共查询到20条相似文献，搜索用时 531 毫秒
1.
猪CD8β基因的克隆、表达及其结构与功能分析 总被引：1，自引：0，他引：1
本研究应用RT-PCR技术,从猪胸腺细胞总RNA中扩增、克隆了猪CD8β基因,序列分析表明CD8β含621 bp的开放阅读框,编码207个氨基酸,与NCBI/GeneBank已发表的参考基因的核苷酸及推导氨基酸序列的同源性分别为97.8%和96.8%,与人、小鼠和鸡CD8B蛋白的氨基酸同源性分别为75.7%、67.9%和33.3%.根据大肠杆菌密码子偏嗜性改造目的基因,构建了pET28a/PCD8 β原核表达系统,并经诱导获得高效表达的分子量为24 ku的重组蛋白(rPCD8 β),表达量占菌体蛋白总量的30%.利用生物信息学和分子生物学软件对猪CD8 β基因编码的蛋白进行结构预测,表明猪CD8 β成熟蛋白为跨膜蛋白,其中172aa在胞外区,22aa在跨膜区,10aa在胞内区;蛋白骨架内含有较多的柔性区域,而且分布不均匀.能形成结构松散的球状蛋白;猪CD8 β分子V区三维结构与鼠的具有非常相似的空间结构,与人的差别较大,这为猪CD8B蛋白结构与功能的进一步研究奠定了基础. 相似文献
2.
3.
为了克隆五指山小型猪程序性死亡因子10(PDCD10)cDNA基因并进行生物信息学分析,试验以构建的五指山小型猪外周血白细胞cDNA文库为材料,采用菌落PCR的方法,克隆得到PDCD10全长cDNA序列,运用生物信息学软件分析其核苷酸序列并预测其编码蛋白的理化性质及二级结构等。结果表明:经比对分析发现,五指山小型猪PDCD10基因的核苷酸序列及其氨基酸序列与人、小鼠、牛、鸡、非洲爪蟾、斑马鱼、黑腹果蝇等具有较高的相似性。生物信息学分析结果表明,该cDNA序列全长1 250 bp,在序列3’末端有终止信号AATAAA。含636 bp(184～819 nt)的开放阅读框,编码212个氨基酸。该蛋白理论等电点(PI)及分子质量分别为7.80和24 701.57 u。 相似文献
4.
在猪IgA重链CH1-CH3区设计一对引物,用RT-PCR方法从地方杂交品种长白猪肠系膜淋巴结组织中扩增出预期大小的片断,插入pGEM-Teasy载体,测序并与约克夏猪、人及其他动物的IgA进行序列比较。随后,将该序列酶切后引入到pQE-30表达载体相应位点,转化JM109大肠杆菌,经IPTG诱导表达后,进行SDS-PAGE分析。结果显示,本研究克隆了猪IgA重链恒定区部分CH1亚区及完整的CH2-CH3亚区基因序列,全长822bp,编码274个氨基酸,该序列与GenBank上登录的约克夏猪参考序列核苷酸序列同源率为99.8%,有2处核苷酸变异,氨基酸序列的同源率为100%。但与人及其他动物显示从84%～51%不等的同源性;在大肠杆菌表达出约31ku的蛋白条带,表达量约占菌体总蛋白的32.3%。本试验为今后的IgA免疫功能研究及基因工程化检测试剂开发打下了基础。 相似文献
5.
本研究旨在获得版纳微型猪近交系(BMI)生长激素基因编码区序列,揭示其原核表达规律.采用RTPCR方法从版纳微型猪近交系(BMI)脑垂体中克隆生长激素(GH)基因,并将其连接到pMD 18-T载体进行测序和生物信息学分析.克隆得到的GH基因cDNA序列长690 bp,其中CDS长651 bp,编码216个氨基酸,前26个氨基酸为信号肽序列.多猪种GH氨基酸序列比对表明其在各猪种中高度保守,版纳微型猪近交系的GH氨基酸序列与五指山猪和宁香猪的相似性均为100％,与藏猪、香猪、大乌猪、太湖猪、成华猪、内江猪、荣昌猪、长白猪、约克夏的相似性均为99％,与雅南猪、杜洛克的相似性均为98％.扩增GH成熟肽区编码序列,定向克隆至表达载体pET-32a(+),转化入大肠杆菌Rosseta (DE3)感受态细胞中,用IPTG诱导表达蛋白.SDS-PAGE和Western blotting分析表明,重组质粒在大肠杆菌中获得了高效表达,融合蛋白以包涵体形式存在,分子质量约为40.6 ku.以上结果为进一步探究GH基因对BMI矮小性状的影响奠定了基础. 相似文献
6.
为了克隆五指山小型猪DAZ相关蛋白2(DAZAP2)cDNA全长并进行生物信息学分析,试验以构建的五指山小型猪外周血白细胞cDNA文库为材料,采用菌落PCR方法克隆得到DAZAP2全长cDNA序列,并运用生物信息学软件对其核苷酸序列进行分析,预测其编码蛋白的理化性质及二级结构等。结果表明:五指山小型猪DAZAP2基因的核苷酸序列及其氨基酸序列与人、苏门达腊猩猩、斑马鱼、非洲爪蟾、牛、褐家鼠等动物具有很高的相似性。DAZAP2 cDNA全长943 bp,5’非翻译区长69 bp,3’非翻译区长367 bp,含有1个完整的开放阅读框,编码168个氨基酸。该蛋白的分子质量为17 311 ku,等电点为7.48。 相似文献
7.
本研究克隆了水牛转录抑制因子CTCF基因序列,并运用生物信息学方法对其核苷酸序列的保守性和氨基酸的理化性质、蛋白质结构进行了系统分析,此外还对CTCF基因在水牛不同组织中的表达差异进行了检测。结果表明,应用RT-PCR技术克隆获得了长2239bp水牛CTCF基因序列,其中编码区全长2184bp,编码727个氨基酸,理论蛋白质分子质量82.7ku,等电点为6.57。多重序列比较分析显示,水牛CTCF核苷酸序列与牛、猪、马、人和小鼠相应序列的相似性分别为99%、96%、96%、94%和92%,结合系统进化树分析结果推测,CTCF基因在不同物种及进化的过程中具有高度的保守性。对水牛CTCF蛋白的二级和三级结构分析结果发现,其存在连续11个锌指C2H2结构,预测其为重要的DNA结合蛋白。定量表达分析结果显示,CTCF在水牛肝脏组织中相对表达量最高,大脑、肌肉和肾脏次之,卵巢和皮肤表达量较低。 相似文献
8.
本研究克隆了水牛缝隙连接蛋白43(connexin 43,Cx43)基因序列,并运用生物信息学方法对其核苷酸序列的保守性和氨基酸的理化性质、蛋白质结构进行了系统分析,对Cx43基因在水牛不同组织和不同发育阶段卵泡中的表达差异进行了检测。结果表明,应用RT-PCR技术克隆获得了水牛Cx43基因序列,其中编码区全长1152 bp,编码383个氨基酸,蛋白质理论分子质量43.13 ku,等电点为8.88。多重序列比对结果显示,水牛Cx43核苷酸序列与牛、羊、猪、马和人相应序列的同源性分别为99%、98%、94%、93%和92%,系统进化树分析结果推测,Cx43基因在不同物种进化过程中具有高度保守性;对水牛Cx43蛋白的二级和三级结构分析发现,其具有缝隙连接蛋白的特有结构。定量RT-PCR结果显示,Cx43在水牛卵巢组织中相对表达量最高,睾丸、肾脏、心脏和皮肤次之,肝脏和大脑表达量较低。免疫组化结果发现,Cx43蛋白表达随卵泡发育时期的不同而变化,Cx43蛋白随卵泡发育表达逐渐增强。 相似文献
9.
通过研究副猪嗜血杆菌（Haemophiius parasuis,Hps）寡肽结合蛋白（Oligopeptide Binding Protein A,OppA）的生物学特性,为副猪嗜血杆菌亚单位疫苗的研制奠定基础。本试验设计了1对特异性引物,应用PCR方法来扩增副猪嗜血杆菌肽聚糖相关脂蛋白的全基因序列,并进行克隆和测序。并且采用生物信息学方法,对Hps的oppA基因核苷酸及其对应氨基酸序列进行比对,选取其中的血清学5型分离株,对其OppA蛋白的分子结构、理化性质及结构功能域、蛋白质二级结构等重要参数进行了预测和分析,并对0ppA蛋白的三级结构进行了同源建模。PCR扩增出1638bp的目的片段;测序结果显示出不同血清型Hps之间oppA基因核苷酸序列相似性有一定的差异,而所对应的氨基酸序列却差异更小;OPPA蛋白的理论等电点为6．45,偏弱酸性;OppA蛋白的二级结构以α螺旋、不规则卷曲和8片层为主要构件;Hps的0ppA蛋白的氨基酸序列与鼠疫耶尔森氏菌2223蛋白的同源性为57．20％,以2223蛋白结构为模板成功构建了Hps的OppA蛋白三维结构分子模型,该OppA蛋白三维结构中与2223蛋白相似,也有3个结构域,在疏水口袋中有1条5肽结构。Hps的OppA蛋白的成功模建为OppA蛋白功能的深入研究提供了参考依据。 相似文献
10.
猪DECR1基因cDNA的克隆、序列分析及原核表达研究 总被引：2，自引：1，他引：1
旨在研究猪2,4-dienoyl-CoA reductase1(DECR1)基因的结构,揭示该基因的原核表达规律。试验以山西马身猪的肝脏组织为材料,采用RT-PCR与RACE技术克隆了DECR1基因的cDNA全序列,并将其重组于pET32a+原核表达载体中,经酶切、序列鉴定正确后,重组质粒转化大肠杆菌BL21进行诱导表达。结果表明:猪DECR1基因的cDNA全长2352bp,包括987bp的开放阅读框(ORF),53bp的5′非翻译区(UTR)和1312bp的3′-UTR;编码区(CDS)编码328个氨基酸残基与猪(电子预测序列)、牛、人、猩猩、猴、马、犬、鼠相应序列的同源性分别为99%、88%、88%、87%、87%、87%、87%和83%;SDS-PAGE电泳结果显示,在IPTG诱导4h时,外源蛋白表达效率最高;Western blot检测发现经诱导表达的蛋白产物大小约为35ku,与预测的大小一致。猪DECR1基因的克隆和表达研究,为进一步探究该基因的生物学功能及其分子遗传机制提供了理论基础。 相似文献
11.
12.
为研究猪肺巨噬细胞FcγR Ⅲ的生物学功能,本研究应用RT-PCR技术从猪肺巨噬细胞总RNA中克隆出猪FcγR Ⅲ的cDNA序列,并对其进行了分析。结果表明,克隆到的序列长820 bp,包含有1个771 bp完整开放阅读框(ORF),与GenBank中登录的猪FcγR Ⅲ序列(AF237453)的核苷酸同源性为99.9％;与人、牛、马、绵羊、猕猴、狗、猫、小鼠氨基酸同源性分别为61.6%、62.9%、55.3%、62.2%、63.0%、59.0%、61.8%和53.2%;蛋白质分子结构预测结果表明,该分子由信号肽（20个氨基酸）、胞外区(185个氨基酸)、跨膜区(23个氨基酸)和胞内区(28个氨基酸)组成,在胞外区存在2个Ig样结构域。猪肺巨噬细胞FcγR Ⅲ基因的成功克隆,为进一步研究其结构与功能奠定基础。 相似文献
13.
CD9 is a glycoprotein of the transmembrane 4 superfamily (TM4SF) and is involved in various cellular processes. Some CD9 cDNA have been cloned in mammals and certain fish genera in recent years, but goat and sheep counterparts of cattle, human and mouse have not been identified. To facilitate the studies, we cloned the cDNA encoding for CD9 of cashmere goat (Capra hircus) and sheep (Ovis aries), and expressed sheep CD9 in Escherichia coli cells. Structural analysis indicated for both goat and sheep that a 1123 bp cDNA spanned an open reading frame of 681 bp which predicted a protein of 226 amino acids with a typical TM4SF structure, including four highly conserved transmembrane domains, two extracellular domains and a CCG motif, which is a hallmark of the TM4SF. The predicted amino acid sequences were highly homologous to those of cattle, mouse and human CD9. Molecular phylogenetic analysis based on CD9 cDNA sequences indicated that goat and sheep CD9 were closely related to CD9 of cattle, which is in agreement with their morphological taxonomy. 相似文献
14.
研究旨在对猪T细胞诱导型刺激物(ICOS)基因的cDNA序列进行克隆与分析。根据已报道的人ICOS基因cDNA序列设计引物,首次从猪脾脏组织总RNA中扩增出ICOS基因编码区全长cDNA序列,克隆于pMD18-T载体后进行测序并进行序列拼接,运用生物信息学分析DNA序列。结果表明:该基因编码区全长630bp,编码210个氨基酸,包含5个外显子。该序列与人全基因核苷酸序列及推导的氨基酸序列的同源性分别为80%和85%;与狗和小鼠的推导氨基酸序列的同源性分别为81%和75%。这为进一步研究该基因的结构特点和功能奠定了良好基础。 相似文献
15.
旨在克隆猪作用于RNA的腺苷脱氨酶2基因（ADAR2）全长cDNA序列,同时对该基因在猪不同组织中的表达规律进行探索。利用RACE （rapid-amplification of cDNA ends）对大白猪ADAR2基因mRNA全长序列进行克隆,并进行生物信息学分析;用荧光定量PCR方法检测35日龄大白猪心、肝、肺、肾、脾、脑、小肠、背最长肌和背部脂肪9种组织中ADAR2的表达水平。结果表明,猪ADAR2基因cDNA全长6 305 bp,共包含12个外显子,编码704个氨基酸,与人、黑猩猩、猕猴、长臂猿、黄牛、山羊和绵羊的CDS区核酸序列和氨基酸序列的一致性均在84%以上。该基因编码的蛋白含有2个双链RNA结合基序和一个脱氨酶结构域。猪ADAR2在检测的各组织中均表达,其中在肺中的表达量最高。综上所述,本研究成功克隆了猪ADAR2基因全长cDNA序列,并且发现其在猪体内广泛表达,为深入研究ADAR2的功能奠定了良好的基础。 相似文献
16.
17.
Wang D Fang L Li T Luo R Xie L Jiang Y Chen H Xiao S 《Veterinary immunology and immunopathology》2008,125(3-4):344-353
The IFN-beta promoter stimulator 1 (IPS-1), also known as MAVS/VISA/Cardif, is an adaptor molecule for the retinoic-acid-inducible protein I (RIG-I) or melanoma-differentiation-associated gene 5 (MDA5) that recognizes intracellular double-stranded RNA (dsRNA) and triggers a signal for producing type I IFN. In the present study, porcine IPS-1 cDNA was cloned, using RT-PCR coupled with rapid amplification of cDNA ends (RACE)-PCR, from porcine peripheral blood mononuclear cells. The open reading frame of porcine IPS-1 consists of 1575bp encoding 524 amino acids. The putative porcine IPS-1 protein contains a N-terminal CARD-like domain, a central proline-rich domain, a C-terminal transmembrane domain, and exhibits similarity to mouse, rat, monkey, human and cattle counterparts, ranging from 59% to 79%. Semi-quantitative RT-PCR showed that porcine IPS-1 mRNA was widely expressed in different tissues. Porcine kidney (PK-15) cells transfected with a DNA construct encoding porcine IPS-1 produced type I IFN, and activated IRF3 and NF-kappaB. Deletion mutant analyses further revealed that both the CARD-like domain and transmembrane domain are essential for these functions. In addition, poly(I:C)-induced porcine IFN-beta promoter activation in PK-15 cells was significantly reduced by siRNA targeting IPS-1, indicating that IPS-1 is an important immunoregulator in the porcine innate immune system. The availability of porcine IPS-1 and establishment of its function in the type I IFN signaling pathway provides a useful molecule for defining its role during the course of pig infectious diseases. 相似文献
18.
Interleukin-2 is a vital cytokine secreted by activated T lymphocytes, and plays important role in the regulation of cellular
and humoral immunity of animals. In our experiment, IL2 cDNA of the Tibet Pig was first cloned by RT-PCR from ConA-stimulated
lymphocytes in the blood and subcloned into pMD-18 T vector, which then was identified with endonuclease restriction. The
sequencing result showed that Tibet pig IL-2 (TPIL-2) cDNA was 503 bp long (ORF was 465 bp) (Genbank accession number: AY
294018). The recombinant prokaryotic and eukaryotic expression plasmids of the cDNA were then constructed to analyse the ability
to stimulate the proliferation of porcine lymphocytes in vitro. The recombinant porcine IL-2 expressed in the prokaryotic cells was found to be of 43 kDa molecular mass, which was consistent
with a 17.4 kDa protein deduced from the IL-2 cDNA sequence (glutathione S-transferase molecular mass is 26 kDa); the recombinant protein in eukaryotic cells was confirmed by use of specific rabbit
anti-porcine IL-2 serum in an ELISA. The bioactivity of TPIL-2 was detected through MTT colorimetry by stimulating the proliferation
of pig ConA-stimulated blasts in vitro. The results indicate that the TPIL-2 significantly promoted the proliferation of ConA-stimulated blasts of pig. This confirms
that IL-2 cDNA of the Tibet pig was successfully cloned and expressed in prokaryotic and eukaryotic cells, which lays the
foundation for the the preparation of specific recombinant IL-2 protein and development of novel immune adjuvants to raise
the immunity of pigs against various infectious pathogens and increase the immunoprotective efficacy of vaccines. 相似文献
19.
试验旨在通过大肠杆菌表达系统表达鼠源重组CD40L蛋白,探讨其对河豚毒素（tetrodotoxin,TTX）人工完全抗原在免疫BALB/c小鼠过程中的免疫增强作用。用Trizol试剂提取BALB/c小鼠脾脏总RNA并反转录成cDNA,根据CD40L CDS区设计引物,PCR扩增目的基因,构建pGEX4T-1重组载体,进行原核表达,并纯化重组CD40L蛋白;根据曼尼希反应原理,用甲醛法制备TTX免疫原TTX-BSA和检测原TTX-OVA;以人工重组蛋白CD40L佐剂组为试验组,弗氏佐剂组作为对照组,免疫BALB/c小鼠,用ELISA方法结合SPSS 19.0软件分析各组免疫效果,探讨重组CD40L蛋白在TTX-BSA免疫过程中对免疫效果的影响。结果显示,本试验成功扩增了783 bp的CD40L目的基因,原核表达并纯化了融合GST标签的55 ku鼠源CD40L重组蛋白;与人工制备的TTX-BSA协同免疫小鼠试验结果显示,在免疫初期与弗氏佐剂相比,CD40L具有极显著的免疫增强效果（P<0.01）。综上所述,重组蛋白CD40L与TTX-BSA完全抗原协同免疫小鼠,在免疫初期CD40L具有增强机体对半抗原的应答强度的作用,为进一步开发适于小分子半抗原抗体高效制备的免疫增强佐剂奠定基础。 相似文献
20.
Cloning and characterization of porcine resistin gene 总被引：5，自引：0，他引：5
Dai MH Xia T Chen XD Gan L Feng SQ Qiu H Peng Y Yang ZQ 《Domestic animal endocrinology》2006,30(2):88-97
Resistin is a member of resistin-like molecules (RELMs) and a hormone secreted from mature adipocytes in rodents and leukocytes in human. We now report the cloning and characterization of the full-length porcine resistin cDNA and gene. Sequence analysis indicated that the pig resistin cDNA sequence had an open reading frame of 330 bp encoding a 12 kDa protein of 109 amino acids. The deduced amino acid sequence showed 75.2% identity to the human resistin. The porcine resistin gene was composed of four exons and had exactly the same exon structure as the human resistin gene. The tissue distribution of porcine resistin mRNA was assessed by semi-quantitative RT-PCR. Resistin gene expression was the highest in porcine leukocytes and low in adipose tissue. Resistin protein could be detected in porcine serum by western blotting and it circulated in serum as dimers and trimers. We provided the first evidence that resistin was abundantly expressed in porcine leukocytes and had an expression pattern similar to that in human resistin mRNA and protein. This suggests that the pig may be a suitable animal model for studying the function of resistin in human insulin resistance. 相似文献