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相似文献
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1.
用正交设计研究了DNA聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)凝胶的简易银染中各因素对银染效果的影响,通过PCR技术扩增了山西白猪第六世代15个耳组织基因组的两条微卫星DNA序列,这些序列经聚丙烯酰胺凝胶电泳分离和500ladder Marker标记跑板后,利用正交法设计简易银染法各因素的组合,对凝胶进行染色。试验结果表明,染色液用AgNO3浓度0.10%、显色用含NaOH1.50%、甲醛0.40%混合液、水温30℃时对PAGE凝胶染色的效果最好。  相似文献   

2.
<正>用2个微卫星标记,通过PCR扩增,利用12%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染显色等方法对河南淮山羊进行微卫星DNA遗传多态性进行研究。结果显示:在Bulge5基因座上检测出6个等位基因,其片段大小在105~140bp之间,其多态信息含量(PIC)、有效等位基因数(Ne)  相似文献   

3.
利用公布的家蚕基因组序列,设计特定的家蚕微卫星引物,对8个不同品种家蚕的微卫星位点进行PCR扩增,所得PCR产物经变性与非变性聚丙烯凝胶(PAGE)分离,银染后发现在非变性PAGE上,条带较粗且模糊,非特异带较多,导致读带误差增大;而在变陛PAGE上,所得条带较细且比较清晰,非特异带明显减少,有利于降低统计误差。  相似文献   

4.
微卫星PAGE银染法及其干胶的简易制备   总被引:3,自引:0,他引:3  
为了使微卫星PCR扩增的DNA片段能得到较好的分离和长期保存实验胶片 ,研究利用 1 5对猪的微卫星引物 ,经PCR扩增 ,非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳 ,银染法显色 ,然后制成了干胶。结果表明 ,聚丙烯酰胺凝胶具有很好的分离微小差异DNA片段的能力 ,而且银染后制成的干胶可长期保存。此法尤其适用于不具备凝胶成像系统和干胶机的实验室使用。  相似文献   

5.
草原红牛微卫星DNA多态性的研究   总被引:1,自引:0,他引:1  
为了更好地培育和改良肉用草原红牛,利用草原红牛、夏洛莱牛、西门塔尔牛、利木赞牛、蒙古牛基因组DNA,用8对微卫星引物进行PCR扩增,并将扩增产物置于1.5%琼脂糖电泳进行观察,如有所需的带则转入8%聚丙烯酰胺变性凝胶(PAGE)中电泳分离,绘制指纹图谱。结果表明微卫星标记方法是一种理想的研究方法。  相似文献   

6.
随机扩增微卫星DNA多态标记(RAMPs)及其应用   总被引:3,自引:0,他引:3  
随机扩增微卫星DNA多态标记是在微卫星DNA基础上衍生出的一种新型分子标记。它综合了微卫星DNA和随机扩增多态DNA(RAPD)两种标记的优点,可用来快速检测动植物群体的遗传变异及分离新的微卫星DNA。本文介绍了随机扩增微卫星DNA多态标记的种类及其应用。  相似文献   

7.
丝羽乌骨鸡群体遗传结构的微卫星标记分析   总被引:9,自引:2,他引:9  
用 9对微卫星引物对 170只丝羽乌骨鸡的基因组DNA进行扩增 ,结果表明 ,9个微卫星标记在该品系中都表现出了丰富的多态性 ,所有扩增结果都能重复。微卫星标记平均每个座位检测到 4 .5 6个等位基因 (3~ 7个 )。 9对微卫星引物平均多态信息含量为 0 .6 0 72 ,标记平均杂合度为 0 .74 2 3。本研究的结果可以为进一步利用微卫星进行丝羽乌骨鸡种质特性等研究提供一定的参考  相似文献   

8.
从鸡血中快速提取高质量基因组DNA方法的研究   总被引:19,自引:1,他引:19  
介绍了一种经改进建立的从鸡血中快速提取高纯度基因组DNA的方法。该方法提取DNA耗时较短,只需2.5~3 h即可拿到DNA样品。提取的DNA样品经紫外分光光度计检测,DNA样品的A260/A280达1.782 2±0.009 3;经琼脂糖凝胶电泳检测,DNA样品的带型清晰、整齐,无拖尾现象;微卫星PCR扩增效果理想。结果表明,该方法所提DNA纯度较高,质量好,分子片段完整,完全能满足分子生物学实验的要求。  相似文献   

9.
微卫星电泳及银染检测中的常见问题分析及对策   总被引:1,自引:0,他引:1  
微卫星DNA,又称短串联重复序列(short tandemrepeat STR),是一类广泛存在于原核/真核生物基因组的DNA串联重复序列。它是继RFLP之后兴起的一种新的分子遗标记技术。因其多态信息含量高,检测快速,重组率低,已被越来越多的应用于基因定位及构建基因组图谱和群体遗传结构分析及杂交优势预测等诸多方面[1]。尽管微卫星标记方法操作简便、快捷,但因其灵敏度高、操作时间短,在实际操作中出现的一些问题常常会影响最终的检测结果。笔者总结了一年来STR工作中所遇到的一些有关于微卫星电泳及银染的常见问题,做出了相应的分析和对策,对于保证…  相似文献   

10.
丝羽乌骨鸡群体遗传结构的微卫星标记分析   总被引:2,自引:0,他引:2  
用9对微卫星引物对170只丝羽乌骨鸡的基因组DNA进行扩增,结果表明,9个微卫星标记在该品系中都表现出了丰富的多态性,所有扩增结果都能重复.微卫星标记平均每个座位检测到4.56个等位基因(3-7个).9对微卫星引物平均多态信息含量为0.6072,标记平均杂合度为0.7423.本研究的结果可以为进一步利用微卫星进行丝羽乌骨鸡种质特性等研究提供一定的参考.  相似文献   

11.
参考1型鸭肝炎病毒基因组序列,设计7条引物,用RT—PCR方法扩增出覆盖整个病毒基因组三个忠实性片段,并按顺序组装进载体pBR322中,获得全长cDNA克隆。测序结果表明,该克隆与母本毒序列同源性达99.6%,并且5’端的T7启动子和3’端的Mlu I线性化位点均成功引入。  相似文献   

12.
根据鸡败血霉形体fMG-2核酸片断序列,设计合成了1对25bp寡核苷酸引物,对鸡败血霉形体基因组DNA进行扩增,均获得预期的732bp扩增产物,检测灵敏度为1bp;参考菌株DNA无扩增。回收纯化琼脂糖电泳凝胶中的扩增产物,DIG随机引物法合成核酸探讨,Dot-blot杂交试验,鸡败血霉形体呈阳性,检测灵敏度为100pg;其他为阴性。对自然发病鸡群检测进一步表明,建立的PCR和探针杂交法具有高度的灵  相似文献   

13.
以产志贺毒素样大肠杆菌(SLTEC)F18ab血清型标准菌株107/86基因组DNA为模板,利用PCR技术成功扩增出编码F18ab完整菌毛操纵子fed基因,克隆入表达载体pBR322,经限制性内切酶酶切分析,DNA琼脂糖电泳鉴定并结合序列测定分析,构建和筛选出含fed完整基因正确插入的pBR322-fed重组质粒,将上述重组质粒转化至不含任何菌毛结构的大肠杆菌SE5000,该表达重组菌能分别与兔抗F18ab亚单位蛋白FedF高免血清、鼠抗F18ab菌毛a单因子单克隆抗体、兔抗F18ab菌毛高免血清和抗F18ab菌毛IgG抗体产生明显的凝集反应。用热抽提法分别抽提和纯化SLTEC F18ab标准株107/86和重组菌SE5000(pBR322-fed)体外表达的F18ab菌毛,纯化菌毛经SDS-PAGE电泳和考马斯亮蓝染色获单一相对分子质量约为15 000蛋白条带。Western-blotting结果表明:兔抗F18ab菌毛高免血清能特异性识别SLTEC F18ab标准株107/86和重组菌SE5000(pBR322-fed)所提纯的单一主要结构蛋白。用重组菌SE5000(pBR322-fed)进行易感仔猪小肠上皮细胞体外黏附试验和黏附抑制试验,结果表明:重组菌SE5000(pBR322-fed)和SLTEC F18ab标准株107/86一样具有较强的黏附易感仔猪小肠上皮细胞的能力,而兔抗F18ab菌毛高免血清能有效地抑制上述重组菌SE5000(pBR322-fed)和SLTEC F18ab标准株107/86对易感仔猪小肠上皮细胞的黏附结合。  相似文献   

14.
以牛精子全蛋白为试验材料进行二维电泳试验研究,优化和改进了一向等电聚焦参数,比较了不同的染色方法,并运用Image Master 6.0软件分析了二维电泳图谱。结果表明,采用24 cm,pH3~10线性IPG胶条进行牛精子全蛋白二维电泳,等电聚焦80000 Vh和结合硝酸银染色方法可得到较多蛋白点和较高分辨率的二维电泳图谱。  相似文献   

15.
PRV闽A株Bam HI片段克隆及其第7片段的鉴定   总被引:4,自引:2,他引:2  
用鸟枪法将PRV闽A株的BamHI酶切片断克隆到pBR322质粒中,再经抗性筛选、酶切鉴定和菌落原位杂交,证实已克隆了PRV闽A株14个BamHI酶切片段中的12个,从而构建了其基因文库,通过Southern转印杂交和酶切图谱分析鉴定了重组质粒pPR128,其插入片段含量包含了PRV闽A株糖蛋白gp50基因在内的BamHI-7片段,核酸长约6.8kb。  相似文献   

16.
鹅微卫星(TG)_n基序的克隆及序列比较分析   总被引:5,自引:2,他引:5  
以(TG)10重复基序设计引物对鹅基因组DNA进行PCR扩增,PCR产物经12%的非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳后银染检测,共获得了7种基因型,4种等位基因;并且在各供试鹅品种上表现出多态性,可以实现遗传分类研究。对回收的不同条带进行纯化、克隆测序;测序结果显示各品种都有(TG)n基序存在,并且各个条带中重复数大于10。  相似文献   

17.
An Anaplasma marginale DNA probe has been developed by using an improved method for the isolation of genomic DNA. Purified genomic A. marginale DNA from the St. Croix isolate was partially digested with Sau 3A1 into fragments (greater than or equal to 5.0 kb). The restriction fragments were cloned using standard techniques in the pBR322 vector and used to transform E. coli (DH5) host cells. The recombinant A. marginale DNA library was screened by the colony lifting procedure. Colonies containing plasmids with A. marginale DNA inserts were identified by hybridization with a genomic A. marginale DNA radiolabeled probe (32P). Seven recombinant A. marginale DNA probes were evaluated by dot-blot in vitro hybridization assays to identify candidates as diagnostic tools in bovine anaplasmosis studies. Specificity and sensitivity experiments were carried out by using heterologous and homologous DNAs. The heterologous panel contained bovine DNA (WBC) and blood parasites DNA from Babesia bovis (Bb), Babesia bigemina (Bbi), Eperythrozoon suis (Es) and Eperythrozoon wenyoni (Ew). The homologous DNA panel included A. marginale DNAs of 12 different isolates which were isolated in the Caribbean, Mexico, and the U.S.A. The selected diagnostic probe was identified as pSt. Croix A1, and labeled with 32P by using in vitro nick translation and random primer techniques. The pSt. Croix A1 probe demonstrated 100% specificity and high sensitivity by hybridization in dot blotting and Southern blotting. The probe can detect 500-1000 infected erythrocytes per microliters which corresponds to a parasitemia of less than 0.01%. The A. marginale DNA insert was approximately 6.4 kb in size and a partial restriction map has been constructed.  相似文献   

18.
Various double-stranded RNA extraction procedures, gel electrophoresis systems, and methods to detect the RNA bands in the gel were investigated to find the most rapid methods to obtain the genome profiles of bluetongue virus in small volumes (1–25 ml) of infected cell culture fluids. Rapid double-stranded RNA extraction procedures coupled with staining the acrylamide gel slabs with ethidium bromide or silver nitrate resulted in well-defined genome profiles from bluetongue virus infected cell cultures in 6–48 h. Radioactive labelling of viral RNA with 32P was time consuming, cumbersome and expensive. These techniques detect less than 0.5 μg of double-stranded RNA which can be obtained from one 1-ml well of a 24-well cluster plate of bluetongue virus infected cell monolayers. The methods were therefore suitable for rapid comparisons of the electropherotypes of multiple virus isolates.  相似文献   

19.
Abstract

Lipopolysaccharide (LPS) was purified from 40 isolates of Edwardsiella ictaluri by two methods: (1) enzyme digestion and hot aqueous phenol extraction and (2) enzyme digestion and gel exclusion chromatography. Purified LPS was examined by sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) and by immunoblot analysis. Both methods of purification yielded smooth LPS as evidenced by a ladderlike pattern of more than 40 LPS bands. With silver staining, both low- and high-molecular-mass LPS bands were seen. Lower-molecularmass LPS stained more intensely than higher-molecular-mass LPS bands, indicating a preponderance of lower-molecular-mass LPSs. Lipopolysaccharide bands from the 40 isolates migrated similarly within SDS-PAGE gels, indicating a high degree of structural similarity among the isolates examined. The ladderlike array was more easily seen with immunoblot analysis than with silver staining of SDS-PAGE gels. Additionally, immunoblot analysis revealed a high degree of antigenic similarity among the 40 isolates.  相似文献   

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