津南芹菜EST-SSR指纹图谱的构建及遗传差异分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

兰青阔  李欧静  张继波  赵新  朱珠  陈锐  徐石勇  王永  郭永泽 《天津农业科学》2012,18(5):7-11

以天津市津南11个芹菜育种材料为研究对象,利用EST-SSR分子标记技术构建津南芹菜分子指纹图谱,并用于遗传多样性分析。从GenBank数据库查询芹菜EST序列1122条,使用BatchPrimer3在线软件扫描分析获得194个候选EST-SSR位点,并设计141对SSR-PCR引物。选择其中47对引物进行多态性分析,确认8对引物具有多态性。构建基于Excel格式的津南芹菜EST-SSR指纹图谱,包括8对引物在供试材料中扩增到的44条多态性条带信息。遗传多样性分析显示,供试材料间遗传相似系数介于0.409～0.864之间,平均为0.664。本研究建立的津南芹菜EST-SSR指纹图谱稳定有效,可用于芹菜种质资源鉴定和品种真实性检测。  相似文献   

基于SNP标记的种子纯度高效检测分析模型的建立   总被引：3，自引：0，他引：3  

李欧静  张桂华  兰青阔  王永  赵新  朱珠  陈锐  郭永泽 《湖南农业科学》2012,(19):9-11,14

单核苷酸多态性(SNP)标记具有二态性等优点,可用于种子纯度鉴定。应用焦磷酸测序技术对黄瓜SNP位点CLA13(C/G)进行了分析。结果表明,该位点在16个黄瓜杂交种中多态信息量达0.556,处于高度多态,适于其中7个品种的纯度检测;为提高种子纯度鉴定效率,引入DNA Pooling技术,建立高效率的3Pooling SNP Pyrosequencing检测分析模型,并验证了分析模型的可行性。  相似文献   

基于高分辨率熔解曲线技术快速筛选黄瓜SNP1     

兰青阔  张桂华  王永  赵新  朱珠  孙玉河  郭永泽  程奕 《分子植物育种》2011,(5):642-647

为筛选用以黄瓜纯度检验和品种鉴定的SNP位点,以17个黄瓜杂交品种及其34份亲本为SNP筛选群体,利用高分辨率熔解曲线(high resolution melting,HRM)技术筛选SNP位点.本研究通过HRM分析和焦磷酸测序确认,获得CLA0(TT/--)、CLA1(C/T)和CLA6(A/G)三个SNP位点,群体...  相似文献   

转基因检测数据库概述     

李夏莹  王颢潜  李文龙  孙双艳  王永  兰青阔  张秀杰 《植物检疫》2021,(2):8-11

转基因检测方法和标准物质是转基因生物安全管理的技术支撑,本文对国内外转基因作物信息数据库、转基因检测方法数据库、筛选检测在线分析工具和转基因标准物质库进行了整理;并分析了各数据库的特点,以期为转基因检测的信息获取提供指引,为我国转基因检测信息平台的建设提供思路。  相似文献   

基于焦磷酸测序技术的基因编辑位点检测方法的建立     

李葱葱  高越  沈晓玲  李飞武  赵新  龙丽坤  李亮  王永  兰青阔 《中国农业大学学报》2019,24(9):10-16

为探索建立基因编辑农产品的检测方法,本研究以猪MSTN基因定点编辑位点为靶标,通过设计PCR-焦磷酸测序引物、优化测序碱基次序、构建标准曲线等步骤,建立基于焦磷酸测序技术的基因编辑产品定性和定量检测方法。结果表明,该方法能够准确检测出MSTN基因第3外显子的AG缺失位点,具备基因分型定性判定和等位基因频率定量检测的功能,从而准确检测样品是否为MSTN基因编辑猪产品,以及样品基因编辑产品的含量。  相似文献   

4种食源性致病菌的PCR-SSCP检测技术研究   总被引：3，自引：0，他引：3  

王永  赵新  兰青阔  朱珠  程奕 《天津农业科学》2009,15(1):13-15

采用细菌的16S rDNA保守区引物作为通用引物,对常见食源性致泻大肠埃希氏菌(Diarrheogenic Escherichiacoli)、沙门氏菌(Salmonellae)、金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)和蜡样芽胞杆菌(Bacillus cereus)进行PCR扩增,产物及其XmnI酶切后产物进行单链构象多态性分析。试验结果显示,4种食源性致病菌的PCR产物经XmnI酶切后进行单链构象多态性分析可以相互区别。因此,PCR-SSCP技术可以方便地用于检测食源性大肠杆菌、沙门氏菌、金黄色葡萄球菌和蜡样芽胞杆菌。  相似文献   

食品中微生物危害控制及风险评估研究   总被引：1，自引：0，他引：1  

王永  赵新  兰青阔  朱珠  陈锐  刘娜  李欧静 《天津农业科学》2014,(5):47-50

近年来我国食品安全恶性、突发性事件频频发生,不仅给消费者带来了健康风险,更危及了人们的生命安全,也扰乱了国际进出口贸易的稳步流通,造成国民经济损失,严重影响我国国际贸易形象和可信程度。在我国,由于食品中微生物危害导致的食品安全问题呈逐年上升趋势。微生物的危害控制和风险评估,能够帮助政府和企业增强风险防范意识、提高风险管理能力,并依此为依据制定合理的相关食品限量标准,从而提高整体食品安全水平。笔者概述了国内外食品中微生物危害控制和风险评估技术的研究现状,探讨了微生物风险评估相对于其他风险评估的难点,并对微生物定量风险评估未来的发展趋势进行了分析。  相似文献   

道地中药材川贝母特异性PCR鉴别方法研究     

张富丽  张义蓉  兰青阔  杨晓凤  刘炜  付绍兵  刘茜  陈敏  尹全 《中国农学通报》2022,38(19):59-65

为建立快速检测中药材川贝母成分的特异性PCR法,从NCBI数据库下载植物HMGR基因序列,根据同源性区域设计兼并引物,对川贝母及其易混品鳞茎基因组进行扩增。通过比对川贝母特异性DNA片段区域,设计引物扩增获得川贝母基原物种特异核酸片段。从川贝母基原鳞茎中提取DNA,设计特异引物对BMH-TF/BMH-TR,优化PCR扩增条件,通过特异性、灵敏度实验验证,建立特异性PCR检测体系。采用该方法从川贝母基原中扩增出一条120 bp左右条带,而非川贝母样品、空白对照在相同条件下无扩增条带,检测灵敏度为2 ng/μL,检测下限为4 ng。对10个市售药材的检测结果证明,该方法简便可行、重现性好。该PCR法可快速、准确鉴别川贝母基原,具有操作简便、快速、特异性高的优点。  相似文献