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中国山核桃属植物种间亲缘关系RAPD分析 总被引：4，自引：0，他引：4
用随机引物扩增多态性DNA(RAPD)技术分析了山核桃属6个种及近缘属化香的种间亲缘关系，从600个随机引物中筛选出20个10bp多态性好的随机引物，通过扩增共得到317个DNA片段，片段大小为200～2800bp，其中多态性谱带为271条，占85．5％，表现出丰富的RAPD多态性；根据遗传距离，利用UPGMA构建品种亲缘关系树状图，结果表明RAPD分析的亲缘聚类基本上与经典分类相一致；从分子角度进一步证明大别山山核桃分种成立，与湖南山核桃、山核桃亲缘关系较近． 相似文献
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采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对取自大连、盘锦、东营、天津的4个地理种群的褶皱臂尾轮虫Brachionus plicatilis的遗传多样性进行了研究。在优化的RAPD反应条件下,对30个10 bp的引物进行了PCR扩增,其中26条引物所得的扩增带带型清晰且重复性好,共检测出311个位点,片段长度为190~2 000 bp。根据4个种群之间的片段共享度和Ne i的平均遗传距离得知,大连与天津种群的遗传距离最大,盘锦与天津种群之间的遗传距离最小。由UPGMA聚类可得:盘锦种群与天津种群聚在一起,然后与东营种群聚在一起,最后与大连种群聚在一起。 相似文献
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濒危植物天目铁木遗传多样性的RAPD分析 总被引：3，自引：0，他引：3
濒危植物天目铁木Ostrya rehderiana现仅在天目山残存5株野生植株,是国家一级保护植物。为研究该物种繁殖与复壮的有效途径,利用随机扩增多态性DNA（RAPD）标记,对这5株天目铁木的遗传多样性和遗传分化进行基因组DNA多态性分析,统计18个扩增较为稳定的引物在5个DNA样品中扩增的电泳带总数与多态带的数目。结果显示：共扩增出176个DNA片段,片段大小为200~2 800 bp,其中多态性谱带为88条,占50%,表现出了丰富的RAPD多态性。根据遗传距离,利用UPGMA构建了个体亲缘关系树状图。结果表明,4号和5号植株间亲缘关系最近,遗传距离为0.133 5,1号和3号植株间亲缘关系最远,遗传距离为0.461 0,1号植株与其他4株的亲缘关系均较远,遗传距离为0.366 5~0.461 0,聚类时被聚在其他4株之外。这一结果与5株间物理距离分布的位置差异相符。 相似文献
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《北京林业大学学报》2010,(Z2)
利用ISSR标记对梅花60个宫粉品种群品种进行了遗传多样性和亲缘关系分析,11个引物共扩增出106条DNA片段,其中多态性DNA带为93条,占总扩增片段的87.7%。引物扩增DNA片段数在6～13条之间,平均每个引物扩增DNA带数为9.6,扩增DNA片段大小在220～2500bp之间;品种间Nei's遗传距离介于0.081～0.543之间,显示宫粉品种群品种间的遗传差异较大;根据ISSR扩增结果,利用UPGMA法构建树状聚类图,聚类分析将60个品种分为2类,聚类群与品种来源有明显的相关性。 相似文献
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中国水稻二化螟5个地理种群遗传差异的RAPD分析 总被引：4，自引：0，他引：4
以中国水稻二化螟5个地理种群的基因组DNA为材料,对其进行随机扩增多态性DNA(RAPD)分析.从50个引物中筛选出29个稳定性好、多态性高的引物,单个引物扩增出的DNA条带数从2～15条不等,其片段大小为200～3 000 bp,5个地理种群共扩增出条带220条,其中为多态片段的97条,平均每条引物扩增出条带7.59条.通过公式计算多态性位点、遗传相似性指数和遗传距离,结果表明:(1)5个地理种群遗传变异较高,其中以广西省全州市多态位点百分率最高(52.73%),吉林省柳河县多态位点百分率最低(34.55%);(2)5个二化螟地理种群间的遗传相似性指数的变异范围为0.551 88～0.849 00,遗传距离指数为0.121 42～0.448 12,平均遗传距离指数为0.312 28;安徽省庐江县与湖北省武汉市地理种群间的遗传距离最小,而吉林省柳河县与广西省全州市地理种群间的遗传距离最大. 相似文献
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利用RAPD分子标记技术对52份洋葱(Allium cepa L.)种质资源进行遗传多样性聚类分析。从150个10 bp随机引物中筛选出28个扩增效果较好的引物进行扩增,80.3%的扩增条带表现出多态性。在遗传距离为0.150和0.132的水平上,52份材料分别被分为2类和5类,与生态型分类及以熟性、产量为特征的经济性状分类有一定的相关性。 相似文献
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利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对毛桃 2 0个品种进行基因组DNA多态性分析 ,利用筛选出的14个 10碱基随机引物共扩增出 181条带 ,其中 14 3条具有自身特征性标记 ,利用这些DNA片段 ,按UPGMA法进行聚类分析 ,并建立树状图。在遗传距离 0 .70 2以上 ,将供试的 2 0个桃品种分为 5类 ,从分子生物学角度为桃种质的保存和育种提供理论依据 相似文献
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利用分子标记对桃属植物的识别及其亲缘关系分析 总被引：22，自引：0，他引：22
采用RAPD技术，用筛选的22个随机引物对桃属主要种类及其类型进行DNA扩增分析。结果表明不同引物扩增出的DNA片段范围在3～13条，分子量范围在300bp～3kb之间，依据特征谱带，可建立种间及其类型识别的分子检索表。利用22个引物扩出的180个位点上的RAPD带，进行聚类分析，结合前人研究出的结果，揭示桃种间亲缘演化顺序为内蒙古长柄扁桃→光核桃→山桃→甘肃桃→白花山桃、红花山桃、帚形山桃→桃巴旦、陕西桃巴旦→新疆桃、毛桃。 相似文献
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利用随机扩增多态性DNA（RAPD）技术对西藏拟溞Daphniopsis tibetana4个群体（新疆赛里木湖、西藏色林错、纳木卡错和班戈湖）的遗传多样性进行了初步研究,用21个随机引物对4个群体80个样本进行了随机扩增,从中筛选出5个扩增效果比较稳定的引物,共得到多态位点为25个。利用POPGENE32分析表明,西藏拟溞各群体遗传变异由高向低依次为色林错（SLC）〉赛里木湖（SLM）〉纳木卡错（NMKC）〉班戈湖（BGH）。根据遗传距离结果,采用UPGMA和NJ方法分别进行聚类分析,结果表明,赛里木湖（SLM）和色林错湖（SLC）两群体亲缘关系较近,纳木卡错（NMKC）与班戈湖（BGH）两群体之间的亲缘关系比较近。 相似文献
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应用44条随机引物,对麦红吸浆虫Sitodiplosis mosellana(Gehin)10个不同滞育阶段的个体进行RAPD检测,筛选出6条随机引物S1,S50,S81,S83,S1031,S1248,可以扩增出清晰稳定的多态性片断81条,相对分子质量在200bp~2000bp之间。应用UPGMA(非加权配对算术平均法)对多态性片断进行聚类分析,构建树状图,推测不同滞育阶段之间的聚类关系。结果表明:在各个滞育阶段中,裸露幼虫相互之间的遗传距离和亲缘关系比较近,具有比较同质的遗传背景,而不同阶段的结茧幼虫相互之间的关系比较复杂。 相似文献
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用CTAB法提取了新疆3个不同居群刺山柑（Capparis spinosa L．）总DNA,使用RAPD技术对其进行多态性的研究。从93种随机引物中筛选出3种扩增较稳定的引物,来扩增3个不同居群刺山柑总DNA,共扩增出25条带,每种引物扩增出6～10条带;多态性条带共13条,多态性比例为52％。利用DPS软件所做的统计分析和聚类分析结果表明,3个群居间相似系数在0．69～0．86之间,平均相似系数为0．76;可聚成2类：阿克陶和乌鲁木齐居群刺山柑可聚为A类;吐鲁番居群刺山柑可聚为B类,他们彼此间的遗传变异较小。 相似文献
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应用RAPD技术探讨红叶李、李和杏的亲缘关系 总被引：2，自引：0，他引：2
为了对红叶李Prunus cerasifera cv.Atropurpurea,李P.salicina和杏P.armeniaca的亲缘关系、品种识别及资源保存提供分子生物学依据,也为了验证传统的形态学分类方法,从132个随机引物中筛选出20个引物对红叶李、李和杏的8个材料进行了基因组DNA扩增,均具有多态性,共扩增出264条带,平均每个引物产生13.2个RAPD片段.RAPD带型及聚类分析表明:RAPD技术能将红叶李、李属植物和杏属植物完全分开,红叶李、李和杏之间表现出一定的亲缘关系,各属品种之间都有不同的遗传距离,证明RAPD技术可作为种和属水平的分类鉴定依据;利用红叶李、李和杏品种的特异谱带结合DNA指纹,可将参试的各品种鉴别出来,从而说明了RAPD技术能够用于种或品种之间的鉴定.图2表2参12 相似文献
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狼亚种分化的RAPD分子证据 总被引：6，自引：1，他引：5
对来自我国东北、内蒙、甘肃、新疆等１０个地区的２１只狼（Ｃａｎｉｓ ｌｕｐｕｓ）应用ＲＡＰＤ方法进行亚种分化研究。筛选出２５个随机引物。通过对ＲＡＰＤ产生的谱带进行比较。找出共享片段,计算共享度和遗传距离。并进行聚类分析,做出聚类图,确定亲缘关系和分类地位。研究结果表明：（１）中国南北方狼有分化。在ＤＮＡ序列上存在着明显差异;（２）把所研究地区的狼划分为５个亚种,即：云贵群体（云南群体和贵州群体）和东南群体（福建群体、浙江群体和广东群体）亚种;东北群体、河北群体亚种;甘肃群体亚种;内蒙群体亚种;新疆群体亚种。 相似文献
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新疆核桃8个天然群体遗传多样性的SSR评价 总被引：1，自引：0，他引：1
[目的]为进一步建立新疆核桃种质资源的分子指纹鉴定体系奠定基础,为制定新疆核桃资源的有效保育和利用策略提供科学依据,并为深入研究新疆栽培与野生核桃资源间的系统关系提供实验数据.[方法]应用12对稳定、适用性好的SSR引物对新疆南北疆核桃的8个栽培及野生群体的230份样品进行扩增,研究其遗传多样性.[结果]12对SSR标记揭示了新疆核桃丰富的遗传多样性:等位基因93个,平均多态性带比率96.77;,平均Nei多样性指数(H)0.315 1,平均Shannon多样性指数(Ⅰ)0.382 0.8个新疆核桃群体的变异主要来源于群体内,群体间分化较小,遗传分化系数仅为0.172 0.估测的群体间基因流(Nm)为1.712 6,表明新疆8个核桃群体之间存在适度的基因交流,种子的传播或人为实生选种以及杂交育种可能是基因交流的主要原因.对新疆核桃8个群体的Nei多样性指数(H)与Shannon多样性指数(Ⅰ)及多态位点百分比进行分析,表明和田实生核桃的遗传多样性最高,伊犁霍城野生核桃的遗传多样性最低.采用UPGMA方法进行供试核桃的遗传距离聚类分析,8个群体被聚为两大类:和田、叶城及温宿等3个群体聚为一大类;而巩留、霍城、吐鲁番、哈密、鄯善等5个群体聚为另一大类,Mantel检测与UPGMA聚类均表明群体间的遗传距离与群体的地理距离之间具有较高的相关性.[结论]新疆核桃有着较高的遗传多样性水平,同时揭示了新疆核桃属植物的遗传变异、群体扩散及其地理系统发育进化等方面的规律,在此基础上,认为在进行遗传多样性保护和种质资源的保存时,应充分重视群体内不同类型个体的保存,同时也要在分布区不同区域内保存不同的群体. 相似文献
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桂花RAPD分析的引物筛选 总被引：1，自引：0，他引：1
从桂花4个品种群(银桂品种群、金桂品种群、丹桂品种群和四季桂品种群)中选取8个桂花样品,用于桂花RAPD分析的引物筛选试验。从Operon公司的OP系统的AB、AC、AD、Y、Z5组共80个10碱基引物中筛选出20个扩增条带多且多态性好的引物,20个引物共扩增116条DNA条带,用100～3000bp的DNAmarker标记片断长度在200～2000bp,多态性条带有72条,多态性位点比率为62.0%。不同引物的扩增带数不同,最多的可扩增出8条DNA条带。 相似文献
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为了对红叶李Prunus cerasifera cv .Atropurpurea , 李P .salicina 和杏P .armeniaca 的亲缘关系、品种识别及资源保存提供分子生物学依据, 也为了验证传统的形态学分类方法,从132 个随机引物中筛选出20 个引物对红叶李、李和杏的8 个材料进行了基因组DNA 扩增,均具有多态性, 共扩增出264 条带, 平均每个引物产生13.2 个RAPD 片段。RAPD 带型及聚类分析表明:RAPD 技术能将红叶李、李属植物和杏属植物完全分开, 红叶李、李和杏之间表现出一定的亲缘关系, 各属品种之间都有不同的遗传距离, 证明RAPD 技术可作为种和属水平的分类鉴定依据;利用红叶李、李和杏品种的特异谱带结合DNA 指纹, 可将参试的各品种鉴别出来, 从而说明了RAPD 技术能够用于种或品种之间的鉴定。图2 表2 参12 相似文献
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三个鸡品系遗传关系的RAPD分析* 总被引：2，自引：0，他引：2
为了从分子水平上阐明快羽系、绿壳蛋系和合成系3个鸡品系之间的遗传差异及其遗传关系,为进一步开展这3个鸡品系的杂交配套利用提供依据,本文采用RAPD标记对3个品系的血样进行了群体遗传关系分析。实验共筛选出27条随机引物,对3个鸡品系的池DNA进行了RAPD分析。27条引物共产生235种扩增片段,扩增产物片段的长度大小在277~2441bp范围内。利用电泳分析数据分别计算了3个品系群体之间的遗传相似系数和遗传距离指数。结果表明:快羽系与绿壳蛋系间的遗传关系最近;而快羽系与合成系间的遗传关系最远。 相似文献