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青花菜又名西兰花、绿花菜。青花菜营养丰富,花球鲜嫩碧绿,烹调后绿色不变,清香柔嫩。由于钱塘江围垦区块生产的青花菜球形好、花球紧实,是当前垦区出口蔬菜的主要品种,具有良好的发展前景。 相似文献
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致敏原是能引发Ⅰ型过敏反应的抗原性物质,桑树的花粉和果实均能引起人的过敏反应。为了解桑树的潜在致敏原信息,以报道的致敏原为探针,搜索桑树蛋白数据库,获得桑树潜在致敏原信息,并对其家族分布、结构和功能进行分析。结果显示,共获得143条桑树的潜在致敏原蛋白,它们分属于71个不同的基因本体(gene ontology,简称GO)注释子条目和49个pfam家族,且其结构和功能各不相同。其中多个成员属于常见的致敏家族,如Bet v 1家族、Profilin家族、Thaumatin家族、Rlp A-like_DPBB家族,与已鉴定的致敏原具有较高的序列一致性和相似的三级结构。研究结果有助于过敏症的临床诊断和交叉反应的预警。 相似文献
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类甜蛋白(thaumatin-like proteins, TLP)被归为病程相关蛋白第5家族,在植物防御和生长发育过程中发挥作用。使用Mega X、CodonW及EMBOSS网站在线软件,分析8种植物(莱茵衣藻、小立碗藓、拟南芥、水稻、谷子、高粱、小麦、玉米)类甜蛋白家族进化和密码子使用偏性。结果表明,植物类甜蛋白主要归为10个聚类组,其中聚类组Ⅴ、Ⅵ、Ⅶ中的TLP数目相对较多;5种禾本科作物TLP家族基因主要以G和C作为第3位密码子,密码子具有较强的偏好性,多数类甜蛋白基因ENC值较小,GC3s值分布较集中;8个最优密码子第3位均为G或C结尾,禾本科植物类甜蛋白家族基因密码子偏好G/C结尾。本研究分析了8种植物中类甜蛋白家族基因的进化特征及密码子使用偏性,为该家族基因的分子进化以及转基因应用提供了理论依据。 相似文献
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块菌又称松露,为珍稀野生药食兼用的大型真菌,具有极高的营养保健价值。密码子使用偏性分析可为块菌的遗传进化与资源开发提供理论依据。基于黑孢块菌(Tuber melanosporum)、白块菌(T. magnatum)和波氏块菌(T. borchii)的基因组数据,利用CodonW 1.4.2、Mega X软件和EMBOSS在线网站,系统分析3种块菌基因组密码子使用特征及其影响因素。结果显示,3种块菌基因组密码子使用模式高度相似,密码子第3位偏好鸟嘌呤或胞嘧啶(G/C),有效密码子数值较高,其中,黑孢块菌与波氏块菌密码子使用性相似度最高,白块菌鸟嘌呤或胞嘧啶碱基相关参数均较高。3种块菌最优密码子中G/C结尾的分别占81.8%、78.9%和61.9%,三者共有的高频密码子24个,共有的最优密码子14个,均偏好鸟嘌呤或胞嘧啶或胸腺嘧啶结尾的密码子,但总体偏好性不强。奇偶偏性、ENC-GC3s关联、中性绘图和对应性分析显示,3种块菌密码子使用偏性形成受选择压力等多种因素影响,其中黑孢块菌主要受翻译选择压力影响,白块菌主要受翻译选择外的其他因素影响,波氏块菌受选择压力影响相对较弱。研究表明,3种块菌基因组密码子使用模式相似,偏性较弱,表达潜力较低,受多种因素影响,研究结果可为块菌的物种演化研究和遗传育种提供理论基础。 相似文献