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对线粒体DNA的数目、大小、基本结构、多态性及其研究方法、遗传特性等方面进行了论述,并进一步阐述了线粒体DNA的多态性在家畜遗传育种中的应用现状。 相似文献
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提取秦川牛血液DNA样品,PCR扩增后,通过非变性PAGE电泳获得基因型,然后进行测序确定微卫星的基因型,研究Y-STR微卫星位点UMN0929、UMN0108、UMN0920I、NRA124、UMN2404、UMN0103在秦川牛群体中的遗传多态性。结果发现,176头无亲缘关系的秦川牛,公牛中在6个Y-STR基因座均有遗传多态。UMN0929、UMN0108、UMN0920、INRA124、UMN2404、UMN0103的等位基因数分别为4、5、2、2、5和4,其等位基因频率分别为0.14、0.57、0.18、0.11,0.10、0.10、0.35、0.35、0.10,0.25、0.75,0.24、0.76,0.10、0.35、0.33、0.12、0.10,0.17、0.14、0.35、0.34;基因多样性分别为0.61、0.73、0.38、0.36、0.73、0.71;共发现了51种单倍型,单倍型多样性为0.94。表明UMN0929、UMN0108、UMN0920、INRA124、UMN2404和UMN0103 6个微卫星位点在秦川牛群体中有遗传多态性,在秦川牛的起源研究和个体识别以及亲子鉴定中有较高的应用价值。 相似文献
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遗传标记的选择对于研究物种遗传多态现象具有十分重要的意义。早期的研究主要是从形态学标记检测动物群体的遗传特征。随着人类社会的进步,尤其是科学技术的发展,已逐步深入到认识白细胞抗原型、蛋白质多态性这样一些遗传标记。然而,所有上述的标记方法,对环境的变化非常敏感,均不能完全反映遗传物质——DNA水平上的差异。 有鉴于此,直接从DNA分子水平研究遗传标记是十分必要的。线粒体DNA 相似文献
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提取秦川牛血液DNA样品,PCR扩增后,通过非变性PAGE电泳获得基因型,然后进行测序确定微卫星的基因型,研究Y-STR微卫星位点UMN0929、UMN0108、UMN0920、INRA124、UMN2404、UMN0103在秦川牛群体中的遗传多态性.结果发现,176头无亲缘关系的秦川牛,公牛中在6个Y-STR基因座均有遗传多态.UMN0929、UMN0108、UMN0920、 INRA124、UMN2404、UMN0103的等位基因数分别为 4、5、2、2、5和4,其等位基因频率分别为0.14、0.57、0.18、0.11, 0.10、0.10、0.35、0.35、0.10,0.25、0.75,0.24、0.76,0.10、0.35、0.33、0.12、0.10,0.17、0.14、0.35、0.34;基因多样性分别为0.61、0.73、0.38、0.36、0.73、0.71;共发现了51种单倍型,单倍型多样性为0.94.表明UMN0929、UMN0108、UMN0920、 INRA124、UMN2404和UMN0103 6个微卫星位点在秦川牛群体中有遗传多态性,在秦川牛的起源研究和个体识别以及亲子鉴定中有较高的应用价值. 相似文献
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遗传多样性也称基因多样性,自达尔文1859年在《物种起源》中将可遗传的变异称为多样性,科研人员就开始了对畜禽遗传资源多样性的研究利用。对野猪资源而言,遗传多样性指猪及其野生近缘种的种问和种内不同种群之间或群体内不同个体的遗传变异的总和。对遗传多样性的早期研究主要是形态学水平上研究,而后经历细胞水平、生理生化水平研究。近年人们在DNA分子水平上开展遗传多样性研究,开始利用DNA分析手段选育品种和寻找具有优良生产性能的基因,为开发利用与物种保护提供依据,并取得许多有价值的成果．本文主要从野猪染色体的遗传多样性、DNA水平的遗传多样性和野猪部分核内基因的多态性进行概述。 相似文献
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血液中的许多蛋白质和酶具有遗传多态性,这类遗传多态性同红细胞的抗原变异一样被应用于血型分类的研究。自５０年代以来,国内外学者对家畜的血液蛋白多态性进行了大量而深入的研究。结果表明,普通牛血液中有２６种以上的蛋白具有多态性。而对牦牛血液蛋白多态性的研究始于８０年代,已发现牦牛血液中有多种蛋白质和酶具有遗传多态性。本文就近年来国内外关于牦牛血液蛋白多态性的研究进展进行概述。１ 牦牛血液蛋白质多态性１１ 血红蛋白（Ｈｂ）牦牛Ｈｂ的遗传机制,一般认为受ＨｂＡ、ＨｂＢ２个等显性等位基因控制,表现出ＨｂＡ… 相似文献
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[目的]通过测定温岭高峰牛线粒体DNA全基因组序列以分析温岭高峰牛的母系起源及遗传多样性。[方法]采用DNA提取、测序及生物信息学方法。[结果]通过对19头温岭高峰牛线粒体DNA全基因组序列分析,共发现263个变异位点,定义9种单倍型,单倍型多样度(Hd±SD)为0.778±0.096,核苷酸多样度(Pi±SD)为0.0017±0.0014,表明温岭高峰牛的遗传多样性较低。构建的NJ系统发育树和单倍型进化网络图表明温岭高峰牛有普通牛和瘤牛2种母系起源。[结论]温岭高峰牛线粒体DNA基因组的遗传多样性较低,有瘤牛和普通牛两个母系起源,但主要受瘤牛的影响。 相似文献
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4个肉牛品种微卫星多态性分析 总被引：1，自引：1，他引：0
本研究探讨了引进牛种（西门塔尔牛、利木赞牛）和山东地方黄牛（鲁西黄牛、利鲁牛）在20个微卫星位点上的多态性。试验从不同地区的种公牛站采集鲁西黄牛、利鲁牛、利木赞牛和西门塔尔牛的血液或精液样本,分别为56、27、31和30个,共计144个样本,血液样本采用Lab-Aid基因组DNA分离试剂盒提取基因组DNA,精液样本采用高盐法提取基因组DNA。利用20个微卫星标记,采用荧光标记毛细管电泳方法,对4个肉牛品种的DNA多态性进行分析,主要研究了每个群体的遗传变异指标（等位基因数、多态信息含量和杂合度）及群体间的遗传关系（F-统计量和基因流）。结果表明,肉牛基因组DNA条带整齐,无拖尾现象,质量较好,可用于本试验。20个微卫星座位中共检测到211个等位基因,平均等位基因数为10.6个。群体的平均观测杂合度在0.6147~0.7176之间,平均期望杂合度在0.6735~0.7862之间。在所有群体中各位点的多态信息含量在0.4853~0.8714之间,平均为0.7284,但在各个群体内的差异较大。近交系数及基因流分析结果表明,4个肉牛品种近交系数较低,群体间平均近交系数为0.085,每个微卫星位点的基因流均>1。总体来看,所选用的20个微卫星座位多态信息含量高,可作为有效遗传标记用于肉牛品种间遗传多样性分析。 相似文献
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盛丽 《青海畜牧兽医杂志》2008,38(1):47-48
随机扩增的DNA多态性(Random Amplified Polymorphic DNA,RAPD)是基于PCR技术基础之上的一种分子标记技术,具有检测效率高、样品用量少、灵敏度高和检测容易等优点,是研究植物遗传多样性的主要的分子标记方法之一.本文介绍了RAPD分子标记的原理和特点,探讨了其在牧草遗传多样性研究中的应用,并对今后在牧草研究领域中的应用作了展望. 相似文献
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The purpose of this study was to assess genetic diversity, phylogenetic relationship and population structure among nine Eurasian cattle populations using 58 single nucleotide polymorphism (SNP) markers. The calculated distribution of minor allele frequencies and heterozygosities suggested that the genetic diversity of Bos indicus populations was lower than that of Bos taurus populations. Phylogenetic analyses revealed the main divergence between the Bos taurus and Bos indicus populations, and subsequently between Asian and European populations. By principal components analysis, the Bos taurus and Bos indicus populations were clearly distinguished with PC1 (61.1%); however, six Bos taurus populations clustered loosely and the partial separation between European and Asian groups was observed by PC2 (12.5%). The structure analysis was performed using the STRUCTURE program. Distinct separation between Bos taurus and Bos indicus was shown at K = 2, and that between European and Asian populations at K = 3. At K = 4, 5 and 6, Mongolian population showed an admixture pattern with different ancestry of Asian and European cattle. At K = 7, all Bos taurus populations showed each cluster with little proportion of admixture. In conclusion, 58 SNP markers in this study could sufficiently estimate the genetic diversity, relationship and structure for nine Eurasian cattle populations, especially by analyses of principal components and STRUCTURE. 相似文献
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[目的]为分析金昌地区西门塔尔牛 MSTN 基因三个外显子的遗传多态性及变异特征。[方法]采用 PCR-SSCP 方法检测了61头西门塔尔牛 MSTN 基因三个外显子的多态性。[结果]显示：金昌西门塔尔牛 MSTN 基因的第1外显子存在 A、B 两个等位基因以及AA、AB 两种基因型,其基因型频率分别为0.7705和0.2295;第2外显子存在 A、B 两个等位基因以及 AA、AB、BB 三种基因型,其基因型频率分别为0.0328、0.3443和0.6229;第3外显子只有 AA 一种基因型。序列分析表明,金昌地区的西门塔尔牛 MSTN 基因第1外显子在269bp 发生了 A→G 的突变和第2外显子在41bp 发生了 C→T 的突变,但都未导致氨基酸发生改变,属于同义突变;外显子3并未检测到突变。[结论]统计结果表明,金昌地区的西门塔尔牛 MSTN 基因第1外显子呈低度多态,第2外显子呈中度多态。 相似文献
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试验旨在研究中国荷斯坦牛Toll样受体4(toll-like receptor 4,TLR4)基因的遗传多态性及其与体细胞评分(somatic cell score,SCS)的关联性,寻找与乳房炎相关的分子标记,加快中国荷斯坦牛的抗病育种。利用PCR-RFLP和PCR-SSCP技术对30个公牛家系的610头中国荷斯坦牛TLR4基因进行多态性检测,用最小二乘均数法对TLR4基因的多态位点与SCS进行相关分析。结果发现,试验共检测到2个单核苷酸多态(single nucleotide polymorphisms,SNPs),TLR4基因5'侧翼区存在SNP -226 G>C突变,经PCR-RFLP检测发现3种基因型:GG、GC和CC,基因型频率分别为0.208、0.482和0.310;外显子3存在SNP 1760 C>T突变,经PCR-SSCP检测发现3种基因型:CC、TC和TT,基因型频率分别为0.738、0.225和0.007,以上2位点均偏离Hardy-Weinberg 平衡。对于SNP -226 G>C位点,基因型个体的SCS差异不显著;对于SNP 1760 C>T位点,CC基因型个体的SCS最小二乘均值极显著低于TT和TC基因型个体(P<0.01)。SNP 1760 C>T的CC基因型对于中国荷斯坦牛的SCS有较大的遗传效应,可作为分子标记应用于奶牛乳房炎抗性筛选。 相似文献
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利用6个微卫星标记对湘西黄牛的遗传多样性进行了初步分析.6对微卫星引物在湘西黄牛中共检测到65个等位基因,平均每对引物上检测到9.3个等位基因;平均有效等位基因7.8759个,等位基因在湘西黄牛群体中的分布很均匀;平均观测杂合度为0.8669,平均期望杂合度为0.8829.6个微卫星座位在湘西黄牛中平均多态信息含量(PIC)为0.8297,均大于0.5,都是高度多态性的.湘西黄牛杂合子的比例较大,基因纯合率都偏低,群体的遗传变异度高,表明湘西黄牛遗传多样性丰富,具有较大的选择潜力,可承受的选择压比较大,这是开展新品种培育工作的有利条件. 相似文献
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[目的]通过Y-SNP分子标记方法研究湘西黄牛的遗传多样性、群体遗传结构及父系起源。[方法]采用PCR扩增、测序与生物信息学方法,对24头湘西黄牛的2个Y-SNPs(UTY-19和ZFY-10)标记进行多态性分析。[结果]结果表明,湘西黄牛有Y1和Y3两种单倍型组,频率分别为12.5%和87.5%,表明湘西黄牛可能有普通牛和瘤牛2个父系起源。湘西黄牛的Y-SNP遗传多样度为0.2283±0.0978,表明湘西黄牛具有较低的父系遗传多样性,品种纯度较高。[结论]湘西黄牛的父系起源为瘤牛Y3单倍型组,其Y1单倍型组为国外肉牛杂交所致。 相似文献
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Maintaining genetic diversity and inbreeding control are important in Japanese Black cattle production, especially in remote areas such as the islands of Okinawa Prefecture. Using a single-nucleotide polymorphism (SNP) array, we evaluated the genetic diversity and genomic inbreeding in Japanese Black cows from the islands of Okinawa Prefecture and compared them to those from other locations across Japan. Linkage disequilibrium decay was slower in cows in the islands of Okinawa Prefecture. The estimated effective population size declined over time in both populations. The genomic inbreeding coefficient (FROH) was estimated using long stretches of consecutive homozygous SNPs (runs of homozygosity; ROH). FROH was higher in the cows on the islands of Okinawa Prefecture than on other locations. In total, 818 ROH fragments, including those containing NCAPG and PLAG1, which are major quantitative trait loci for carcass weight in Japanese Black cattle, were present at significantly higher frequencies in cows in the islands of Okinawa Prefecture. This suggests that the ROH fragments are under strong selection and that cows in the islands of Okinawa Prefecture have low genetic diversity and high genomic inbreeding relative to those at other locations. SNP arrays are useful tools for evaluating genetic diversity and genomic inbreeding in cattle. 相似文献
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摘 要：［目的］本研究旨在从基因组水平探究隆林牛和郏县红牛的线粒体DNA（mtDNA）全基因组遗传多样性与母系起源,并对2个黄牛品种的mtDNA全基因组遗传多样性进行比较分析。［方法］采用全基因组重测序及生物信息学方法。［结果］在15头隆林牛和28头郏县红牛mtDNA全基因组序列中,共检测到36种单倍型,其中郏县红牛有26种单倍型,隆林牛仅有8种单倍型,2个黄牛品种共享2种单倍型。郏县红牛和隆林牛的平均单倍型多样度（Hd）分别为1.000和0.943,平均核苷酸多样度（Pi）分别为0.0080和0.0053,表明其遗传多样性丰富。构建的系统发育树表明,隆林牛和郏县红牛具有瘤牛和普通牛两个母系支系。［结论］隆林牛以瘤牛起源为主,郏县红牛为普通牛与瘤牛的混合起源,这2个地方黄牛品种具有独特的母系遗传信息,表现出明显的母系遗传差异。 相似文献
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[目的]为了探究广西南宁市肉牛的父系遗传背景与遗传组成。[方法]利用PCR扩增、限制性酶酶切和生物信息学方法,对南宁屠宰场的73头肉牛Y染色体USP9Y基因的遗传多态性进行分析。[结果]发现73头公牛USP9Y基因的PCR产物具有多态性,2头牛显示471 bp带型,71头牛显示552 bp带型。在71个552 bp带型中,有28个可以被SspI酶切成2条带(338 bp和215 bp),表明这28头牛为Y3单倍型组(38.36%),而其余43个不能被SspI酶切,表明这43头牛为Y2单倍型组(58.90%)。仅有2头牛的PCR产物为471 bp,表明这2头牛为Y1单倍型组(2.74%)。屠宰牛群的单倍型多样度为0.5122±0.0309,表明屠宰牛群的Y染色体遗传多样度较高。[结论]南宁市屠宰牛群的来源比较复杂,有普通牛(Y1与Y2单倍型组)和瘤牛(Y3单倍型组)2个父系起源。 相似文献