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对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒(IHHNV) PCR检测方法的建立 总被引：6，自引：1，他引：6
对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒(IHHNV)病是国际兽疫局(OIE)划定的甲壳类其他重要疾病之一,它分布较广,危害严重,对世界对虾养殖业发展影响重大.本文根据Genbank登录的IHHNV基因序列(AF218266),设计了1对特异性引物,从纯化的IHHNV DNA和感染IHHNV凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)组织DNA中成功地扩增出产物大小为703bp的DNA片段,该对引物对IHHNV DNA的检测灵敏度为19.85fg(8.83×103病毒拷贝),与健康对虾组织DNA、对虾白斑综合征病毒(WSSV) DNA及对虾肝胰腺细小病毒(HPV) DNA无交叉反应.本方法可快速、灵敏、特异地检测出对虾感染和携带IHHNV状况,为对虾健康养殖、无特定病原(SPF)种群选育及流行病调查提供了有效的检测手段. 相似文献
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2013年,河北、天津等地区养殖的凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)育苗期出现死苗、出苗率低的情况,生产上,仔虾个体大小差异较大,造成了严重损失.本研究采用荧光定量PCR方法(Real-time PCR)对天津大港地区采集的108尾凡纳滨对虾仔虾样品进行单尾病原检测.结果显示,传染性皮下及造血组织坏死病毒(Infectious hypodermal and hematopoietic necrosis virus,IHHNV)和虾肝肠胞虫(Enterocytozoon hepatopenaei,EHP)均有检出.IHHNV阳性检出率100％,每微克对虾组织DNA的病毒拷贝数为103-107,且个体较大的样品(1.2-2.0 cm)携带病毒拷贝数偏高;EHP阳性检出率为49.1％,每微克对虾组织DNA的拷贝数为103-105,且集中于个体较小样品(0.7-1.1 cm).对IHHNV和EHP阳性凡纳滨对虾样品进行生物学体长与病毒载量指数相关性分析,显示IHHNV载量指数与对虾生长速率呈正相关,虾组织IHHNV平均载量达8.51×104 copies/μg DNA,为较高的感染水平;EHP的载量与对虾生长速率呈负相关关系,与较大个体阳性检出率较低相对应,虾组织EHP平均载量达到2.19× 104 copies/μg DNA,为较高的感染水平.由此,该批凡纳滨对虾仔虾患病为IHHNV和EHP的混合感染所致,本研究数据为IHHNV和EHP病原混合感染流行情况及其对养殖育苗期仔虾生长的影响提供科学依据. 相似文献
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《渔业科学进展》2017,(2)
2013年,河北、天津等地区养殖的凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)育苗期出现死苗、出苗率低的情况,生产上,仔虾个体大小差异较大,造成了严重损失。本研究采用荧光定量PCR方法(Real-time PCR)对天津大港地区采集的108尾凡纳滨对虾仔虾样品进行单尾病原检测。结果显示,传染性皮下及造血组织坏死病毒(Infectious hypodermal and hematopoietic necrosis virus,IHHNV)和虾肝肠胞虫(Enterocytozoon hepatopenaei,EHP)均有检出。IHHNV阳性检出率100%,每微克对虾组织DNA的病毒拷贝数为10~3–10~7,且个体较大的样品(1.2–2.0 cm)携带病毒拷贝数偏高;EHP阳性检出率为49.1%,每微克对虾组织DNA的拷贝数为10~3–10~5,且集中于个体较小样品(0.7–1.1 cm)。对IHHNV和EHP阳性凡纳滨对虾样品进行生物学体长与病毒载量指数相关性分析,显示IHHNV载量指数与对虾生长速率呈正相关,虾组织IHHNV平均载量达8.51×10~4 copies/μg DNA,为较高的感染水平;EHP的载量与对虾生长速率呈负相关关系,与较大个体阳性检出率较低相对应,虾组织EHP平均载量达到2.19×10~4 copies/μg DNA,为较高的感染水平。由此,该批凡纳滨对虾仔虾患病为IHHNV和EHP的混合感染所致,本研究数据为IHHNV和EHP病原混合感染流行情况及其对养殖育苗期仔虾生长的影响提供科学依据。 相似文献
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根据偷死野田村病毒(CMNV)的保守基因序列,设计筛选出1对特异性引物CMN279,利用已公布的凡纳滨对虾白斑综合征病毒(WSSV)和传染性皮下及造血器官坏死病毒(IHHNV)特异性引物WSS235和IHHN356,建立了一种同时检测WSSV、IHHNV和CMNV的多重PCR检测方法。收集18种病原、健康对虾组织及WSSV、IHHNV、CMNV阳性病料,开展特异性测试,该方法可以特异性扩增出WSSV、IHHNV、CMNV基因片段,健康对虾肌肉组织、其他18种病原均未扩增出任何片段,特异性强。应用克隆方法制备目的基因质粒,应用连续稀释质粒方法开展灵敏度测试,测定该方法检测灵敏度分别为WSSV 9.74fg、IHHNV7.65fg、CMNV 10fg;与已报道的多重PCR检测灵敏度相比较,检测灵敏度提高10倍。应用本研究建立的多重PCR检测方法与实验室标准检验方法同时进行22个样品检验,多重PCR检验方法的检验结果与实验室标准方法检验结果符合率为100%。上述实验结果表明:本研究建立的多重PCR检验方法具有特异性强、灵敏度高、检验时间短、检验结果准确度高的特点,可用于WSSV、IHHNV和CMNV三种病原的快速检测诊断。 相似文献
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本研究针对养殖对虾6种病毒,包括白斑综合征病毒(WSSV)、传染性皮下及造血组织坏死病毒(IHHNV)、肝胰腺细小病毒(HPV)、桃拉综合征病毒(TSV)、对虾杆状病毒(BP)和传染性肌肉坏死病毒(IMNV),选择各自的基因分别设计特异性引物和探针,首先进行了单一病毒的PCR验证,在此基础上建立了同时特异性检测6种对虾病毒的多重PCR检测体系。对反应条件进行优化并进行特异性和灵敏度的验证。50μl反应体系,Mg2+的最佳浓度为5mmol/L,ExTaq酶最佳用量为3.75U,反应程序中最佳退火温度为55.5℃。6种病毒之间以及与对虾基因组都存在很好的特异性。最终经试验验证,该系统的检测灵敏度对WSSV可达104拷贝,IHHNV可达102拷贝,HPV可达104拷贝,TSV可达103拷贝,BP可达105拷贝,IMNV可达105拷贝。虽然该多重PCR方法灵敏度不如单一的PCR检测高,但是通过实际样品检测验证了该方法省时、消耗较少,又不失准确性,在实际应用中具有可靠性和应用价值。 相似文献
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对虾WSSV和IHHNV多重PCR检测试剂盒的研究与应用 总被引：1，自引：0，他引：1
在对虾白斑综合征病毒(WSSV)和传染性皮下和造血器官坏死病毒(IHHNV)二温式PCR检测技术前期研究的基础上,将这2种病原的特异性引物与PCR基础反应液一起组装成快速检测试剂盒。通过对试剂盒敏感性、稳定性和保存期等技术指标的测定以及对临床样品的检测试验,该试剂盒对同一样品中的WSSV和IHHNV DNA模板均能特异性地扩增出2条与实验设计相符的593 bp(WSSV)和356 bp(IHHNV)的DNA片段,而对其它对虾病原的扩增结果均为阴性;该试剂盒最低能检测到102pg的WSSV DNA和10 pg的IHHNV DNA。对WSSV和IHHNV DNA的检出量分别为102~103pg和10~102pg。 相似文献
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多重RT-PCR体系检测4种虾病毒的方法 总被引：1，自引：1，他引：0
根据多重RT-PCR的技术原理,利用对虾传染性表皮与造血组织坏死症病毒、白斑综合征病毒、黄头病毒和桃拉综合征病毒的基因序列分别设计了4对特异引物,建立多重RT-PCR体系用于虾4种病毒的检测。多重RT-PCR体系能特异地扩增出IHHNV、WSSV、YHV和TSV的目的片段:TSV特异性扩增片段508 bp,WSSV 特异性扩增片段435 bp,IHHNV 特异性扩增片段301 bp 和YHV。特异性扩增片段614 bp。结果表明,多重PCR虾病毒检测系统具有较高的特异性和敏感性,并对其它对虾病原呈阴性。IHHNV、TSV、WSSV和YHV模板在多重PCR虾病毒检测体系中的检测下限分别为0.1,1,0.02和0.2 pg。病毒感染病料检测试验中,该检测体系的检测结果与单纯PCR的检测结果呈现出较好的吻合度。 相似文献
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《福建水产》2021,(4)
传染性皮下及造血组织坏死病毒(Infectious hypodermal and hematopoietic necrosis virus, IHHNV)作为对虾疾病的主要病原之一,能够感染多种对虾,对幼虾危害尤其明显,虽然死亡率不高,但可以引起对虾生长缓慢,造成巨大的经济损失,严重影响对虾养殖业持续健康发展。本文根据IHHNV病毒基因的保守序列,采用Primer Explorer V4软件设计6条LAMP特异性引物组合,建立了一种以环介导等温核酸扩增技术(Loop-mediated isothermal amplification, LAMP)为基础的快速检测IHHNV的方法。对本研究的LAMP检测方法的敏感性和特异性进行分析,并将其灵敏度与实时荧光定量PCR、普通PCR检测方法进行比较。结果显示:LAMP检测方法在63℃恒温条件60 min内完成反应,阳性结果出现可视化的绿色,阴性结果颜色不发生变化;LAMP方法的最低检出限为10.3 copies/μL,灵敏度与荧光实时定量PCR相当,较常规PCR高。结果表明建立的LAMP方法适用于对虾IHHNV的现场快速检测。 相似文献
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根据GenBank中对虾传染性皮下和造血器官坏死病毒(IHHNV)保守基因序列(AF218226),设计合成了1对引物和1条TaqMan探针,建立了检测IHHNV的荧光定量PCR技术.将建立的荧光定量PCR检测方法与常规PCR对比.结果显示,所建立的荧光定量PCR方法灵敏度可达2个拷贝,比常规PCR灵敏度高1 000倍.对保存的15份经常规PCR检测为IHHNV阳性的DNA样品进行荧光定量PCR检测,结果都为阳性,检测的病毒含量为2.15×107～4.21×104拷贝/μL.用该方法对不同浓度的样品进行了重复检测,表明该方法具有良好的重复性,可满足IHHNV的临床诊断需要. 相似文献
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ABSTRACT: Suppressive effects of non-ionic (sorbitol, maltose, and trehalose) and ionic (Na-glutamate, Na-acetate, Na-sulfate, and ammonium sulfate) compounds on the thermal inactivation of myosin subframgent-1 (S-1) and myofibril Ca2+ -ATPase were compared. All compounds suppressed S-1 denaturation. When myofibrils were used (at 0.1 M KCl), sugars and sugar alcohol (non-ionic compounds) suppressed denaturation similar to S-1, while Na-glutamate, Na-acetate, and Na-sulfate weakly suppressed them. Ammonium sulfate accelerated denaturation, but suppressed denaturation when heated in 2 M KCl, at which myosin lost protection by F-actin. It was thus concluded that ionic compounds affected the denaturation of myofibrils in two ways; suppression as established with S-1, and acceleration as a result of loss of protection by F-actin caused by increase in ionic strength. 相似文献
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E. G. Drakou D. C. Bobori A. S. Kallimanis A. D. Mazaris S. P. Sgardelis J. D. Pantis 《Ecology of Freshwater Fish》2009,18(3):369-379
Abstract – We examined the relative contribution of environmental heterogeneity and dispersal limitation on freshwater fish community composition in 18 Greek protected lakes and reservoirs. Environmental heterogeneity was measured by spatial pattern metrics (calculated by digital map processing, e.g., patch richness density, area-weighted mean patch area), altitude, maximum lake depth and trophic status. Dispersal limitation was measured by straight-line distances among lake centres. Ecosystems were clustered according to species composition. We examined the correlation of similarity in species composition among ecosystems with that of environmental heterogeneity and with straight-line distances, for the entire dataset, as well as for the occurring clusters. Fish species richness increased with ecosystem area and decreased with altitude. The clusters identified (aquatic ecosystems of Northern vs. ecosystems of Western Greece), implied an underlying biogeographical pattern as defined, with Pindus range acting as a natural barrier. Between ecosystems similarity, based on fish species composition, showed a weak to insignificant correlation with environmental heterogeneity, but was significantly correlated to dispersal limitation for the entire dataset as well as within each occurring cluster. Thus, natural barriers, species biogeography and dispersal limitation played a more significant role in shaping freshwater fish communities than environmental heterogeneity. 相似文献
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Bacterial kidney disease (BKD), caused by Renibacterium salmoninarum (Rs), is a serious threat to salmon in aquaculture as well as to wild populations. We have developed a real-time polymerase chain reaction (PCR) for detection of Rs in kidney samples. The PCR is based on detection of unique parts of the 16S rRNA gene of Rs and DNA equivalent to 1-10 Rs genomes was detected per reaction. No cross-reactivity with other fish pathogenic or related bacteria could be demonstrated. Analysis of individual kidney samples collected from BKD classified populations identified 39.9% of the fish as positive by real-time PCR compared with 28.0% by polyclonal enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). The real-time PCR assay was found to be well suited for complementary use with ELISA for diagnosis of BKD, with the ability to detect clinical as well as covert Rs infections. The infection level determined by the polyclonal ELISA and by real-time PCR was significantly correlated. 相似文献
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丁鱥雌核发育鱼的异源精子诱导及其与亲本的RAPD比较分析 总被引：1，自引：0，他引：1
Gynogenesis is thought to be a useful method to generate fully inbred line and to initiate monosex culture in teleost fish. This article presents results of a study of gynogenesis of tench, Tinca tinca L. from Eltrix River of Xinjiang, China, induced by the common carp ( Cyprinus carpio ) sperm inactivated with UV irradiation. When cold shocking method was used to prevent exmasion of the second polar body in order to produce gynogenetic diploids, the optimum treated parameters were screened as cold shocking for 20min at 4℃, 5min after insemination. On this condition, 10.23% of the treated eggs survived at feeding stage. A comparative study between the gynogenesis and their parents was made by RAPD technique. 82 random primers of 10 nucleotide long sequence were used in RAPD analysis. The results showed that each primer gives 3- 12 fragments for each sample with the fragment length 330 - 2 460 bp, and the genetic similarity between gynogenesis and their mother was 97.4 %, while the genetic similarity between gynogenesis and their father was 27.4%, and there were no bands only shared by gynogenesis and their father, the common carp. It revealed that the chromosome of their father, the common carp, did not penetrate into the construction of gynogenetic tench. 相似文献
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栉孔扇贝生物沉积作用的研究 总被引：4，自引：0，他引：4
2001年3～9月,在自然养殖状态下对栉孔扇贝(Chlamys farreri)的生物沉积及其对物质输运的影响进行研究.结果表明,栉孔扇贝能加速海洋中颗粒物质的沉积,生物沉积率分别为小个体(壳长30～40 mm)72.31～109.85 mg·ind-1·day-1、中等个体(壳长50～60 mm)103.49～207.77 mg·ind-1·day-1和大个体(壳长60～70 mm)120.05～237.65 mg·ind-1·day-1.栉孔扇贝的生物沉积与其壳长呈正相关线性关系,与其干组织重呈正相关的指数关系,而单位重量的生物沉积则与壳长和干组织重分别为负相关的线性和幂指数关系.海水温度和环境中饵料数量是影响栉孔扇贝的生物沉积的重要因子. 相似文献
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鱼类人工雌核发育的研究始于20世纪50年代,在随后的50年里发展迅速。雌核发育可以为纯系建立、性别控制、基因定位等研究提供一种有效途径,乃鱼类遗传育种研究工作活跃领域之一[1-3]。丁(Tincatinca)隶属于鲤科、雅罗鱼亚科、丁属,是一种广温性鱼类(0～37℃)。主要分布于欧洲,在我国仅分布于新疆额尔齐斯河流域[4]。由于丁雌鱼生长比雄鱼快,Linhart等[5]对其人工诱导雌核发育和雌核发育子代性逆转进行了研究。但到目前为止,与其他大多数鱼类雌核发育研究工作一样,尚未获得功能性雄鱼。本研究旨在对丁人工雌核发育条件进行探索,… 相似文献