共查询到20条相似文献，搜索用时 359 毫秒
1.
养殖大口黑鲈的遗传多样性分析 总被引：7，自引：0，他引：7
用RAPD技术分析了广东养殖大口黑鲈Micropterus salmoides 3个群体基因组DNA的多态性.结果表明:用12条随机引物对3个群体共88尾大口黑鲈的基因组DNA进行扩增,共获得了106个位点,平均每条随机引物扩增出8.8个位点;广州群体、顺德大良群体和顺德南水群体的多态位点比例分别为32.08%、33.02%和40.57%;Nei遗传多样性指数分别为0.1151、0.1176和0.1627;Shannon's遗传多样性指数分别为0.1708、0.1742和0.2378.这表明目前广东地区养殖大口黑鲈种质资源还具有一定的遗传多样性,但养殖群体的遗传多样性在降低,且具有不同程度的种质退化. 相似文献
2.
用RAPD技术对养殖的大口黑鲈M icropterus salm oides群体的遗传多样性进行了分析,即用20个随机引物对30个个体的基因组DNA进行PCR扩增,共扩增出2790条DNA片段,平均每个个体扩增出93条带。在检测到的93个位点中,多态位点数为49个,占52.7%,标记的分子量为0.2~3kb。个体间最大的遗传距离为0.4533,最小的遗传距离为0,其中有27个样品间的遗传距离较小(0.16~0),部分样品之间的遗传距离为0;有3个样品的遗传距离较大,表明大口黑鲈间的相似度较高,遗传多样性较少,但也有少数变异个体。30个个体的平均遗传距离为0.0796±0.1265,与胭脂鱼、黄颡鱼、鳑鮍、鲢、草鱼等其它淡水鱼类相比,它们的遗传多样性水平相仿。 相似文献
3.
太湖日本沼虾的遗传多样性分析 总被引：8，自引：0，他引：8
利用随机扩增多态DNA（RAPD）技术对太湖湖区不同水域（无锡、宜兴、苏州及湖州水域）野生日本沼虾群体进行基因组DNA的遗传多样性分析。在事先优化的条件下,试验从选用的50个随机引物中筛选出16个有效引物,共检测到117个清晰稳定的位点,大小为200bp～2000bp,其中92个位点具有多态性。四个群体的多态位点比例分别为49．57％、60．68％、53．85％、57．26％,杂合度为0．2077～0．2163,Shannon信息指数为0．2967-0．3053,群体间遗传分化指数Gst值为0．1644-0．2002。AMOVA分析结果显示,群体的遗传变异有16．67％是由群体间遗传变异引起的,显著性检验表明群体间遗传变异对总遗传变异影响显著。遗传距离显示四个群体有一定遗传分化,其中苏州和宜兴群体间遗传距离最大（0．1481）,无锡与宜兴群体间遗传距离最小（0．1141）。利用UPGMA进行聚类分析表明,无锡与宜兴群体首先聚在一起,湖州与苏州群体随后聚在一起,再与无锡、宜兴群体聚在一起。 相似文献
4.
利用随机扩增多态DNA（RAPD）技术对太湖湖区不同水域（无锡、宜兴、苏州及湖州水域）野生日本沼虾群体进行基因组DNA的遗传多样性分析。在事先优化的条件下,试验从选用的50个随机引物中筛选出16个有效引物,共检测到117个清晰稳定的位点,大小为200bp～2000bp,其中92个位点具有多态性。四个群体的多态位点比例分别为49．57％、60．68％、53．85％、57．26％,杂合度为0．2077～0．2163,Shannon信息指数为0．2967-0．3053,群体间遗传分化指数Gst值为0．1644-0．2002。AMOVA分析结果显示,群体的遗传变异有16．67％是由群体间遗传变异引起的,显著性检验表明群体间遗传变异对总遗传变异影响显著。遗传距离显示四个群体有一定遗传分化,其中苏州和宜兴群体间遗传距离最大（0．1481）,无锡与宜兴群体间遗传距离最小（0．1141）。利用UPGMA进行聚类分析表明,无锡与宜兴群体首先聚在一起,湖州与苏州群体随后聚在一起,再与无锡、宜兴群体聚在一起。 相似文献
5.
长江口日本鳗鲡群体遗传多样性RAPD初步分析 总被引：5，自引：0，他引：5
对2005年采集自长江口地区4个采样点、5批、共10尾性成熟前成鳗、82尾玻璃鳗的日本鳗鲡样本的遗传多样性进行了RAPD分析。在51条随机引物中筛选出具有稳定扩增、条带清晰的多态性引物16条，16条引物共检测到132个位点，其中多态位点114个（86．36％）。五个采样群体各自的平均杂合度（Hc）在0．2053～0．3150之间，平均基因多样性指数（Ho）在0．2974～0.4526之间；采样群体两两间的遗传分化指数几，在0．0508～0．1524之间。群体内遗传变异和群体间遗传变异对群体总遗传变异的贡献率分别为79．18％和20．82％；Nei的遗传距离在0．0593～0．1425之间；在玻璃鳗采样群体间未发现遗传差异同采样地点及月份有何显著关系，显示它们可能同属一个大混合群体。而遗传距离、遗传分化指数及NJ树分析结果一致表明：成鳗和玻璃鳗之间可能存在相当的遗传距离和遗传分化。 相似文献
6.
对2005年采集自长江口地区4个采样点、5批、共10尾性成熟前成鳗、82尾玻璃鳗的日本鳗鲡样本的遗传多样性进行了RAPD分析。在51条随机引物中筛选出具有稳定扩增、条带清晰的多态性引物16条，16条引物共检测到132个位点，其中多态位点114个（86．36％）。五个采样群体各自的平均杂合度（Hc）在0．2053～0．3150之间，平均基因多样性指数（Ho）在0．2974～0.4526之间；采样群体两两间的遗传分化指数几，在0．0508～0．1524之间。群体内遗传变异和群体间遗传变异对群体总遗传变异的贡献率分别为79．18％和20．82％；Nei的遗传距离在0．0593～0．1425之间；在玻璃鳗采样群体间未发现遗传差异同采样地点及月份有何显著关系，显示它们可能同属一个大混合群体。而遗传距离、遗传分化指数及NJ树分析结果一致表明：成鳗和玻璃鳗之间可能存在相当的遗传距离和遗传分化。 相似文献
7.
德宏水牛和摩拉水牛及杂交后代的遗传差异分析* 总被引：1，自引：0，他引：1
为了解德宏水牛、摩拉水牛及二者杂交后代之间的遗传差异,本研究采用随机扩增多态性DNA标记技术,从70个随机引物中筛选出11个多态性丰富的引物对德宏水牛、摩拉水牛及二者杂交后代共80个个体进行了遗传变异检测,结果11条引物共产生89种扩增片段,多态片段73条,多态率82.02%。两亲本群体相对遗传距离为 0.220 3 ,杂交后代群体与德宏水牛、摩拉水牛群体的相对遗传距离分别为 0.101 7 和 0.135 3 ,表明杂交后代群体与两亲本群体间的遗传差异小于两亲本群体间的遗传差异,杂交后代群体与德宏水牛群体遗传关系更接近。 相似文献
8.
鳜野生群体与养殖群体的RAPD分析 总被引：13，自引：0，他引：13
用60个随机引物对鳜Siniperca chuatsi Basilewsky野生群体和养殖群体进行随机扩增多态DNA(RAPD)分析,经过引物筛选,分别用55个和54个引物对野生鳜和养殖鳜进行群体内分析。结果表明,野生群体多态位百分率为85．75％,群体内遗传相似率和遗传距离分别为0．8547和0．1453;养殖群体多态位百分率为16．39％,遗传相似率和遗传距离分别为0．9527和0．0473;两群体间遗传相似率和遗传距离分别为0．6905和0．3095;鳜野生群体具有较高的遗传多样性,养殖群体的遗传多样性却显著降低,野生群体与养殖群体间有明显的遗传差异,说明人工繁育对鳜基因组造成了显著的影响。 相似文献
9.
采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对取自大连、盘锦、东营、天津的4个地理种群的褶皱臂尾轮虫Brachionus plicatilis的遗传多样性进行了研究。在优化的RAPD反应条件下,对30个10 bp的引物进行了PCR扩增,其中26条引物所得的扩增带带型清晰且重复性好,共检测出311个位点,片段长度为190~2 000 bp。根据4个种群之间的片段共享度和Ne i的平均遗传距离得知,大连与天津种群的遗传距离最大,盘锦与天津种群之间的遗传距离最小。由UPGMA聚类可得:盘锦种群与天津种群聚在一起,然后与东营种群聚在一起,最后与大连种群聚在一起。 相似文献
10.
《西南农业学报》2016,(6)
采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术,研究了四川省甘孜州地区蝗虫的遗传结构。用筛选出的12条随机引物对9个种群91个个体进行扩增。结果表明,12条引物共检测到95个位点,其中多态位点共计72个。Shannon信息指数(I)和Nei's遗传多样性(H)估计的9个种群的遗传多样性水平分别是0.4161和0.2810。利用Nei's基因多样性指数进行群体内遗传多样性评价,Shannon多样性指数(I)具有相同的结果,来自四川甘孜雅县雅江(YJGL)种群值最高,为0.1674,白玉县金沙乡(BYJS)种群最低为0.0405;居群内基因多样度Hs为0.0777,表明遗传变异主要存在于居群间。基因分化系数Gst为0.7255,表明居群内的遗传变异小,群间有较大的遗传变异。用NJ法对Nei's遗传距离作聚类分析,构建分子系统树,在0.765水平上,可将9个地区的蝗虫种群完全分开,理塘县的雄坝乡汉戈村和甲洼乡俄曲村蝗虫与东亚飞蝗关系较为密切。群内的遗传距离都小于地理上的遗传距离。 相似文献
11.
[目的]探讨我国不同地区福寿螺的遗传多样性和遗传结构。[方法]应用ISSR分子标记技术对我国江苏苏州、福建漳州、广东珠海3个不同地理群体福寿螺的遗传多样性和遗传结构进行了分析。[结果]从77个ISSR引物中筛选出3个引物对福寿螺3个群体60个样品进行扩增,得到33个清晰的扩增位点,多态位点为31个。江苏、福建和广东3个福寿螺群体的Shannon′s指数分别为0.353 6、0.424 70、.279 6,由此分析,其遗传变异主要来自于群体内个体间。福寿螺UPGMA聚类图显示,广东群体和福建群体首先聚在一起,再与江苏群体聚类。3个群体的遗传多样性处于相同水平上,且遗传多样性高低依次为福建群体>江苏群体>广东群体。[结论]3个地区福寿螺群体产生一定的遗传分化,表明福寿螺具有广适性的遗传特性。 相似文献
12.
从50条随机引物中筛选出10条有效引物,采用RAPD技术对蒙自响水河和草坝的2个鲤鱼群体进行遗传多样性分析。结果表明:在2个群体中分别检测到47、53个位点,多态位点分别为44、51个,平均多态位点比例分别为93.61%和96.23%;利用Popgene version1.32软件分析获得2个鲤鱼群体Shannon信息指数(I)分别为0.479 9和0.455 7,Nei's基因多样性指数(H)分别为0.328 7和0.298 4,等位基因观察数(Na)分别为1.821 4和1.910 7,有效等位基因数(Ne)分别为1.584 3和1.487 9,群体间的遗传相似性系数为0.958 1,遗传距离为0.041 9。2个鲤鱼群体间的遗传分化系数Gst为0.082 4,表明群体间的遗传变异占总的遗传变异的8.24%,群体内的遗传变异占总变异的91.76%。 相似文献
13.
14.
[目的]利用RAPD技术对草鱼、鲢鱼和鲫鱼群体遗传变异进行初步研究。[方法]用20种10 bp长的随机引物对草鱼、鲢鱼和鲫鱼进行RAPD-PCR扩增,从20种引物扩增出来的DNA条带中筛选条带清晰的6种引物,分析这3种鱼的遗传变异。[结果]结果表明:草鱼与鲢鱼的RAPD指纹图谱带型差别不明显,草鱼与鲢鱼、鲫鱼品种间的带纹相似系数分别为0.375和0.416,遗传距离分别为0.625和0.584;鲢鱼与鲫鱼品种间带纹相似系数为0.366,遗传距离为0.634。[结论]RAPD是一种非常灵敏的种间鉴定技术,特别是对鱼种类的鉴定有重要意义。 相似文献
15.
应用RAPD技术对东北地区白桦种源遗传变异的分析 总被引：7，自引：0，他引：7
用随机扩增多态DNA（RAPD）分子标记方法对白桦13个种源115个个体进行了遗传变异的比较分析。通过14个随机引物扩增共检测到233个位点。各种源多态位点百分率差异明显，在20.17%-32.19%之间，多态位点百分率最高的是帽儿山种源和清源种源，最低的是绰尔种源。遗传变异在大兴安岭、小兴安岭和长白山3个区域间占23.88%，种源间遗传变异占27.99%，种源内个体间遗传变异占48.13%。根据种源间的遗传距离，构建了白桦13个种源的遗传关系聚类图，结果大兴案岭地区的白桦和源聚为一类，小兴安岭、张广才岭、完达山和长白山分布区的白桦种源聚为另一类。同时，根据地理气候因子和遗传距离对白桦13个种源进行了种源区的划分，为种子调拨提供了依据。 相似文献
16.
松江鲈群体遗传多样性的AFLP分析 总被引：2，自引：0，他引：2
利用AFLP分子标记技术对辽宁鸭绿江水域丹东段和河北秦皇岛渤海海域两个松江鲈Trachidemusfasciatus群体的遗传多样性进行分析研究.结果表明:用6对选择性引物,从两个群体的63个个体共扩增出360个位点,多态位点214个;松江鲈丹东和秦皇岛两群体的多态位点比率为50.28%、50.00%,平均杂合度和Shannon's指数分别为0.1690、0.1733和0.2534、0.2592,说明两个群体遗传多样性在同一水平上;Shannon's指数和AMOVA分析均显示松江鲈的遗传变异主要来自于群体内个体间,而群体间无明显的遗传分化;松江鲈UPGMA系统树没有依据群体分别聚类,未出现明显分支,无明显遗传差异;群体的显性基因型频率分布显示两个群体的遗传结构相似. 相似文献
17.
利用RAPD技术对管角螺（Hemifusus tuba Gmelin）4个自然群体（广西北海、广东湛江、浙江温州、江苏连云港）的遗传多样性进行了分析。所选择的19条有效引物在4个自然群体200个个体中总共产生182个扩增片段,片段数量为19 983个,片段大小在250~2 500 bp之间。其中每条引物可产生4~17条带,平均5.28个位点。4个自然群体共检测到149个多态位点,多态位点比例为81.87%,其中北海群体的多态位点比例最高,占66.48%,其次是湛江群体为47.25%,温州群体为44.51%,连云港群体为36.81%。4个群体中均未检测到各群体特有的扩增带。4个自然群体管角螺的Nei’s指数和Shannon指数表现为一致性,表明遗传多样性在4个自然群体的大小为北海群体>湛江群体>温州群体>连云港群体。4个自然群体的遗传距离在0.054 2~0.137 4之间。基于群体间遗传距离的值进行聚类分析,结果表明, 4个群体中,北海与湛江群体首先聚在一起,温州与连云港群体随后聚在一起,最后4个群体聚在一起。 相似文献
18.
日本沼虾4个地理群体遗传变异的RAPD分析 总被引：4，自引：0，他引：4
采用随机扩增多态DNA（RAPD）技术对取自六安、龙感湖、淮南和高淳等4个地理群体的日本沼虾（Macrobrachium nipponense）各30个个体进行遗传多样性分析。在事先优化的反应条件下。所使用的OPP、OPX2个系列40个随机引物中，有16个引物扩增出清晰稳定的片断。共产生173个位点。大小在250～2000bp，利用PopGen1．32进行分析，日本沼虾多态位点为75个（多态性片断的比例为43．4％），Shannon信息指数为0．1771～0．2466。遗传距离显示日本沼虾群体间有一定遗传分化。其中高淳群体和龙感湖群体之间遗传距离最大（0．1712）．六安群体和淮南群体之间最小（0．1146）。用UPGMA对4个地理群体进行聚类分析，六安和淮南群体首先聚在一起。高淳和龙感湖群体最后。 相似文献
19.
张雷 《上海海洋大学学报》2007,(6):524-530
利用RAPD标记技术对罗氏沼虾缅甸引进群体和浙江本地群体及其一对一杂交产生的F1的分离方式进行了研究,并分析了双亲及F1的遗传结构。结果显示,50个RAPD随机引物中有9个可扩增出多态性位点,共产生47个位点,其中22个有多态性,占总位点的46.8%;9个位点可用于遗传连锁作图;13个为偏分离位点,1个为异常分离位点。克隆分析该异常分离位点发现,其大小为707 bp,与已知序列同源性极低。父母本之间的遗传距离为0.185 7,双亲与F1间的距离分别为0.158 2和0.107 3。以上结果表明,F1群体可以作为作图群体应用于罗氏沼虾遗传图谱的构建。 相似文献
20.
张雷 《上海水产大学学报》2007,16(6):524-530
利用RAPD标记技术对罗氏沼虾缅甸引进群体和浙江本地群体及其一对一杂交产生的F1的分离方式进行了研究,并分析了双亲及F1的遗传结构。结果显示,50个RAPD随机引物中有9个可扩增出多态性位点,共产生47个位点,其中22个有多态性,占总位点的46.8%;9个位点可用于遗传连锁作图;13个为偏分离位点,1个为异常分离位点。克隆分析该异常分离位点发现,其大小为707 bp,与已知序列同源性极低。父母本之间的遗传距离为0.185 7,双亲与F1间的距离分别为0.158 2和0.107 3。以上结果表明,F1群体可以作为作图群体应用于罗氏沼虾遗传图谱的构建。 相似文献