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利用广义线性方法定位家畜抗性等级性状的QTL 总被引：1，自引：1，他引：1
在广义线性模型的框架内模拟研究了家畜抗性等级性状的QTL定位方法，QTL参数的估计采用最大似然方法，比较了阈模型方法与一般线性方法的QTL定位效率，并对影响等级性状QTL定位效率的主要因素（QTL效应、性状的遗传力）进行了模拟研究。试验为多个家系的女儿设计，资源群体大小为500头。结果表明：在QTL位置参数估计及检验功效方面，阈模型方法具有一定的优势，对抗性等级性状QTL定位的功效也高于线性方法。另外，性状遗传力和QTL效应的大小对QTL定位的准确度也有直接的影响，随着性状遗传力QTL效应的增大，2种方法QTL定位的效率均有不同程度的提高。 相似文献
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畜禽数量性状基因座位的精细定位 总被引：6，自引：0，他引：6
数量性状基因座位(QTL)的精细定位是实施QTL克隆及标记辅助选择(MAS)的重要基础。然而就目前畜禽QTL定位的结果来看,除了通过候选基因法识别的少数基因外,大多数QTL定位的精度仍无法满足实际应用的要求。为进一步提高QTL定位的精度,缩小QTL定位的置信区间,人们相继提出并发展了一系列新的QTL定位方法。本文在分析畜禽QTL定位的基本方法及影响畜禽QTL定位精度的主要因素基础上,对提高QTL定位精确性的策略和方法进行了相应的探讨。 相似文献
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一般家养畜禽群体规模小、选择强度高，连锁不平衡（linkage disequilibrium , LD）现象普遍存在，尤其在杂种或新培育品种群体中更为突出。随着分子遗传学的发展，我们可以直接选择影响性状的基因或包含基因的染色体区域（QTL），可分型的遗传标记和QTL之间是否存在连锁不平衡是畜禽群体中QTL定位和应用的关键。目前，畜禽群体中用基因组范围内SNPs的连锁不平衡精细定位影响畜禽重要经济性状的QTL正受到广泛关注。作者从LD定位QTL的原理、畜禽群体中LD程度、利用LD进行QTL定位的试验设计及统计分析方法、LD在畜禽QTL精细定位中的应用等几个方面进行了综述。并进一步阐述了畜禽群体中利用LD进行标记辅助选择（MAS）的策略，对LD在畜禽QTL定位及标记辅助选择方面的应用进行了新的探讨。 相似文献
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在早期的QTL定位研究中,研究者所关注的主要是QTL检出效率的高低。随着QTL定位研究的不断深入,研究者们发现：即使是在QTL检出效率很高的情况下,其定位的精确性仍然可能很低。就目前的定位精度来看,虽然基本可以满足实施标记辅助选择的要求,但还远远不能满足分子克隆技术所能达到的操作程度。因此有必要寻找新的定位策略以达到QTL精细定位的目的。本文简要综述了QTL精细定位新策略-传递不平衡检测（TDT）的概念及发展、原理与方法及其在QTL精细定位中的应用。 相似文献
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在早期的QTL定位研究中,研究者所关注的主要是QTL检出效率的高低.随着QTL定位研究的不断深入,研究者们发现:即使是在QTL检出效率很高的情况下,其定位的精确性仍然可能很低.就目前的定位精度来看,虽然基本可以满足实施标记辅助选择的要求,但还远远不能满足分子克隆技术所能达到的操作程度.因此有必要寻找新的定位策略以达到QTL精细定位的目的.本文简要综述了QTL精细定位新策略一传递不平衡检测(TDT)的概念及发展、原理与方法及其在QTL精细定位中的应用. 相似文献
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人类基因组计划和分子生物学技术的发展，推动了猪基因图谱的研究进展，使猪的QTL定位研究取得长足的进展，从而为利用分子标记进行数量性状位点的鉴别和定位奠定了坚实的基础。目前，对影响猪的数量性状的QTL的研究已成为国际上的研究重点，并已取得了一定的成果。猪主要性状的QTL定位结果见表1。 相似文献
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本文论述了分子标记技术的发展历程,并阐述了微卫星标记的特点、QTL(quanti-tative trait loci)定位的理论依据与方法以及近10年来国内外学者在定位功能基因和QTL方面的一些主要研究进展情况,同时也指出了分子标记技术在QTL精细定位方面存在的问题,为以后的研究工作奠定了基础。 相似文献
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在家畜中普遍存在的是分离群体．在数量性状基因定位方面．由于分离群体在各个家系内标记之间及标记与QTL之间的连锁状态不同,同一位点可能存在着多个等位基因,且只有部分个体提供信息,因而在分离群体中进行QTL定位时,其资源群体要以家系为单位,估计的参数也是以QTL方差组分为主。半同胞设计是家畜QTL分析的常用方法．设计中以父系半同胞为资源群体．利用父系及其半同胞后代的标记信息和表型信息进行QTL分析。 相似文献
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猪QTL图谱的研究进展 总被引：1，自引：0，他引：1
猪的经济性状多数受数量性状基因座（QTL）控制,随着分子生物学技术的发展,猪QTL成为研究的热点,总数达到4928个,详细数据可在猪的数量性状定位数据库（QTLdb）中查询。本文概述了QTL的定位方式、存在问题、增加其发现的方法及QTL定位的重要意义。 相似文献
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本研究旨在对比值性状QTL采用贝叶斯定位方法进行探讨。将两个具有正态分布的普通数量性状之比定义为比值性状。由于此类性状不服从正态分布,因此在遗传分析上不同于普通性状。利用构成比值性状的两个组分性状的线性结合,我们提出了定位比值性状数量性状位点(QTL)的最大似然法。在此基础上,进一步探索比值性状的贝叶斯定位策略。首先采用贝叶斯压缩方法估计两个组分性状的QTL参数,然后利用两个组分性状的群体均值和QTL遗传效应,产生一个关于比值性状QTL遗传效应的后验样本,通过对这个后验样本的统计分析,来推断比值性状的QTL。模拟研究表明:新方法表现出比似然法更高的QTL检测效力。 相似文献
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不同标记数对家蚕茧质性状的QTL定位比较 总被引：2，自引：1，他引：1
分析了家蚕茧质性状不同标记数的QTL定位效果 :6 92个标记和 5 4 2个标记的全茧量都是以基因互作效应为主 ,而茧层量、茧层率以及蛹体重性状既有加性也有显性和互作效应 ,且与全茧量、茧层量、茧层率和蛹体重之间的基本相关性相吻合 ;392个标记的分析结果与前两种类型有别 ,定位的总QTL组合数、QTL总数 ,以及效应显著的QTL数都表现最多 ,表明标记数减少反而定位出更多的QTL ,但 392个标记定位的QTL在连锁群的分布同全茧量与蛹体重、茧层量与茧层率之间的显著正相关不符合。分析认为 6 92个标记数的定位结果比较可靠。QTL的效应与贡献率之间的关系分析结果显示 :QTL效应值与QTL贡献率的相关系数达 0 95以上 ,表现为显著的正相关关系 ;但QTL的效应值和贡献率的大小与QTL效应的显著性并无直接关系。 相似文献
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利用Bayesian—MCMC方法对不同家系结构的畜禽远交群体的二级离散性状进行QTL连锁检测，在分析中，基于IBD方差组分的随机模型的定位策略，同时利用MCMC的3种不同抽样技术（Gibbs抽样、Metropolis抽样和Reversible jump MCMC抽样）产生相应QTL参数的后验样本，在此基础上进行目标参数的Bayesian统计推断。结果表明：Bayesian—MCMC方法能够对QTL数目进行准确估计，并且在不同家系结构下得到较为理想的参数估计结果。 相似文献
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近几年,随着人类基因组计划的完成和大量DNA分子标记的出现,使得在分子水平上利用连锁不平衡进行QTL精细定位进入了一个新的阶段。应用于人类疾病基因定位领域中的方法逐渐地移植到畜禽的QTL定位中,同时结合畜禽的特点对精细定位进行了研究。本文主要介绍了基于连锁不平衡原理同源相同检测、传递不平衡检测和系谱传递不平衡检验等方法,并对这些方法进行了对比和展望。 相似文献