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变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)技术是一种新型的用于检测核酸变异和点突变的电泳方法,主要根据突变型和野生型核酸序列的不同而导致其变性浓度的差异,从而利用变性梯度胶进行分离,可用于肠道菌群结构多样性和种群动态变化的研究。文章对DGGE技术的原理、在肠道菌群多样性和动态性的应用、局限性及发展前景及上综述。 相似文献
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综述了不依赖于培养的分子生物学方法变性梯度凝胶电泳的原理、步骤、优点以及变性梯度凝胶电脉的不是及解决方法。对变性梯度凝胶电脉在环境微生物,动物肠道的多样性及微生物菌群动态变化及前景进行了研究和阐述,并指出了变性梯度凝胶电泳具有良好的发展前景。 相似文献
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综述了不依赖于培养的分子生物学方法变性梯度凝胶电泳的原理、步骤、优点以及变性梯度凝胶电脉的不是及解决方法.对变性梯度凝胶电脉在环境微生物,动物肠道的多样性及微生物菌群动态变化及前景进行了研究和阐述,并指出了变性梯度凝胶电泳具有良好的发展前景. 相似文献
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《黑龙江畜牧兽医》2015,(19)
为了研究补饲糖蜜尿素舔砖对放牧羊瘤胃中细菌种群结构随时间变化的规律,试验采用基于16S DNA的PCR变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术,在放牧羊舔食舔砖的不同时间点取样,进行瘤胃液的DGGE分析。结果表明:舔食糖蜜尿素舔砖后放牧羊瘤胃细菌主要以拟杆菌门、硬壁菌门为主。在舔食15 d后瘤胃细菌多样性显著增加,舔食30 d后瘤胃细菌多样性达到最高。糖蜜-尿素对瘤胃微生物种群具有明显的筛选作用,舔食前以Capnocytophaga canimorsus为优势菌群,舔食一段时间后各菌群或出现或消失,呈动态变化和定植过程;30 d后瘤胃种群结构基本保持稳定,Prevotella ruminicola Bryant处于优势地位。说明舔食舔砖前后细菌种群结构存在明显差异,舔砖可明显增加瘤胃微生物多样性。 相似文献
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本试验旨在分析幼年、成年、老年川金丝猴肠道菌群结构以及随年龄变化的趋势。将提取的幼年、成年、老年川金丝猴粪样总DNA进行聚合酶链反应-变性梯度凝胶电泳(PCRDGGE),对结果进行UPGMA聚类分析、主成分分析、生物多样性比较。用荧光定量PCR技术检测肠道菌群中真细菌、乳酸杆菌属(Lactobacillus spp.)、肠杆菌科(Enterobacteriaceae)、双歧杆菌属(Bifidobacterium spp.)的数量。结果显示:无论是UPGMA聚类分析,还是主成分分析以及生物多样性比较均表明,不同年龄段川金丝猴肠道菌群多样性存在明显差异;指纹图谱中成年与幼年川金丝猴的优势条带较多,老年川金丝猴的优势条带则较少。各年龄段川金丝猴肠道菌群中真细菌的数量都为同一数量级(1011);幼年川金丝猴肠道菌群中Enterobacteriaceae的数量显著少于成年和老年川金丝猴(P0.05);成年川金丝猴肠道菌群中Lactobacillus spp.的数量极显著多于幼年和老年川金丝猴(P0.01);老年川金丝猴肠道菌群中Bifidobacterium spp.的数量极显著少于成年和幼年(P0.01)。由此得出,川金丝猴肠道菌群随年龄增长,多样性呈幼年到成年增加、成年到老年降低的趋势,老年时期优势菌群显著减少;此外,川金丝猴肠道各菌群的数量在不同年龄段有较大差异。 相似文献
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为研究人工饲料对柞蚕幼虫肠道菌群组成、多样性特征及菌群功能的影响,收集从收蚁开始分别饲育柞树叶和人工饲料至2龄时期的柞蚕肠道样品,通过高通量测序技术对其肠道微生物进行分析,并采用Tax4Fun软件预测菌群潜在功能。结果发现,不同饲育组柞蚕幼虫肠道菌群结构存在显著差异,人工饲料组柞蚕幼虫肠道菌群多样性低于柞树叶组。肠道菌群功能预测结果显示,人工饲料组肠道菌群中翻译、复制和修复、能量代谢、辅助因子和维生素代谢等功能基因丰度显著升高,在碳水化合物代谢、膜运输等功能基因丰度显著降低。结果表明人工饲料显著改变了柞蚕肠道的菌群结构组成,并影响其代谢功能,这些变化可能与柞蚕幼虫生长缓慢、体质量减轻有关。 相似文献
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采用PCR-DGGE技术分析蛋鸡肠道细菌种群结构及多样性 总被引:16,自引:0,他引:16
利用基于16S rDNA的PCRDGGE(变性梯度凝胶电泳)图谱技术结合特异性和共性条带割胶回收DNA进行克隆和测序,对2、4、6和8周龄蛋鸡嗉囊、十二指肠、空肠、回肠和盲肠内容物细菌群落的结构和多样性进行了比较,并鉴定了8周龄蛋鸡部分特异性和共性群落成员,分析蛋鸡年龄和肠段部位对微生物群落结构和多样性的影响。肠道菌群DGGE图谱显示肠道部位对细菌种群结构影响很大,盲肠内微生物的多样性最高,其次是回肠和空肠,嗉囊和十二指肠的微生物多样性比较低。十二指肠内细菌与其它肠段相比差异最大,其次是盲肠与其它肠段细菌组成的差异。随着蛋鸡周龄的增加,消化道微生物经历了由简单(2周)到复杂(4周),再回复简单(6周)到复杂(8周)的变化过程。DGGE图谱中共性条带序列分析表明8周龄蛋鸡消化道前段的优势细菌是三得利乳杆菌(Lactobacillus suntoryeus)、索氏梭菌(Clostridium sordellii)和大肠杆菌,盲肠中的特异性条带主要是各种不可培养的细菌以及超巨巨单胞菌(Megamonas hypermegale)和梭菌属细菌(Clostridium spp)。该研究结果表明蛋鸡肠道部位决定细菌群落的结构和多样性,蛋鸡的周龄影响肠道细菌多样性。 相似文献
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肠道菌群对于动物消化及健康有着至关重要的作用,但在性别差异上的研究仍然有限。本研究通过高通量测序技术对贺兰山阿拉善马鹿(Cervus elaphus alashanicus)的20个粪便样本进行多样性分析,雌雄各半,并讨论性别因素对肠道菌群的影响。结果表明,阿拉善马鹿雌雄肠道菌群的多样性及结构均存在差异,且雌性肠道菌群的多样性更高。菌群构成的门水平上,雄性肠道菌群的优势菌门为厚壁菌门(Firmicutes 49.47%)和疣微菌门(Verrucomicrobia 14.21%),雌性肠道优势菌门为厚壁菌门(54.47%)和变形菌门(Proteobacteria 54.41%)。在属水平上,雌雄肠道菌群的优势菌属都为孢杆菌属(Sporobacter),含量为(雌性:6.79%,雄性:7.97%),拟杆菌属(Bacteroides),含量为(雌性:3.87%,雄性:4.42%),NMDS分析及LEfSe分析表明,性别因素对阿拉善马鹿雌雄肠道菌群的影响存在显著差异(P<0.05)。本研究表明性别因素对阿拉善马鹿冬季肠道菌群的多样性及构成存在影响,可为深入研究性别因素对阿拉善马鹿肠道菌群的影响提供依据。 相似文献
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鸡肠道微生物组成及影响因素的研究进展 总被引:1,自引:0,他引:1
《黑龙江畜牧兽医》2020,(9)
动物肠道内的复杂菌群对动物机体的代谢和免疫有重要作用。鸡肠道微生物的生长定植容易受到如日龄、饲粮、饲料添加剂和环境等多种因素的影响。维持肠道内有益微生物群落多样性和微生态平衡是保证肠道发挥正常生理功能的前提。文章阐述了鸡肠道微生物的组成多样性和影响其组成的因素,旨在为对鸡肠道菌群的进一步研究提供理论依据。 相似文献
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肠道菌群平衡与动物机体健康及生长发育密切相关,有机酸(organic acid, OA)作为一种绿色安全的功能性饲料添加剂,对动物具有抑菌、促消化、调节菌群平衡等作用。随着饲料产业的不断发展,OA已从饲料酸化、防腐、防霉逐渐向制剂化、动物生长促进剂和替抗产品转变,已成为畜牧行业广泛使用的一种功能性添加剂。笔者综述了猪肠道菌群的形成和分布,OA调节猪肠道菌群的组成结构和多样性及其对肠道菌群代谢产物产生和肠道免疫反应等方面的影响,并对其调控猪肠道菌群的作用机制进行探讨,旨在进一步揭示OA与肠道菌群的相互影响机制,为促进猪肠道健康与OA的合理利用提供借鉴。 相似文献
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中药有效成分可通过多靶点调控机体机能来发挥作用。越来越多的证据表明肠道菌群是中药功效发挥的作用靶点之一。肠道微生物与动物机体在物质、能量、信息交换等方面联系紧密,肠道菌群保持稳态,对机体正常机能的维持至关重要。近年来,肠道菌群与机体关系的研究不断深入,但中药通过作用于肠道菌群继而影响机体机能的报道较少。通过对中药以肠道菌群为作用靶点,干预疾病发生、发展,机体机能的最新研究进行综述,以期为致力于中药及肠道菌群研究者提供新思路,为中药的研发和应用提供参考。 相似文献
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应用ERIC-PCR技术对健康仔猪与黄白痢仔猪的粪样样品进行了扩增,并对其菌群结构特征进行了系统分析。结果发现,健康仔猪粪样ERIC-PCR图谱相似性较黄白痢仔猪高,仔猪肠道菌群中至少有一种类型的细菌异常增殖,影响正常细菌的正常生存,导致了菌群结构失调,造成黄白痢。基于ERIC-PCR的分子生物学技术来反映仔猪肠道微生物群落结构特征和监测生物种群动态是有效可行的。通过ERIC-PCR的动态监测,发现患黄白痢仔猪粪样菌群多样性减少,结构趋于简单化;健康仔猪个体之间条带的数量、位置及灰度基本一致,其中共有一些优势条带。 相似文献
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《中国畜牧兽医文摘》2015,(8)
肠道微生物组是一个较为庞大且复杂的微生物群落,同时,也能够起到重要的代谢作用,机体肠道对营养素的消化和吸收需要依靠寄居其中的菌群结构,在此过程中会产生很多化学成分,本文主要对动物肠道菌群结构与代谢化学成分的相互关系进行分析和探讨,以期为相关疾病的防治提供一定的指导。 相似文献