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畜禽全基因组选择 总被引:2,自引:1,他引:1
数量遗传学在经历了传统的数量遗传学后逐步发展产生了数量遗传学与分子遗传学、生物技术相结合的分子数量遗传学。应用分子标记定位影响重要经济性状的QTL已经取得了显著的成果。QTL一旦得到定位,确定了该位点对表型的贡献率,就可以利用位于QTL侧翼的标记直接进行标记辅助选择。然而应用于标记辅助选择的标记只捕获了构成表型的一部分变异,而无法检测到构成性状的所有变异,为了解决这个问题,其中的一个途径就是利用全基因组范围内的标记,进行标记与表型的全基因组关联分析,鉴定对性状有影响的遗传标记,然后将这些标记应用于选择,这就是全基因组选择。文章就家畜QTL定位和标记辅助选择进行了简要的概述,同时对家畜全基因组选择进行了重点综述。 相似文献
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以东北农业大学F2资源群体为试验材料,采用PCR-RFLP和PCR-SSCP对胰岛素样生长因子-1受体(IGF-1R)基因130 936 bp区域内的7个多态性位点(g.26636CT、g.101698AG、g.111012CG、g.115412AC、g.115463TC、g.123900GA和g.130936TC)进行多态性检测和基因分型,利用Haploview软件对IGF-1R基因进行tag SNPs筛选。结果显示,g.26636CT、g.101698AG、g.111012CG、g.115412AC和g.115463TC多态性位点为IGF-1R基因的tag SNPs;g.115463TC、g.123900GA和g.130936TC 3个多态性位点彼此之间强连锁,处于一个单倍型块中(r20.8),g.115463TC是单倍型块的tag SNP。进一步研究tagSNPs对鸡生长和体组成性状的影响,发现g.115463TC对绝大部分骨骼和体重性状有显著或接近显著的影响。因此推断影响鸡骨骼生长发育和6~12周龄体重的QTL可能位于此单倍型块内或处于与此单倍型块紧密连锁的下游区域。 相似文献
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[目的]通过开展绵羊D1x3基因启动子结构、活性、多态性及其与羊毛品质性状的关联等分析,揭示D1x3基因在绵羊毛囊发育中的作用及其作用机制.[方法]采用PCR扩增D1x3基因起始密码子上游1.5kb区域,利用荧光素酶报告基因技术分析D1x3基因启动子活性,采用测序方法寻找D1x3基因启动子区SNP,并利用PCR-RFLP技术进行SNP分型.[结果]①D1x3基因启动子近端序列的保守性较高,该区域内人、鼠及绵羊都具有23个保守的转录因子结合位点和一个CpG岛,而启动子的远端序列的保守性较低;②D1x3基因的启动子在绵羊胚胎成纤维细胞中具有启动子活性;③D1x3基因启动子的-1 551-1 108 bp与-1 108-707 bp区域对启动子活性影响较大;④D1x3基因启动子区SNP位点(G-1166A)多态性与羊毛卷曲度显著相关.[结论]①D1x3基因启动子在绵羊胚胎成纤维细胞中有活性;②D1x3基因启动子的近端序列组成在人、鼠和绵羊中较为保守,而其远端序列的保守性较低,但是D1x3基因启动子的远端序列对启动子活性影响较大;③D1x3基因启动子区G-1166A位点是羊毛卷曲度的一个分子标记. 相似文献
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对鸡脂肪性状候选基因进行连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD)分析可以为理解鸡体脂沉积的遗传学机制提供重要信息,并且可以提高脂肪性状相关分子遗传标记的检出效率.本研究以东北农业大学肉鸡高、低脂双向选择品系第8世代肉仔鸡为实验材料,通过直接测序、高效液相色谱(DHPLC)、单链构象多态性(PCR-sscv)、限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)、长度多态性(PCR-LP)等方法对过氧化物酶增殖体激活受体(PPAR-γ)、载脂蛋白B(ApoB)、解耦联蛋白(UCD)以及其他10个鸡脂肪性状重要候选基因进行多态性检测,计算候选基因标记间LD参数∣D'∣与r2,分析这些候选基因标记间的LD模式并探讨其规律.初步发现了以下特征:1、在各候选基因内,标记间的∣D'∣与r2值并不匹配,取值区间差异很大,∣D'∣值普遍大于r2;另外,在有些基因内的相同标记间,∣D'∣、r2值相差很大,甚至在∣D'∣=1时,r2接近于0.2、在不同基因甚至在同一基因内不同区域LD水平差异很大且物理距离与LD关系并不成线性关系.3、在有些基因内,如ApoB基因,相间位点间的∣D'∣和r2值大于相邻位点间的值.4、有些基因,如PPAR4-γ,相同标记间LD水平在高、低脂系间存在很大差异.本研究结果提示,在群体遗传学研究中进行候选基因LD分析时,LD参数r2的应用价值比∣D'∣更大. 相似文献
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CCAAT增强子结合蛋白α(CCAAT/enhancer-binding protein α,C/EBPα)在脂肪细胞分化过程中起重要作用,是生长和体组成性状的重要候选基因。以东北农业大学肉鸡(Gallusgallus)高、低腹脂双向选择品系的第9、10世代肉仔鸡为材料,采用测序方法对鸡C/EBPα基因的部分5′侧翼区、编码区和部分3′侧翼区序列进行多态性检测,研究该基因多态性与鸡生长和体组成性状之间的关系。研究发现在C/EBPα基因编码区552bp位置存在一个沉默突变c.*552G〉A。统计分析结果表明,该突变对肉鸡的腹脂重、腹脂率、肝脏重、肝脏率、胫围、胫骨重等性状具有显著影响(P〈0.05)。相对于GG基因型个体,AA基因型个体具有较高的腹脂重和腹脂率(P〈0.05);对于肝脏重、肝脏率、胫围、胫骨重等性状,GG基因型个体则显著高于AA基因型个体(P〈0.05)。初步推断C/EBPα基因可能是控制腹脂沉积、骨骼生长发育的主效基因或与主效基因紧密连锁。 相似文献
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潍城区某养鸡户饲有罗曼商品蛋雏 3 0 0 0只 ,在 3 5日龄时有部分鸡发病 ,经笔者系统检查 ,确诊为食用过量劣质鱼粉引起的肌胃糜烂症。经采取措施 ,病情得到控制。现场调查和临诊症状该养鸡户一直自配饲料 ,鱼粉用量为 4 5% ,鱼粉用手攥成块不能自然松开且有氨味。在 3 5日龄刚开始发病时 ,主要表现为食欲下降 ,精神不振 ,羽毛蓬松 ,不爱活动 ,嗜眠 ,排稀便 ,个别病鸡呈犬坐姿势。以后有些病鸡嗉囊外观渐呈黑色 ,倒提病鸡 ,用手挤压嗉囊 ,可从口中流出酱油色液体 ;排黑色褐色软粪 ,肛门周围粘有黑褐色稀粪。前后死亡达 2 0 0余只。剖检病变… 相似文献