棉花纤维发育早期RNA-Seq转录组分析   总被引：3，自引：2，他引：1  

李锡花  吴嫚  于霁雯  张金发  范术丽  宋美珍  庞朝友  喻树迅 《棉花学报》2013,25(3):189-196

 为了揭示棉花纤维发育早期基因表达变化情况,本研究以纤维长度存在显著差异的两个陆海回交近交系NMGA-062（32.58 mm）和NMGA-105（27.06 mm）为材料,利用Illumina HiSeq^TM 2000对0、3 DPA（Days post anthesis）的胚珠及10 DPA的纤维进行RNA-Seq测序。六个文库进行拼接,共得到长度大于200 bp的Unigene 98464个,总长度约为88.2 Mb。对10 DPA的纤维转录组数据进行差异表达分析,共筛选到1931个差异表达基因,1536个Unigene上调,395个Unigene下调。GO（Gene ontology）功能显著性富集和Pathway显著性富集分析发现,差异表达基因富集在脂质转移活性（Lipid transport activity）分子功能组和脂质代谢通路（Lipid metabolism pathway）,由此推测脂类相关基因可能在纤维伸长发育过程中起重要作用。通过对棉纤维发育10 DPA基因转录水平差异比较分析,为深入开展纤维伸长相关功能基因的克隆和功能验证提供了丰富的资源,并为揭示棉花纤维伸长的机制打下了坚实的基础。  相似文献   

陆地棉MADS-box基因GhMADS13的功能分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

江苏城  宋美珍  庞朝友  魏恒玲  范术丽  喻树迅 《棉花学报》2013,25(5):377-381

为了研究GhMADS13的功能,利用NCBI上提交的序列设计引物进行PCR扩增,扩增序列与提交序列的ORF (Open reading frame)的一致性为100％.qRT-PCR结果表明:棉花的各个组织中,GhMADS13在花中的表达量最高,是表达量低的根的几百倍;花器官中GhMADS13在萼片、花瓣、雄蕊、心皮和胚珠中都有表达,表达量虽有差异,但差异不大,其在胚珠中的表达量最高.将GhMADS13插入到pBI121载体上,构建了植物超表达载体.通过浸花法转化拟南芥,获得了2个转基因株系,分子检测和表型数据统计的结果表明GhMADS13的转录水平越高植株越矮小,角果的长度越短,种子的数目越少.根据GhMA DS13的qRT-PCR结果和异位表达分析,推测GhMADS13主要抑制胚珠的发育.  相似文献   

棉花GhMADS29启动子克隆及表达分析   总被引：3，自引：2，他引：1  

张文香  范术丽  宋美珍  庞朝友  魏恒玲  喻树迅 《棉花学报》2013,25(4):309-315

以实验室克隆的GhMADS29(GeneBank登录号:JQ682642)基因的cDNA序列Blast搜索雷蒙德氏棉的基因组序列,根据Blast结果设计引物,克隆到起始密码子上游-19位开始的1316 bp的序列;利用PlantCARE启动子在线分析软件预测其含有核心启动子元件TATA-box和CAAT-box,并含有光、温、赤霉素、水杨酸、生长素等的响应元件.通过替换pBI121载体上的CaMV35S启动子构建了GhMADS29启动子与GUS基因的融合表达载体并转化拟南芥,组织化学染色分析发现其在14d幼苗的根和叶中都有表达,在萼片、花瓣、雌蕊、果瓣中也表达,而在雄蕊和种子中不表达.综上所述,我们推测GhMADS29可能与各种开花途径有关,与萼片、花瓣、雌蕊等花器官的发育有关,还可能与果实是否开裂有关.  相似文献   

利用基因芯片技术筛选棉花产量性状相关的基因   总被引：2，自引：2，他引：0  

张利媛  于霁雯  吴嫚  马建辉  范术丽  宋美珍  庞朝友  李兴丽  张金发 《棉花学报》2013,25(5):417-425

根据皮棉产量数据的重复性测验及显著性分析,从SG747(Gossyp ium hirsutum L.)和Giza75(Gossypium Barbadense L.)的回交自交系群体中选取高产组和低产组品系各3个材料,取这2组材料和其父母本开花后10d的纤维进行芯片分析.比较芯片数据,获得了1508个差异表达基因.对这些差异表达基因进行聚类分析,结果显示高产组品系和低产组品系分别聚类在一起,符合基于田间数据分组的预期结果.利用Blast2GO软件对1508个差异表达基因进行Blast-Mapping-Annotation-KEGG分析,结果表明参与细胞质膜发育、过氧化物酶活性、抗逆和营养物质运输等生物学过程的基因最多.进一步利用RT-PCR分析,得到一系列与纤维品质和产量等性状密切相关的基因.研究结果为棉花高产基因工程和分子育种提供了丰富的基因资源.  相似文献   

丰产优质棉花品种——新石K24     

杨永林  李豪  许鸿越  杨名  徐媛媛  秦江鸿  马启峰  王龙  范术丽 《中国棉花》2019,46(8):34-35

主要介绍新石K24的选育过程、生物学特性、产量、纤维品质、抗病性及栽培技术要点。  相似文献   

早熟陆地棉新品种酒棉20号的选育与栽培技术   总被引：2，自引：2，他引：0  

詹有俊  范术丽  杨涛  孙建船  王龙  张璇  陈辅志  喻树迅  杨军  马启峰 《中国棉花》2018,45(4):26-27

本文概述了酒棉20号的亲本特点、选育过程及其主要农艺经济性状、抗病性和栽培技术要点。  相似文献   

中棉所36均一化全长cDNA文库的构建与鉴定   总被引：10，自引：0，他引：10  

吴东  刘俊杰  喻树迅  范术丽  宋美珍 《作物学报》2009,35(4):602-607

  相似文献   

新一代测序技术的应用及其对作物分子育种的影响     

代军杰  喻树迅  庞朝友  宋美珍  范术丽 《中国棉花》2012,39(4):1-5

作为分子生物学研究中最常用的技术之一,近年来DNA测序技术的快速发展,催生了一批基因组学和后基因组学研究手段。本文概述了以Roche/454Genome Sequencer FLX System、Illumina/Solexa Ge-nome Analyer IIx和ABI SOLID System等测序平台为标志的新一代测序技术的基本原理以及优缺点,并分析了目前的主要应用情况,展望了新技术的发展对作物分子育种产生的影响。  相似文献   

非洲三国棉花考察报告（一）   总被引：1，自引：0，他引：1  

王坤波  毛树春  杨伟华  范术丽  申和平  李宁辉  周旭英 《中国棉花》2012,39(3):1-8

 通过对马里、贝宁和乍得棉花考察,概述了其棉区分布与特点、棉花品种、主要生产管理技术等。  相似文献   

棉花芽黄材料主要光合特性和农艺性状的研究   总被引：1，自引：0，他引：1  

宋明梅  范术丽  庞朝友  魏恒玲  喻树迅  宋美珍 《棉花学报》2014,26(6):531-538

以v1、v2、v3、v4、v5v6、v8、v9、v10、v11、v13、v14、v15、v16v17、v18、v19、vg和彭泽芽黄等17份芽黄突变体材料及中棉所58突变体中58vsp为研究对象,测定了各材料不同时期不同叶位的SPAD值、叶绿素荧光参数最大光化学效率值(Fv/Fm)和光系统Ⅱ量子产量(φPSⅡ),同时对各芽黄突变体材料的主要农艺性状和纤维品质性状进行了调查和研究。结果表明,芽黄材料作为一种叶色突变体,其叶片相对叶绿素含量在不同时期、不同叶位的差异较大,各芽黄材料均以倒5叶或倒4叶的SPAD值最高,刚展平的倒2叶的SPAD值最小,其中中58vsp的倒2叶SPAD值最低;随着植株的发育,所有芽黄材料在7月5日、15日其倒4、倒5叶的SPAD值达到最大。与光合作用密切相关的最大光化学效率值(Fv/Fm)和PSⅡ量子产量(φPSⅡ)在各芽黄突变体材料之间差异也较大,其中v2最高,v3、v19最低。另外还发现各芽黄突变体材料的主要农艺性状和纤维品质性状存在较大的差异。本文对于不同芽黄突变体材料特性的初步研究,将为更好地将芽黄突变体用于棉花遗传育种和分子生物学研究打下了理论基础。  相似文献