三角帆蚌基因组DNA提取方法的比较研究   总被引：1，自引：0，他引：1  

刘瑾  舒妙安 《水利渔业》2008,28(4)

采用4种DNA提取方法(即苯酚法、改进苯酚法、CTAB法和改进ROSE法)提取三角帆蚌基因组DNA,并对4种方法提取的DNA进行分析;通过限制性酶切和SSR-PCR扩增基因组DNA,并对扩增产物进行电泳分析.结果表明,4种方法均有较好的提取效果;所提取的DNA能用于进一步的分子生物学的研究;改进苯酚法提取的DNA纯度最高,SSR-PCR扩增效果最好;苯酚法的DNA得率最高.  相似文献   

大黄鱼血液基因组DNA的提取及其效果   总被引：2，自引：0，他引：2  

张祖兴  李明云  张春丹  刘伟成  管丹冬 《水利渔业》2006,26(3):24-25

应用Sangon血液基因组DNA小量抽提试剂盒,提取大黄鱼血液组织的基因组DNA,并以所提取的DNA为模板进行RAPD扩增效果分析。结果显示,血液基因组DNA稳定性好、质量高,分子量大小在20kb左右;RAPD扩增条带清晰,能满足RAPD等一般分子实验对于模板DNA的质量要求。为大黄鱼的隔代连续研究和濒危鱼类分子实验所要求的活体基因组DNA的获得提供了一个可行的样本组织采集方法。  相似文献   

三角帆蚌不同组织基因组DNA提取效果比较     

许巧情  刘俊 《水利渔业》2010,(2)

利用平衡酚-氯仿法分别提取三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)斧足、鳃、闭壳肌、性腺、肝脏、心脏中的基因组DNA,采用紫外分光光度测定法、琼脂糖凝胶电泳法、PCR扩增法分析三角帆蚌不同组织基因组DNA的提取质量。结果表明,三角帆蚌6个组织均能成功地提取基因组DNA,但提取的DNA质量存在差异;斧足中提取的DNA纯度、浓度最高,PCR扩增的条带最亮,因而是三角帆蚌提取DNA的最佳组织;其次是肝脏和闭壳肌,心脏和性腺提取的DNA较差。  相似文献   

三角帆蚌不同组织基因组DNA提取效果比较   总被引：1，自引：0，他引：1  

许巧情  刘俊 《水生态学杂志》2010,31(2):121-124

利用平衡酚-氯仿法分别提取三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)斧足、鳃、闭壳肌、性腺、肝脏、心脏中的基因组DNA,采用紫外分光光度测定法、琼脂糖凝胶电泳法、PCR扩增法分析三角帆蚌不同组织基因组DNA的提取质量.结果表明,三角帆蚌6个组织均能成功地提取基因组DNA,但提取的DNA质量存在差异;斧足中提取的DNA纯度、浓度最高,PCR扩增的条带最亮,因而是三角帆蚌提取DNA的最佳组织;其次是肝脏和闭壳肌,心脏和性腺提取的DNA较差.  相似文献   

紫菜基因组DNA提取及酶切   总被引：13，自引：1，他引：13       下载免费PDF全文

刘必谦  周湘池  王亚军  俞小燕 《中国水产科学》2001,8(2):14-16

利用两种市售的DNA提取试剂盒对几种紫菜进行基因组DNA提取，该方法需要的组织量少，需要时间短，获得的基因组DNA纯度高，可被AFLP内切酶，特别是EcoR I完全酶切，完全满足AFLP研究的需要，不同的DNA提取方法及提取出的基因组DNA的质量对酶切效果以及后的实验结果有影响。  相似文献   

鲍基因组DNA提取新方法研究   总被引：7，自引：0，他引：7  

杨文新  苏秀榕  杨志彪  李太武  宁淑香 《水产科学》2003,22(1):14-16

为更好地保存样本,提取高质量的基因组DNA,采取先将试验材料用75%乙醇固定,然后再提取基因组DNA的方法,经过检测后用于RAPD等基因工程分析。与从新鲜材料和液氮冷冻材料提取DNA方法的比较表明,用乙醇固定材料提取DNA是一种确实可行的方法,并克服了通常用新鲜材料或液氮冷冻材料所存在的不足(DNA容易降解)和远途异地取材的困难。  相似文献   

坛紫菜DNA提取的初步研究   总被引：4，自引：0，他引：4  

吴立山  王亚军  刘必谦 《水利渔业》2005,25(4):21-22,26

对几种常见的紫菜DNA提取方法———SDS裂解法、CTAB法、LiCl法及试剂盒法提取坛紫菜叶状体DNA效果进行了全面的比较。提取的DNA量LiCl法>CTAB法>试剂盒法>SDS裂解法,纯度试剂盒法>CTAB法>LiCl法>SDS裂解法。同时利用2种试剂盒对坛紫菜丝状体进行了DNA提取,发现其提取效果要远远好于叶状体。  相似文献   

鲫鱼基因组DNA提取方法的探讨   总被引：19，自引：1，他引：19  

刘臻  鲁双庆  肖调义  陈开键 《水利渔业》2004,24(6):20-22

以鲫鱼的血液、肌肉、肝、肾为材料，采用苯酚一氯仿法、试剂盒法提取鲫鱼基因组DNA，对不同方法提取的结果进行了紫外分光光度、琼脂糖凝胶电泳、微卫星PCR扩增等方法的鉴定。结果表明不同方法提取的鲫鱼基因组DNA浓度在385．8～3167．5ng/μL，A260／280比值处于1．66～1．87，所提取的DNA适合微卫星PCR扩增。因此，用苯酚-氯仿法对鲫鱼的血液、肌肉、肝、肾，用试剂盒法对鲫鱼的血液均能提取鲫鱼基因组DNA。  相似文献   

中华绒螯蟹不同组织中基因组DNA含量比较     

张代臻  唐伯平  张华彬 《水产科学》2009,28(2)

用改进后的柱式回收法提取了中华绒螯蟹不同组织中的基因组DNA,并通过紫外吸收光谱法初步分析了附肢肌肉组织、鳃、性腺组织和肝脏组织中基因组DNA的含量,初步得出同质量不同组织中基因组DNA含量大小关系趋向于:鳃>肝脏>性腺>附肢肌肉.  相似文献   

黄河鲶基因组DNA提取与纯化方法的研究   总被引：3，自引：0，他引：3  

吴旭东  张奇  侯玉霞  张文吉 《淡水渔业》2006,36(1):19-21

从鲶肌肉、肝、肾、血中提取基因组DNA。经过0.8%琼脂糖凝胶电泳检测,DNA带型整齐。紫外分光光度仪测定基因组DNA的D260 nm/D280 nm达1.77~1.82,证明所提取基因组DNA质量较好,可用作聚合酶链式反应(PCR)的模板所需。  相似文献   

鳙鱼不同组织基因组DNA提取方法的探讨   总被引：2，自引：0，他引：2  

范武江  王晓清  杨品红  谢春华 《南方水产》2007,3(1):44-47

分别采用试剂盒和常规苯酚/氯仿抽提法提取新鲜的鳙鱼肌肉、肝脏、尾鳍以及用乙醇保存的3种组织基因组DNA,并对其进行综合分析。结果表明,对3种组织的新鲜样品2种方法均能提取高质量的DNA,而用乙醇保存的3种组织,DNA样品质量最好的是尾鳍,其次是肌肉,肝脏最差;总的来看,试剂盒法提取的DNA纯度较好,但是浓度低,而苯酚法得到的DNA浓度高,质量好,且相对成本低。综合比较,苯酚/氯仿抽提法提取乙醇保存的尾鳍组织基因组DNA是一种行之有效的方法,可以在鱼类分子研究中推广应用。  相似文献   

一种保存鱼类鳍条的便捷方法   总被引：1，自引：0，他引：1  

李超  鲁翠云  郑先虎  程磊  徐鹏  孙效文 《鲑鳟渔业》2014,(1):22-24

鳍条是研究鱼类分子生物学常用的组织样本,长期保存的鳍条为实验提供源源不断的基因组DNA。本研究介绍一种便捷保存鱼类鳍条用于DNA提取的方法---干燥法,并说明了用此方法保存鲤（Cyprinus carpio）、施氏鲟（Acipenser schrenckii）和虹鳟（Onchorynchus mykiss）鳍条效果。采集新鲜鳍条,贴在滤纸等吸水性强的纸张上,覆盖另一张滤纸,防止受潮、霉变,自然干燥后在室温保存3个月。剪取部分鳍条样本,用常规酚、氯仿抽提法提取基因组DNA,分别用紫外分光光度计、琼脂糖凝胶电泳、PCR扩增方法检测基因组DNA的质量。结果显示：用干燥法保存的3种鱼类的鳍条样品,提取获得的基因组DNA的OD260/OD280值在1.82-1.89之间, OD260/OD230值在2.29-2.70之间,琼脂糖凝胶电泳条带清晰明亮,可以用于后续的分子生物学研究。本研究证实用干燥法长期保存鱼类鳍条能够获得高质量的基因组DNA,为珍贵样品的长期保存提供了一种行之有效的方法,也为远距离、大样品的采集和保存提供了便捷的选择。  相似文献   

大黄鱼肝脏蛋白质组双向电泳技术的建立及优化   总被引：4，自引：0，他引：4  

李明云  冀德伟  吴海庆  陈炯  史雨红 《水产科学》2010,29(1)

通过对不同裂解液配方、等电聚焦程序和上样量等条件的对比试验,建立和优化了大黄鱼肝脏蛋白质组双向电泳的相关技术体系。试验结果表明,裂解液中添加Tris和TBP,聚焦时适当延长除盐时间,提高聚焦电压和功率,能显著提高双向电泳图谱的分辨率,而17 cm pH 5~8 IPG胶条的最佳上样量为2.0 mg。通过相关条件优化提高了大黄鱼肝脏蛋白双向电泳图谱的分辨率,为大黄鱼肝脏蛋白质组学的进一步研究奠定了基础。  相似文献   

三种赤潮微藻基因组DNA快速制备方法的研究     

石彦红  张凤英  马凌波 《海洋渔业》2009,31(4):438-443

采用超声波法、煮沸法和微波法3种方法分别对塔玛亚历山大藻、环状异帽藻和角毛藻进行细胞破碎及快速制备基因组DNA的研究。通过细胞计数和DNA浓度测定的手段对三种方法进行了比较,以选择适合不同藻种的细胞破碎方法。结果表明,塔玛亚历山大藻和环状异帽藻用超声波法破碎效果较好;角毛藻用微波法较好。对用该三种方法制备的基因组DNA做了PCR扩增,电泳检测表明,与CTAB法扩增效果一样。本文建立的微藻DNA快速制备方法有望应用在赤潮藻类的快速分子鉴定方面。  相似文献   

不同固定剂及固定时间对三角帆蚌DNA提取效果比较   总被引：2，自引：0，他引：2  

许巧情  董明钢 《淡水渔业》2009,39(5)

以三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)为对象,研究了无水乙醇,95%乙醇,4%多聚甲醛,福尔马林溶液,TE缓冲液5种固定剂不同固定时间对三角帆蚌斧足DNA提取质量及PCR扩增的影响。结果显示95%乙醇固定后提取的三角帆蚌基因组DNA降解少,DNA浓度高,OD260/OD2 8 0在1.8~2.0之间,OD260/OD230在1.5左右,表明95%乙醇固定后三角帆蚌基因组DNA的提取质量最好,再依次为无水乙醇、福尔马林溶液、4%多聚甲醛,DNA提取质量最差的是用TE固定的三角帆蚌。  相似文献   

用于PCR检测对虾皮下及造血组织坏死杆状病毒(HHNBV)的一种快速提取DNA方法   总被引：13，自引：4，他引：9  

王馗  史成银  黄倢 《海洋水产研究》2000,21(1):8-12

使用采样液ＳＥＭＰ－Ｔｒｉｓ保存人工感染ＨＨＮＢＶ（ＷＳＳＶ的一个分离株）的中国对虾组织,然后分别用酚抽提法、玻璃乳（Ｇｌａｓｓ Ｍｉｌｋ）回收法、硝酸纤维素膜结合法和煮沸－乙醇沉淀法提取ＤＮＡ。应用ＨＨＮＢＶ引物对提取的ＤＮＡ进行ＰＣＲ扩增,使用琼脂糖凝胶电泳对扩增产物进行鉴定和检测。通过比较表明,煮沸－乙醇沉淀法是一种最快速、简便的从采样液ＳＥＭＰ－Ｔｒｉｓ保存的病虾组织中制备ＰＣＲ模板的方法  相似文献   

草鱼鳃组织蛋白双向电泳技术的建立及优化     

徐湛宁  李福贵  陈杰  蒋霞云  邹曙明 《淡水渔业》2017,47(5)

为建立并优化草鱼鳃蛋白质组双向电泳的技术体系,实验将草鱼鳃经裂解处理后,通过固相p H梯度胶条进行一向等电聚焦和SDS聚丙烯酰胺凝胶垂直电泳进行蛋白分离,对不同的裂解液配方、蛋白纯化方法、IPG胶条的分离范围、上样量和染色方法等进行了探索和优化,并应用lmage Master 2D Platinum 7.0软件对电泳图谱进行了分析。结果表明:采用裂解液中添加DTT来取代Tris和TBP、选择分离范围为pH4-7的IPG胶条和150μg的主动水化上样,电泳结束后对凝胶进行硝酸银染色,获得了覆盖范围广、低背景、高分辨率、适合差异蛋白分析的双向电泳参考图谱。  相似文献   

鱼类种质保存研究进展     

王小刚  骆剑  尹绍武  朱晓平 《海洋渔业》2012,34(2):222-230

开展鱼类种质保存的研究,不仅可以保护鱼类种质资源和生物多样性,而且也是对鱼类种质资源进行有效开发和利用的前提条件。目前鱼类种质保存包括分子(DNA)保存、细胞保存和活体保存等。其中,分子(DNA)保存按照技术难易程度分为基因组DNA保存、基因组文库保存、cDNA文库保存、DNA芯片保存4种;细胞保存一般可分为配子保存、胚胎保存、细胞系保存3种;而活体保存按鱼类生长环境不同可分就地保护和易地保护2种。综述了多种海、淡水鱼类种质保存的研究现状与进展,包括鲤科、鲆科、鲷科、鲱科以及鲽科等科鱼类种质保存的具体情况,为我国鱼类种质保存提供参考资料,同时对今后鱼类种质保存研究提出了展望。  相似文献   

扩增香螺SSR指纹研究的试验条件的优化     

隋娜  侯林  董长勇  李妍  王明昌  张筠 《水产科学》2008,27(4):199-202

利用SSR技术对香螺进行了PCR扩增,探索香螺基因组DNA的提取方法。从香螺23对近缘种引物中筛选出8对可以扩增的引物,对引物浓度、Taq酶浓度、循环次数、模板浓度等方面进行了研究,从而探索出一个适合香螺SSR分析的反应体系和反应条件并对微卫星引物通用性进行初步分析。  相似文献