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青壳性状是鸭(Anas platyrhynchos domesticus)重要的经济性状,但其遗传机制尚未揭晓.为研究鸭青壳性状形成的转录组基础,本研究通过测交法选育出基因型为纯合青壳以及纯合白壳绍兴鸭,并对两种基因型个体子宫组织进行转录组测序.本研究共获得288 008 582个高质量数据,组装出64 587个转录本,其中包括19 589个新转录本.鉴定20 302次可变剪切事件,其中外显子跳跃是最主要的可变剪切类型.表达分析发现1 768个基因在两种基因型个体间差异表达,其中包括与蛋壳主要色素物质(原卟啉、胆绿素及其螯合物)相关的基因,例如胆绿素还原酶A基因(biliverdin reductase A,BLVRA)、尿卟啉原Ⅲ合酶基因(uroporphyrinogenⅢsynthase,UROS)、血红蛋白α亚基基因(hemoglobin subunit alpha-1,HBAl)以及血红素绑定蛋白1基因(heme binding protein 1,HEBPl)等.差异基因的基因本体(Gene Ontology,GO)注释以及京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析表明这些基因涉及广泛的生物功能及通路,其中与蛋壳颜色形成密切相关的有血红素代谢功能(例如,血红素绑定以及四吡咯绑定)及胆汁代谢通路(例如,胆汁酸合成通路,胆汁分泌通路).本研究首次探索了鸭蛋壳颜色形成的转录组基础,获得了一批差异表达基因,这些基因为进一步研究鸭蛋壳颜色形成的遗传机制提供了有价值的信息. 相似文献
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鸽子GR基因cDNA克隆与表达分析 总被引：1，自引：0，他引：1
糖皮质激素受体(glucocorticoid receptor, GR)是保守的核受体超家族中的一员,属于核转录因子,GR对维持机体稳态起着重要作用,同时在动物繁殖代谢过程中扮演着重要的角色.本研究旨在克隆鸽子(Columba livia domestica) GR基因的cDNA全长并分析其组织表达谱.参照鸡(Gallus gallus domesticus)的GR基因序列设计引物,利用RT-PCR和RACE技术,克隆得到了鸽子的GR基因的cDNA序列.测序结果表明,鸽子GR基因包含有2313bp的全长CDS序列,102bp的5'UTR序列,以及18 bp的3'UTR序列,共编码770个氨基酸(GenBank登录号:NM001037826.1).通过序列同源性分析发现,鸽子GR氨基酸序列与鸡的同源性为94％,与短吻鳄(Alligator mississippienses)的同源性为85％,与人(Homo sapiens)的同源性为75％.通过与鸡、鳄鱼和人的氨基酸序列比对分析发现,鸽子的GR氨基酸序列中有一个非常保守的DNA结合区(DNA binding domain,DBD)和一个保守性较高的激素识别区(hormone recognition domain, LBD),此外还包括一个GR特异区域.利用qRT-PCR技术发现在鸽子不同组织中均有表达,表达量由高到低依次为睾丸、胰、肺、卵巢、腹部脂肪、肝、心、骨骼肌、肾、脾、输卵管、胃、下丘脑、大脑、肠和嗉囊.睾丸中表达量显著高于其他组织(P＜0.05),其次为胰腺和肺(P＜0.05),在嗉囊中的表达量显著低于其他各组(P＜0.05).本研究获得鸽子GR基因cDNA全长、组织表达规律,为进一步研究鸽子GR基因的功能提供了基础资料. 相似文献
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为研究胆绿素还原酶A(BLVRA)基因的结构功能,探索其与鸭青壳性状的相关性,根据鸭BLVRA基因部分已知编码序列(CDS),采用RT-PCR和5′RACE方法扩增缙云麻鸭BLVRA基因mRNA的3′和5′末端未知序列,应用荧光定量PCR方法测定鸭输孵管子宫部BLVRA基因表达量,用反射系数法测定蛋壳颜色。结果表明:鸭BLVRA基因cDNA由1071个核苷酸组成,编码302个氨基酸,等电点为7.15,分子量为34.3ku,分别将已有编码区序列向5′和3′端延伸238和199bp,与鸡、珍珠鸟、蟾蜍、牛、人和小鼠的相应氨基酸序列的相似性分别为95.3%、95.0%、70.0%、61.1%、60.5%和59.5%。白壳蛋缙云麻鸭输孵管子宫部BLVRA基因的相对表达量约是深青壳蛋鸭相对表达量的3倍(P0.01),蛋壳颜色的反射系数与BLVRA基因mRNA相对表达量呈显著的正相关(r=0.719,P0.05)。初步推断BLVRA基因可作为青壳蛋鸭分子选育的候选基因。 相似文献
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旨在获得白羽王鸽(Columba livia)卵清蛋白关联蛋白Y基因(OVALY)的cDNA序列,并进行生物信息分析。研究结果显示:OVALY基因cDNA全长为2 068 bp,其中5'非编码区序列180 bp,3'非编码区序列720 bp,开放阅读框1 164 bp,编码的蛋白分子量约44.19 ku,含氨基酸残基388个(GenBank∶KX230792);与NCBI数据库中朱鹮(Nipponianippon)OVALY基因序列同源性最高(81%),与白尾鹰(Haliaeetusalbicilla)和沙鸡(Pteroclesgutturalis)OVALY基因序列的同源性分别为80%和79%。经潜在糖基化位点和磷酸化位点预测分析发现,OVALY蛋白结构中潜在糖基化位点和磷酸化位点分别为4个和22个;经CDD(conserved domain database)数据库分析发现,OVALY蛋白具有丝氨酸蛋白酶抑制剂家族的反应中心区域,属于丝氨酸蛋白酶抑制剂超家族。 相似文献
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对法国番鸭和2个地方选育番鸭品系(分别定名为品系Ⅰ和品系Ⅱ)杂交,并对这2个杂交后代个体从出生到屠宰日龄的体重进行间隔称重,对这些结果进行生长曲线拟合和屠宰性能的比较分析。结果表明,法国番鸭与品系Ⅱ的杂交后代生长性能表现出明显的后期生长加快,前期(即初生到50日龄)体重没有显著的差异,生长曲线拟合表明法国番鸭与品系Ⅰ的杂交后代Logistic生长模型拟合较好,拟合度为99.68%;而与品系Ⅱ的杂交后代则适合用Gompertz模型描述,拟合度为99.80%;屠宰测定结果说明,法国番鸭与地方品系Ⅰ的杂交后代要比与地方品系Ⅱ的杂交后代性能表现更为明显(P>0.01),杂交优势主要表现在活体重、屠体重、半净膛重、全净膛重上。 相似文献
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为比较不同品系鸭及其杂交组合的蛋品质差异,从绍兴鸭、缙云麻鸭、山麻鸭、绍兴鸭×缙云麻鸭和山麻鸭×缙云麻鸭共5个品种(组合)选育出的5个青壳系为研究对象,每个品系随机抽取青壳蛋各30枚,进行蛋品质测定和相关性分析。结果表明:各品系蛋形指数无显著差异(P>0.05),均符合蛋形标准;绍兴鸭×缙云麻鸭的蛋壳厚度最大,与绍兴鸭、山麻鸭、山麻鸭×缙云麻鸭3个品系差异显著(P<0.05);绍兴鸭×缙云麻鸭和山麻鸭的蛋壳强度最大,与绍兴鸭差异显著(P>0.05);绍兴鸭的蛋重最大,显著高于其他品系(P<0.05);蛋白高度绍兴鸭×缙云麻鸭最高,与其他品系差异显著(P<0.05);缙云麻鸭的哈夫单位数值最大,绍兴鸭最小,差异显著(P<0.05)。总体上看,绍兴鸭×缙云麻鸭蛋壳厚度、蛋壳强度和蛋白高度均为最佳,而绍兴鸭的蛋重最大。蛋品质各性状相关分析发现:蛋壳厚度与蛋壳强度呈极显著正相关(P<0.01);哈夫单位与平均蛋重呈负相关(P<0.05),与蛋白高度强正相关(P<0.01)。 相似文献
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白耳黄鸡体尺及屠宰性能的相关性分析 总被引：4，自引：0，他引：4
对30只150日龄的白耳黄鸡进行体尺及屠宰性能的测定,并对所有测定性状间的相关性进行了分析。结果表明,白耳黄鸡的平均活重、屠体重、半净膛重、全净膛重、胸肌重、腿肌重分别为1 286.00 g,1 147.00 g,981.27 g,777.67 g,64.97 g,99.60 g;屠宰率89.19%;半净膛率76.31%;全净膛率60.50%;胸肌率8.36%;腿肌率12.85%;相关分析表明,性状间存在显著或极显著的相关。 相似文献
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大豆黄酮对产蛋初期期和后期绍兴鸭产蛋性能及血清激素水平的影响 总被引：7，自引：0，他引：7
日粮中添加3mg/kg大豆黄酮分别饲喂产蛋初期和产蛋后期绍兴鸭,观察其对产蛋性能、血清GH、IGP-1和E2水平的影响.结果表明,产蛋初期添加大豆黄酮显著降低绍兴鸭产蛋率和平均蛋重,饲料转化率下降,并伴随有血清GH水平显著降低.相反,产蛋后期添加大豆黄酮,绍兴鸭产蛋率和平均蛋重均显著增加,血清GH水平也明显提高.无论在产蛋初期还是后期添加大豆黄酮对血清IGF-1和E2水平均无显著影响.结果表明,产蛋初期添加大豆黄酮对绍兴鸭的产蛋性能具有抑制作用,而产蛋后期添加大豆黄酮可以促进绍兴鸭的产蛋性能,血清生长激素水平的相应变化提示GH可能是大豆黄酮作用途径的一个环节. 相似文献
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众所周知，鸭蛋蛋壳色泽与蛋壳质量密切相关，青壳鸭蛋色彩鲜自然，且其蛋壳质量明显优于白壳蛋。在加工、运输、贮藏过程中，较好的蛋壳质量有利于减少因破损所造成的经济损失，又因青壳鸭蛋具有自然鲜艳的外观，深受消费者的喜爱，消费量与日俱增。目前，国内对绿壳鸡蛋的蛋壳质量与营养成份的研究报道甚多，普遍认为绿壳鸡蛋的营养价值高于普通鸡蛋，而对青壳与白壳鸭蛋的蛋壳质量及营养成份对比研究报道甚少，为此，我们进行了本项研究，现将结果报道如下： 相似文献