共查询到20条相似文献，搜索用时 593 毫秒
1.
《海洋渔业》2014,(1)
通过线粒体细胞色素氧化酶Ⅰ(COI)和细胞色素b(Cytb)基因2个分子标记对阿根廷滑柔鱼(Illex argentinus)冬生群体与秋生群体的遗传变异进行了研究,并检验了冬生群体在时间上的遗传差异。结果显示,基于COI基因序列分析得到的单倍型数、单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数及平均核苷酸差异数分别为11、0.535±0.066、0.002 24±0.001 59和1.243。基于Cytb基因序列分析得到的单倍型数、单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数及平均核苷酸差异数分别为7、0.528±0.058、0.002 65±0.001 89和1.222。2个分子标记均揭示:阿根廷滑柔鱼2个产卵群体具有较高的单倍型多样性指数和较低的核苷酸多样性指数。单倍型邻接树、分子方差分析(AMOVA)及两两群体间的遗传分化系数F st均表明,阿根廷滑柔鱼2个产卵群体间的遗传差异不显著,不存在显著的群体遗传结构。此外,冬生群体在时间上的遗传差异也不显著,。可见,阿根廷滑柔鱼产卵群体间具有频繁的基因流。推测与该物种为大型洄游性种类,生命周期短,以及海洋环流有关。 相似文献
2.
长江流域铜鱼和圆口铜鱼的遗传多样性 总被引：2，自引：2，他引：0
利用线粒体DNA控制区序列多态性分析了长江流域铜鱼（Coreius heterodon）和圆口铜鱼（Coreius guichenoti）各4个群体的遗传结构；同时利用9对自行开发的多态性微卫星标记分析圆口铜鱼4个群体的遗传结构。结果显示，铜鱼线粒体DNA（mtDNA）D-loop序列共检出22个多态位点，28种单倍型，平均单倍型多样性指数（h）和核苷酸多样性指数（7r）分别为0．849和0．00257。圆口铜鱼线粒体DNA（mtDNA）D-loop序列共检出18个多态位点，28种单倍型，平均单倍型多样性指数和核苷酸多样性指数分别为0．902和0．00424。分子变异分析（AMOVA）结果提示，铜鱼和圆口铜鱼分别有98．80％和99．17％的遗传变异发生于群体内部，表明铜鱼和圆口铜鱼未出现种群分化。选用的9个微卫星标记在圆口铜鱼群体中共检测到48个等位基因；群体平均观测杂合度在0．631～0．753之间；平均期望杂合度为0．598-0．728：平均多态信息含量为0．548～0．670。结果表明，长江流域铜鱼遗传多样性较低，长江上游圆口铜鱼遗传多样性较高，且均未出现种群遗传分化。圆口铜鱼SSR固定指数为0．12l58，高于D．1oop固定指数，显示SSR标记对圆口铜鱼群体间遗传差异的检测更为灵敏。[中国水产科学，2008，15（3）：377-385] 相似文献
3.
茎柔鱼广泛分布在东太平洋海域,分布水域广,种群结构复杂。采用线粒体COⅠ序列为遗传标记分析了东南太平洋茎柔鱼(Dosidicus gigas)遗传结构特征。在秘鲁外海8个群体239个样本的线粒体COⅠ序列中共检测到46种单倍型,42个变异位点。8个群体的单倍型多样性为(0.469±0.114)～(0.759±0.086),核苷酸多样性为(0.001 04±0.001 07)～(0.003 63±0.001 21),均具有较高的单倍型多样性水平和较低的核苷酸多样性水平。基于单倍型构建的NJ树以及基于群体间遗传距离构建的UPGMA树分析显示,8个群体间没有明显的地理谱系结构特征。AMOVA及F_(st)分析结果表明,群体间变异百分比为0.26%,群体内变异百分比为99.74%,说明遗传变异主要来自群体内部,群体间不存在显著的遗传结构分化。群体间的基因流数据分析表明,各群体间具有显著的基因交流。研究结果可为茎柔鱼资源的合理利用、开发及科学管理提供必要参考。 相似文献
4.
基于线粒体DNA分子标记的东太平洋茎柔鱼群体遗传多样性比较分析 总被引：1，自引：2，他引：1
为合理开发利用东太平洋茎柔鱼资源,需要准确掌握其种群结构。基于线粒体细胞色素b(Cytb)与细胞色素氧化酶Ⅰ(COⅠ)2个分子标记对茎柔鱼赤道海域与秘鲁外海2个地理群体的遗传多样性现状进行比较分析。分析认为,基于Cytb基因所有序列得到2个群体总的单倍型数、单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数及平均核苷酸差异数分别为7、(0.397±0.079)、(0.001 09±0.000 96)和0.600,秘鲁外海群体单倍型多样性指数仅为(0.282±0.101),明显低于赤道海域群体。基于COⅠ基因所有序列得到2个群体总的单倍型数、单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数及平均核苷酸差异数分别为17、(0.787±0.051)、(0.002 90±0.001 38)和1.802。单倍型网络关系图及两两群体间遗传分化系数Fst分析结果显示,赤道海域群体与秘鲁外海群体不存在显著的遗传差异(Cytb:Fst=0.005 91,P>0.05;COⅠ:Fst=0.055 23,P>0.05),2个地理群体可能在赤道海域海流的作用下发生基因交流。单倍型网络关系图、中性检验和核苷酸不配对分析结果均表明,茎柔鱼经历过近期群体扩张事件,发生群体扩张的时间在138 900～167 900年前。 相似文献
5.
东太平洋公海茎柔鱼种群遗传结构初步研究 总被引：8，自引：1，他引：7
根据2009年7月到10月我国大型鱿钓渔船在东太平洋(81.9°～94.9°W,8.9°N～11.3°S)秘鲁和哥斯达黎加外海作业期间采集的样本,利用线粒体DNA细胞色素b基因的724 bp部分序列,分析了采自秘鲁7个采样点和哥斯达黎加3个采样点的155个个体的序列多样性与种群遗传结构.结果显示,724 bp片段中发现了16个变异位点,155个个体出现43个单倍型.序列多样性分析结果揭示,155个个体的平均单倍型多样性指数为0.873,核苷酸多样性指数为0.003 69.群体间共享6个单倍型,秘鲁外海茎柔鱼群体享有最多特有单倍型(20个).分子方差分析揭示,82.70％的遗传变异性出现在种群内;群体间的FST分析揭示部分秘鲁群体与哥斯达黎加群体,部分秘鲁群体间存在着显著的遗传分化;而哥斯达黎加群体内部不存在显著的遗传分化. 相似文献
6.
7.
基于线粒体COⅠ和Cytb基因序列的北太平洋柔鱼种群遗传结构研究 总被引：2，自引：1，他引：1
为准确掌握柔鱼的种群遗传结构,拟通过线粒体DNA的COI和Cytb基因序列分析方法对柔鱼不同产卵季节群体的遗传多样性和遗传结构进行研究。经PCR扩增与测序分别获得600 bp COI与481 bp Cytb基因序列。基于COI基因序列分析得到的单倍型数、单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数及平均核苷酸差异数分别为24、(0.729 ±0.033)、(0.005 70 ± 0.003 25)和3.421。基于Cytb基因序列分析得到的单倍型数、单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数及平均核苷酸差异数分别为28、(0.852 ± 0.016)、(0.006 45 ± 0.003 73)和3.101。分析认为, 北太平洋柔鱼2个产卵季节群体均具有较高的单倍型多样性指数和较低的核苷酸多样性指数。单倍型邻接树、两两群体间的Fst值以及AMOVA分析结果均表明, 北太平洋柔鱼2个产卵季节群体间的遗传差异不显著, 不存在显著的群体遗传结构。初步认为, 该海域因缺乏地理上的障碍, 加之北太平洋海流的作用以及柔鱼个体较强的游泳能力, 使得群体之间具有较强的基因流。 相似文献
8.
高邮湖大银鱼、太湖新银鱼Cytb和COⅠ 基因序列多态性分析 总被引：1，自引：0，他引：1
为探明高邮湖大银鱼、太湖新银鱼野生资源状况,利用线粒体DNA Cytb和COⅠ基因序列,对高邮湖大银鱼、太湖新银鱼的遗传多样性水平及遗传结构进行分析。试验结果显示,大银鱼Cytb基因序列全长1141 bp,其中多态性位点14个,共定义12个单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.871±0.031和0.00172±0.00019,具有高单倍型多样性和低核苷酸多样性特征。COⅠ基因片段长度为630 bp,其中多态位点5个,共定义6个单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.747±0.041和0.00202±0.00019,具有高单倍型多样性和低核苷酸多样性特征;太湖新银鱼Cytb基因序列全长1141 bp,其中多态性位点13个,共定义9个单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.609±0.078和0.00094±0.00027,具有高单倍型多样性和低核苷酸多样性特征。COⅠ基因片段长度为630 bp,其中多态位点2个,共定义3个单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.232±0.085和0.00038±0.00014,呈现低单倍型多样性和低核苷酸多样性。大银鱼和太湖新银鱼Tajima′s D和Fu′Fs中性检验值为负值,且歧点分布曲线呈单峰型,表明历史上经历过种群扩张。研究结果表明,应通过多种措施加强高邮湖银鱼种质资源保护。 相似文献
9.
基于线粒体Cytb基因和D-loop区序列的高邮湖湖鲚(Coilia nasus)遗传多样性分析 总被引：2，自引：0，他引：2
本研究利用线粒体细胞色素b(Cytb)基因和控制区(D-loop)序列作为分子标记,调查了高邮湖湖鲚(Coilia nasus)种群遗传多样性。结果显示,Cytb基因和D-loop区序列碱基A+T含量均高于G+C含量,显示碱基组成具有偏倚性。38条Cytb基因序列检出26个变异位点,定义13个单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.716±0.078和0.002 70±0.000 57;40条D-loop区序列检出53个变异位点,定义21个单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.906±0.034和0.006 27±0.000 99。13个Cytb基因单倍型之间的遗传距离在0.001~0.014之间,NJ系统进化树显示单倍型聚为1支;21个D-loop区单倍型之间的遗传距离在0.001~0.019之间,NJ系统进化树显示单倍型聚为2支。中性检测结果和歧点分布图均表明高邮湖湖鲚种群稳定,近期没有发生种群扩张。整体来看,高邮湖湖鲚种质资源遗传多样性水平较高,具有高单倍型多样性和低核苷酸多样性的特征。 相似文献
10.
基于Cytb基因的滆湖鲌类国家级水产种质资源保护区3种鲌鱼的遗传多样性分析 总被引：1，自引：0，他引：1
为研究滆湖鲌类国家级水产种质资源保护区主要保护对象的种质遗传状况,通过PCR和测序技术,获得保护区翘嘴鲌(Culter alburnus)、达氏鲌(Culter dabryi)、蒙古鲌(Culter mongolicus)等3种鲌属鱼类的细胞色素b(Cytb)基因序列,并分析了其遗传多样性和群体结构。结果显示,3种鲌鱼的Cytb基因全长为1 141 bp,碱基组成相似,均表现为A+T的含量(56.4%)高于G+C的含量(43.6%)。翘嘴鲌的Cytb基因有16个变异位点,定义14种单倍型,单倍型和核苷酸多样性分别为0.907和0.002 4;蒙古鲌的Cytb基因有8个变异位点,定义6种单倍型,单倍型和核苷酸多样性分别为0.863和0.002 4;达氏鲌的Cytb基因有10个变异位点,定义7种单倍型,单倍型和核苷酸多样性分别为0.573和0.001 2。整体来看,3种鲌鱼均具有高单倍型多样性和低核苷酸多样性的遗传多样性模式,暗示3种鲌鱼群体在历史上经历过种群扩张,与中性检验结果和歧点分布图分析结果相一致。翘嘴鲌和蒙古鲌的种内遗传距离为0～0.006,达氏鲌的种内遗传距离为0～0.004,... 相似文献
11.
确立了离子色谱法检测琼胶中硫酸基含量的样品处理方法和检测条件。样品前处理采用灰化降解琼胶粉中的有机成分,超纯水溶解定容、过膜后测定;检测时利用戴安ICS-3000型离子色谱仪、电导检测器、ASRS 4mm抑制器和IonPac AS23型分离柱,淋洗液组成为9．0mmol·L^-1Na2CO3溶液和1．6mmol·L^-1NaHCO3溶液,流速1．0mL·min^-1。此方法硫酸根（SO4^2-）在1．0～15．0mg·L^-1浓度范围内呈良好的线性关系（R^2=0．9995）,检出限为0．01mg·L^-1,样品加标回收率为89．0％-102．0％,分析快速准确。离子色谱法与传统方法相比,操作快速简便,灵敏度高,重现性好。 相似文献
12.
在对江苏近海海域好氧菌进行调查中,选择了ZD-B287（N119°35′E34°40′）和JC-H187（N121°53′E32°20′两个采样点,分别在春、夏、秋、冬进行了4次水样和底层表面泥层样品采集。以随机挑选的方法分离、纯化了395株海洋好氧细菌,运用16SrDNA基因序例进行鉴定。通过NCBI的BLAST检索系统进行序列同源性比较,与GenBank数据库中获得菌株的16SrDNA基因序列进行多序列匹配排列。得到13株可培养的好氧菌,分别为假交替单胞菌属（Pseudoalteromonas）、假单胞菌属（Pseudomonas）、微小杆菌属（Exiguobacterium）、芽孢杆菌属（Bacillus）、弧菌属（Vibrio）、红细菌属（Rhodobacter）、海杆菌属（Marinobacter）、伯克霍尔德菌属（Burkholderia）、海洋单胞菌属（Marinomonas）、动性微菌属（Planomicrobium）、变形杆菌属（Proteus）、玫瑰杆菌属（Roseobacter）和交替单胞菌属（Alteromonas）。 相似文献
13.
设计一套虾池自动投饲装置,初步解决了虾池自动投饲问题。提出非接触定位、测距定位和接触定位三种投饲装置自动沿岸行驶方案,并对不同方案的优缺点进行了分析比较;对机械执行系统进行了详细的结构设计,该系统包含拉线和投饲装置两部分,拉线约束投饲装置自动沿岸行驶,投饲装置完成投料动作;采用应变式重量传感器和微控制器等,开发出投饲装置的控制系统,实现定时定量的投料控制。同时,采用新兴的ZigBee无线网络通信技术,实现对投饲装置的虾料重量和蓄电池电压的远程监控。投喂实验表明,该系统的工作过程稳定、可靠。 相似文献
14.
15.
Nomoto R Unose N Shimahara Y Nakamura A Hirae T Maebuchi K Harada S Misawa N Itami T Kagawa H Yoshida T 《Journal of fish diseases》2006,29(11):673-682
A Lancefield group C streptococcal (GCS) infection caused by Streptococcus dysgalactiae that is characterized by severe necrotic lesions of the caudal peduncle has been an increasing cause of mortality in farmed fish such as amberjack, Seriola dumerili, and yellowtail, Seriola quinqueradiata, in the southern part of Kyushu, Japan. In this study, enzymatic profiles of GCS strains from fish and mammals were investigated using the API ZYM system, and genotypic characterization of GCS strains was performed using biased sinusoidal field gel electrophoresis (BSFGE). The partial sequence of the 16S-23S rDNA intergenic spacer region of the GCS strain isolates from fish and mammals was also compared. The API ZYM test indicated that it is difficult to differentiate isolates of S. dysgalactiae from fish and animals based on enzymological variations. In the BSFGE analysis, the macrorestriction profiles, which were obtained using SmaI or ApaI as a restriction enzyme, revealed variations between the fish and animal isolates. The partial sequence of the 16S-23S rDNA intergenic spacer region of all the tested fish isolates differed from all mammalian isolates in one or two nucleotides. The possibility of a clonal expansion of S. dysgalactiae strains in farmed fish was also suggested by the BSFGE profiles of fish isolates. 相似文献
16.
从广东省南澳县西山等养蛙场多次收集息黄杆菌病牛蛙,其症状是：歪头、狂游、双眼白内障和腹水等。从病蛙脑浆、眼底和腹水中分离到多株病原菌,急性毒性试验表明病原菌对健康牛蛙致病力强。取有代表性的981007—2等菌株进行系统的生理生化试验显示,革兰氏染色阴性、无鞭毛、无芽孢的短杆菌;分离菌株内毒素检验阳性;病原菌显示了对青霉素类药物高度耐药、好氧型、利用葡萄糖等生理、生化特性。经VITEK—AMS—60自动化检测系统鉴定为黄杆菌IIb群(Flavobacterium group IIb)。选用47种抗菌药物,通过K—B纸片扩散法对病原菌进行耐药性研究结果,分离菌株对38种抗菌药物显示耐药(占80．85％)、对4种药物中等敏感(占8．51％),仅对利福平、环丙沙星、氧氟沙星、氟啶酸、麦迪霉紊等5种药物(占10．64％)敏感。应用试管稀释法测定上述5种敏感药物的平均MIC分别是0．19、0．27、0．53、2．40和10．2ug/ml。 相似文献
17.
Lancefield group C Streptococcus dysgalactiae infection responsible for fish mortalities in Japan 总被引：2，自引：0，他引：2
Nomoto R Munasinghe LI Jin DH Shimahara Y Yasuda H Nakamura A Misawa N Itami T Yoshida T 《Journal of fish diseases》2004,27(12):679-686
A Lancefield serological group C Streptococcus sp. was isolated from cultured amberjack, Seriola dumerili Risso, and yellowtail, Seriola quinqueradiata Temminck and Schlegel, immunized with Lactococcus garvieae commercial vaccines in Japan. The isolated bacteria were Gram-positive cocci, auto-aggregating in saline, morphologically long chains in growth medium, catalase negative and alpha-haemolytic on blood agar. An almost complete gene sequence of the 16S rDNA of two isolates was determined and compared with that of bacterial strains in the database. The isolates were identified as Streptococcus dysgalactiae based on the results of the 16S rDNA sequence, the bacteriological properties and the Lancefield serological grouping. Oligonucleotide primers specifically designed for the 16S-23S rDNA intergenic spacer region of S. dysgalactiae amplified a gene from all the fish isolates, as well as the type strains alpha-haemolytic S. dysgalactiae subsp. dysgalactiae ATCC430738 and beta-haemolytic S. dysgalactiae subsp. equisimilis ATCC35666, but not those of S. equi ATCC33398, Lactococcus garvieae ATCC43921 and L. garvieae KG9408. The severe necrotic lesions of the caudal peduncle seen in experimentally infected fish were similar to those seen in naturally infected fish. 相似文献
18.
ENU诱变草鱼及其雌核发育后代的微卫星遗传分析 总被引：1，自引：1，他引：0
为了获得雌核发育ENU诱变草鱼(Cetpharyngodon idellus)群体的相关遗传参数,实验采用Partec Cy Flow倍性分析仪测定ENU诱变草鱼群体(Q群体)和雌核发育ENU诱变草鱼群体(E群体)相对DNA含量分别为24.02和23.80,二者的DNA含量接近,均为二倍体。选取28个微卫星标记对Q群体和E群体多样性进行了检测。结果表明,E群体和Q群体的平均等位基因分别为3.7143、5.1786,平均有效等位基因分别为2.1857、4.0028,平均期望纯合度分别为0.5122、0.2814,平均期望杂合度分别为0.4878、0.7186,多态信息含量(PIC)平均值分别为0.4282、0.6606。从个体在微卫星位点的纯合率分析,在E群体中,每个个体的纯合度均小于1.00,说明没有完全纯合的个体。从每个微卫星位点在群体的纯合率分析,除了微卫星位点5476,HLJC118和HLJC81外,其他位点的纯合度以不同的速率得到明显的提高。综上所述,经过减数雌核发育方法,ENU诱变草鱼群体的各微卫星位点的纯合度以不同的速率得到提升,遗传多样性明显降低,此方法可以获得纯合度较高的雌核发育ENU诱变草鱼个体,为ENU诱变草鱼良种选育提供了重要的遗传数据资料。 相似文献
19.
Abstract – The influence of hydrologic cycle and trophic groups on the energy content of food was investigated for five fish species from a Central Amazonian floodplain area. Sampling was carried out monthly using gillnets of different mesh sizes immersed in water for 24 h. We examined the presence and absence of food in fish stomachs and those with food were analysed and their energy content determined. Amongst the trophic groups studied, the piscivores Acestrorhynchus falcirostris and Pygocentrus nattereri showed high numbers of empty stomachs throughout the sampling period and very high levels of energy density in their food, which may explain why they take food less frequently. On the other hand the invertivorous species Hemiodus sp. and Hoplosternum littorale and the herbivore Rhytiodus microlepis , need to take food very frequently. The energy of the piscivorous species' stomach contents was not significantly different during the hydrologic cycle, whereas the invertivore and herbivore varied significantly, showing a general tendency of high levels of energy during high waters. 相似文献
20.
缢蛏选优群体和全同胞家系早期生长性能的比较 总被引：2，自引：1，他引：1
为了比较缢蛏早期的生长性能,以乐清湾的优良群体子四代为亲本材料,分别建立了群体繁育组(QF)、群体选优组(QX)和27个全同胞家系(F1、F2、…F30),其中F18、F24和F28 3个家系由于幼虫死亡率过高而淘汰,全同胞家系建立采用单对配对的方法。对各实验组的受精率、D幼率、变态率、不同阶段的生长速度和规格大小等指标进行了分析。结果发现,各实验组受精率、D幼率、D形幼虫大小和变态率均无显著差异。不同发育阶段各实验组的个体大小、生长速率不同,群体选优组(QX)在幼虫发育的各个时期都显著大于群体繁育组(QF)。全同胞家系间存在着生长差异,其中家系F2、F7、F9、F13、F19壳长显著大于群体繁育组(QF);家系F5、F6、F14、F25、F27壳长显著小于群体繁育组(QF)。通过比较各家系和群体组早期的生长性能,筛选到优良群体和家系资料,为今后缢蛏良种的培育提供了理论基础和优良实践材料。 相似文献