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1.
利用PCR-RFLP技术对中国荷斯坦奶牛、三河牛和中国西门塔尔牛3个奶牛品种207头个体的TLR2基因进行多态性分析。结果表明:3个奶牛群体的扩增片段为448bp,PCR产物经限制性内切酶EcoRⅤ酶切后均表现出中度多态,其中中国西门塔尔牛PIC为最高,且3个奶牛品种在该基因座位均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。最小二乘值表明:该酶切多态位点对3个奶牛品种SCS的影响达到了显著水平(P<0.05),且BB基因型个体的SCS显著低于AA和AB基因型个体(P<0.05),说明BB基因型为抗乳房炎的有利基因型。 相似文献
2.
核转录因子NF-κB与动物机体的炎症反应、免疫应答、细胞分化和凋亡等密切相关,而Toll样受体(TLR)通过对侵入机体的病原微生物的抗原识别和信号转导,在NF-κB介导的炎症和免疫应答反应中发挥着重要作用。本研究在新疆褐牛和荷斯坦牛隐性乳房炎调查和TLR4外显子3+2021位点(E3+2021)SNP基因型与隐性乳房炎相关性研究的基础上,分析和比较了E3+2021 SNP位点3种不同基因型奶牛个体NF-κB信号通路上9个基因(NFκB1、NFκB2、RelA、c-Rel、RelB、IKKα、IKKβ、IKKγ和IκBα基因)转录水平的差异。结果显示,在BB基因型中,NFκB1和IKKα基因的mRNA转录水平在新疆褐牛与荷斯坦牛品种间差异显著(P0.05),RelA、RelB、IKKβ、IKKγ和IκBα基因mRNA转录水平在品种间差异极显著(P0.01)。在AB基因型中,IκBα基因mRNA转录水平在品种间差异显著(P0.05)。在对新疆褐牛的研究中发现,RelB、IKKγ和IκBα基因mRNA转录水平在AB和BB两种基因型间差异显著(P0.05);而在荷斯坦牛检测的9个基因的mRNA转录水平在AB和BB两种基因型间差异均不显著。因此,Toll样受体信号转导通路下游NFκB1、RelA、IKKβ、IKKγ和IκBα基因的mRNA转录水平在品种间的变化,可能与新疆褐牛乳汁中体细胞数(SCS)显著低于荷斯坦牛相关。在新疆褐牛中,RelB、IKKγ和IκBα基因mRNA转录水平的变化可能是AA基因型SCS显著高于AB基因型的原因之一。 相似文献
3.
利用PCR-RFLP方法检测TLR2基因在297头中国荷斯坦牛中的多态性,并分析其多态性与体细胞评分(SCS)的相关性.结果显示,TLR2基因exon2扩增片断的109 bp处产生C→A的突变,并导致天冬氨酸改变为谷氨酸.TLR2基因exon2被EcoRV消化后表现多态性,表现AA、AB、BB 3种基因型,其中B等位基因为优势等住基因,等位基因频率为0.784 5,而A等位基因频率则为0.215 5.经X2适合性检验,中国荷斯坦牛在该位点达到Hardy-Weinberg平衡状态.同时,群体EcoRV基因座不同基因型与SCS相关分析的结果表明,BB、AB型个体的SCS指标显著高于AA型(P<0.05),AA基因型可作为乳腺炎抗性的有利基因型,可将TLR2作为奶牛乳腺炎候选基因,应用于乳腺炎抗性分子标记辅助选择育种. 相似文献
4.
奶牛TLR2基因遗传变异与乳房炎体细胞评分的相关研究 总被引：9，自引：0，他引：9
选用中国荷斯坦奶牛、三河牛和中国西门塔尔牛共207头奶牛为研究对象,采用PCR-RFLP和创造酶切位点RFLP（CRS-RFLP）技术对其TLR2基因进行多态性研究,发现TLR2基因第2外显子上T/G,G/A和G/A 3个突变,分别是EcoRⅤ,HaeⅢ和HhaⅠ限制性内切酶的酶切多态位点,其中T/G突变引起蛋白质氨基酸天冬氨酸/谷氨酸的变化。对3个酶切多态位点进行基因型分析,χ^2检验表明：中国荷斯坦奶牛、三河牛和中国西门塔尔牛在3个酶切多态位点都达到了Hardy-Weinberg平衡。中国西门塔尔牛在3个酶切多态位点PIC为最高。运用SAS9.0软件,采用最小二乘拟合一般线性模型分析了3个酶切多态位点与中国荷斯坦奶牛、三河牛和中国西门塔尔牛体细胞评分（SCS）的关系,结果表明：在这3个酶切多态位点中,只有EcoRⅤ酶切多态位点BB基因型个体的SCS显著低于AA和AB基因型个体（P〈0.05）,说明BB基因型可能为抵御乳房炎的有利基因型。 相似文献
5.
核转录因子NF-κB与动物机体的炎症反应、免疫应答、细胞分化和凋亡等密切相关,而Toll样受体（TLR）通过对侵入机体的病原微生物的抗原识别和信号转导,在NF-κB介导的炎症和免疫应答反应中发挥着重要作用。本研究在新疆褐牛和荷斯坦牛隐性乳房炎调查和TLR4外显子3 +2021 位点（E3+2021）SNP基因型与隐性乳房炎相关性研究的基础上,分析和比较了E3+2021 SNP位点3种不同基因型奶牛个体NF-κB信号通路上9个基因(NFκB1、NFκB2、RelA、c-Rel、RelB、IKKα、IKKβ、IKKγ和IκBα基因)转录水平的差异。结果显示,在BB基因型中,NFκB1和IKKα基因的mRNA转录水平在新疆褐牛与荷斯坦牛品种间差异显著（P＜0.05）,RelA、RelB、IKKβ、IKKγ和IκBα基因mRNA转录水平在品种间差异极显著（P<0.01）。在AB基因型中,IκBα基因mRNA转录水平在品种间差异显著（P＜0.05）。在对新疆褐牛的研究中发现,RelB、IKKγ和IκBα基因mRNA转录水平在AB和BB两种基因型间差异显著（P＜0.05）;而在荷斯坦牛检测的9个基因的mRNA转录水平在AB和BB两种基因型间差异均不显著。因此,Toll样受体信号转导通路下游NFκB1、RelA、IKKβ、IKKγ和IκBα基因的mRNA转录水平在品种间的变化,可能与新疆褐牛乳汁中体细胞数（SCS）显著低于荷斯坦牛相关。在新疆褐牛中,RelB、IKKγ和IκBα基因mRNA转录水平的变化可能是AA基因型SCS显著高于AB基因型的原因之一。 相似文献
6.
本研究旨在阐明Toll样受体6(TLR6)基因的多态性与荷斯坦母牛乳房炎抗性之间的关系.采用PCR-SSCP和PCR-RFLP技术检测208头荷斯坦母牛TLR6基因多态性,用最小二乘法分析该基因多态性与荷斯坦母牛钵细胞评分(somatic cell score,SCS)的关系.结果发现,TLR6基因mRNA序列中存在T853A、G855A、G1793A、C1859A、G1934A和A1980G 6个多态位点,其中T853A突变使编码氨基酸由缬氨酸变为谷氨酸,G855A突变使天冬氨酸变为天冬酰胺,A1980G突变使异亮氨酸变为缬氨酸.T853A和G855A突变位点经SSCP检测发现3种基因型AA、AB和BB,其频率分别为0.308、0.490和0.202;X~2检验表明荷斯坦母牛在该位点处于Hardy-Weinberg平衡;BB基因型SCS最小二乘均值极显著低于AB和AA基因型所对应的值(P<0.01);AB基因型SCS最小二乘均值极显著低于AA基因型所对应的值(P<0.01).G1793A突变位点经BsiY Ⅰ酶切产生2种基因型CC和CD,其频率分别为0.332和0.668;荷斯坦母牛在该位点偏离了Hardy-Weinberg平衡,CC和CD基因型SCS最小二乘均值差异不显著(P>0.05).C1859A突变位点经BstX Ⅰ酶切产生2种基因型EE和EF,其频率分别为0.178和0.822;荷斯坦母牛在该位点偏离了Hardy-Weinberg平衡;EE和EF基因型SCS最小二乘均值差异不显著(P>0.05).G1934A突变位点经BsiY Ⅰ酶切产生2种基因型GG和GH,其频率分别为0.356和0.644;荷斯坦母牛在该位点偏离了Hardy-Weinberg平衡;GG和GH基因型SCS最小二乘均值差异不显著(P>0.05).A1980G突变位点经Bcl Ⅰ酶切产生3种基因型II、IJ和JJ,其频率分别为0.260、0.567和0.173,荷斯坦母牛在该位点处于Hardy-Weinberg平衡;JJ基因型SCS最小二乘均值极显著低于IJ和II基因型所对应的值(P<0.01);IJ基因型SCS最小二乘均值极显著低于II基因型所对应的值(P<0.01).对于奶牛乳房炎抗性,BB和JJ是有利基因型,AA和II是不利基因型.本研究结果初步表明TLR6基因T853A和G855A突变位点的B等位基因以及A1980G突变位点的J等位基因是提高奶牛乳房炎抗性的2个潜在的DNA标记. 相似文献
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利用PCR-RFLP技术对中国荷斯坦奶牛、三河牛和中国西门塔尔牛3个奶牛品种207头个体的TLR2基因进行多态性分析.结果表明：3个奶牛群体的扩增片段为448 bp,PCR产物经限制性内切酶EcoRV酶切后均表现出中度多态,其中中国西门塔尔牛PIC为最高,且3个奶牛品种在该基因座位均处于Hardy-Weinberg平衡状态（P＞0.05）.最小二乘值表明：该酶切多态位点对3个奶牛品种SCS的影响达到了显著水平（P＜0.05）,且BB基因型个体的SCS显著低于AA和AB基因型个体（P＜0.05）,说明BB基因型为抗乳房炎的有利基因型. 相似文献
8.
试验旨在研究中国荷斯坦牛Toll样受体4(toll-like receptor 4,TLR4)基因的遗传多态性及其与体细胞评分(somatic cell score,SCS)的关联性,寻找与乳房炎相关的分子标记,加快中国荷斯坦牛的抗病育种。利用PCR-RFLP和PCR-SSCP技术对30个公牛家系的610头中国荷斯坦牛TLR4基因进行多态性检测,用最小二乘均数法对TLR4基因的多态位点与SCS进行相关分析。结果发现,试验共检测到2个单核苷酸多态(single nucleotide polymorphisms,SNPs),TLR4基因5'侧翼区存在SNP -226 G>C突变,经PCR-RFLP检测发现3种基因型:GG、GC和CC,基因型频率分别为0.208、0.482和0.310;外显子3存在SNP 1760 C>T突变,经PCR-SSCP检测发现3种基因型:CC、TC和TT,基因型频率分别为0.738、0.225和0.007,以上2位点均偏离Hardy-Weinberg 平衡。对于SNP -226 G>C位点,基因型个体的SCS差异不显著;对于SNP 1760 C>T位点,CC基因型个体的SCS最小二乘均值极显著低于TT和TC基因型个体(P<0.01)。SNP 1760 C>T的CC基因型对于中国荷斯坦牛的SCS有较大的遗传效应,可作为分子标记应用于奶牛乳房炎抗性筛选。 相似文献
9.
研究旨在分析生长激素受体(GHR)基因外显子10的多态性及其与奶牛产奶性状的相关性。选用30头草原红牛与145头中国荷斯坦牛为材料,采用PCR-RFLP的方法对该基因外显子多态性进行分析,并对突变位点用SPSS软件分析其与产奶性状的相关性。结果表明:GHR基因外显子10的扩增产物被限制性酶BsaH I酶切消化后表现出多态性,经电泳检测显现AA、AB、BB 3种不同的基因型。使用SPSS软件对所得基因型与产奶性状进行相关性分析发现,在中国荷斯坦牛群体中,AA型个体乳脂率显著高于BB型(P<0.05),AA型个体的体细胞数显著低于AB型个体(P<0.05),AA型为优势基因型,等位基因A可显著提高个体的乳脂率,降低个体体细胞数,为中国荷斯坦牛的早期选种选育、改善乳品质提供依据。 相似文献
10.
《黑龙江畜牧兽医》2016,(20)
乳房炎抗性的遗传选择已成为抗病育种的新措施,对现代畜牧业预防疾病具有重要的意义,可以永久地改变群体遗传组成,长期有效地控制疾病的发生。笔者采用Sequenom SNP分型测序方法对宁夏地区764头中国荷斯坦奶牛的EEF1D和TRAPPC9基因进行单核苷酸多态性分析,并研究不同基因型与体细胞评分(SCS)关联性。结果表明:EEF1D-3位点有GG、AA和GA 3种基因型,其基因型频率分别为0.58,0.04,0.38;TRAPPC9-2525852位点有GG、TT和GT 3种基因型,其基因型频率分别为0.18,0.30,0.52;2个位点均偏离Hardy-Weinberg平衡状态且处于中度多态;平均小于5,其中EEF1D-3位点中GA基因型SCS最低为3.95;TRAPPC9-2525852位点中TT基因型SCS最低为3.91,即该地区中国荷斯坦奶牛均为健康牛。不同基因型与SCS关联性分析表明,基因型个体的SCS差异不显著(P0.05)。 相似文献
11.
This study aims to identify single nucleotide polymorphisms (SNPs) and haplotypes in the TLR2 gene, and analyze the association of SNPs or haplotypes and somatic cell scores in 151 Xinjiang Brown cattle and 138 Holsteins to evaluate the role of TLR2 during intramammary infections. TLR2 coding region was amplified by PCR and screened for SNP sequencing. Genotypes and frequencies of SNPs were identified. Finally, the associations of genotypes or haplotypes and somatic cell scores (SCS) were analyzed. The results showed that: (i) 15 SNPs (E+653, E+945, E+978, E+1010, E+1250, E+1688, E+1707, E+1779, E+1782, E+1891, E+1995, E+2025, E+2055, E+2214 and E+2295) were observed and detected from 289 cows; (ii) distribution of the 14 SNPs were significantly different from Xinjiang Brown cattle and Holstein (P < 0.001) except for the E+945 (P > 0.05); (iii) in 11 SNPs (E+945, E+978, E+1010, E+1688, E+1707, E+1779, E+1782, E+1995, E+2025, E+2055 and E+2214), the SCS of AB genotype was lower than AA (P < 0.05) in Xinjiang Brown cattle; and (iv) haplotypes composed of the above‐mentioned 11 SNPs were constructed. The SCS of cattle with Hap5 was lower than that of Hap3 (P < 0.05). This suggests that Hap5 might play an important role in sub‐mastitis resistance in Xinjiang Brown cattle. 相似文献
12.
利用基因测序技术对CXCR2基因进行了多态性筛查,结果发现存在+612A→G、+684G→A、+777G→C、+855G→A、+858C→A和+861G→A等6个突变位点,其中+855为新发现的SNP。6个位点都处于连锁不平衡状态,+684与+861位点之间和+777与+858之间的相关程度高(r2分别为0.635和0.541)。基因效应模型分析表明:+855和+861位点不同基因型对奶牛体细胞评分的影响没有显著性差异(P0.05)。+612位点不同基因型对体细胞评分的影响具有显著性差异(P0.05),AA基因型个体的体细胞评分最低为4.19,乳房炎抗性最强。+777位点不同基因型对体细胞评分的影响差异性显著(P0.05),GG基因型个体体细胞评分最低为4.17,对乳房炎的抗性较强,说明该基因+612和+777SNPs可作为奶牛乳房炎抗性分子标记位点。 相似文献
13.
根据人和小鼠TLR2基因序列设计了特异性PCR引物,优化PCR条件后扩增到中国梅山猪、欧洲约克夏猪、PIC-2系及PIC-3系商品猪的TLR2基因690 bp的基因片段,并对其进行序列分析。序列分析结果显示,猪TLR2基因多态性程度低,发现在猪TLR2基因编码区第1 255位点上存在1个单碱基突变位点。利用双向特定等位基因PCR扩增法(B i-PASA)建立了检测猪TLR2基因变异的遗传标记。利用猪TLR2基因的B i-PASA标记,分析了TLR2基因在大河乌猪、撒坝猪和黔邵花猪中的基因频率和多态性。研究建立的B i-PASA遗传标记和基因变异信息,将为进一步分析猪TLR2基因变异与疾病抵抗力及经济性状的相关分析提供基础资料。 相似文献
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用PCR-SSCP方法检测猪Toll样受体4(TLR4)基因外显子3的SNP 总被引：1，自引：0，他引：1
Toll样受体(TLRs)能识别各种微生物成分并诱导免疫反应。作为TLR家族中一员的TLR4是识别革兰氏阴性菌内毒素-脂多糖(LPS)的主要受体,其多态性与动物对相关病原的免疫力有着明显的相关性。本文利用PCR-SSCP并结合PCR产物双向测序的方法,对梅山猪、新淮猪、大白猪、长白猪和杜洛克猪共203个样本TLR4基因外显子3部分片段的单核苷核多态性进行了研究。结果检测到了5个SNP,分别是T611A,G826A,G960A,G962A和C1027A,其中有4个非同义的SNP,有2个SNP的氨基酸性质发生了改变。猪TLR4的SNP出现频率在各猪种中有差异,其中T611A仅在新淮猪和大白猪中检测到,而G826A和C1027A仅分别在新淮猪和大白猪中检测到。 相似文献
15.
ABSTRACT: Bovine mastitis remains the most common and costly disease of dairy cattle worldwide. A complementary control measure to herd hygiene and vaccine development would be to selectively breed cattle with greater resistance to mammary infection. Toll-like receptor 1 (TLR1) has an integral role for the initiation and regulation of the immune response to microbial pathogens, and has been linked to numerous inflammatory diseases. The objective of this study was to investigate whether single nucleotide polymorphisms (SNPs) within the bovine TLR1 gene (boTLR1) are associated with clinical mastitis (CM).Selected boTLR1 SNPs were analysed within a Holstein Friesian herd. Significant associations were found for the tagging SNP -79 T > G and the 3'UTR SNP +2463 C > T. We observed favourable linkage of reduced CM with increased milk fat and protein, indicating selection for these markers would not be detrimental to milk quality. Furthermore, we present evidence that some of these boTLR1 SNPs underpin functional variation in bovine TLR1. Animals with the GG genotype (from the tag SNP -79 T > G) had significantly lower boTLR1 expression in milk somatic cells when compared with TT or TG animals. In addition, stimulation of leucocytes from GG animals with the TLR1-ligand Pam3csk4 resulted in significantly lower levels of CXCL8 mRNA and protein.SNPs in boTLR1 were significantly associated with CM. In addition we have identified a bovine population with impaired boTLR1 expression and function. This may have additional implications for animal health and warrants further investigation to determine the suitability of identified SNPs as markers for disease susceptibility. 相似文献
16.
以189头荷斯坦奶牛为研究对象,对FcRn受体α链基因(FCGRT)启动区采用PCR-SSCP方法进行多态性检测。结果表明,FCGRT基因启动区在P1、P2和P3引物扩增片段中存在PCR-SSCP多态性,位于引物P1扩增产物有AA、AB、BB3种基因型,其频率分别为25.40%、59.26%、15.34%;引物P2扩增产物有CC、CD、DD3种基因型,其频率分别为20.63%、56.61%、22.75%;引物P3扩增产物有EE、EF、FF3种基因型,其频率分别为1.59%、12.17%、86.24%。经克隆测序分析,在3个片段上分别发生了T→C、C→A、G→T的碱基序列突变。经χ2适合性检验,除SNP1外,荷斯坦奶牛在该基因位点上的SNP2和SNP3均处于Hardy-Weinberg平衡状态。 相似文献
17.
Muneta Y Minagawa Y Kusumoto M Shinkai H Uenishi H Splichal I 《The Journal of veterinary medical science / the Japanese Society of Veterinary Science》2012,74(5):553-559
In the present study, we have developed an allele-specific primer-polymerase chain reaction (ASP-PCR) for genotyping a single nucleotide polymorphism (SNP) of swine Toll-like receptor 2 (TLR2) (C406G), which is related to the prevalence of pneumonia caused by Mycoplasma hyopneumoniae. We also compared the allele frequency among several pig breeds of Japan and the Czech Republic. Allele-specific primers were constructed by introducing 1-base mismatch sequence before the SNP site. The swine TLR2 C406G mutation was successfully determined by the ASP-PCR using genomic DNA samples in Japan as previously genotyped by a sequencing method. Using the PCR condition determined, genomic DNA samples from pig blood obtained from 110 pigs from 7 different breeds in the Czech Republic were genotyped by the ASP-PCR. The genotyping results from the ASP-PCR were completely matched with the results from the sequencing method. The allele frequency of the swine TLR2 C406G mutation was 27.5% in the Czech Republic and 3.6% in Japan. The C406G mutation was only found in the Landrace breed in Japan, and was almost exclusively found in the Landrace breed in the Czech Republic as well. These results indicated the usefulness of ASP-PCR for detecting a specific SNP for swine TLR2. 相似文献
18.
为了探究猪Toll样受体（Toll-like receptor 5,TLR5） 基因表达水平与F18大肠杆菌抗性的关系,试验通过不同血清型产肠毒素大肠杆菌（F18ab和F18ac）侵染猪小肠上皮细胞（IPEC-J2）,同时通过脂多糖（LPS）分别诱导IPEC-J2细胞4和8 h,利用实时荧光定量PCR检测TLR5基因表达水平变化,并利用Western blotting进行蛋白表达分析。结果显示,不同血清型大肠杆菌（F18ab和F18ac）菌体侵染IPEC-J2细胞后,TLR5基因表达水平均极显著上调（P<0.01）;LPS诱导IPEC-J2细胞4和8 h后,TLR5基因表达水平均极显著上调（P<0.01）,且在LPS诱导IPEC-J2细胞8 h后,TLR5基因表达水平明显高于诱导4 h。与对照组相比,细胞中TLR5蛋白的表达水平极显著上调（P<0.01）,与LPS诱导及F18大肠杆菌菌体刺激IPEC-J2细胞后mRNA表达水平结果相一致。本研究在细胞水平上分析了TLR5表达水平和F18大肠杆菌侵染的相关性,进一步证实猪TLR5基因的表达水平在细胞抵抗F18大肠杆菌的侵染过程中发挥了重要的调控作用,为今后关于TLR5基因功能及其在大肠杆菌腹泻遗传育种应用的研究奠定基础。 相似文献