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四个微卫星标记在苏钟猪中的多态性分析 总被引：2，自引：0，他引：2
微卫星标记是近年来发展起来的一种检测基因DNA多态性的新型DNA标记，因其数量多、分布广、多态性丰富及检测方便等优点而倍受推崇。本文利用四个微卫星标记分析其在苏钟猪中的遗传多样性。结果表明，四个微卫星座位在苏钟猪中均存在较高的遗传多样性，基因杂合度为0.5962-0.8823；多态信息含量为0.5146-0.8709；有效等位基因数为2．4768-8．4935。以上结果表明，本研究采用的四个微卫星标记可以作为苏钟猪的遗传多样性的标记辅助选择。 相似文献
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8个微卫星座位在海北金银滩藏羊群体中的多态性分析 总被引：1，自引：0，他引：1
研究旨在分析金银滩藏羊的微卫星DNA多态性,以期了解该品种的遗传多样性,为该品种的保种选育和品质的进一步提高提供有益资料。利用8对微卫星引物,以金银滩藏羊为研究对象,通过计算基因频率、多态性信息含量、有效等位基因数和杂合度,评估其品种内的遗传变异。结果表明：在8个微卫星座位中,共检测到83个等位基因,每个座位平均10.38个等位基因;平均杂合度0.893;平均有效等位基因数9.06;平均多态性信息含量0.871。结果提示,金银滩藏羊群体存在丰富的遗传多样性,所选微卫星标记可用于绵羊遗传多样性评估。 相似文献
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兰州大尾羊微卫星DNA多态性研究 总被引：1，自引：0，他引：1
研究旨在分析兰州大尾羊的微卫星DNA多态性,以期了解该品种的遗传多样性,为该品种保种选育和品质的进一步提高提供资料。选择15对微卫星引物,通过计算基因频率、多态性信息含量、有效等位基因数和杂合度,评估其品种内的遗传变异。结果表明:在15个座位中,共检测到153个等位基因,每个座位平均为10.2个等位基因;座位平均杂合度为0.8149;平均有效等位基因数为6.0891;平均多态性信息含量为0.7762。结果提示,兰州大尾羊群体存在丰富的遗传多样性,所选微卫星标记可用于绵羊遗传多样性评估。 相似文献
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(目的)旨在分析欧拉型藏羊的微卫星DNA多态性,以期了解该品种的遗传多样性,为该品种保种选育和品质的进一步提高提供一些有益资料.(方法)利用15对微卫星引物,以欧拉型藏羊为研究对象,通过计算基因频率、多态性信息含量、有效等位基因数和杂合度,评估其品种内的遗传变异.(结果)结果表明:在15个座位中,共检测到175个等住基因,每个座位平均为11.67个等位基因;座位平均杂合度为0.885 4:平均有效等位基因数为9.042;平均多态性信息含量为0.865 7.(结论)结果提示,欧拉型藏羊群体存在丰富的遗传多样性,所选微卫星标记可用于绵羊遗传多样性评估. 相似文献
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文章旨在分析甘南藏羊不同类群的微卫星DNA多态性,以期了解该资源的遗传多样性,为该羊种保种、选育和品质的进一步提高提供一些有益资料.利用8对微卫星引物,以欧拉型藏羊、甘加型藏羊和乔科型藏羊为研究对象,通过计算基因频率、多态性信息含量、有效等位基因数和杂合度,评估其品种内的遗传变异.结果表明:在8个座位中,共检测到96个等位基因,每个座位平均为12个等位基因;座位平均杂合度0.876;平均有效等位基因数9.902;平均多态性信息含量0.896.结果提示,甘南藏羊群体存在丰富的遗传多样性,所选微卫星标记可用于绵羊遗传多样性评估. 相似文献
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LIU Yang-yang JIA Qing YIN Yan-kai ZHAO Si-si FANG Xiao-huan YIN Xue-jiao LI Sai 《中国畜牧兽医》2017,44(10):3001-3008
In order to establish a simple detecting index system for the genetic diversity of Shen-xian pig population, 179 samples in 4 generations of Shenxian pigs were collected,and the population genetic diversity were detected using 27 microsatellite markers which were jointly recommended by the Food and Agriculture Organization of the United Nations (FAO) and the International Society for Animal Genetics (ISAG). 2-stage and multi-gradient sampling were conducted to the 27 microsatellite markers. The suitable number of microsatellite loci was determined according to the comparation of the polymorphic information content (PIC) of the sampled groups and total population,then validated with 4 generations of samples. The results showed that the relative deviation value PIC of eight microsatellite markers was no more than 5% comparing with all markers, and the relative deviation was about 10% in the different generations. 8 microsatellite markers including S0155, S0228, SW632, S0090, CGA, S0101, S0227 and SW122 constituted the final simplified index system, which could represent the changes of genetic diversity in Shenxian pig conservation population. Therefore, the genetic diversity monitoring of the population of Shenxian pig could be simplified to detect the eight microsatellite markers. At the same time, the method used in this study could also provide a reference for the simplified treatment of genetic diversity monitoring methods. 相似文献
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为建立深县猪种群多样性监测的简化指标体系,试验采集河北省深县猪4个世代179头猪样本,采用联合国粮农组织和国际动物遗传协会联合推荐的27个微卫星标记进行群体遗传多样性分析,对27个微卫星标记进行两阶段、多梯度抽样,并根据抽样群体和总群体的多态信息含量（PIC）值的变化确定适宜抽样微卫星位点数,再以4个世代样本进行验证。结果表明,选取8个微卫星位点时与全部位点的比较相对偏差可控制在5%以内,且以各分世代的验证比较相对偏差在10%左右,通过比较确定以S0155、S0228、SW632、S0090、CGA、S0101、S0227、SW122这8个微卫星位点构成的简化指标体系可较好地反映深县猪种群遗传多样性的变化。因此,深县猪的保种群群体遗传多样性监测可以简化为检测这8个微卫星位点,同时本研究采用的方法也可为其他保种群的遗传多样性监测方法的简化处理提供参考。 相似文献
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四川地方乌骨鸡种群遗传变异的微卫星DNA分析 总被引：11，自引：0，他引：11
利用10个微卫星标记，对四川不同地区5个乌骨鸡种群的等位基因频率、各群体的遗传杂合度、群体间的遗传距离等进行了分析，并根据遗传距离对这几个乌骨鸡种群进行了聚类分析。结果表明，各乌骨鸡群体的遗传多样性较为丰富，并具有较高的选择潜力。各乌骨鸡种群间有一定的遗传距离，UPGMA聚类分析表明，四川山地乌骨鸡黑羽系与川南山地乌骨鸡被聚为一类，草科鸡与旧院黑鸡被聚为一类。 相似文献
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试验旨在探究陆川猪种群之间的遗传差异,对陆川猪种群进行遗传多样性分析,为种质改良与创新提供参考。以29份陆川猪种及部分广西地方猪种样品为试验材料,采用了3条带型清晰、重复性好的ISSR引物,通过对PCR扩增及电泳得到的DNA片段条带进行聚类分析并构建聚类树状图,并对陆川猪种群进行遗传差异分析。结果显示,ISSR分子标记上共发现182条条带,其中84条多态性条带,3条ISSR引物扩增出来的总DNA片段条带与多态性DNA片段条带差异较大且分布不均匀,表明所选择的3个ISSR分子标记在陆川猪种群中具有丰富的多态性;陆川猪种群之间遗传相似系数变异范围为0.43~1.00,表明种群间的遗传差异变化较大,遗传背景丰富;UPGMA聚类分析表明,陆川猪与长陆二元杂猪、巴马香猪、环江香猪均可聚为一类,大陆二元杂猪、三元杂猪和龙宝猪聚为一类。本研究证实了所选的3条ISSR引物可作为有效的遗传标记用于陆川猪种群间的遗传差异分析,丰富了当前的陆川猪ISSR分子标记资源,同时也表明陆川猪种群具有丰富的遗传多样性。 相似文献
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利用选自家禽基因组的10个微卫星标记,对四川常羽乌骨鸡5个群体(四川山地乌骨鸡白羽系、黑羽系;黄忠山地乌骨鸡;黄忠山地乌骨鸡绿壳蛋系;草科乌骨鸡)的遗传多样性进行了检测,计算了各群体的群体杂合度、群体间遗传距离,并根据遗传距离进行了聚类分析。结果表明所选择的微卫星标记在各群体中表现出较高的多态性;四川5个乌骨鸡群体遗传多样性比较丰富,群体平均杂合度为0.5383到0.6659;各群体间的遗传距离有一定的差异;聚类分析将5个群体聚为三类。 相似文献
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应用21个微卫星标记监测马身猪遗传多样性变化趋势 总被引：5，自引：2，他引：3
本研究旨在通过对不同年份马身猪群体遗传多样性变化趋势分析,评价马身猪保种效果,制定有效的保种措施。选用FAO-ISAG联合推荐的21个微卫星标记分析不同年份马身猪群体的遗传多样性。结果表明,在马身猪群体中,共检测到105个等位基因,平均等位基因数为5个,平均有效等位基因数为2.244 0,平均观察杂合度和PIC分别为0.317 6和0.391 9。从1999年到2007年,平均等位基因数从4.285 7下降到3.428 6,平均有效等位基因数从2.509 5下降到1.977 0,平均观察杂合度从0.311 6下降到0.298 1,平均多态信息含量从0.441下降到0.341。马身猪群体基因纯度较高,遗传多样性有逐年降低趋势,在今后的保种和利用工作中,应对马身猪群体的遗传多样性进行实时监测,在世代更替中注意低频率等位基因的保护。 相似文献
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云南高黎贡山猪微卫星DNA多态性分析 总被引：1，自引：0，他引：1
高黎贡山猪是云南省独特的小型猪种,其肌内脂肪的非饱和脂肪酸和营养必需脂肪酸的含量远高于其他猪种,具有发展优质保健猪肉的良好潜质。本研究选用世界粮农组织（FAO）和国际动物遗传学会（ISAG）联合推荐的20个微卫星位点对高黎贡山猪和杂种群体进行遗传学检测和分析。结果表明：20个微卫星座位在群体中均表现为多态,每位点等位基因数2—5个。群体平均多态信息含量高黎贡山猪为0．6829,杂种群体为0．5924,平均杂合度分别为0．7302和0．6465。 相似文献
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C Lemus-Flores R Ulloa-Arvizu M Ramos-Kuri F J Estrada R A Alonso 《Journal of animal science》2001,79(12):3021-3026
The main Creole pig population in Mexico, the hairless Mexican pig, remains as an unimproved and endangered genetic resource. In order to learn more about the genetic characteristics of this pig population, we assessed the allele frequency of 10 microsatellite loci in 177 unrelated hairless pigs from seven regions at Mexico and in 111 pigs of four commercial breeds (Landrace, Large White, Hampshire, and Duroc). Genetic diversity in each population was estimated by the unbiased average heterozygosity and the allele number. Nei's standard genetic distances and a neighbor-joining dendrogram were used to reveal the genetic relationships among these populations. In this report, we present data showing that the level of the genetic diversity in Mexican hairless pigs is high compared with previous reports, and that they belong to a genetic lineage divergent from commercial breeds. Furthermore, Mexican hairless pigs seem to have developed several genetically distinct lines associated with their geographic location. We conclude that the Mexican Creole pig populations may be a reservoir of genetic diversity that is important to preserve and evaluate as a source of new alleles for the future improvement of commercial pig lines. 相似文献