水牛DGAT1基因第17外显子多态性及其与乳成分含量的关联性分析     

孟莉  陈立  苗永旺  张永云  赵素梅  霍金龙  李卫真 《云南农业大学学报(自然科学版)》2013,28(2):190-196

 二酰甘油酰基转移酶1（DGAT1）在乳脂合成过程中发挥重要作用,但水牛DGAT1基因第17外显子遗传多态性及其与产奶性状的关联性还不清楚。本文采用PCR-SSCP结合DNA测序方法对48头德宏水牛和93头产奶杂交水牛（F1: 摩拉水牛×德宏水牛）的第17外显子进行了多态性检测并结合乳成分数据进行了关联分析。在水牛DGAT1基因第17外显子发现1个SNP位点,即c.1350C＞G,其为同义替换。该SNP位点在德宏乳用和非乳用水牛中群体遗传组成相近,且不同基因型个体间的乳糖率、乳脂率及乳蛋白率无显著差异（P>0.05）。表明该SNP对水牛乳糖率、乳脂率及乳蛋白率等无显著影响。序列比对显示,水牛、普通牛、瘤牛、山羊和绵羊DGAT1基因第17外显子间仅存在1个编码氨基酸差异,揭示其具有较高的保守性。  相似文献   

利用微卫星PCR技术分析山猪的遗传结构^*     

伍革民  许晓风  章熙霞  霍金龙  苗永旺  霍海龙 《云南农业大学学报(自然科学版)》2008,23(1):79-83

 选用世界粮农组织（FAO）和国际动物遗传学会（ISAG）联合推荐的23个微卫星位点对山猪群体的遗传多样性进行检测。通过等位基因频率、有效等位基因数、杂合度、多态信息含量的计算以及瓶颈效应分析,判断山猪群体目前遗传结构和濒危状况。结果表明,23个微卫星座位的多态信息含量在0.452~0.847之间。群体平均多态信息含量和平均杂合度分别为0.686和0.731。瓶颈效应分析表明,山猪群体拥有极显著的杂合度过剩位点数,在无限等位基因模型和逐步突变模型下的平均杂合度为0.559和0.672,推断其有效群体大小近几十年在明显下降,从而说明山猪群体已经处于被灭绝的威胁中。上述研究结果对于山猪的保种和开发利用具有重要的指导意义。  相似文献   

利用76个微卫星标记分析滇南小耳猪的遗传多样性   总被引：2，自引：0，他引：2  

霍金龙  霍海龙  苗永旺  李大林  刘丽仙  刘建平  李云辉 《云南农业大学学报(自然科学版)》2008,23(5)

滇南小耳猪是云南省优良地方猪种之一,其数量大,分布广。为了阐明其群体遗传变异情况,以对其进一步有效保护和合理利用提供科学依据,本研究采用分布在家猪19条染色体上的76个微卫星标记对该猪群体54个个体进行了群体遗传变异检测。共检测到338个等位基因,每个座位的等位基因数在2~8个之间,有效等位基因数在1.956 0~5.714 3之间,平均每个座位等位基因数(4.447 4±1.204 4)个,有效等位基因数(3.509 1±0.919 7)个,群体平均杂合度及平均多态信息含量分别为0.691 7±0.097 9和0.638 8±0.114 2。研究结果表明,滇南小耳猪群体遗传多样性较丰富。  相似文献   

近交系实验动物在生物医学等领域中的研究和应用     

霍金龙  张娟  罗古月  张美  李小梅  曾养志 《猪业科学》2003,20(12):59-61

本文综述了近交系实验动物的发展简史、命名、优点在生物医学各领域中的应用及展望。  相似文献   

版纳微型猪近交系PPARD基因克隆及95G/A突变检测          下载免费PDF全文

陈园园  王配  霍金龙  王淑燕  潘伟荣  施晨  程霞  曾养志 《家畜生态学报》2015,36(9):13-19

为深入研究PPARD在猪体内的调节和功能,以版纳微型猪近交系(BMI)为试验动物,通过RT-PCR方法扩增得到PPARD基因全长编码区序列,在编码区第95位检测到A/G两种核苷酸(GenBank登录号:KP757025、KP757026)。结果表明,该基因编码462个氨基酸,蛋白分子量为49.74kD,等电点为7.53。蛋白质结构分析PPARD存在2个保守域,无跨膜结构,不存在信号肽,存在1个亮氨酸富集的核输出信号,其N端、C端均亲水;亚细胞定位显示该蛋白分泌到细胞周质的概率为69.6%。系统进化分析表明猪与牛、犬的亲缘关系较近。利用qPCR检测了PPARD基因mRNA在BMI 14个组织中的表达量,发现在肝脏、耳朵、脾脏、小肠中表达量较高。  相似文献   

版纳微型猪近交系生长激素基因克隆及原核表达研究     

王淑燕  霍金龙  王配  潘伟荣  曾养志 《畜牧兽医学报》2012,43(10):1669-1676

本研究旨在获得版纳微型猪近交系(BMI)生长激素基因编码区序列,揭示其原核表达规律.采用RTPCR方法从版纳微型猪近交系(BMI)脑垂体中克隆生长激素(GH)基因,并将其连接到pMD 18-T载体进行测序和生物信息学分析.克隆得到的GH基因cDNA序列长690 bp,其中CDS长651 bp,编码216个氨基酸,前26个氨基酸为信号肽序列.多猪种GH氨基酸序列比对表明其在各猪种中高度保守,版纳微型猪近交系的GH氨基酸序列与五指山猪和宁香猪的相似性均为100％,与藏猪、香猪、大乌猪、太湖猪、成华猪、内江猪、荣昌猪、长白猪、约克夏的相似性均为99％,与雅南猪、杜洛克的相似性均为98％.扩增GH成熟肽区编码序列,定向克隆至表达载体pET-32a(+),转化入大肠杆菌Rosseta (DE3)感受态细胞中,用IPTG诱导表达蛋白.SDS-PAGE和Western blotting分析表明,重组质粒在大肠杆菌中获得了高效表达,融合蛋白以包涵体形式存在,分子质量约为40.6 ku.以上结果为进一步探究GH基因对BMI矮小性状的影响奠定了基础.  相似文献   

版纳微型猪近交系性别决定基因（SRY）原核表达载体的构建及蛋白高效表达     

霍金龙  王配  成文敏  王淑燕  曾养志 《云南农业大学学报(自然科学版)》2012,27(2):198-203

 为了构建版纳微型猪近交系SRY的原核表达载体pET 32a(+) SRY,并通过诱导使其在大肠杆菌中获得高效表达,研究采用添加限制性内切酶位点的引物特异性扩增SRY,连入pMD19 T simple载体,转化入大肠杆菌DH5α,克隆后提取pMD19 T SRY阳性重组质粒,使用相同的内切酶同时对pMD19 T SRY质粒和原核表达pET 32a（+）载体进行酶切,连接后使SRY定向克隆到pET 32a(+)表达载体中。经PCR、酶切和测序鉴定后,重组质粒转化大肠杆菌感受态DH5α,提取质粒后再次转化大肠杆菌Rosetta（DE3）,用不同浓度的异丙基硫代半乳糖苷（IPTG）诱导表达,并通过15% SDS PAGE鉴定。结果显示,不同浓度IPTG诱导的SRY均在大肠杆菌中进行了高效特异性融合表达。  相似文献   

从鸡血中快速提取高质量基因组DNA方法的研究   总被引：19，自引：1，他引：19  

苗永旺  霍金龙  李莲军  刘丽仙  刘建平  潘伟荣  叶朗惠  毕保良 《黑龙江畜牧兽医》2005,(12):10-12

介绍了一种经改进建立的从鸡血中快速提取高纯度基因组DNA的方法。该方法提取DNA耗时较短,只需2.5~3 h即可拿到DNA样品。提取的DNA样品经紫外分光光度计检测,DNA样品的A260/A280达1.782 2±0.009 3;经琼脂糖凝胶电泳检测,DNA样品的带型清晰、整齐,无拖尾现象;微卫星PCR扩增效果理想。结果表明,该方法所提DNA纯度较高,质量好,分子片段完整,完全能满足分子生物学实验的要求。  相似文献   

利用微卫星标记分析蓝孔雀群体的遗传多样性^*     

陈涛  苗永旺  霍金龙  魏红江  叶朗惠  潘伟荣  田应华 《云南农业大学学报(自然科学版)》2006,21(3):346-350

 蓝孔雀不仅具有观赏价值,其作为特禽来养殖也具有较高的经济价值。为了进一步了解蓝孔雀群体的遗传变异状况,筛选出10对家鸡微卫星引物,利用PCR、聚丙烯酰胺凝胶电泳技术对西双版纳蓝孔雀群体的59个个体进行了遗传多样性检测。10个微卫星座位共检测到35个等位基因,各基因座位的等位基因数为2~5个,平均每个座位的等位基因数和有效等位基因数分别为3.50和3.00个;群体平均多态信息含量为0.5533,平均杂合度为0.6168。表明蓝孔雀群体遗传多样性丰富。  相似文献   

RNAi及其在哺乳动物中的应用^*     

信吉阁  韩佃刚  魏红江  何飞  霍金龙  曾养志 《云南农业大学学报(自然科学版)》2006,21(2):210-216

 RNA干扰(RNAi)是由特定双链RNA(dsRNA)引发的转录后基因沉默,广泛存在于真菌、植物和动物中,它是近年来迅速发展起来的高效、特异、易操作的基因阻断技术,在功能基因组的研究中有着广阔的应用前景。研究表明,断裂dsRNA产生的小干扰RNA(siRNA)可抑制哺乳动物基因表达。从哺乳动物整体水平应用研究的角度,对RNAi的分子机制、生物学功能和特点,siRNA导入体内的方法以及应用等方面的研究作一综述。  相似文献