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为预测前期筛选到的可能影响烟草烟碱含量的NtABCG6L基因是否具有转运烟碱功能,本研究采用生物信息学方法对NtABCG6L基因的启动子序列以及编码蛋白的理化性质和结构进行分析,利用软件对烟碱与NtABCG6L蛋白进行分子对接,并分别在烟株打顶0、7、14、21 d取根、茎、叶测定烟碱含量和NtABCG6L基因的相对表达量,以分析NtABCG6L基因表达量与烟碱转运效率的关系。结果表明,NtABCG6L基因共编码729个氨基酸;NtABCG6L蛋白分子量为81.29 kDa,理论pI值为8.97,含有ABC_transporter-like_ATP-bd、ABCG_dom、ABC_2_trans结构域,二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成,存在跨膜结构,主要定位在细胞膜上,预测NtABCG6L是一个跨膜转运蛋白。NtABCG6L蛋白与烟碱可以通过氢键结合,结合能为-2.95。 NtABCG6L基因主要在烟草根部表达,打顶14 d表达量最高,其表达量与烟碱转运系数呈显著正相关关系,初步推测NtABCG6L基因参与了烟碱的转运过程。本研究结果可为进一步采用基因编辑技术明确其功能提供依据。 相似文献
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为研究低氧条件对猪胸膜肺炎放线杆菌(Acfinobacillus pleuropneumaniae,APP)血清1型ArcA基因表达的影响,并探讨ArcA在低氧环境中的作用机制,作者建立了体外培养模型,在低氧环境中培养APP,采用半定量RT-PCR方法,以看家基因recF为内参,检测ArcA基因在低氧条件下的表达水平。结果表明ArcA基因在常氧条件下不转录或低转录,而在低氧环境下高转录,并呈现转录量先升高后降低的趋势。这表明ArcA基因可能是胸膜肺炎放线杆菌潜在的毒力基因,在致病过程中发挥重要作用。 相似文献
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基于荧光检测技术的小麦品种SSR鉴定体系的建立 总被引:6,自引:3,他引:3
【目的】建立基于SSR荧光标记的小麦品种DNA指纹鉴定体系,为中国小麦育成品种鉴定提供高通量技术手段。【方法】收集已定位到小麦21条染色体上的SSR标记引物,通过PCR扩增和变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测技术,筛选在中国小麦育成品种中多态性高的标记,对筛选出的引物5′末端利用6-FAM、HEX、ROX和TAMRA 4种荧光染料之一进行标记,利用DNA分析仪对扩增产物的峰型进行评价并检测不同等位变异的扩增片段大小,选择峰型简单易读、多态性高、较均匀分布到21条染色体上的标记,确定不同位点等位变异的大小及相应的参照品种,建立基于荧光SSR标记的高通量小麦品种鉴定体系。【结果】利用2 438对SSR标记对8份植物学性状差异大的小麦育成品种进行初步筛选,共筛选出260对多态性较高、扩增稳定的SSR引物。利用上述260对引物对48份小麦品种继续进行复筛,选出130对扩增稳定、多态性高、带型好的SSR引物。对这些引物的正向5′末端分别标记6-FAM、HEX、ROX和TAMRA荧光后,利用DNA分析仪进行检测评价,最终选择了42个PCR扩增稳定、峰图简单、多态性高、连锁群分布均匀的SSR荧光标记。根据DNA分析仪检测到的每个标记的不同等位变异大小,为相应位点的不同等位变异进行了命名,并为每个等位变异选取了相应参照品种。根据每个引物标记的荧光和扩增的片段大小范围对42对引物进行合理搭配,在同一毛细管内对多个荧光标记进行检测,提高了DNA指纹数据采集效率,降低了检测成本。利用该体系对1 625份小麦育成品种进行DNA指纹数据采集,在42个位点中共检测到434个等位变异,每个位点的等位变异个数在3-23,平均10.3个;每个位点的PIC值范围为0.240-0.829,平均0.610。利用1 625份小麦育成品种DNA指纹数据,构建了中国小麦育成品种的DNA指纹数据库。【结论】筛选出42对SSR标记引物,建立了基于荧光SSR标记的小麦品种鉴定体系,可用于高通量小麦品种DNA指纹鉴定。 相似文献
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食品包装材料与食品直接接触,其本身所含有的单体、添加助剂、分解产物等化学物就可能通过吸收、溶解、扩散等途径迁移到被包装的食品中,污染食品,危害消费者健康.通过对油脂、瓶装水、调味品、奶制品、饮料这五类食品的包装进行了1074个样本数的市场调查,研究了塑料包装材质占食品包装材质的比例.结果发现:塑料包装制品是市场主导的食品包装材料,占所调查食品包材的一半以上,其次为玻璃包材,纸质材料及金属包材占比很少.研究讨论了塑化剂在食品包装材料的残留及迁移规律,以及不同的包装材料对食品的方便性、稳定性和成本方面的影响,探讨了食品包装的发展趋势. 相似文献
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为探明水稻千粒重与外观品质性状的相关性,进而为水稻大粒品种的选育提供理论参考,对鄂晚10号和大粒王组配的F7代242个群体进行千粒重及外观品质性状的考察,运用SPSS 17.0软件,进行相关性及通径分析。结果表明:千粒重与粒长、粒宽、粒厚及垩白粒率呈极显著正相关,粒长与长宽比、粒厚、垩白粒率呈极显著正相关,粒宽与长宽比呈极显著负相关,与粒厚、垩白粒率呈极显著正相关,长宽比与粒厚、垩白粒率呈极显著负相关,粒厚与垩白粒率呈极显著正相关。通径分析表明,粒宽对千粒重的作用最大,粒长次之。 相似文献
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针对目前土壤-农作物镉污染问题,以浙江省40个县(市、区)主要优势农产品产区为研究对象,在粮食、油菜、蔬菜种植地以及茶园和果园土壤中共采集898个单元土壤样品及相对应的五大类农作物,并对其镉含量进行分析评价;同时采用富集系数比较不同农作物对土壤重金属镉的吸收差异。结果表明,研究区产地土壤和农作物的镉含量存在一定程度超标,土壤超标率为10.69%,农作物超标率为4.57%。不同农作物对土壤镉的富集系数差异较大,变化范围在0.002~0.257之间。土壤-农作物镉含量的相关性并不显著。 相似文献
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叶片数是烟草产量的重要构成因素,对提高烟农种烟收入和保证卷烟原料的供应有重要意义。低温易引起烤烟早花,导致叶片数减少,而韭菜坪2号可在高海拔地区种植,且叶片数不受影响。为揭示韭菜坪2号烤烟叶片数的遗传规律,本研究以叶片数较少的优质烤烟NC82和叶片数较多的烤烟品种韭菜坪2号为亲本,构建六世代(P1、P2、F1、F2、BC1和BC2)遗传群体,采用“主基因+多基因”混合遗传模型对韭菜坪2号的叶片数进行遗传分析。结果表明,最优模型为2MG-ADI,即受2对加性-显性-上位性主基因控制,2对主基因中加性效应起主导作用,且存在互效作用;主基因在F2、BC1、BC2世代的遗传率分别为62.72%、6.87%、45.51%,遗传率不高,可能受环境或其他因素的影响较大。本研究结果为韭菜坪2号叶片数基因的遗传和利用提供参考依据。 相似文献
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YABBY基因家族是种子植物特有的一类转录因子,具有C2C2锌指结构域和YABBY结构域,该家族在植物的发育过程中起重要调控作用。为研究烟草YABBY基因家族的成员及其作用,利用生物信息学技术从烟草基因组数据库中鉴定YABBY基因,并分析其蛋白理化性质、构建系统发育树、分析启动子顺势作用元件等。结果表明:在烟草基因组中一共鉴定到7个NtYABBYs基因,分为5个亚家族,均无跨膜结构,定位于细胞核内,启动子顺式作用分析表明NtYABBY基因含有与植物生长发育、植物激素、防御与胁迫等相关的顺势作用元件。该结果可为烟草NtYABBYs基因家族的进一步研究提供理论基础。 相似文献