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《畜牧兽医杂志》2021,(3)
为明确我国地方鸽种资源的保护与利用方向,以太湖点子鸽、塔里木鸽、石歧鸽为研究对象,同时以白羽王鸽为对比,对体型外貌、生产性能(生长和繁殖性能、体尺和屠宰测定)等方面进行比较分析。结果显示,太湖点子鸽、塔里木鸽、石歧鸽和白羽王鸽各项指标产生了不同程度的差异。28日龄体重,白羽王鸽(506 g)和石歧鸽(461 g)极显著大于太湖鸽点子(367 g)、塔里木鸽(390 g),P0.01;屠体重,白羽王鸽(443 g)和石歧鸽(405 g)显著大于太湖鸽点子(325 g)、塔里木鸽(344 g),P0.05;结合这两个数据来看,白羽王鸽、石歧鸽确实是良好的肉用品种,塔里木鸽和太湖点子鸽直接当肉鸽使用体重太小。年产蛋数,白羽王鸽(18.3个)显著高于石歧鸽(16.1个)和太湖点子鸽(15.4个)(P0.05),极显著高于塔里木鸽(12.5个)(P0.01)。白羽王鸽也可以作为蛋鸽使用,石歧鸽和太湖点子鸽可以往蛋鸽方向选育,塔里木鸽不适宜作为蛋用。太湖点子鸽是良好的观赏用鸽,其五趾性状将来在肉鸽培育中可以充分利用。 相似文献
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旨在利用简化基因组测序技术(genotyping-by-sequencing, GBS)构建四川省龙日种畜场的3个麦洼牦牛保种群(全黑群、粉嘴群和弗洛群)系谱，为麦洼牦牛保种选育工作打下基础。本研究从3个保种群选取406头麦洼牦牛(全黑群211头、粉嘴群140头、弗洛群55头),采血提取DNA后进行GBS测序，利用获得的SNP对保种群亲缘关系展开研究，并初步构建系谱。结果：GBS测序后获得高质量SNP位点126 122个。PCA分析(principal component analysis, PCA)表明粉嘴群和全黑群有明显的分化趋势，弗洛群与全黑群、粉嘴群部分个体聚类紧密。本研究共计算出164 836个亲缘关系对，依据个体间的亲缘系数，判定出134个全同胞关系，912个半同胞关系，136个疑似亲子关系或全同胞关系，520个疑似半同胞关系或叔侄关系，205个疑似半同胞关系或叔侄关系或祖孙关系。结合群体进化树和亲缘关系分析，将保种群划分为12个家系(G1～G12)。家系遗传多样性分析结果表明，12个家系的观测杂合度(observed heterozygosity,Ho)为0.288 9～... 相似文献
3.
为更好地了解奶山羊在世代更替中的遗传谱系,避免因错误谱系记录造成群体近交程度过高,本研究利用液相SNP芯片标记技术确立羊群遗传谱系及其亲缘关系。通过简化基因组测序,对25个不同种群的崂山奶山羊基因组DNA样本进行分析,挑选出1 792个SNP多态性位点,再通过靶向测序基因型分型,合成低通量的探针,最后对探针进行相应的捕获测试,开发出检测崂山奶山羊遗传基因的低密度液相SNP芯片。将该液相芯片应用于300只崂山奶山羊群体的血缘关系鉴定,与已知300只奶山羊系谱记录的亲缘关系进行对比,发现结果高度吻合,证明此芯片具有很高的准确性。本实验开发出均一性高、位点多态性好的低密度液相芯片技术,可专门用于崂山奶山羊亲缘关系鉴定,从而更好地指导奶山羊的选种选配。 相似文献
4.
旨在利用覆盖全基因组和与性状相关的SNPs标记分析西门塔尔牛和地方黄牛两个亲本群体的遗传结构,通过亲本种群之间的遗传距离预测不同杂交组合在生长、胴体和肉质性状上的杂种优势。本研究选择来自内蒙古锡林郭勒盟乌拉盖管理区牧场的1 222头西门塔尔牛和8个地方黄牛品种190头共组成8个杂交组合,对亲本群体进行遗传结构分析。利用牛770K SNP芯片对两个亲本群体进行基因型分型,通过牛QTL数据库筛选与目的性状对应的QTLs,对全基因组SNP位点进行映射分析得到与性状相关的SNP标记。利用两种SNP标记构建状态同源矩阵,计算各杂交组合亲本间的遗传距离。结果,所有亲本群体聚成3类,西门塔尔牛聚成一类,北方黄牛（蒙古牛、西藏牛和柴达木牛）聚成一类,南方黄牛（昭通牛、平武牛、南丹牛、文山牛和凉山牛）聚成一类。西门塔尔牛与北方黄牛在PCA图上的距离较近,说明两者之间亲缘关系相对较近,遗传背景差异较小。在各性状中,遗传距离最大的亲本组合都是西门塔尔牛与南丹牛杂交组合。除了大理石花纹评分性状是西门塔尔牛与昭通牛之间的遗传距离最小,其余性状遗传距离最小的亲本组合都是西门塔尔牛与平武牛杂交组合。据此推测,各性状杂种优势较优的可能组合是西门塔尔牛与南丹牛杂交组合。 相似文献
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《畜牧与兽医》2017,(9):8-12
以基于酶切的简化基因组测序技术对3个绵羊品种(滩羊(TY)、蒙古羊(MGY)、湖羊(HY))进行测定,通过序列比较发现品种间存在SNP,在分析品种群体遗传参数的基础上,建立系统发生树。结果表明,滩羊的SNP位点平均数为24 008个,湖羊SNP位点平均数为23906个,蒙古羊SNP位点平均数为23 306个。系统发生树分析表明,3个绵羊群体未能明确分类。基于个体间的SNP差异程度,利用PCA分类成2个亚群,蒙古羊和湖羊聚为一类,滩羊单独为一类。通过样本的群体结构,推翻了3个绵羊群体来自于同一祖先的说法。品种之间存在大量的SNP,该研究为地方绵羊识别和进化提供依据。 相似文献
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深县猪是河北优质地方猪种之一，为探究其群体遗传多样性情况，本研究利用39头深县猪的全基因组重测序数据分析了深县猪群体全基因SNP变异情况及特征，并进一步利用检出的SNP探究了其有效群体大小、近交状况和个体间亲缘关系等。结果表明深县猪有效群体大小为5.83头，相比于大白猪（42.47）、北京黑猪（10.27）和民猪（8.38）较小，略高于蓝塘猪（3.52），但遗传多样性保持良好。基于ROH的分析表明群体平均近交系数为（0.054±0.01），通过IBS距离分析则发现部分个体间亲缘关系略近。为了更好地鉴定和区分深县猪，本研究综合运用最大分类能力方法及机器学习方法，最终确定了10个SNP作为深县猪群体特征位点。本研究结果有助于了解深县猪群体的保种现状并为其后续保种措施的制定提供一定参考，同时也为深入挖掘深县猪重要性状形成的分子机制提供新的素材，此外本研究中所挖掘的深县猪SNP特征位点可用于对深县猪进行快速鉴定，从而推动深县猪在地方猪育种中更广泛地应用。 相似文献
8.
试验旨在研究塔里木鸽和白卡奴鸽体重与体尺性状之间的关联性,为塔里木鸽和白卡奴鸽表型性状的选育提供数据支撑。试验选取28日龄塔里木鸽和白卡奴鸽各60只（公、母各半）,测定体重与体尺性状,并进行主成分分析和聚类分析。相关性分析结果显示,塔里木鸽和白卡奴鸽的体重与体尺的变异系数均低于10%;塔里木鸽的体重与6项体尺指标均呈现极显著正相关（P<0.01）,白卡奴鸽体重与5项体尺指标均呈现极显著正相关（P<0.01）。主成分分析结果显示,塔里木鸽和白卡奴鸽的体重与6项体尺指标可综合为3个主成分指标,累计贡献率分别为78.301%和79.371%,塔里木鸽的3个主成分中贡献率最大的指标分别为体重、胫围和胸宽,而白卡奴鸽的3个主成分中贡献率最大的指标分别为龙骨长、胫围和胸宽。聚类分析结果显示,体重、体尺指标可聚为体重、胸宽和胫围3类,与主成分分析结果一致。研究表明,对塔里木鸽和白卡奴鸽的体重、体尺性状选育时至少应包括体重、胫围、胸宽和龙骨长4个指标。 相似文献
9.
《中国畜牧杂志》2019,(12)
为研究不同品种肉鸽的种质特征,本实验以白卡奴鸽、泰深鸽、深王鸽、银王鸽及白王鸽为实验材料,测量每个品种30对种鸽体重及体尺,比较品种间的差异,并进行各指标间的相关分析。结果表明:白王鸽体型最大,其龙骨长、胫长、胫围及胸深均显著高于其他品种;深王鸽体型中等,其母鸽体重、胸宽、骨盆宽均显著高于白卡奴鸽、泰深鸽和银王鸽;银王鸽和白卡奴鸽体型最小。相关分析结果表明,白卡奴鸽的体重与体斜长显著相关;白王鸽的体重与胫长显著相关;深王鸽体重与体斜长、龙骨长、胫围、胸宽及骨盆宽显著相关;泰深鸽体重与胫围、体斜长显著相关。综上,不同品种体型从大到小依次为白王鸽、深王鸽、泰深鸽、白卡奴鸽和银王鸽,且不同品种、不同性别的肉鸽体重与体尺指标相关性不同。 相似文献
10.
本研究旨在探究0～28日龄塔里木鸽生长发育特征并选择适宜的生长曲线模型，以揭示塔里木鸽生长发育规律。选取0日龄塔里木鸽雏鸽80只，记录0～28日龄雏鸽的体重，并利用Logistic、Gompertz和Von Bertalanffy模型进行生长曲线拟合，同时测定14、21、28日龄雏鸽的羽毛发育情况。分析结果表明：在25日龄时，塔里木鸽体重达到最大，为317.01 g;0～9日龄的绝对生长量逐渐上升，而9～28日龄的绝对生长量逐渐下降；3种模型中Logistic模型拟合度（R2=0.929）最大，拐点体重为159.85 g，拐点日龄为8.996 d，更接近实测值，因此Logistic模型对塔里木鸽的生长发育规律拟合效果最佳。塔里木鸽羽毛的主翼和覆主翼的长和宽随着日龄的增加而增加，主翼羽毛与覆主翼的差值随日龄增大。由此可见，塔里木鸽早期生长发育速度较快，Logistic模型对塔里木鸽生长发育曲线拟合程度最佳，在实际生产中可以依据最佳的生长模型指导塔里木鸽雏鸽的饲养管理。 相似文献
11.
藏系绵羊分布范围广泛,品种资源丰富,目前主要分为三大类群,但藏系绵羊群体结构不清。为分析藏系绵羊SNP位点及群体结构,实验利用Illumina Ovine SNP 600K商业化芯片对西藏阿旺绵羊、岗巴绵羊、多玛绵羊和霍尔巴绵羊等150只藏系绵羊进行了SNP基因分型,并通过PCA和NJ-tree等方法分析了藏系绵羊群体结构。SNP质控结果表明,共有147个个体符合质控条件,共获得456 418个SNP位点。群体结构分析表明,西藏地区的岗巴绵羊、多玛绵羊和霍尔巴绵羊分别聚为一类,而其他地区的藏系绵羊混乱聚集在一起。本实验研究结果为今后西藏当地绵羊遗传资源的鉴定和保护开发利用提供了理论基础和参考依据。 相似文献
12.
利用mtDNA Cytb基因为标记,研究不同鸽种的亲缘关系和遗传多样性。研究结果:通过对6个鸽种样本Cyt b基因进行PCR扩增和测序,采用生物信息学方法进行数据处理分析,结果显示所有样本中A、G、C、T碱基平均含量分别为26.5%、13.4%、34.8%、25.3%;共发现变异位点数为371个,变异类型为转换和颠换;共发现38个单倍型,平均单倍型多样度(Hd)为0.997,平均核酸多样性(Pi)为0.11373;6个品种之间双参数遗传距离为0.000~0.018,其中王鸽与石岐鸽之间遗传距离最小,岩鸽与蓝环鸽及卡奴鸽间遗传距离最大。结合NCBI上已发表的34个鸠鸽科同源序列进行聚类分析,表明6个家鸽品种只有一个单一的起源。 相似文献
13.
本试验通过对京海黄鸡卵巢组织进行转录组分析,旨在为完善京海黄鸡部分基因结构和发掘新基因提供参考。选取高、低产京海黄鸡各4只,利用转录组测序(RNA-Seq)技术对其卵巢转录组进行测序,然后对得到的测序数据进行生物信息学分析。测序数据经过质量控制后,8个样品共得到484 992 074条有效数据(Clean Reads),总计61.09 Gb。筛选出1 445 264个京海黄鸡品种内SNP位点,其中位于基因区的SNP位点916 108个,位于基因间区的SNP位点552 168个。8个样品中平均新预测的可变剪接12 883个,并对7 481个基因结构进行了优化。与所选的参考基因组序列对比分析,共发掘4 431个新基因,通过与各数据库进行序列对比,1 809个新基因得到功能注释。本研究通过转录组测序技术检测了京海黄鸡卵巢组织的基因结构,为进一步完善京海黄鸡的基因结构信息及发掘潜在的新基因提供分子水平的依据。 相似文献
14.
《中国家禽》2018,(20)
本研究利用目标区域捕获测序技术对TRNAL-AAG(transfer RNA leucine(antico-don AAG))基因进行序列测定,找出不同鸡种TRNAL-AAG基因序列上的差异,为鸡抗病育种研究提供基础材料。利用MEGA X软件对25个鸡种和6种其他鸟类的基因序列进行比对分析,统计SNPs位点和Indel位点,并构建系统进化树进行分析。结果发现该基因SNP共19个,有义突变16个,均集中在序列第47位和第50位,可作为该基因有关抗病的候选SNPs位点。另外,该基因在25个鸡品种间高度保守,没有碱基插入或缺失且相似性高达98%,仅有雪山草鸡和北京油鸡存在一个有义突变,体现两品种在该基因上的多态性。进化树将31种鸟类分为两类:雪山草鸡和北京油鸡及所选6种鸟类聚为一类,其余鸡种聚为一类。说明鸟类品种间的同源性较小,不同鸟类品种TRNAL-AAG基因具有较为丰富的遗传多样性。 相似文献
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为提高云南黄山羊新品种培育的育种效率和遗传进展，准确度量育种素材波尔山羊黄色群体的近交程度及亲缘关系是一个有效途径。本研究采用简化基因组测序（GBS）技术对来自云南省种羊推广中心的37只黄色波尔山羊公羊进行测序，通过质控获取高质量高密度SNP变异信息，并使用Gmatrix v2、Plink v1.90、MegaX v10.0等软件进行主成分分析（PCA）、状态同源距离计算（identity by state，IBS）、基因型亲缘关系G矩阵构建、亲缘系数计算、NJ聚类分析和基因组近交系数计算。结果显示，在37只黄色公羊中检测出位于29条常染色体上的高质量SNPs位点88 393个，共检测出长纯合片段（ROH）1 537条，大小在1 000.582~18 400.12 kb之间，平均每条ROH长2 576.34 kb，平均含有93.15个SNPs；37只黄色公羊被分为11个家系，其中3个家系仅各有1只黄色公羊，家系A与K亲缘关系最远；基于ROH的群体平均基因组近交系数为0.043，其中3只黄色公羊的基因组近交系数>0.125，存在较多的近交积累。本研究结果为波尔山羊黄色群体在云南黄山羊新品种培育中的合理利用提供了科学依据，也为评估山羊个体近交水平、防止近交衰退、优化选种选配方案提供了有力的技术手段。 相似文献
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《畜牧兽医学报》2016,(2)
本研究旨在利用SNP标记估计西门塔尔牛亲缘关系系数,以期准确确定估计个体间亲缘关系系数所需的SNPs数量。研究以1 059头出生于2008-2012年的西门塔尔牛为试验群体,利用Illumina bovineHD(770k)芯片,根据最小等位基因频率(MAF)区间,分别选择100、500、1 000、1 500、2 000、2 500和3 000个SNPs用于个体间亲缘关系系数的估计。结果显示,随着标记数目的增多,估计的亲缘关系系数准确性逐渐增加。且当SNP标记数目达到2 500时,所估计的亲缘关系系数与利用所有标记估计的个体间亲缘关系系数差异不显著,二者相关系数达到0.89以上。同时,利用不同等位基因频率区间内标记估计的个体间亲缘关系系数差异不显著。由此可以看出,当所选标记数目达到2 500以上时,可以得到较高的亲缘关系系数估计准确性。本研究为基于SNP标记信息估计亲缘关系系数的进一步研究提供了理论基础,同时为西门塔尔牛群体个体间亲缘关系的研究提供依据。 相似文献
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有研究表明TYR基因第四内含子中ALV的插入缺失与禽类的羽毛颜色有关，本研究旨在探讨旧院黑鸡TYR基因第四内含子中ALV的插入频率和类型，为进一步探讨其与旧院黑鸡羽毛颜色的相关性提供参考。采用双重PCR对ALV插入整合进行检测、测序，DNA测序序列通过相关分子生物学软件比对与分析，从而分析序列中的识别位点和突变位点。用引物Diag05-dw进行测序，可以看出在不含ALV插入整合频率的N片段中，只存在一个6 bp的识别位点5′-CAGTGT-3′；将不含ALV插入整合频率的N片段的测序结果与参考序列DQ118702.1进行比对，共发现有5个SNP，这5个SNP都位于第四内含子，重要的识别位点5′-CAGTGT-3′存在一个SNP位点5890 G/A。 相似文献
18.
为了对新组建的上杭槐猪保种群实施有效管理，维持群体遗传多样性，本研究通过“中芯一号”50K芯片对229头上杭槐猪DNA样本进行基因分型，并下载杜洛克猪、大白猪、长白猪等西方商业猪种60K芯片数据，合并后进行群体遗传结构分析，重构上杭槐猪保种群系谱并对上杭槐猪公猪群进行家系划分。结果显示：该上杭槐猪保种群与西方商业猪种群体在遗传结构上有明显区别，其个体种质资源纯正，是良好的保种材料。在5次重复系谱构建中，229个基因型个体亲缘关系均相同，系谱早期的22个虚拟个体及其所属亲缘关系在5次重复中均保持一致从而被保留。上杭槐猪保种群中公猪个体之间的亲缘关系较远，可划分为8个家系进行保种管理。本研究表明，通过数量丰富的SNP数据对多世代上杭槐猪群进行系谱构建与公猪家系划分以进行群体保种管理，可为上杭槐猪群体的保种工作提供科学的指导与建议。 相似文献
19.
为深入了解白卡奴鸽和银王鸽的应用潜力，试验对不同季节296只28日龄白卡奴鸽和银王鸽体重体尺指标、屠宰性能及器官指数进行比较分析。结果显示：季节因素对28日龄白卡奴鸽和银王鸽的体尺指标、屠宰性状及器官指数等生产特性产生一定的影响。(1)秋季组和冬季组28日龄白卡奴鸽的体斜长和腿肌率极显著高于春季组和夏季组（P<0.01）；秋季组28日龄白卡奴鸽的胸深、半净膛率、屠宰率极显著高于夏季组（P<0.01）；春季组28日龄白卡奴鸽的胸宽极显著高于夏季组（P<0.01）。(2)秋季组和冬季组28日龄银王鸽的体斜长极显著高于春季组和夏季组（P<0.01）；春季组28日龄银王鸽的胸宽和胫围极显著高于其他三组（P<0.01）；春季组和夏季组28日龄银王鸽的胸角极显著高于秋季组和冬季组（P<0.01）；春季组28日龄银王鸽的全净膛率、半净膛率、屠宰率极显著高于秋季组（P<0.01），春季组28日龄银王鸽的胸肌率极显著高于夏季组（P<0.01）。研究表明白卡奴鸽和银王鸽具有屠宰性能优良、产肉性能良好的特点，并且季节对白卡奴鸽和银王鸽的体尺指标、屠宰性能、器官... 相似文献
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为探究湖羊种公羊个体间的亲缘关系以及群体遗传结构,本研究使用Illumina Ovine 50K SNP芯片对某规模化养殖场248只湖羊种公羊进行基因分型。结果表明,248只种公羊共获得52 843个SNPs标记,平均检出率为99.15%,质控后得到45 521个高质量的SNPs位点;湖羊种公羊群体多态信息含量为0.302 8,观测杂合度为0.385 0,期望杂合度为0.382 0;同源遗传距离（Identity by state,IBS）在0.131 2～0.320 9之间,平均为0.301 1;248只种公羊共检测到20 214个连续性纯合片段（Runs of Homozygosity,ROH）,平均总长度为122.11 Mb,平均近交系数为0.049 9;结合主成分分析和进化树结果,248只种公羊可划分为6个家系。本研究从基因组水平揭示了湖羊种公羊个体间亲缘关系和群体遗传结构,为后续育种计划的制定和实施以及种群的利用提供了参考。 相似文献