影响伪狂犬病病毒同义密码子用法特点的因素分析          下载免费PDF全文

殷华平  郭万柱  徐志文  杨丽 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》2007,33(3):247-253

为了充分了解伪狂犬病病毒基因组结构和病毒进化机制,计算伪狂犬病病毒各基因(组)Nc值、RSCU值、GC3s含量和双核苷酸组成,分析伪狂犬痛病毒密码子用法特点.采用目前最普遍使用的多变量统计分析方法(对应分析)分析影响伪狂犬病病毒基因组同义密码子用法偏爱性的因素.结果表明:①在GC含量丰富的伪狂犬病病毒基因组中,所有基因都偏爱于以G或C结尾的密码子;②伪狂犬病病毒对CpG、CpC、GpC和GpG 4种双核苷酸具有显著偏爱性,而较少使用ApA、ApT、TpA和TpT 4种双核苷酸;③碱基组成限制、碱基突变压力、翻译选择和基因功能是形成伪狂犬病病毒密码子用法特点的4种因素.伪狂犬病病毒所有基因Nc-GC3s分布图显示有些基因如LLT ORF1、LLT ORF2等的偏向性完全是由于碱基的组成限制.GC3s-GC12s散点图则显示碱基突变和自然选择都是PRV密码子偏向性的形成因素.根据RSCU值进行的对应分析表明伪狂犬病病毒大多数基因密码子用法受基因表达水平和基因功能影响.综上所述,伪狂犬病病毒偏爱于G或C结尾的密码子,且碱基组成限制、碱基突变、翻译选择和基因功能是影响伪狂犬病病毒同义密码子用法特点的主要因素.  相似文献   

三株芽孢杆菌对大肠杆菌的体外拮抗作用研究     

颜其贵  王新  郭万柱  袁孟伟  宋振辉  李璟  殷华平  曹洪志 《四川农业大学学报》2006,24(4):448-450

以3株芽孢杆菌为材料,采用与致病性大肠杆菌同时接种及先后接种的方法,对其与大肠杆菌的生物拮抗作用进行了研究。结果表明:X1、X2、X33株芽孢杆菌与大肠杆菌同时接种培养后对大肠杆菌均有一定的抑菌效果,共培养8h后开始呈现一定的抑制作用,24～48h时作用最明显;先接种X1、X2、X33株芽孢杆菌培养24h后再接种大肠杆菌,对大肠杆菌均呈现明显的抑制作用,12h后开始呈现一定的抑制作用,24h时作用最明显,至48h时也还有一定的抑制作用;X3对沙门氏杆菌没有抑制作用。先接种大肠杆菌培养12h后再接种X1、X2、X33株芽孢杆菌对大肠杆菌也呈现明显的抑制作用,8h后开始呈现一定的抑制作用,12h时作用最明显,至24h时抑制作用基本消失。  相似文献   

两种商品化圆环病毒疫苗的临床应用效果分析     

杨树青  王锐  张振东  陈仲前  殷华平  董启轩  曲向阳 《中国猪业》2023,(3):68-70+75

当前养猪行业普遍以降本增效作为经营管理的目标,为评估两种价格差异较大的圆环病毒疫苗免疫的投入产出比,给同行提供圆环病毒疫苗筛选评估的数据。选取某种猪场生产的商品育肥猪,在断奶时分A/B两组分别免疫圆环病毒A苗和B苗,比较育肥猪的出栏均重、正品率和料肉比数据,进而比较投入产出比。结果显示,A组正品率96.65%,B组正品率94.03%,差异显著(P<0.05)。A组育肥猪的出栏均重为145.8 kg、平均日增重为736.7 g、料肉比为2.898;B组育肥猪的出栏均重为149.0 kg、平均日增重为710.0 g、料肉比为2.881,差异不显著(P>0.05)。A组免疫的猪圆环病毒疫苗价格高,但综合比较各项生产成绩及投入产出比,免疫A疫苗的投入产出比明显高于B疫苗。  相似文献   

含绿色荧光蛋白基因的伪狂犬病毒Fa株重组猪细小病毒VP2基因表达载体的构建   总被引：2，自引：0，他引：2  

罗燕  郭万柱  徐志文  刘艳丽  殷华平  王小玉 《四川农业大学学报》2005,23(2):232-237

分别用限制性核酸内切酶EcoRⅠ、BamHⅠ和KpnⅠ酶切含PRVFa株gI片段的质粒pPI,补平连接后得到去除EcoRⅠ、HindⅢ、EcoRⅤ、BamHⅠ和KpnⅠ酶切位点的大小约5.7kb的质粒pPI-2,再以CMV早期启动子控制的增强型绿色荧光蛋白(EGFP)基因作为报告基因,将其插入pPI-2中gI基因起始密码子ATG下游的StuⅠ位点,构建了以gI为同源序列含有EGFP报告基因的转移载体质粒pPI-2.EGFP。然后根据AnaI.Ranz等报道的猪细小病毒(PPV)NADL-2株的序列,设计一对包含其结构蛋白VP2基因的PCR引物,扩增得到VP2基因后,将其插入转移载体质粒pPI-2.EGFP中,首次构建了含PPVVP2基因及其EGFP报告基因的PRV基因缺失转移载体质粒pPI-2.EGFP.VP2,为进一步构建PRV重组PPVVP2基因活载体疫苗奠定了基础,同时EGFP的引入也为进一步研究PRV在机体内的定植和感染机理打下了基础。  相似文献