基于生物信息学的条斑紫菜microRNAs及其靶标预测     

尹旭岗  冯佳  吕俊平  刘琪  南芳茹  谢树莲  高帆 《山西农业科学》2018,(8)

目前,作为模式红藻的条斑紫菜面临着日益严峻的生存危机。非编码RNA介导的基因后转录水平调控对于条斑紫菜资源的保护与开发具有十分重要的意义。研究利用BLASTn结合Mireap软件,共预测到5条新的条斑紫菜miRNAs;利用Target Finder工具预测到5条与紫菜生长发育及代谢相关的靶标基因,另预测到59条未知功能的靶标位点。Clustal W结合WebLoGO的分析结果显示了条斑紫菜miRNAs在植物间保守性;Clustal W结合MEGA的miR164家族系统进化结果显示,pre-miR64s与物种进化不同步,且具有进化的随机性与序列的多态性。研究结果丰富了条斑紫菜miRNAs及其靶标信息,可为条斑紫菜后转录水平的分子选育及其功能的开发与利用奠定基础。  相似文献   

满天星无菌实生苗丛芽诱导培养研究     

李云海  刘琪  陈丽华 《现代农业科技》2018,(18)

采用满天星成熟种子诱发的无菌实生苗作试验材料,以MS为基本培养基,并分别添加不同浓度的6-BA形成对比试验组,以探寻适宜满天星实生苗丛芽诱导的6-BA浓度。结果表明,以6-BA浓度为0.6 mg/L的处理最适宜满天星种子无菌实生苗的丛芽诱导培养。  相似文献   

猪脑心肌炎病毒非结构蛋白3C的原核表达及生物信息学分析     

罗亚坤  梁琳  朱禹  王静  刘琪  刘存  崔尚金 《中国畜牧兽医》2017,44(6):1588-1595

为获得猪脑心肌炎病毒（EMCV）3C蛋白并进一步了解其结构,本研究以EMCV HB10株的RNA为模板,通过RT-PCR扩增3C基因,将其克隆至pMD18-T载体,经PCR、双酶切和测序鉴定,挑选测序正确的质粒经双酶切获得目的片段并将其克隆至pET32a载体以构建重组原核表达质粒。将重组质粒转化至大肠杆菌TranSetta（DE3）感受态细胞,经IPTG诱导后,SDS-PAGE检测目的蛋白表达情况,Western blotting检测纯化后3C蛋白及其对EMCV的反应原性。结果显示,成功克隆3C基因,长度为615 bp,编码205个氨基酸。SDS-PAGE结果显示,3C蛋白主要以包涵体形式表达,His-3C蛋白大小约为40 ku。Western blotting分析可知,纯化后His-3C蛋白条带单一,同时3C蛋白与EMCV细胞毒有良好的反应原性。经生物分析软件预测可知,EMCV 3C蛋白为非分泌蛋白,无跨膜区,有多个磷酸化位点,参与蛋白的水解过程。3C蛋白酶作为EMCV基因组编码蛋白中唯一的蛋白酶,在病毒复制的过程中具有不可或缺的作用。本研究成功构建了EMCV 3C蛋白原核表达载体并对其结构进行了预测,为进一步研究3C蛋白的作用及催化机理奠定基础。  相似文献   

猪流行性腹泻病毒环介导等温扩增检测方法的建立及应用     

罗亚坤  梁琳  王静  刘存  刘琪  刘畅  蔺文成  崔尚金 《中国畜牧兽医》2017,44(2):344-349

试验旨在建立一种快速检测猪流行性腹泻病毒（PEDV）的环介导等温扩增方法（LAMP）,为诊断PEDV提供简便、敏感、准确可靠的工具。参考GenBank中PEDV基因序列（登录号：KT799997）,针对PEDVN基因设计了6条引物,对所建立的LAMP反应体系、反应温度进行优化,建立可特异性扩增PEDV的LAMP方法。结果显示,本试验成功建立了PEDV LAMP检测方法,在60℃恒温下反应60 min,能特异性地检测PEDV,检测限量为91拷贝/μL,比常规PCR方法的敏感性高100倍。对比75份临床样本的LAMP和常规RT-PCR法检测结果,显示两种方法符合率为97.3%。综上所述,本试验建立的LAMP方法具有特异性强、敏感性高,操作简单,设备要求低的特点,适用于PEDV临床样本的快速检测。  相似文献   

上市公司审计失败问题研究 ——以F公司为例     

刘琪 《技术与市场》2022,(3):157-159

上市公司财务舞弊事件时有发生,严重破坏资本市场环境,挫伤投资者信心.以高新技术行业的"白马股"——F公司为研究对象,以企业发布的前期会计差错更正为起点,基于GONE理论分析企业财务舞弊的原因,通过文献研究和案例研究的方式,一方面发现财务舞弊是由内外因素共同作用形成的结果;另一方面为资本市场追本溯源、塑造诚信氛围、打击舞...  相似文献   

山地拖拉机坡地等高线旋耕土壤侵蚀规律研究     

孙景彬  刘琪  雒鹏鑫  杨福增  刘志杰  王峥 《农业机械学报》2022,53(5):44-56

针对黄土高原丘陵山区坡地等高线旋耕作业时土壤耕作侵蚀(土壤由坡高侧向坡低侧迁移)严重及其机理不明等问题,通过理论分析、仿真试验、土槽及实地试验相结合的方法,深入开展山地拖拉机坡地旋耕侵蚀规律研究。首先,构建了H245标准型常用旋耕刀在坡地工况下的扰土体积参数方程,完成了旋耕刀坡地扰土过程的经典力学分析,确定了导致坡地旋耕土壤侵蚀的主要影响因素：坡地角、耕作深度、刀轴转速以及旋耕作业速度;然后,基于EDEM离散元仿真软件研究了单把旋耕刀和旋耕机整机的坡地扰土规律,得出土壤颗粒在旋耕刀侧切刃的动态滑切作用下有水平向后运动的行为,浅层土壤颗粒位移最大,深层土壤颗粒位移最小,并且深层靠近旋耕刀回转中心的土壤颗粒位移最大;土壤的侧向位移方向受旋耕刀正切刃朝向的影响;随着旋耕刀的入土,土壤颗粒在垂直方向的位置呈先变深后变浅的趋势。最后,选取旋耕刀轴转速、旋耕作业速度和坡地角作为试验因素,进行了实地旋耕单因素和正交试验,单因素试验得到土壤水平、侧向位移随着上述3个因素变化的规律;正交试验方差分析得到影响土壤侧向位移的主次因素为坡地角、旋耕刀轴转速、旋耕作业速度,影响土壤水平位移的主次因素为旋耕作业速...  相似文献   

黄土高原坡地土壤与旋耕部件互作离散元仿真参数标定     

孙景彬  刘琪  杨福增  刘志杰  王峥 《农业机械学报》2022,53(1):63-73

针对黄土高原坡地土壤-旋耕部件互作机理研究以及坡地专用旋耕机具设计缺乏准确可靠离散元仿真参数的问题,以典型坡地粘壤土(含水率13.4％±1％)为研究对象,选取EDEM中Hertz-Mindlin with JKR Cohesion接触模型,对相关仿真参数进行标定.首先,对土壤颗粒间接触参数进行了标定,以土壤颗粒的仿真堆...  相似文献   

单糖组合对藤壶金星幼虫附着的影响研究     

尤嘉杰  平双双  刘琪  靳翠丽  周晓见 《水产养殖》2021,(2):30-36

藤壶Amphibalanus(=Balanus)amphitrite是典型的海洋污损生物,藤壶金星幼虫受外源信号的指引,寻找到合适的附着地点才能进行附着和变态。针对前期发现的有一定诱导活性的4种单糖Man、Xyl、Glc和Fuc,该研究利用正交试验研究其对藤壶金星幼虫附着的影响。结果发现,单糖组合对藤壶金星幼虫附着具有显著性影响,Man(5.00×10^-8 mol/L)、Glc(1.25×10^-8 mol/L)、Xyl(1.25×10^-8 mol/L)和Fuc(1.90×10^-7 mol/L)为最优组合。组合中4种单糖的影响力由高到低依次是Man>Fuc>Glc>Xyl,且Man、Fuc和Glc的影响具有显著性,Xyl对幼虫附着影响不大。添加单糖除了影响金星幼虫的附着率以外,更重要的是能显著缩短幼虫附着的时间进程。  相似文献   

李品种选育与引进简述     

刘琪  黄丹敏 《福建果树》1996,(3):34-35

李品种选育与引进简述刘琪，黄丹敏（永泰县李果研究所）永泰是福建省也是全国最大李生产县，占９５％的品种是芙蓉李，为调整李树品种结构，于１９８９年着手开展了李树品种的选育与引进研究，现已取得初步成果，现将选种与引种的情况初报如下。（一）选种１９８９年冬对...  相似文献   

松墨天牛Homothorax基因的鉴定及表达分析     

陈敬祥  刘琪司  林同 《华北农学报》2017,32(1)

为了探讨Meis家族中Homothorax基因在昆虫中的表达特性,以松墨天牛为研究对象,从cDNA文库中筛选到松墨天牛Homothorax基因,命名为MaHth(GenBank:KX364396)。该序列长为1347bp,编码448个氨基酸。由此预测的蛋白质二级结构主要由α螺旋与无规则卷曲组成,其次是β转角与延伸链;SWISS-MODEL同源建模预测其三级结构的基元为α螺旋-β转角-α螺旋。MaHth基因编码蛋白,定位于细胞核,并存在2个独立的核定位信号:KRDK、KKNQKKR。通过DNAMAN软件比对发现MaHth与赤拟谷盗同源性最高,为97%,且存在Hox保守结构域序列;用MEGA4.0构建系统发育树,显示松墨天牛与赤拟谷盗处在同一分支。通过RT-qPCR分析表明:卵、蛹中的表达量比幼虫、成虫中的高,在成虫中最低;幼虫头部中MaHth表达量最高,马氏管中表达量较低;成虫头部、马氏管中MaHth表达量最高,足、翅、触角中表达量较低。  相似文献