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6个地方鸡种线粒体COⅠ基因的DNA条形码 总被引：10，自引：0，他引：10
以我国6个地方鸡(Gallus gallus)品种为研究对象,利用DNA测序技术测定了线粒体细胞色素C氧化酶Ⅰ(cytochrome coxidaseⅠ,COⅠ)基因的2段序列,研究COⅠ这一特定基因的特定区段作为DNA条形码在识别地方鸡种方面的可行性和有效性。研究结果表明,所选择的2段序列中,经过多态性分析筛选,以Bar1序列(712～1359位)突变位点较多,为24个,为24种单倍型,其中22种单倍型为6个鸡品种所特有;品种间平均多态性3.860%,6个鸡品种均有其特异位点;6个品种的NJ聚类分析结果显示,6个鸡品种基本被聚为不同的类别,与形态学分类基本一致,COⅠ基因的Bar1序列用于这些品种鉴定是可行的。而对Bar2序列(1800～2314位)进行序列多态性分析,只发现5个突变位点,为5种单倍型,且大多品种没有其特异位点。由于其多态性低,且NJ聚类分析6个品种的聚类结果与形态学分类不一致,Bar2序列不利于品种鉴定。研究结果表明,COⅠ基因的Bar1序列更适合地方鸡品种鉴定条形码。 相似文献
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屠云洁 《农业生物技术学报》2007,15(6)
本研究利用线粒体细胞色素C氧化酶I (cytochrome c oxidase ⅠCOⅠ)这一特定基因的特定区段来做DNA条形编码的基础，选择其中二段序列（Bar1 Bar2）设计2个引物对6个中国地方鸡种的线粒体DNA进行扩增，以对其进行种品鉴定。本研究选择的2段序列中，以Bar1序列648bp（712位点到1359位点）多态性最高，突变位点最多，为24个，品种间平均多态性为3.860%，6个鸡种在此序列中有各自不同的特异位点，NJ聚类分析6个品种基本被聚为不同的类别，与形态学分类基本一致，该COⅠ基因的Bar1序列用于这些品种鉴定是可行的；而Bar2序列进行序列多态性分析，由于其多态性低，大多品种没有其特异位点，NJ聚类分析6个品种基本被聚为不同的类别，与形态学分类基本一致，不利于品种鉴定。从本研究结果看，利用COⅠ基因的DNA条形编码（DNA Barcodes）进行不同鸡品种鉴定具有方便、快捷、经济、准确等优点，结合传统形态学鉴定手段将会揭示更深层次的遗传多样性和系统进化关系, 经过进一步改进是用于品种鉴定的优良工具。 相似文献
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利用25个微卫星标记,对以隐性白羽鸡和仙居鸡为亲本建立的F2资源群体500只鸡进行遗传检测,并测定各个体的活体重、屠体重、胸肌重、腿肌重和腹脂重,采用方差分析法对标记与性状进行连锁分析.结果表明:各位点平均等位基因数为5,平均杂合度为0.701 2,平均多态信息含量为0.646 8.方差分析显示:MCW0095、ABR0322、ADL289、MCW004、ADL166、MCW104和MCW67对活体重、屠体重有显著影响(P＜0.05或0.01);ADL211、MCW004和ADL0301对胸肌重有显著影响(P＜0.05或0.01);MCW004、ADL0301和MCW67对腿肌重有极显著影响(P＜0.01).表明这些标记与性状间可能存在连锁关系. 相似文献
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通过比较不同杂交组合优质冷鲜鸡体重和鸡冠性状,初步筛选杂交组合,并通过分析鸡冠性状与体重的相关性,建立最佳回归方程,提高育种效率。对63日龄三个杂交组合优质冷鲜鸡体重和鸡冠指标进行测定,利用SPSS 16.0软件进行相关及回归分析,采用逐步回归法构建体重与鸡冠性状的多元回归方程。结果表明:三个杂交组合63日龄母鸡体重均超过1.8kg,公鸡体重均超过2.2kg。冷鲜鸡杂交组合1(ABC)大鸡冠公鸡鸡垂周长、总周长、鸡冠面积、鸡垂面积与总面积均显著高于其他组合;ABC大鸡冠公鸡鸡冠平均色R显著高于其他组合;ABC大鸡冠公鸡鸡垂色度级别显著高于冷鲜鸡杂交组合2(ABD)公鸡和冷鲜鸡杂交组合3(AEB)公母鸡;ABC大鸡冠公鸡鸡冠色度级别显著高于ABC母鸡、ABD公鸡、AEB公母鸡。63日龄体重与鸡垂周长、总周长(鸡冠+鸡垂)、鸡垂面积、鸡冠面积、总面积(鸡冠+鸡垂)均极显著正相关(P0.01),相关系数在0.579~0.753之间,其中与总周长(鸡冠+鸡垂)相关系数最大,为0.753。建立鸡冠对体重的最优回归模型:Y=1659.091+9.186 X1+0.052 X2,通过测定鸡冠总周长和鸡冠总面积能够较准确地评估体重变化。 相似文献
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【目的】肌纤维类型的差异是直接影响肌肉生长发育和肉品质的重要因素,红肌纤维比例高的肌肉肉品质要显著优于白肌纤维比例高的肌肉,然而,目前对于鸡骨骼肌纤维类型形成及转换的分子调控机制尚不明确。本究以中国优良的地方品种清远麻鸡为研究对象,首次对其骨骼肌中不同类型肌肉的转录组差异进行了研究,以期挖掘在鸡肌纤维生成和类型转换中发挥调控作用的关键因子。【方法】采用Agilent鸡全基因组表达谱芯片对清远麻鸡骨骼肌表型差异较大的比目鱼肌和趾长伸肌中与肌纤维类型组成和转换相关的候选基因进行系统筛查,采用荧光定量PCR对芯片筛选出的差异表达基因进行验证,采用慢病毒质粒包装系统构建特异靶向鸡PPARGC1A基因的RNA干扰慢病毒载体进行基因功能研究。【结果】芯片结果共发现差异倍数在2倍及以上的基因1 224个(P0.05,FC≥2),以趾长伸肌作为参照,比目鱼肌中上调基因为654个,下调基因为570个,尽管芯片和荧光定量PCR两种方法得出的差异倍数并不完全一致,但所选基因的表达趋势是一致的,表明芯片结果是可靠的。对差异表达基因进行GO(GO ontology)功能分类,共发现了74个显著性GO,主要分为生物学过程、分子功能和细胞组分等3大类。基于KEGG Pathway分析发现,一些已知的与肌纤维类型转换、肌肉发育以及脂质代谢相关的信号通路在两种类型的肌肉中被显著富集。综合差异基因的GO、KEGG Pathway和共表达网络分析,推测PRKAG3,ATP2A2以及PPARGC1A可能是与肌纤维类型性状紧密关联的关键基因。进一步对PPARGC1A基因进行功能研究发现,PPARGC1A基因的敲低,引起了PPP3CA,MEF2C以及SM等慢肌纤维标志基因以及与肌纤维发育与转换相关基因表达水平的显著降低,而快肌纤维标志基因FWM的表达水平则显著上升。【结论】揭示了鸡红肌和白肌两种不同类型肌肉间的转录组差异,证明了PPARGC1A基因能够与钙离子信号通路相关基因协同从而在鸡肌纤维类型组成和转换中发挥着重要作用,从而为中国地方鸡肉品质性状的遗传改良提供一定的理论依据。 相似文献
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5个白鹅群体的遗传结构和进化分析 总被引：11，自引：0，他引：11
应用微卫星标记对我国5个白鹅品种资源群体(太湖鹅、四川白鹅、织金白鹅、伊犁鹅、皖西白鹅)的遗传结构和进化进行了研究。结果表明:(1)5个白鹅群体的平均杂合度都较高,反映了各鹅种群体内的遗传变异较大,各鹅种的适应性较强;(2)通过计算DS遗传距离和UPG-MA聚类,发现5个白鹅群体间的遗传距离较远,分化时间较长,5个白鹅群体分别独自为一类,聚类结果反映了5个鹅品种的进化与它们的选育历史及地理分布关系密切。应加强对我国现有鹅种资源的保护力度和开发力度。 相似文献
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鸡肉品质是决定肉鸡生产效益的重要因素之一。近年来,白条纹鸡肉(white striping, WS)和木质化鸡胸肉(woody/wooden breast, WB)两种新型肌肉缺陷问题因其出现概率高、影响范围大,正受到业界的广泛关注。WS是指肌肉表面出现平行于肌纤维的白色脂肪沉积条纹,WB主要表现为胸肉明显硬化。这两种肌肉缺陷问题表现出类似的组织学特征,并且常常共同出现。WS和WB的出现严重影响了屠宰鸡肉及分割产品的外观、营养品质以及加工特性,给肉鸡产业造成了严重的经济损失。目前,WS和WB的特征、性质及发生机理方面已取得较大进展,但大多数研究为国外团队报道,国内相关报道较少。本文针对WS和WB的病理学特征、品质特性以发生机理等方面相关研究进展进行综述,旨在为后续研究提供基础理论支撑及参考。 相似文献