不同鸡品种BTN2基因SNP和INDEL分析     

王统苗  郑圣晗  张莘  陈博雯  刘本帅  张扬  王志秀  常国斌  陈国宏 《四川农业大学学报》2018,(3)

【目的】研究BTN2基因多态性,为鸡的免疫和抗病育种研究提供候选基因。【方法】选取26个不同鸡品种,对BTN2基因进行目标捕获测序,以NCBI中Gallus gallus的BTN2基因序列号(NC_006103.4)为参照,使用MEGA6软件进行不同鸡种基因序列比对,筛选出BTN2基因外显子和内含子中的SNP、INDEL以及氨基酸的变化,最后制成系统发育进化树。【结果】26个不同鸡种中,BTN2基因的外显子筛选出28个SNP位点,且SNP位点大多发生在Exon8上,氨基酸突变大多为错义突变;内含子筛选出48个SNP位点,多数发生在Intron7上;插入缺失多发生在外显子上。聚类分析图结果表明:26个鸡种分为3大类,文昌鸡、SPF-来航鸡、太湖鸡、萧山鸡等聚为一类,他们都具有耐粗饲、适应性强等特点;溧阳鸡、北京油鸡、如皋鸡等聚为一类,他们都具有肉质鲜美等优点;茶花鸡、仙居鸡、固始鸡、大骨鸡等聚为一类。【结论】不同鸡种中BTN2基因的具有遗传多样性,第8外显子中138 264~138 986位点的SNP可以作为鸡免疫特性的候选标记。  相似文献   

不同鸡品种BLEC1基因序列比较分析     

张莘  常国斌  郑圣晗  王统苗  陈博雯  张扬  王志秀  陈国宏 《华北农学报》2018,(4)

BLEC1基因(C-type lectin-like receptor 1)编码C型凝集素样受体区域,与CD69家族的激活抗原相关,密切联系于禽类的先天性免疫功能。为了探究BLEC1基因在鸡中的遗传多样性以及不同鸡品种之间的抗病性差异,用苯酚和氯仿法提取26个不同鸡品种的DNA,对其BLEC1基因序列进行目标捕获测序,然后以NCBI上红色原鸡的BLEC1基因序列作为参考序列,序列号为NC_006103. 4,通过MEGA 6软件对26个鸡品种的BLEC1基因序列进行序列比对分析,筛选出不同鸡种BLEC1基因序列上的SNPs位点和Indels位点以及对应氨基酸的变化,并根据基因序列的差异运用邻接法系统聚类分析构建进化树。在26个鸡品种中共检测到14个SNPs位点和12个Indels位点,其中有5个SNPs位点和3个Indels位点在外显子上,外显子上的3个Indels位点在鸡种中广泛存在,且Indel1存在于除黑狼山鸡以外的所有鸡种中,这些SNPs位点和Indels位点导致氨基酸发生极大改变,外显子中氨基酸有3个发生错义突变,其余为同义突变。邻接法系统聚类分析将26个鸡品种分为3大类,其中,安卡鸡、SPF-来航鸡和泰和乌骨鸡聚为一类;萧山鸡单独为一类;其余鸡种聚为一类。综上表明,BLEC1基因在我国地方鸡品种中有着丰富的遗传多样性,且与不同鸡种的先天性免疫功能和抗病性相关。  相似文献   

鸡脂肪酸脱氢酶基因多态性及其与脂肪酸含量的关联分析     

刘向萍  雷黎立  周琼  王克华  常国斌 《中国家禽》2010,32(16)

利用PCR-SSCP技术检测安卡鸡、文昌鸡和如皋鸡△9-脂肪酸脱氢酶基因的单核苷酸多态性(SNP),并对不同基因型与胸肌脂肪酸含量进行关联分析.结果表明:在外显子6没有检测到SNP突变,在外显子2检测到T101C和C197T 2+SNP突变,共3种基因型,其中A为优势等位基因,其频率在3个鸡种中均大于0.81,该位点在各品种中均处于Haray-Weinberg平衡(P>0.05).脂肪酸含量的最小二乘检验表明,AB基因型个体的多不饱和脂肪酸(PUFA)和必需脂肪酸(EFA)含量显著高于AA和BB基因型个体(P<0.05),提示AB型可能对脂肪酸含量有重要的影响.  相似文献   

鹌鹑早期原始生殖细胞迁移和聚集规律的研究   总被引：2，自引：0，他引：2  

常国斌  程旭梅  李碧春  刘向萍  秦玉蓉  陈蓉  陈国宏 《畜牧兽医学报》2010,41(4)

本研究旨在观察鹌鹑早期原始生殖细胞的迁移和聚集规律,为分离PGCs,并将其应用于转基因技术提供依据。运用QH1单抗标记特异性的识别鹌鹑的PGCs,检测早期各个阶段PGCs的分布和数量。研究表明:鹌鹑的原始生殖细胞(PGCs)起源于胚盘暗区,而后逐渐迁移至明区、生殖新月区。孵化27h,已有少量PGCs分布于明区的血管中。到孵化36h时,有大量的PGCs聚集在明区血管网中,左右两侧都有。孵化45h时,从头部到脐肠系膜PGCs均有散在和聚团分布,并主要聚集在头部间充质的血管中。PGCs在各个时期的数量存在差异,有2个增殖高峰期,即原条期(孵化6h)和十体节期(孵化36h)。QH1单抗可鉴定早至未孵化期的鹌鹑原始生殖细胞,PGCs在早期胚盘中是随机散在分布的,而且具有2个增殖高峰期。  相似文献   

CENPA基因在不同鸡种上的序列比较分析     

郑圣晗  陈颖  陈国宏  常国斌 《上海农业学报》2019,(4)

为找出不同鸡种CENPA基因序列上的差异,为鸡抗病育种研究提供基础材料,利用目标区域捕获测序技术对25个鸡种的CENPA基因进行序列测定。以NCBI网站上Gallus_gallus-5. 0(GCF_000002 315. 4)的CENPA基因序列为参照,利用MEGA 6. 06软件对25个鸡种的基因序列进行比对分析,统计SNPs位点和InDel位点,并构建系统进化树。结果表明:CENPA的外显子没有丰富的多态性,CENPA内含子的丰富多态性主要体现在Intron4上。CENPA基因在Exon3具有保守性,在鸡的进化历史中稳定遗传。25个鸡种大致可被分为4大类,表明我国的地方鸡品种资源丰富,且之间的同源性较低,可为抗病育种的研究提供丰富的样本。  相似文献   

不同品种鸡BTN1基因序列差异分析     

陈颖  郑圣晗  孔令琳  朱鹏飞  吴允  郭其新  陈国宏  常国斌 《甘肃农业大学学报》2019,(1):11-15

【目的】BTN1基因位于MHC家族的BF/BL核心区域,研究其SNPs和InDels对提高鸡抗病性有重要意义.【方法】以NCBI中Gallus gallus BTN1基因序列为参照,利用MEGA6.06软件对26个品种鸡的BTN1基因序列比较分析,筛选出与抗病性有关的InDels、SNPs和氨基酸变化,并对26个品种鸡的BTN1基因序列进行聚类分析.【结果】在Exon5和Exon17上各有1个SNPs位点,且为错义突变.SNPs位点主要发生在Intron10、Intron13、Intron18、Intron22和Intron23上.‘雪山草鸡’和‘安卡红鸡’等抗病性强、适应性强的品种鸡在Exon17上发生错义突变;与抗病性较强的‘安卡红鸡’相比,‘来航鸡’在Exon5上存在一个错义突变.【结论】BTN1的Exon5和Exon17上SNPs位点对抗病性具有一定的影响,为家禽的抗病育种研究提供参考依据.  相似文献   

我国鹌鹑遗传资源现状考查分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

常国斌  常洪 《中国家禽》2004,26(9):59-60

通常人们所说的鹌鹑，系指日本鹌鹑，简称“鹑”；在我国又名“早秋”．“罗鹑”，“赤喉鹑”等。属鸟纲(Aves)，鸡形目(Califormes)，雉科(Phasianidae)，鹑属(Coturnix)，其学名为Coturnix joponica。  相似文献   

地方鸡种小分子RNA在性腺中表达形式的初步研究     

陈蓉  秦玉蓉  陈国宏  戴有理  常国斌 《畜牧与兽医》2009,41(10)

选用12周龄的文昌鸡12只(8♂4♀)、如皋鸡10只(3♂7♀)、安卡鸡8只(4♂4♀),分别采集睾丸和卵巢,提取小分子RNA后,统计在16~25 bp,26~45 bp,60~200 bp这3个片段区间里小分子RNA的条带数目并计算各自的频率,初步研究小分子RNA在地方鸡种性腺中的表达形式。结果发现:(1)miRNA在不同鸡种的卵巢和睾丸中均未检测到,piRNA的分布较少,snoRNA的含量最高;(2)piRNA和snoRNA在3种鸡的卵巢和睾丸之间分布都没有显著性差异(P>0.05);(3)在睾丸组织中,piRNA和snoRNA在如皋鸡和安卡鸡之间差异显著(P<0.05);(4)在卵巢和睾丸之间,piRNA和snoRNA表达分布趋势表现一致,但在不同品种之间存在一定的差异。这一结果为探讨小分子RNA的遗传特性及发生和消失的机理提供了基础依据。  相似文献   

稻田鸭回收后不同饲养模式鸭肉品质及蛋用性能的比较     

姜庆林  包强  翁恺麒  戴网成  张扬  徐琪  常国斌  陈国宏 《扬州大学学报(农业与生命科学版)》2020,41(6):107-111

  相似文献   

生态草鸡不同饲养方式的生长性能比较     

侯庆文  胡锦农  顾健  吴信生  赵文明  包文斌  常国斌 《中国家禽》2008,30(22)

随着经济的不断发展和人们生活水平的普遍提高，生态环境和食品安全倍受人们关注和重视，大力发展无公害、绿色、有机食品的生产，促进畜牧业向优质、高产、高效、安全、生态方向发展成为未来的趋势。在家禽生产中，生态草鸡以其优美的外型、独特的风味、丰富的营养、无药残、无污染等优点深受消费者青睐，成为行业新的增长点。但是生态草鸡的发展也存在诸多问题：目前还没有专门的配套系以及饲养管理体系，生长速度慢，饲料消耗多等。  相似文献