鲑鳟通用型低通量单核苷酸多态性芯片的开发          下载免费PDF全文

邰如玉  许建  江炎亮  张瀚元  白庆利  杨世勇  徐鹏  赵紫霞 《渔业科学进展》2019,40(1):53-61

为开发常见鲑鳟养殖物种通用的遗传分析工具,本研究利用Affymetrix虹鳟(Oncorhynchus mykiss) 57K高通量单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)芯片,对国内代表性鲑鳟养殖群体开展了分型检测,包括山女鳟(Oncorhynchus masou masou)、银鲑(Oncorhynchus kisutch)、美洲红点鲑(Salvelinus fontinalis)、白斑红点鲑(Salvelinus leucomaenis) 4个物种,从57,501个SNP标记中筛选出96个共享多态性标记,应用Fluigidm 96.96动态芯片平台,构建了大麻哈鱼属(Oncorhynchus)和红点鲑属(Salvelinus)通用型低通量SNP芯片。该芯片分型结果准确性较高,与Affymetrix高通量芯片分型一致性达到96.55%。使用该芯片对来自6个家系的48尾银鲑个体及其候选亲本进行检测,应用Cervus 3.0.7软件进行亲权鉴定,结果能够准确重现复杂家系的真实系谱。在用于单亲本亲权鉴定时,第一亲本非排除率(Non-exclusion probability for first parent, NE-1P)为4.120×10~(–4);用于双亲本亲权鉴定时,双亲非排除率(Non-exclusion probability for parent pair, NE-PP)低至6.219×10~(–12),表明该芯片在鲑鳟养殖群体系谱鉴定应用中具有较高的准确性。使用该芯片开展4个鲑鳟养殖群体遗传结构分析,样本分群聚类结果与其所属的分类阶元相符,能够准确反映群体遗传组分构成和遗传关系。本研究构建的低通量SNP芯片在常见鲑鳟养殖物种中具有良好的通用性,将其应用于养殖群体遗传分析,能够为鲑鳟制种、育种和引种等科学决策提供基因组信息参考。  相似文献   

花羔红点鲑和白斑红点鲑肌肉营养成分分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

白庆利  张玉勇  张永泉  王炳谦  李建兴 《淡水渔业》2011,(4):85-88

测定了花羔红点鲑(Salvelinus malma)和白斑红点鲑(S.leucomaenis)的肌肉营养成分,并对其进行比较.结果显示:(1)花羔红点鲑肌肉的蛋白质含量、脂肪含量均显著高于白斑红点鲑(P＜0.05),而其灰分含量值则低于白斑红点鲑,但其差异并不显著(P＞0.05);(2)花羔红点鲑在氨基酸总量、必需氨基...  相似文献   

美洲红点鲑人工孵化和苗种培育的初步报道   总被引：1，自引：0，他引：1  

李建兴  白庆利  贾钟贺 《黑龙江水产》2011,(1):5-6

作者对美洲红点鲑人工孵化进行了总结,孵化期间要求水质清澈,色度一般<30度,水中悬浮物小于15mg/L最佳,溶解氧一般要求在大于7.5mg/L,孵化期间注意避光,每3-4天用600mg/L福尔马林流水浸泡15分钟,防止水霉发生;在苗种培育阶段注意饲料选择全价饲料,保证鱼类生长所必须的营养物质,此期间注意细菌性烂鳃病和小瓜虫的预防和治疗。  相似文献   

虹鳟免疫诱导型基因Cathelicidin2启动子功能分析          下载免费PDF全文

赵紫霞  许建  江炎亮  白庆利  蒋立坤  陈葆华  徐鹏 《渔业科学进展》2018,39(4):37-45

本研究通过实时荧光定量PCR实验对虹鳟(Oncorhynchus mykiss)Cathelicidin2(Cath2)基因的转录模式进行了分析。结果显示,该基因在鳃、头肾等与机体免疫防御功能密切相关的组织内转录,在细菌和病毒感染后,转录水平均显著升高。对基因上游调控序列进行启动子和转录因子结合位点预测,发现该启动子具有真核生物典型的TATA盒和CAAT盒结构,基因上游直至第一内含子区域内,密集存在多个免疫相关转录因子结合位点,其中,2个核因子κB(Nuclear factor kappa B,NFκB)预测结合位点均位于核心启动子正链区域。在草鱼(Ctenopharyngodon idellus)肾组织细胞系内,绿色荧光蛋白和萤火虫荧光素酶基因都能够在该启动子驱动下表达,表明其具有启动子活性,且启动子活性在受到免疫诱导后增强,包括细菌脂多糖(Lipopolysaccharides,LPS)模拟的细菌感染和聚肌胞苷酸(Polyinosinic polycytidylic acid,Poly I:C)模拟的病毒感染。双荧光素酶报告基因检测显示,启动子活性在与NFκB转录因子表达时,增强至4.39倍,证明Cath2基因受NFκB通路调控。研究表明,虹鳟Cath2基因能够在多种免疫刺激诱导下表达,其启动子可以应用为免疫诱导型的基因工程元件,驱动外源免疫基因在鱼体内适时表达,抵御外界病原感染,同时,避免非必要条件下的过度表达形成生长负担。  相似文献   

野生亚东鲑群体遗传多样性及其种质来源研究   总被引：2，自引：0，他引：2  

户国  王芳  周建设  潘瑛子  李宝海  谷伟  孙鹏  白庆利  王炳谦 《东北农业大学学报》2016,(1):58-65

以褐鳟(Salmo trutta)日本品系和亚东鲑群体为研究对象,通过测定上述两个群体8个微卫星标记和线粒体D-loop基因多态性,综合分析日本品系和亚东鲑群体遗传多样性及其种质来源。结果表明,褐鳟日本品系等位基因数为2~10个,亚东鲑群体为4~9个,平均有效等位基因数分别为3.1304和3.8988;观测杂合度范围分别为0.3404~0.7128和0.1020~0.8776,其中褐鳟日本品系平均观测杂合度为0.5612,亚东鲑群体为0.5510,期望杂合度分别为0.4671~0.7794和0.5216~0.7932;褐鳟日本品系多态信息含量(PIC)为0.3680~0.7440,平均为0.5964,而亚东群体PIC为0.4660~0.8370,平均为0.5926。研究分析褐鳟、亚东鲑线粒体D-loop基因序列和欧洲褐鳟已知五个地理居群D-loop基因序列,日本品系褐鳟和亚东鲑与欧洲大西洋居群褐鳟聚在一支,亲缘关系最近。  相似文献   

虹鳟鱼饲料中肉骨粉替代鱼粉的研究   总被引：3，自引：0，他引：3  

徐奇友  许红  李婵  白庆利  牟振波 《饲料工业》2007,28(6):26-27

研究在饲料中用10%肉骨粉替代10%鱼粉对虹鳟鱼的影响。试验分2个处理组,处理1组和处理2组饲料中鱼粉和肉骨粉的添加量分别为15%、10%和5%、20%,试验共进行11周。试验结果表明,2个处理组虹鳟鱼成活率、增重率、特定生长率、肥满度和饵料系数未产生显著的差异(P>0.05);处理2组单位鱼成本下降0.68元/kg,显著提高了体脂肪含量、肝体比、脏体比(P<0.05),粗灰分含量显著下降(P<0.05),体水分和体蛋白含量也表现出下降的趋势。可见,用10%肉骨粉替代10%鱼粉对虹鳟鱼的生产性能没有影响,但可影响体脂肪含量。  相似文献   

美洲红点鲑和白斑红点鲑杂交子代及其亲本早期生产性能比较     

阿地力  谷伟  户国  白庆利  叶远涛  王炳谦 《鲑鳟渔业》2013,(4):8-11

采用完全双列杂交、群体间杂交及群体内自繁等方法对美洲红点鲑（Salvelinus fominalis）和白斑红点鲑（Salvelinus leucomaenis）进行了配组繁殖,成功地获得了4类组合的子一代群体。比较了各交配组合的受精率、孵化率、成活率等生存力,结果表明：正交子一代（白斑红点鲑♀×美洲红点鲑♂）组合的受精率明显高于父本和反交子一代组合,与母本子一代组合差异不显著（p〉0．05）,孵化率和成活率与双亲自繁对照组差异不显著（P〉O．05）,高于反交子一代（美洲红点鲑♀×白斑红点鲑♂）组合。杂交子一代和亲本后代140d室内生长试验表明：不同发育阶段的正交子一代表现出杂种优势,体质量的杂种优势率为27．09％～35．66％,体长的杂种优势率为8．47％～11．25％,在体质量、体长增长量均高于双亲子一代。反交子一代群体生长发育始终没有表现杂种优势（H〈0）。  相似文献   

不同消毒剂对三种鲑科鱼受精卵成活率的影响   总被引：1，自引：0，他引：1  

张铁奇  户国  谷伟  白庆利  王炳谦 《水产学杂志》2013,26(1):19-22

在水温4.5±1.3℃下和桶式流水孵化器中,研究了不同浓度过氧化氢水溶液、聚维酮碘、甲醛溶液和二氧化氯对虹鳟（Oncorhynchus mykiss）、金鳟（Oncorhynchus mykiss）和白斑红点鲑（Salvelinus leucomaenis）受精卵至发眼期胚胎的成活率和防治水霉菌等感染的效果。结果表明：二氧化氯处理组与对照组鱼胚胎的发眼率与畸形率差异显著;聚维酮碘处理组鱼胚胎的发眼率虽与对照组无显著差异,但畸形率明显高于甲醛对照组。因此,聚维酮碘和二氧化氯不适于这三种鱼受精卵的消毒。1000 mg.L-1的过氧化氢饱和水溶液（双氧水）与1500 mg.L-1甲醛处理组鱼胚胎的在发眼率无显著差异,但随着药物浓度的增加,其畸形率显著高于对照组。因此,建议鲑鳟鱼受精卵孵化过程中可用1000 mg.L-1双氧水防止水霉菌滋生,提高受精卵的成活率。  相似文献   

鲑鳟鱼类育种中常用策略、方法及其应用概述     

户国  谷伟  白庆利  王炳谦 《鲑鳟渔业》2014,(6):66-72

鲑鳟鱼类是世界上最早采用现代数量遗传学理论指导育种实践的水产动物之一,在近50年育种实践中积累了大量经验,形成了一整套行之有效的育种策略、选择方法,为其他水产动物的遗传选育提供借鉴。育种者为满足消费市场和养殖者对鱼肉品质、鱼体规格、高抗病力、高饲料转化率等需求,利用多种育种策略和选择方法来开发相应的养殖品种和品系。本文从育种策略、选择方法等概括介绍目前我国鲑鳟鱼遗传育种领域的主要支撑技术,以期为其他水产动物育种提供参考。  相似文献   

高蛋白和高脂肪饲料对二倍体与三倍体山女鳟生长性能和营养成分的影响     

贾钟贺  王常安  徐奇友  许红  白庆利 《大连水产学院学报》2010,25(4):337-342

以二倍体山女鳟Oncorhynchus masou（初重为113.53 g±1.65 g）和三倍体山女鳟（初重为115.49 g±1.66 g）为对象,研究了饲喂高蛋白和高脂肪饲料对山女鳟生长性能和生化成分的影响。试验设二倍体普通饲料组（G1）、高脂肪饲料组（G2）、高蛋白饲料组（G3）以及三倍体普通饲料组（G4）、高脂肪饲料组（G5）和高蛋白饲料组（G6）,每个处理设3个重复,每个重复放30尾鱼。试验期间,水温为10.5～16.7℃,pH为7.2～7.5,溶氧〉6.0 mg/L,试验共进行140 d。结果表明：各处理组山女鳟的增重率、特定生长率、成活率和肥满度均无显著差异（P〉0.05）;二倍体对照组（G1）与三倍体对照组（G4）鱼肌肉中的粗脂肪、粗灰分和初水分无显著差异（P〉0.05）;各处理组鱼肌肉中的粗蛋白含量均无显著差异（P〉0.05）;二倍体高脂肪饲料组鱼肌肉中的粗脂肪水平显著高于其对照组（P〈0.05）,三倍体高脂肪饲料组鱼肌肉中的粗脂肪水平显著高于其对照组（P〈0.05）;各处理组鱼肌肉中的氨基酸组成及各种氨基酸含量均无显著差异（P〉0.05）;但二倍体高蛋白饲料组鱼的必需氨基酸含量和必需氨基酸指数显著高于其对照组（P〈0.05）,三倍体高蛋白饲料组的必需氨基酸含量和必需氨基酸指数显著高于其高脂肪饲料组（P〈0.05）。与二倍体山女鳟相比,三倍体山女鳟其生长和营养成分并不好于二倍体鱼;投喂高蛋白饲料增加了二倍体山女鳟肌肉中的必需氨基酸含量,但未显著提高三倍体鱼的必需氨基酸含量;饲喂高脂肪饲料可提高二倍体和三倍体鱼肌肉中的脂肪水平。  相似文献