共查询到20条相似文献，搜索用时 31 毫秒
1.
利用黑尾鹿、白尾鹿等近缘物种的18对微卫星引物,对2个东北马鹿肌肉DNA样品和176个粪便DNA样品进行扩增,通过毛细管电泳法筛选适合东北马鹿的微卫星位点。结果表明,其中3个位点为高度多态性位点（PIC〉0.5）,1个为中度多态性位点（0.5〉PIC〉0.25）。共检测到26个等位基因片段,平均每个位点6.5个等位基因。多态信息含量0.393～0.827,个体识别率0.643～0.958,累积个体识别率为0.9999,累积非父排除率为0.9976。这4个多态性微卫星位点为东北马鹿的遗传研究提供了理论依据。 相似文献
2.
《黑龙江畜牧兽医》2015,(19)
为了掌握圈养黑熊的相关遗传信息,试验采用微卫星血液DNA标记法研究圈养黑熊的遗传多态性,试验选择延边地区3个熊场175头圈养黑熊,对其进行遗传多态性检测,计算其等位基因频率、多态信息含量(PIC)等。结果表明:圈养黑熊的6个微卫星座位总共检测到39个等位基因,每个位点的等位基因数量为4.000~8.000个,每个微卫星的平均位点为6.500个,基因频率分布在0~1之间;6个微卫星基因座的平均PIC为0.571 7,且PIC值在0.453 4~0.742 2之间,延边3个黑熊养殖群体的平均PIC均高于0.5,表明6个微卫星标记均具有高度多态性,因此可以分析圈养黑熊的遗传多态性。 相似文献
3.
新疆艾比湖鹅喉羚mtDNA D-Loop区序列多态性研究 总被引：1，自引：0，他引：1
《中国畜牧兽医》2016,(5)
为探讨新疆艾比湖鹅喉羚(Gazella subgutturosa)遗传多样性和遗传背景,本试验对艾比湖鹅喉羚35份粪便样本进行了研究,采用非损伤性DNA分析技术,扩增其mtDNA D-Loop区878bp片段序列,测序结果进行GenBank数据库的BLAST比对及Clustal W和DNASP软件分析。结果表明,成功扩增出以上片段序列,共检测到55个多态性位点,其中未发现缺失、插入现象;发现15个变异位点,包括14个转换位点、1个颠换位点。A、T、C、G含量分别为28.03%、31.57%、24.84%、15.56%,A+T的含量(59.6%)高于C+G含量(40.4%),具有明显的碱基组成偏向性。除此之外共测到16种单倍型,单倍型多态性(h)为0.886±0.037,核苷酸多态性(π)为0.037±0.01528。表明中国新疆艾比湖国家级自然保护区鹅喉羚mtDNA D-Loop区序列存在丰富的多态性。 相似文献
4.
5.
为分析某保种场伊犁鹅的保种效果,本研究利用9个微卫星标记对新疆伊犁鹅3个世代（0世代、1世代、2世代）的遗传多样性进行检测。试验以3个世代伊犁鹅血液为样本,使用苯酚-氯仿抽提法提取DNA,随后进行12%聚丙烯酰胺凝胶电泳检测、银染法显色及判型。结果表明,9个微卫星位点在伊犁鹅的3个世代中共检测到78个等位基因,0世代、1世代和2世代均检测到26个等位基因;3个世代的平均期望杂合度（He）分别为0.4322、0.4232和0.4516;平均多态信息含量（PIC）分别为0.3751、0.3707和0.3936,表明伊犁鹅的3个世代均处于中度多态,遗传变异处于中等水平,且3个世代间平均期望杂合度和平均多态信息含量均差异不显著（P>0.05）;3个世代的遗传距离分别为0.0097、0.0184和0.0074。综合来看,伊犁鹅具有较丰富的遗传多样性,且该保种场目前所采用的保种方法较好地保存了伊犁鹅原有的遗传多样性。 相似文献
6.
为分析某保种场伊犁鹅的保种效果,本研究利用9个微卫星标记对新疆伊犁鹅3个世代(0世代、1世代、2世代)的遗传多样性进行检测。试验以3个世代伊犁鹅血液为样本,使用苯酚-氯仿抽提法提取DNA,随后进行12%聚丙烯酰胺凝胶电泳检测、银染法显色及判型。结果表明,9个微卫星位点在伊犁鹅的3个世代中共检测到78个等位基因,0世代、1世代和2世代均检测到26个等位基因;3个世代的平均期望杂合度(He)分别为0.4322、0.4232和0.4516;平均多态信息含量(PIC)分别为0.3751、0.3707和0.3936,表明伊犁鹅的3个世代均处于中度多态,遗传变异处于中等水平,且3个世代间平均期望杂合度和平均多态信息含量均差异不显著(P0.05);3个世代的遗传距离分别为0.0097、0.0184和0.0074。综合来看,伊犁鹅具有较丰富的遗传多样性,且该保种场目前所采用的保种方法较好地保存了伊犁鹅原有的遗传多样性。 相似文献
7.
《畜牧兽医学报》2015,(6)
旨在利用微卫星技术检测晋南牛、郏县红牛、鲁西牛和秦川牛四大地方黄牛的牛群遗传多样样及遗传结构。采用16个微卫星DNA标记对4个牛群进行检测分析。16个微卫星DNA标记中,除HEL9位点在所有牛群中呈单态外,其他15个位点的有效等位基因数为2~8个,平均有效等位基因数为3.067 6个。BM1818为低度多态(PIC=0.083 0,PIC0.25),其余位点均为高度多态(PIC0.5),其中HUAT24多态性最大(PIC=0.727 5)。4个牛群共检测到80个等位基因,其中晋南牛为63个,郏县红牛为65个,鲁西牛65个,秦川牛68个。在IDVGA46位点,仅有晋南牛有B等位基因,而在TGLA44位点,仅有晋南牛没有B等位基因。4个牛群的平均表观杂合度为0.385 2,平均期望杂合度为0.640 3,平均杂合度为0.578 0。晋南牛在NJ树上单独聚为一支,与鲁西黄牛、郏县红牛及秦川牛的遗传距离分别为0.809 3、0.759 8、0.807 1。结果表明,晋南牛遗传资源独特,群体遗传多样性丰富,是一个生长进化上较为封闭的群体。 相似文献
8.
生境评价对物种保护具有非常重要的意义。本文以鹅喉羚为研究对象,2013～2017年通过对新疆各地区开展多次野外考察,共收集了180个鹅喉羚出现点数据,作为其分布点数据,选取19个气候因子、3个地形因子、植被因子、人类干扰因子等4类24种因子作为环境变量因子,利用MaxEnt模型分析了鹅喉羚的生境适宜性分布特征和主要环境变量因子对鹅喉羚分布的影响。结果表明:模型预测结果准确性较高,平均AUC(area under the curve,受试工作者曲线下面积)值为0. 973; Jackknife检验结果显示:海拔、最冷月最低温度(BIO6)、最干季平均温度(BIO9)、年均温(BIO1)、最冷季平均温度(BIO11)为对鹅喉羚生境分布影响最大的环境变量。鹅喉羚在新疆的适宜分布区主要是天山山脉南部的塔里木盆地和塔克拉玛干大沙漠周边区域、天山山脉北部的准噶尔盆地周边区域、新疆东部的吐哈盆地周边地区、新疆最北部的阿勒泰山脉周边区域等。本研究不仅揭示了新疆鹅喉羚的实际分布状况,同时为了更有效地保护新疆鹅喉羚及其栖息环境提供科学依据。 相似文献
9.
利用位于绵羊不同染色体的9个微卫星标记对新疆紫泥泉国家二级种羊场中国美利奴(新疆军垦型)A品系、B品系绵羊基因组DNA的遗传多样性进行了检测。统计了中国美利奴(新疆军垦型)A品系、B品系绵羊在9个位点的平均杂合度(H)、有效等位基因数(E)、9个微卫星位点的等位基因频率多态信息含量(PIC)和位点平物多态信息含量(PIC)以及中国美利奴(新疆军垦型)A品系、B品系绵羊基因座频率的抽样估计等遗传指标。研究表明:9个微卫星位点在中国美利奴(新疆军垦型)A品系、B品系中均存在遗传多态性,其中5个与产毛性状相关的位点可作为区分A、B品系的依据(5个位点为BM6438、ILSTS004、BM143、BM6516、BM1824);通过分析各品系的遗传结构和特性,如等位基因频率等,对中国美利奴绵羊的选育提高有帮助。 相似文献
10.
夏南牛与13个黄牛群体mtDNA及微卫星DNA遗传多样性比较研究 总被引：1，自引：0，他引：1
采用mtDNA和微卫星DNA两种标记方法,对夏南牛与13个黄牛群体的179个个体进行遗传多样性和群体间的亲缘关系及母系起源分析。通过测定14个黄牛群体179条mtDNA D-loop区序列,共发现124个变异位点和60种单倍型,表明14个黄牛群体具有丰富的遗传多样性。夏南牛群体mtDNA D-loop区序列共发现49个变异位点和7种单倍型,单倍型多样度(Hd)为0.732±0.017,其单倍型多样度较中国地方牛种低,中国黄牛具有更丰富的遗传多样性。通过测定9个具有高度多态性的微卫星座位的等位基因数(Na)、平均杂合度(H)和多态信息含量(PIC),表明9个微卫星位点在60个夏南牛个体中共发现47个等位基因,平均每个位点的有效等位基因数为1.229~6.584。总群体的PIC和H分别为0.608~0.798和0.695~0.837,夏南牛的PIC和H分别为0.692和0.715,夏南牛的遗传多样性较中国黄牛低,中国黄牛群体的遗传多样性高于外来牛种,这一结果和群体间mtDNA D-loop区研究结果一致。构建的NJ系统进化树显示14个黄牛群体主要起源于普通牛和瘤牛,夏南牛受瘤牛的影响更大,具有瘤牛和普通牛的种质特征。本研究为夏南牛遗传资源的保护、合理利用和选育改良提供了理论依据。 相似文献
11.
为了对摩拉水牛、尼里-拉菲水牛进行合理有效的保护,研究其遗传多样性,掌握其遗传背景,试验利用15个微卫星位点对96个个体(尼里-拉菲、摩拉水牛各48头)进行遗传多样性检测。结果表明:在尼里-拉菲水牛15个微卫星位点上共检测到92个等位基因,平均等位基因为6. 133 3,平均有效等位基因为2. 942 3,平均多态信息含量(PIC)为0. 565 5,平均期望杂合度值为0. 618 4;在摩拉水牛15个微卫星位点上共检测到76个等位基因,平均等位基因为5. 133 3,平均有效等位基因为2. 545 4,平均PIC为0. 493 7,平均期望杂合度值为0. 541 3。说明摩拉水牛、尼里-拉菲水牛群体的遗传多样性比较丰富,尼里-拉菲水牛群体的遗传多样性高于摩拉水牛群体。 相似文献
12.
利用微卫星标记技术,选用16个微卫星位点对60只闽西南黑兔群体遗传多态性和遗传结构进行分析。结果表明,在所检测的闽西南黑兔群体中,16个微卫星位点共检测到了75个等位基因,各位点的等位基因数在3～7之间,平均等位基因数为4.688个,平均有效等位基因数为3.443。各位点平均基因频率取样方差V（pij）为5.7546×10-3。16个微卫星位点平均观察杂合度HO为0.764,范围在0.200～1.000之间,平均期望杂合度He 0.685,其范围在0.410～0.811之间,各位点多态信息含量（PIC）变动范围为0.359～0.776,平均PIC为0.629,其中有13个位点处于高度多态（PIC〉0.5）,16个微卫星位点的平均固定指数（F）为-0.115。在所检测的16个微卫星位点上,经x2平衡检验,闽西南黑兔群体偏离Hardy～Weinberg程度不大。 相似文献
13.
14.
4个肉牛品种微卫星多态性分析 总被引：1，自引：1，他引：0
本研究探讨了引进牛种(西门塔尔牛、利木赞牛)和山东地方黄牛(鲁西黄牛、利鲁牛)在20个微卫星位点上的多态性。试验从不同地区的种公牛站采集鲁西黄牛、利鲁牛、利木赞牛和西门塔尔牛的血液或精液样本,分别为56、27、31和30个,共计144个样本,血液样本采用Lab-Aid基因组DNA分离试剂盒提取基因组DNA,精液样本采用高盐法提取基因组DNA。利用20个微卫星标记,采用荧光标记毛细管电泳方法,对4个肉牛品种的DNA多态性进行分析,主要研究了每个群体的遗传变异指标(等位基因数、多态信息含量和杂合度)及群体间的遗传关系(F-统计量和基因流)。结果表明,肉牛基因组DNA条带整齐,无拖尾现象,质量较好,可用于本试验。20个微卫星座位中共检测到211个等位基因,平均等位基因数为10.6个。群体的平均观测杂合度在0.6147~0.7176之间,平均期望杂合度在0.6735~0.7862之间。在所有群体中各位点的多态信息含量在0.4853~0.8714之间,平均为0.7284,但在各个群体内的差异较大。近交系数及基因流分析结果表明,4个肉牛品种近交系数较低,群体间平均近交系数为0.085,每个微卫星位点的基因流均1。总体来看,所选用的20个微卫星座位多态信息含量高,可作为有效遗传标记用于肉牛品种间遗传多样性分析。 相似文献
15.
4个肉牛品种微卫星多态性分析 总被引：1，自引：1，他引：0
本研究探讨了引进牛种（西门塔尔牛、利木赞牛）和山东地方黄牛（鲁西黄牛、利鲁牛）在20个微卫星位点上的多态性。试验从不同地区的种公牛站采集鲁西黄牛、利鲁牛、利木赞牛和西门塔尔牛的血液或精液样本,分别为56、27、31和30个,共计144个样本,血液样本采用Lab-Aid基因组DNA分离试剂盒提取基因组DNA,精液样本采用高盐法提取基因组DNA。利用20个微卫星标记,采用荧光标记毛细管电泳方法,对4个肉牛品种的DNA多态性进行分析,主要研究了每个群体的遗传变异指标（等位基因数、多态信息含量和杂合度）及群体间的遗传关系（F-统计量和基因流）。结果表明,肉牛基因组DNA条带整齐,无拖尾现象,质量较好,可用于本试验。20个微卫星座位中共检测到211个等位基因,平均等位基因数为10.6个。群体的平均观测杂合度在0.6147~0.7176之间,平均期望杂合度在0.6735~0.7862之间。在所有群体中各位点的多态信息含量在0.4853~0.8714之间,平均为0.7284,但在各个群体内的差异较大。近交系数及基因流分析结果表明,4个肉牛品种近交系数较低,群体间平均近交系数为0.085,每个微卫星位点的基因流均>1。总体来看,所选用的20个微卫星座位多态信息含量高,可作为有效遗传标记用于肉牛品种间遗传多样性分析。 相似文献
16.
为了更好地保护极度濒危的普氏原羚物种,选择非损伤性样品——粪便作为研究材料,应用10对非洲糜羚微卫星引物和10对绵羊微卫星引物对普氏原羚的基因组DNA进行PCR扩增,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳,结果发现,有8对引物在普氏原羚基因组DNA中扩增出了多态性位点。各位点基因杂合度介于0.71~0.84,平均杂合度为0.78,有效等位基因数介于 3.40~6.59,平均有效等位基因为5.98,同时利用这8对多态性引物对39个粪便样品的个体进行识别,结果发现这39个粪便样品来自35个不同的个体。 相似文献
17.
主要探讨微卫星DNA标记在蓝狐(Alopex lagopus)单亲亲权鉴定中的可行性,为蓝狐育种的系谱精确鉴定提供依据。选择15个多态信息含量较高的微卫星DNA位点,以6窝蓝狐(母本6只,子代61只)为试验材料,计算15个基因座位的等位基因频率、杂合度(H)、多态信息含量(PIC)、非父排除概率(EP)、累积非亲排除概率(CCE)、亲权指数(PI)和亲权相对机会(RCP)。结果表明:15个微卫星位点的累积非亲排除概率值(CCE)为0.999996。单亲鉴定的PI值为850.5213~966160,RCP为99.8826%~99.9999%。说明所选的15个微卫星位点可用于蓝狐单亲亲权鉴定,其判定成功率和准确率较高,结果可靠。 相似文献
18.
本研究旨在筛选中国地鼠微卫星位点,为中国地鼠遗传分析提供遗传标记。根据建立的中国地鼠微卫星富集文库,对筛选的含微卫星DNA序列的克隆应用引物设计软件Primer 3.0设计引物135对,选择合成11对理论上易出现影子带的引物,用20个中国地鼠个体对这些引物进行了评估。结果显示,11对引物均能扩增出谱带,这11条带的平均多态信息含量(PIC)为0.4195,平均观察杂合度(Ho)为0.3895,平均期望杂合度(He)为0.4565,每个位点的平均等位基因数为5.818。筛选出的微卫星位点均可用于中国地鼠种群遗传结构分析,这将为中国地鼠品种选育、种系评估提供更多的微卫星遗传标记信息。 相似文献
19.
采用VORTEX7．3软件对鹅喉羚的种群生存力进行了分析。研究结果显示：鹅喉羚集合种群在100年内的种群动态变化接近于根据野外工作得到的种群动态。种群在100年内的灭绝概率为零，在25年种群数量最大440，25～65年间鹅喉羚的种群数量呈下降趋势，65年时鹅喉羚的灭绝概率最大32%，种群数量约减少20％，之后种群数量处于稳定下降趋势。已经处于濒危状态，需妻保护。鹅喉羚死亡率的变化对它们种群生存力的影响要大于环境变化；逐步使鹅喉羚生境良性发展有利于鹅喉羚种群的良性发展；通过鹅喉羚种群闯进行个体交换有利于保持它们的进化潜力。 相似文献