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相似文献
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1.
根据已报道的TMV U1株系(TMV-U1)的序列设计了特异性引物,利用RT-PCR技术,从烟 草花叶病毒蚕豆分离物(TMV-B)上扩增移动蛋白(MP)基因及其邻近序列。将此cDNA片段克隆于 pBluscript SK质粒上,进行测序分析。结果表明:MP基因由807个核苷酸组成,编码268个氨基酸。与 TMV-U1的MP基因序列比较,核苷酸序列及推导出的氨基酸序列的同源性分别为99.01%和 98.89%。与TMV-Yu的MP基因序列比较,同源性分别为98.14%和98.89%。说明TMV的MP基因 在不同株系中是非常保守的。  相似文献   

2.
根据已报道的TMVU1株系(TMV-U1)的序列设计了特异性引物,利用RT-PCR技术,从烟草花叶病毒蚕豆分离物(TMV-B)上扩增移动蛋白(MP_基因及其邻近序列,将比CDNA片段克隆于pBluscriptSK质粒上,进行测序分析,结果表明MP基因由807个核苷酸组成,编码268个氨基酸,与TMV-U1的MP基因序列比较,核苷酸序列及推导出的氨基酸序列的同源性的99.01和98.89%,与TMV  相似文献   

3.
鸽Ⅰ型禽副粘病毒F基因克隆及序列分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
利用RT-PCR技术获得了编码鸽Ⅰ型禽副粘病毒GD-P1分离株F0裂解位点附件884bp的F基因cDNA片段,并将其克隆到pGEM-T Easy质粒中,获得了重组质粒T-pPMV-F-I,核酸序列测定和分析表明,该片段与新城疫病毒强毒株F48E9和HER/33相应区域的同源性分别为87.5%和88.19%,与新城疫病毒弱毒株LaSota和B1株的同源性分别为83.83%和84.15%。该病毒F0裂  相似文献   

4.
用 P C R 技术,从马立克氏病病毒( M D V) C V I988/ C 株感染的鸡胚成纤维细胞( C E F)基因组 D N A 中扩增出含起始密码子的 M D V pp 38 基因同源物编码序列。在以 Digoxigenin ( Dig.)标记的 pp38 基因作为探针,在 Southern blot中,该探针能识别该 P C R 扩增片段。将该 P C R 扩增片段在 Bam HⅠ和 PstⅠ位点克隆进 p U C18 质粒载体,酶切分析筛选到含 pp38 基因同源物的重组质粒并进行了全序列分析,证明该重组质粒是 pp 38 基因同源物克隆。  相似文献   

5.
用PCR技术,从马立克氏病病毒(MDV)CV1988/C株感染的鸡胚成纤维细胞(CEF)基因组DNA中扩增出含起始密码子的MDVpp38基因同源物编码序列,在以Digoxigenin标记的pp38基因作为探针,在Soulthern blot中,该探针能识别该PCR扩增片段。将该PCR扩增片段在BamH I和PstI位点克隆进pU18质粒载体,酶切分析筛选到含pp38基因同源物的重组质粒并进行了全序  相似文献   

6.
从家蚕核型多角体病毒和苜蓿银纹夜蛾核型多角体病毒中分别克隆出其P10基因。从BmNPVP10中亚克隆得到基5端上游片段,经PCR定位突变使之ATG区突变成一个Bg1Ⅱ酶切位点。从AcMNPVP10中亚克隆得到基因3端下游片段,克隆人经突变的BmNPVP10基因启动子的下游,构建成一个新的转移表达载体pBmAcPV-1,由于BmNPV和AcMNPVP10基因及两端的同源性高达90%以上,  相似文献   

7.
本文以鸡外周血单个核细胞总 R N A 为模板,据已报道的8 种哺乳动物 I L—1β核酸序列保守区设计合成1 对引物,反转录合成c D N A 链,经 P C R 扩增,回收扩增后的 D N A 片段,用klenow 酶处理,与 Pu c1 9 / Sm a I 连接构成重组质粒,转化宿主菌大肠杆菌 J M1 0 9 ,筛选出含有插入片段的重组质粒,用 P C R 及酶切分析鉴定,结果表明获得了带有鸡 I L- 1β片段的c D N A 克隆;再经序列分析测定,得知此片段长为270bp ,与人及小鼠 I L—1β基因核苷酸序列同源性分别为45 % 和30 % 。  相似文献   

8.
马立克氏病病毒gB基因的重组痘苗质粒构建   总被引:1,自引:0,他引:1  
根据马立克氏病病毒(MDV)gB基因序列设计PCR引物,以gB质粒为模板,扩增出MDVgB基因5’端到3’端388bp的DNA片段。用EcoRⅠ和XbaⅠ双酶消化PCR产物,将其克隆入pBluescript质粒,构建中间质粒Ⅰ;用XbaⅠ消化gB质粒,切出MDVgB基因XbaⅠ片段,并正向克隆入中间质粒Ⅰ的XbaⅠ位点,将MDVgB基因137bp的PCR产物与其XbaⅠ片段正向连接,构建中间质粒Ⅱ用EcoRⅠ调出中间质粒Ⅱ中的MDVgB基因,正向克隆入痘苗病毒表达载体p16启动子下游,构建MDVgB基因表达质粒p16-MDVgBMDVgB基因重组痘苗表达质粒的成功构建,为下一步进行重组病毒的构建及CTL应答的深入研究奠定了基础  相似文献   

9.
 本实验所用的马传染性贫血病毒(EIAV)L株(EIAV-L)是我国研制成功的EIAV弱毒疫苗的原始强毒株。以EIAV-L感染马外周血液白细胞中DNA为模板,利用PCR技术,分4个片段扩增EIAV-L前病毒DNA,并分别克隆到载体质粒pBluescript SK中,得到 4个重组质粒p2.8、p2.4、p3.1和 p1.2,经酶切鉴定后测序。对测序结果分析、拼接,得到 EIAV-L前病毒基因组全序列。EIAV-L前病毒基因组全长 8235bp,其中 G+C含量为 38%。通过使用计算机软件DNASIS分析,EIAV-L与马传贫驴强毒和马传贫驴白细胞疫苗毒序列同源性分别为98.4%和96.9%。同源性如此接近反映了它们之间的亲缘关系,另外 EIAV-L与驴强毒的同源性高于其与驴白细胞弱毒疫苗株的同源性,这符合驴白细胞弱毒疫苗株的衍生过程。基因组两端是长为316bp的LTR,其中U3为197bp,R为80BP,U5为39bp。前病毒基因组有 3个较大的开放阅读框架(ORF),分别编码 gag、pol和 env基因。gag基因位于 713~1912位碱基之间,全长1200bp;pol基因位于 1708~5109位碱基之间,全长  相似文献   

10.
葡萄卷叶伴随病毒Ⅲ基因的克隆及序列分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
根据葡萄卷叶伴随病毒Ⅲ美国分离物的GLRaV-3CP基因序列,设计并合成了1对该病毒的PCR引物,利用IC-RT-PCR成功地检查到合适大小的PCR产物;同时将PCR产物克隆到中间载体PGEM-3Zf,转化大肠杆菌DH5α菌株,筛选阳性克隆。通过双酶切以及序列分析表明,扩增样品与美国分离物的同源性为94.1%。  相似文献   

11.
利用 PCR技术 ,从纯化番鸭细小病毒 M91 G2 7毒株鹅胚尿囊液中扩增出病毒结构多肽 VP3基因。将该 PCR扩增片段克隆入 p UC1 8质粒载体的 H inc 和 Sac 位点之间 ,酶切分析筛选到含 1 .6kb基因片段的重组质粒 MP1 3。结果表明 :该片段与国外已报道毒株核苷酸序列有 98.8%的同源性 ,氨基酸序列有 98.1 %的同源性 ,证明该重组质粒是 VP3基因的克隆。  相似文献   

12.
IBDV超强毒HZ株VP2基因的克隆和真核表达质粒的构建   总被引:3,自引:0,他引:3  
利用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR),扩增克隆传染性法低囊病病毒超强毒(vvIBDV)HZ株VP2基因,并VP2基因进行全序列测定、序列分析和聚类分析,同时将VP2基因与真核表达载体pcNDA3相连接。结果克隆到VP2基因全序列长1356bp,分析表明HZ株与欧洲超强毒株UK661高度相似,同时将VP2基因正向插入pcDNA3的CMV启动子下游,得到了VP2基因的真核表达质粒。为IBDV分子流行病学和基因工程疫苗的研究奠定了物质基础。  相似文献   

13.
本文以鸡外周血单个核细胞总RNA为模板,据已报道的8种哺乳动物IL-1β核酸序列保守区设计合成1对引物,反转录合成cDNA链,经PCR扩增,回收扩增后DNA片段,用kleonow酶处理,与P^uc19/SmaI连接构成重组质粒,转化宿主菌大肠杆菌JM109,筛选出含有插入片段的重组质粒,用PCR及酶切分析鉴定,结果表明获得了带有鸡了IL-1β片段的cDNA克隆,再经序列分析测定,得知此片段长为27  相似文献   

14.
采用RT-PCR技术,利用2对引物,从猪瘟病毒(CSFV)强毒石门株感染的猪血中成功扩增了NS4B基因,片段大小分别为757bp和774bp。克隆后经酶切鉴定,自动测序和序列分析,结果显示该基因较为保守,与其他猪瘟病毒毒株均有很高的同源性,与同属的BVDVSD-1株和NADL株也有较高的同源性。  相似文献   

15.
应用套式PCR在MDCK细胞系中发现犬细小病毒   总被引:3,自引:0,他引:3  
本研究自1997年至1999年从国内部分大学实验室、卫生防疫站和动检局陆续收集11个犬肾(MDCK)细胞系样品,选取犬细小病毒基因组的VP2基因上4段核苷酸序列作引物,对样品DNA进行套式PCR(Nested PCR)检测;PCR扩增产物经0.01g/mL琼脂糖凝胶电泳和克隆到pGEM^-T载体并进行核苷酸序列测序鉴定后,发现我国MDCK细胞系中存在犬细小病毒的传代病毒株。该病毒基因组部分序列测定结果显示与犬细小病毒CPV-N株有91%同源性。  相似文献   

16.
采用RT-PCR技术,利用2对此物,从猪瘟病毒(CSFV)强毒石门株感染的猪血中成功扩增了NS4B基因,片段大小分别为757bp和774bp。克隆后经酶切鉴定,自动测序和序列分析,结果显示该基因较保守,与其他猪瘟病毒毒株均有很同的同源性,与同 BVDVSD-1株和NADL株也有较高的同源性。  相似文献   

17.
根据已发表的猪瘟病毒序列,设计并合成了3对引物,利用RT-PCR技术,从猪瘟病毒石门株感染猪血中成功扩增了各cDNA片段,覆盖整个NS5A基因,片段大小各为774,685,917bp。克隆后测序。序列比较结果显示,该基因在CSFV中较为保守。与同属的BVDV的序列同源性较低,且氨基酸的同源性低于核苷酸的同源性。推测它参与决定瘟病毒的特异性。  相似文献   

18.
为探索鸽新城疫的流行特点,在分子水平上阐明鸽新城疫病毒分离株鸡新城疫毒株之间的相互关系,我们用RT-PCR技术获得了分离株F0裂解位点附近300bp的基因片段,将其克隆到pUC19载体上得到一重组克隆pNDV21,序列分析表明,插入片段与鸡析城疫强毒Texas相应区域的同源性为87.7%,而与弱毒株D26/76及La Sota的同源性分别是91.7%和98%。  相似文献   

19.
中国家蚕抗菌肽基因的PCR扩增,克隆和序列测定   总被引:4,自引:0,他引:4  
本实验采用PCR技术,扩增中国家蚕抗菌肽cecropinB基因片段,并以PUC19质粒为载体,将该基因片段转化到大肠杆菌中。从筛选得到的阳性克隆中分离出cecropinB基因,测定其序列,并由此推导出氨基酸序列。结果表明:(1)抗菌肽cecropinB基因片段长为866bp,包括73bp的ExonI,556bp的Intron,87bp的ExonⅡ和150bp的3’端非编码区。其中,非内含子部分的碱基序列与已克隆的日本家蚕的两个ceropinBcDNA序列比较,同源性分别为87.5%和95%;(2)推导出的成熟抗菌肽由37个氨基酸残基组成,其氨基酸序列与日本家蚕和天蚕的氨基酸序列相比较,同源性为91.9%和80.6%。  相似文献   

20.
猪肺炎支原体168弱毒株P46基因的克隆和鉴定   总被引:4,自引:0,他引:4  
猪肺炎支原体的表面抗原基因P46基因可引起宿主早期特异性免疫反应,其分子量约46kDa,根据GenBank公布的P46序列设计1对能扩增1377bpP46结构基因的引物作PCR,成功地从猪肺炎支原体168弱毒株染色体DNSA中扩增出目的基因。PCR产物克隆于pUC19质粒中,部分测序表明克隆基因与J株基因因同源性达96%。  相似文献   

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