expressed sequence tags or related genomic sequences, they can be used for cultivar identification and, accordingly, contribute to genetic evaluations in breeding programs.  相似文献   

14.
从棉花ESTs数据库中筛选微卫星标记的初步研究   总被引:12,自引:3,他引:12  
利用生物信息学方法在含有94709条棉花EST序列的数据库中进行微卫星标记筛选,共发现微卫星序列4396个,占整个EST数据库的4.64%。其中双碱基重复序列1282个、三碱基序列2411个,分别占在EST数据库中发现微卫星序列总数的29.27%和54.8%。根据筛选到的微卫星序列设计并合成引物25对,其中24对引物有扩增产物,17对产物条带比较清晰,对这些条带比较清晰的产物作了一系列的分析。  相似文献   

15.
虽然中国具有丰富的犬种遗传资源,但其发掘与开发利用水平还较低。从分子层次上深入系统研究中国犬遗传资源状况,可以为制定科学合理的选育利用方案提供必要的理论基础。通过分析中国犬微卫星DNA遗传多态性及其在亲权鉴定中的应用,发现其遗传多样性较丰富,大部分的微卫星DNA位点能成功地运用于犬类的亲权鉴定中。  相似文献   

16.
甜叶菊微卫星富集文库的构建与多态性标记的筛选   总被引:1,自引:0,他引:1  
甜叶菊是我国一种重要特种经济作物, 其分子标记相关遗传背景研究甚少。本研究基于生物素与链霉亲和素的强亲和性原理, 用链霉亲和素顺磁颗粒捕捉人工合成的标记有生物素的寡核苷酸探针(AG)15, 间接筛选出含有甜叶菊基因组微卫星序列的DNA酶切片段, 将筛选得到的片段连接到pUC-T载体中, 构建甜叶菊微卫星序列的富集文库。挑取354个克隆进行菌落PCR检验, 从中筛选出158个阳性克隆进行测序。结果表明, 134个(84.81%)克隆中含有微卫星序列, 其中完美型85个(63.43%)、非完美型15个(11.19%)、复合型34个(25.38%)。根据微卫星序列共设计出71对微卫星引物, 其中62对能扩增出稳定的条带。利用24个甜叶菊品系对这62对引物的遗传多样性的分析表明, 有16个位点表现出多态性, 等位基因数为2~8个, 平均每个位点扩增得到4.5个等位基因, 多态性信息含量在0.3163~0.7595之间, 观测杂合度(Ho)与期望杂合度(He)的范围分别为0.2174~0.9167与0.3555~0.8076。通过聚类分析, 将甜叶菊分为大小叶两大类。本研究开发出的微卫星标记可为甜叶菊的分子遗传育种提供有效的遗传标记。  相似文献   

17.
本文利用CAPS和SSR两种分子标记技术,对野生种多毛和醋栗番茄与栽培种番茄的DNA指纹图谱进行了分析。结果表明,30对CAPS和10对SSR引物中,分别有19对和7对引物产生清晰明显且稳定的多态性条带。利用两种标记共获得了98个标记位点,分析表明SSR标记的检测效率高于CAPS标记。相对于栽培种而言,多毛番茄有16.3%的特异信息,醋栗番茄有10%的特异信息。该些标记为番茄遗传图谱的构建、重要基因的标记及遗传育种提供了有力工具。  相似文献   

18.
首批海岛棉基因组来源的微卫星标记的分离、评价和定位   总被引:1,自引:1,他引:0  
海岛棉(Gossypium barbadense)是世界上最重要的栽培棉种之一。海岛棉纤维品质优良,是优质棉的重要产源。为了研究海岛棉的遗传多样性,为海岛棉育种提供参考依据,从海岛棉遗传标准系中分离基因组来源的微卫星标记用于海岛棉遗传评价。采用两种方法分离微卫星标记,一是用ISSR (inter simple sequence repeat) 引物扩增Pima3-79,克隆测序后从中开发微卫星标记;二是利用简并引物扩增Pima3-79,克隆测序后从中开发微卫星标记。共挑选1 447个克隆,筛选出239个独立克隆。测序后得到214个单一序列,其中包含微卫星并可用于引物设计的序列70个,获得86对引物。86对引物用于扩增56个海岛棉材料和4个陆地棉材料,16对引物没有扩增,43对引物在所有材料中没有多态性;27对引物在海岛棉和陆地棉之间有多态性,19对引物在海岛棉中表现多态性。利用Jaccard相似系数和UPGMA方法进行聚类分析可以明显区分陆地棉和海岛棉,并且将海岛棉分为4类。14对引物在BC1群体中表现多态性,产生14个位点。9个位点整合到BC1连锁图的7个染色体上,4个位于A亚基因组,5个位于D亚基因组。海岛棉微卫星标记扩展了棉花微卫星标记,有助于海岛棉遗传多样性的研究,有利于棉花遗传图谱的进一步丰富。  相似文献   

19.
针对吉林省主推玉米品种,构建了一套科学高效的纯度鉴定体系。以吉林省主推的50个玉米品种为研究材料,从GB/T 39914-2021公布的40对SSR引物中筛选出9对用于吉林省主推玉米品种的纯度鉴定。筛选出的9对引物杂合度在82%~100%,平均杂合度为91.5%,PIC值在0.44~0.75,平均PIC值为0.63。该组引物多态性高、稳定性强、分辨率高且非特异扩增片段少。将9重扩增体系进行优化,形成吉林省主推玉米品种纯度鉴定体系。用这9对引物对吉林省主推的6个品种进行纯度鉴定,可准确检测出品种的典型株、自交苗和异型株,共检测出10个自交苗和7个异型株,6份样品最高纯度为98%,最低纯度为96%,鉴定结果与田间鉴定结果相关性系数为0.766,相关性较高,结果可靠。  相似文献   

20.
棉花是新疆重要的经济作物,寻找一种有效的棉花品种(系)纯度检测方法是解决目前市场上棉花品种多、乱、杂问题的有效途径。本研究选取新疆棉花品种(系)中的41个常规种为试验材料,利用简单重复序列(simple sequence repeats, SSR)分子标记技术筛选出15对条带清晰、多态性高的核心引物,对41份试验材料进行纯度检测。每份试验材料使用2~4对引物进行纯度鉴定,检测结果显示,41份试验材料的种子纯度达到100%的占19.51%,纯度高于80%的品种(系)占73.17%。本研究所筛选出的SSR核心引物及研究结果为开展棉花常规种种子纯度鉴定提供参考。  相似文献   

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