利用微卫星标记分析皖南山区中华蜜蜂遗传多样性     

殷玲  吉挺  陈晶  陈国宏  刘敏 《扬州大学学报(农业与生命科学版)》2008,29(4)

利用23对微卫星标记,对皖南山区中华蜜蜂群体遗传多样性进行分析,评估其群体遗传结构。结果表明：23个微卫星座位中共检测到144个等位基因,等位基因数为2-13,平均等位基因数为6.26;所有位点的平均期望杂合度和平均多态信息含量分别为0.6058和0.5714,说明皖南山区中华蜜蜂群体遗传多样性较为丰富。  相似文献   

版纳斗鸡群体遗传多样性研究   总被引：3，自引：0，他引：3  

陈涛  霍金龙  苗永旺  刘建平  杨泽宇 《云南农业大学学报(自然科学版)》2007,22(3):393-395

 版纳斗鸡是我国著名的斗鸡品种之一。利用33个鸡微卫星标记对版纳斗鸡群体的47个个体进行了分子水平上的遗传多样性分析，共检测出123条多态性片段，每个微卫星座位上的观察等位基因数在2～6之间，平均每个微卫星座位上的等位基因数和有效等位基因数分别为3.7个和2.95个。群体平均杂合度为0.619 4，平均多态信息含量为0.553 3。33个微卫星座位有10个为中度多态座位，其它23个属于高度多态座位。结果表明：版纳斗鸡是一个遗传变异丰富的群体，有较大的选育潜力。  相似文献   

灵昆鸡群体微卫星DNA遗传多样性研究   总被引：1，自引：0，他引：1  

袁青妍  虞德兵  吴春琴  李国勤  王德前  卢立志 《浙江农业学报》2010,22(4):0

为阐明灵昆鸡群体遗传变异和遗传结构状况,采用23个家鸡特异性的微卫星标记对该鸡种自然群体中30个个体进行PCR扩增和聚丙烯酰胺凝胶电泳分析,检测其等位基因。结果表明,共检测到174个等位基因,23个座位都呈现出多态性,23个微卫星座位的等位基因数在3～12个,平均等位基因数为7.5个。群体平均杂合度和平均多态信息含量分别为0.758和0.723。分析结果表明灵昆鸡自然群体遗传多样性较丰富。  相似文献   

鲁西黄牛群体遗传多样性的微卫星标记研究     

毕伟伟  汪运舟  王慧  王中华 《山东农业大学学报(自然科学版)》2010,41(3)

本研究采用微卫星标记技术,检测了鲁西黄牛群体的遗传多样性现状.从联合国粮农组织(FAO)和国际动物遗传学会(ISAG)推荐的30对微卫星引物中,筛选出6对多态性丰富的微卫星位点,对112个个体的DNA多样性进行了检测,结果共检测到101个基因座,每个座位的等位基因数范围为4-6个.所有座位的平均等位基因数为4.67±0.82,平均有效等位基因数为2.54±0.64,平均杂合度(H)为0.59±0.09,平均期望杂合度为0.41±0.09,平均多态性信息含量(PIC)为0.53±0.09,符合评价遗传多样性的要求.检测结果发现,鲁西黄牛群体的遗传多样性较高.研究结果为鲁西黄牛的保种和合理开发利用提供了科学依据.  相似文献   

陇东绒山羊微卫星多态性及其与部分经济性状相关性的研究     

张建军  薛科邦  史兆国  朱玉成  潘燕玲  宗海万 《广东农业科学》2009,(8):193-197

为了在陇东绒山羊群体实施标记辅助选择,根据山羊遗传连锁图谱和相关文献资料,选用9个微卫星座位,8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳PCR扩增产物,对我国特有遗传资源50只陇东绒山羊基因组DNA的遗传多样性进行了检测,通过标记多态性与生产性状的最小二乘线性模型,进行了分子标记与经济性状的相关分析.结果表明:9个微卫星座位在陇东绒山羊群体中共检测到90个等位基因,平均每个座位的等位基因数为10个.其中微卫星座位LSCV24等位基因数最多,为14个,等位基因数最少的是DB6,只有6个;在所标记群体内平均多态信息含量为0.84±0.03,平均遗传杂合度为0.86±0.03.在9个基因座上发现与某些经济性状密切相关的标记效应(P＜0.05),同时在这些位点上找到各经济性状优势基因型以及对相应性状具有正效应或负效应的等位基因.  相似文献   

长江三角洲白山羊群体遗传多样性分析   总被引：2，自引：0，他引：2  

王兰萍  常洪  耿荣庆  杨章平  孙伟 《江苏农业学报》2006,22(3):253-257

以结构基因座和微卫星标记检测长江三角洲白山羊群体的遗传多样性。结果表明,9个结构基因座上的平均杂合度、多态信息含量及有效等位基因数分别为0.176 7、0.145 7和1.283 7;7个微卫星座位的平均杂合度、多态信息含量及有效等位基因数分别为0.886 7、0.877 4和11.290 7。微卫星标记揭示的群体遗传多样性高于结构基因座。  相似文献   

盐津乌骨鸡微卫星DNA多态性研究^*   总被引：2，自引：0，他引：2  

陈涛  苗永旺  霍金龙  杨泽宇  罗正雄  徐志兰  张昌东  宁勤刚 《云南农业大学学报(自然科学版)》2007,22(4):543-546

 筛选了33对微卫星引物对盐津乌骨鸡的53个个体进行了遗传多样性检测分析，共检测到136条DNA片段，每个座位观察等位基因数从2个到8个不等，群体等位基因数平均为4.12个，平均有效等位基因数为3.18，平均杂合度和平均多态信息含量分别为0.623 2和0.571 2。以上数据表明：盐津乌骨鸡群体遗传多态性较高。  相似文献   

朝鲜鹌鹑微卫星多态性分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

吴胜军  庞有志  赵淑娟  张晓辉  于美琴  朱鹏飞 《河南农业科学》2010,(10)

利用微卫星标记技术对朝鲜鹌鹑群体9个微卫星座位的遗传多样性进行分析,旨在为朝鲜鹌鹑遗传资源的评价、保护和利用提供新的依据。结果表明,9个微卫星座位共检测出44个等位基因,平均每个座位检测到4.89个。平均杂合度为0.7096,平均多态信息含量为0.6639,表明朝鲜鹌鹑是遗传多样性较丰富的群体。χ2检验结果表明,9个微卫星座位的基因分布均处于Hardy-Weinberg不平衡状态。  相似文献   

巴什拜羊群体遗传多样性与遗传分化的研究   总被引：1，自引：0，他引：1  

韩业东  决肯·阿尼瓦什  帕娜尔·依都拉  李齐发  谢庄 《南京农业大学学报》2011,34(1)

利用10个微卫星标记对新疆巴什拜羊4个品系(红毛、白毛、黑毛和瘦肉型新品系)189个个体进行检测,分析群体遗传多样性和群体间的遗传分化、系统发育关系。结果表明:在巴什拜羊10个微卫星座位中共检测到110个等位基因,平均每个座位等位基因数为11个;4个群体10个微卫星标记的平均多态信息含量为0.791 4,平均杂合度为0.814 9,说明巴什拜羊4个群体均具有丰富的遗传多样性;4个绵羊群体的总近交系数为-0.178 2,群体内近交系数为-0.211 2,群体间基因分化系数为0.023 7,说明4个绵羊群体间2.37%的遗传变异来自群体间,而97.63%的遗传变异是由各群体内个体间的差异引起的;基因流(Nm)平均值为8.916 7。聚类分析发现,红毛品系与黑毛品系亲缘关系较近,之后与白毛品系相聚,最后与瘦肉型新品系聚在一起,聚类结果与品系育成史基本一致。  相似文献   

凡纳滨对虾遗传多样性的微卫星DNA分析   总被引：4，自引：0，他引：4  

陈晓汉  曾地刚  李咏梅  彭敏  蒋伟明  杨春玲 《广西农业科学》2006,37(5):579-583

通过对5个微卫星座位的聚合酶链式反应(PCR)扩增、聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染色检测,探究凡纳滨对虾群体的遗传多样性。结果表明,供试的凡纳滨对虾群体在5个微卫星位点上有2~4个等位基因,平均等位基因数3个,平均杂合度0.5755,平均多态信息量0.4864,平均有效等位基因数2.5053。全群基因纯合度0~0.8,平均0.3917。显示凡纳滨对虾群体遗传多样性水平处于中度多态。  相似文献   

武定鸡群体遗传变异的微卫星标记分析^*   总被引：2，自引：3，他引：2  

钱林东  陈涛  霍金龙  田应华  杨有昌  杨泽宇  苗永旺 《云南农业大学学报(自然科学版)》2006,21(5):651-656

 武定鸡是一个能适应高寒和冷凉气候的地方鸡种,以其肥育性能好,沉积脂肪能力强,肉质鲜嫩等特性而著称。为了进一步阐明其群体遗传变异和遗传结构状况,筛选了分别位于家鸡22条染色体上的25对微卫星引物,对武定鸡53个个体进行了检测分析。共检测到107个等位基因片段,每个座位等位基因数目从2到6个不等,平均等位基因数为4.28,该鸡群体平均杂合度(H)和多态信息含量(PIC)分别为0.6957,0.6382。所得结果表明:武定鸡群体内存在较为丰富的遗传变异,具有较高的选择潜力。  相似文献   

云南屏边大围山微型鸡遗传多样性^*   总被引：2，自引：0，他引：2  

贾俊静  文生萍  熊保良  马振峰  苗永旺  张曦  李琦华  曹振辉  葛长荣 《云南农业大学学报(自然科学版)》2009,24(5):654-660

 云南屏边大围山微型鸡是我国具有独特遗传特性的、属于亚热带热带型早熟地方家禽品种。研究采用了33个家鸡特异性的微卫星标记对该鸡种自然群体中30个个体进行了多态性电泳检测,目的在于阐明其群体遗传变异和遗传结构状况。研究结果显示：33个微卫星座位共检测到65个等位基因,每个座位的等位基因数在1～3个之间,这些等位基因的频率大小在0.0333～1.000之间,平均每个座位的等位基因数为1.9697个,有效等位基因数在100～263个之间, 平均有效等位基因数为1.6846。群体平均杂合度（H）和群体平均多态信息含量（PIC）为0.1737和0.3279。结果表明,大围山微型鸡群体平均杂合度和群体平均多态信息含量较低,纯合度较高,未受到其它外来血液的混杂,是一个封闭的原始群体,具有较高的遗传一致性  相似文献   

4个暗纹东方鲀群体的遗传多样性分析   总被引：2，自引：0，他引：2  

程长洪  张敏莹  徐东坡  刘凯  段金荣  周彦锋  施炜纲 《华中农业大学学报》2012,31(5):634-640

采用10对暗纹东方鲀(Takifugu obscurus)和16对红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)微卫星引物对4个暗纹东方鲀群体(1个长江常熟江段捕捞群体,1个江苏扬中放流群体和2个养殖群体)的遗传多样性进行分析。结果显示,20个微卫星位点能成功扩增出片段并且具有一定的多态性,在4个群体中共检测到113个等位基因。每个群体的平均等位基因数为4.95～5.50,平均观测杂合度为0.686 7～0.761 7,平均期望杂合度为0.653 0～0.700 0,平均多态信息含量为0.601 3～0.638 4。各个群体都有一些微卫星位点偏离Hardy-Wein-berg平衡(P<0.05),主要表现为杂合子不足。群体间遗传分化系数为0.040 6,基因流值为5.905 6,群体间遗传分化程度较小,群体间基因流水平较高。4个群体间的遗传相似系数为0.859 0～0.915 8,遗传距离为0.088 0～0.151 9,采用UPGMA法对4个群体进行聚类,可分2类:上海养殖群体单独为一类,扬中放流群体、常熟江段捕捞群体和南通养殖群体为另一类。  相似文献   

暗纹东方鲀微卫星筛选和群体遗传多样性分析     

程长洪  张敏莹  刘凯  徐东坡  段金荣  周彦锋  施炜纲 《江西农业大学学报》2011,(5)

为了解长江野生暗纹东方鲀群体遗传多样性现状,采用已发表的16对红鳍东方鲀微卫星引物对暗纹东方鲀基因组DNA进行PCR扩增,结果有10对微卫星引物(占总数62.5%)能扩增出特异性条带。利用这10对微卫星引物对采自长江常熟江段30尾暗纹东方鲀群体进行扩增分析,共获得51个等位基因,每个位点等位基因数在2到10之间,平均为5.1。10个位点平均观察杂合度(Ho)为0.820 0,平均期望杂合度(He)为0.692 8,平均多态信息含量(PIC)为0.630 0。8个位点表现为高度多态(PIC>0.5),2个位点表现为中度多态(0.25相似文献   

利用微卫星标记分析迪庆黄牛的遗传多样性*     

田应华  钱林东  凌军  霍金龙  祁宏  刘丽仙  苗永旺 《云南农业大学学报(自然科学版)》2009,24(6):842-846

 采用分布在黄牛基因组15条染色体上的15个微卫星标记对迪庆黄牛60个样品进行了群体遗传变异检测分析。共检测到63个等位基因,每个座位的等位基因数从2~6不等,有效等位基因数在2.0000~4.0000之间,平均每个座位等位基因数（4.2000±0.8619）个,有效等位基因数（3.552 9±0.531 2）个,群体平均表观杂合度、期望杂合度及平均多态信息含量分别为0.9958±0.0161,0.7098±0.0637和0.6573±0.0851。结果表明,迪庆黄牛群体遗传变异丰富。  相似文献   

凡纳滨对虾3个亲本及其子代群体的SSR分析（摘要）（英文）   总被引：1，自引：0，他引：1  

栗志民  谢丽  叶富良  陈国良 《农业科学与技术》2010,11(3):57-61

利用微卫星标记技术,采用8对微卫星引物对凡纳滨对虾3个亲本群体（OI Q、SIS Q、Kona Bay Q）及其子一代（OI Z、SIS Z、Kona BayZ）共计120个个体进行遗传分析。计算6个群体在8个微卫星位点上的平均等位基因数（Na）、平均有效等位基因数（Ne）、平均观测杂合度（Ho）、平均期望杂合度（He）、平均多态信息含量（PIC）和平均Hardy-Weinberg平衡指数（D）,以上各参数均采用群体遗传学分析软件POP-GENE3.2处理,同时根据Nei的方法计算群体间的遗传距离和遗传相似系数。运用MEGA3.0软件,采取UPGMA方法根据6个群体的遗传距离进行聚类。结果表明：8对微卫星引物在6个群体中共检测到28个等位基因,每个位点的等位基因数为2 ～6个,平均等位基因数为3.5;各位点的期望杂合度均比观测杂合度高;多态信息含量（PIC）值为0.479 4 ～0.769 9,说明这8个位点在凡纳滨对虾中具有较高的信息含量。在亲本和子代群体遗传结构分析中,子代的有效等位基因数、杂合度和多态信息含量等指标均略低于亲本群体,但子代的遗传多样性并未受到太大影响,仍保持较好的遗传力。  相似文献   

利用多重荧光PCR分析秦川牛遗传多样性     

王均辉  昝林森  张桂香  王志刚  齐国强  韩旭 《安徽农业科学》2007,35(20):6051-6053

[目的]分析秦川牛的遗传多样性,加强对该品种资源的保护。[方法]利用15个微卫星座位,运用多重荧光PCR技术对59头秦川牛个体的基因组DNA进行扩增,通过等位基因频率、多态信息含量、基因杂合度和有效等位基因数分析秦川牛品种的遗传多样性。[结果]结果表明:在15个座位的等位基因数为5～18个,平均等位基因数为10.3个;各座位上的杂合度都较高,平均杂合度为0.7959;平均有效等位基因数为5.3066;15个座位中多态信息含量为0.6441～0.8649,均为高度多态。[结论]通过荧光标记可用于牛品种遗传多样性的分析,并可为进一步QTL定位和标记辅助选择研究提供参考。  相似文献   

凡纳滨对虾三个亲本及其子代群体的SSR分析     

栗志民  谢丽  叶富良  陈国良 《安徽农业科学》2010,38(13):6735-6738

利用微卫星标记技术,采用8对微卫星引物对凡纳滨对虾3个亲本群体（OIQ、SISQ、Kona Bay Q）及其子一代（OIZ、SISZ、Kona Bay Z）共计120个个体进行遗传分析。结果表明,8对微卫星引物在6个群体中共检测到28个等位基因,每个位点的等位基因数为2～6个,平均等位基因数为3.5;各位点的期望杂合度均比观测杂合度高;多态信息含量（PIC）值为0.4794～0.7699,说明这8个位点在凡纳滨对虾中具有较高的信息含量。在亲本和子代群体遗传结构分析中,子代的有效等位基因数、杂合度和多态信息含量等指标均略低于亲本群体,但子代的遗传多样性并未受到太大影响,仍保持较好的遗传力。  相似文献