从罗氏沼虾肝胰腺转录组角度阐述罗氏沼虾对动植物蛋白利用的差异     

王成丽  刘翥  田其真  徐亚亚  徐禾  张馨月  邱新雯  温馨茹  朱毅佳  丁志丽 《中国饲料》2023,1(4):63-69

为了探究罗氏沼虾（Macrobrachium rosenbergii）对动植物蛋白利用的差异,从肝胰腺转录组角度出发,采用IlluminaHiSeqTM4000高通量测序平台对罗氏沼虾肝胰腺组织进行转录组测序。然后将所测序列经质控,组装后对比到GOKEGG等数据库中进行注释（梁华芳等,2013）,并对其进行差异基因等的聚类分析。试验将健康的初始均重为0.448g的罗氏沼虾分为两组,分别以鱼粉为动物蛋白源（FP组）,豆粕、玉米蛋白粉和谷朊粉为植物蛋白源（PP组）进行饲喂,每组3个重复,养殖周期为8周。结果显示,两组样本6个样品共产生160783350个Cleanreads,分别对两组样本6个样品进行两两比较,一共检测到518个差异表达基因,其中显著上调基因有460个,显著下调基因有58个,GO功能分析表明,差异表达的基因对比到GO数据库共37098个GOterm,这些term分别对应细胞组分,分子功能以及生物过程等三大类59个分支,差异基因主要涉及到糖类转运、氨基酸合成、酶活性细胞膜组成等。通过KEGG富集分析结果表明,两组样本之间的差异表达基因主要富集在139条通路上,主要涉及代谢、遗...  相似文献   

不同品种(配套系)黄羽肉鸡皮肤毛囊密度性状发育规律     

姬改革  栾德琴  刘一帆  屠云洁  单艳菊  邹剑敏  章明  巨晓军  束婧婷 《中国家禽》2023,(6):19-23

研究旨在探讨不同品种黄羽肉鸡毛囊密度性状的发育变化规律和品种间差异。试验以花山鸡、817肉鸡、清远麻鸡、溧阳鸡、瑶鸡和广西三黄鸡等为素材,测定不同周龄各品种毛囊密度。结果显示：各品种背部和腿部毛囊密度随着日龄的增长呈逐渐下降的趋势;3～9周龄时,花山鸡、清远麻鸡、溧阳鸡、瑶鸡和广西三黄鸡背部和腿部毛囊密度在不同周龄之间均呈显著差异（P<0.05）。处于上市日龄品种间的比较,除溧阳鸡、广西三黄鸡、花山鸡和817肉鸡,其他品种的背部和腿部毛囊密度显著高于罗斯308肉鸡、毛囊直径低于罗斯308肉鸡（P<0.05）;文昌鸡、狼山鸡、鹿苑鸡和崇仁麻鸡的背部和腿部毛囊直径显著低于其他品种（P<0.05）。品种内公母之间比较,瑶鸡和崇仁麻鸡的腿部毛囊密度在公母间存在显著差异（P<0.05）。各品种的体重分别与背部毛囊密度和腿部毛囊密度呈极显著负相关（P<0.01）,背部和腿部毛囊密度呈极显著正相关（P<0.01）。结果提示,可以通过对体重的选择间接调控毛囊密度性状,性别可能会影响不同品种腿部毛囊密度的大小,研究结果为培育适合冷鲜上市的黄羽肉鸡配套系提供基础。  相似文献   

香猪皮肤转录组衰老相关病毒源基因的筛选和鉴定     

张红辉  黄世会  牛熙  李升  冉雪琴  王嘉福 《中国畜牧杂志》2023,(8):228-236

皮肤是哺乳动物抵御致病因素的第1道防线,在皮肤衰老的过程中,整合到哺乳动物基因组中的病毒源基因序列会被重新激活,影响宿主基因的表达,激起细胞对病毒的反应,引起慢性炎症、促进细胞衰老。本研究旨在探究病毒源基因表达与皱皮香猪皮肤皱纹形成的关系,选取12～18月龄皱皮香猪和普通香猪各5头进行转录组测序和生物信息学分析,采用RT-qPCR方法对皱皮香猪中差异表达的病毒源基因进行验证。2组中皮肤组织差异表达基因与病毒整合位点数据库进行比对分析,筛选出612个差异表达的病毒源基因。以普通香猪为对照,得到上调基因182个,下调基因430个,这些差异表达的病毒源基因主要富集在皮肤发育、炎症反应等GO条目,以及长寿调控途径、FoxO信号通路、细胞衰老等KEGG通路。经猪-人同源基因转换,与免疫、衰老、人类皮肤相关的基因取交集,筛选出高表达的候选基因6个：AGT、CAT、CTNNB1、JUP、KRT75和LIPE,采用RT-qPCR验证了皮肤中这6个基因的差异表达,与转录组测序结果趋势一致。研究结果表明,皱皮香猪皮肤皱纹的形成与病毒源基因的异常表达有紧密联系,本研究可为后期皱皮香猪皮肤褶皱形成的分子机制及...  相似文献   

基于脾脏转录组筛选北京油鸡和广明白鸡抗热应激相关功能基因     

王子渲  王巧  张锦  Astrid Lissette Barreto Sánchez  郑麦青  李庆贺  崔焕先  安炳星  赵桂苹  文杰  李和刚 《畜牧兽医学报》2023,(5):1905-1914

旨在通过对北京油鸡(BY)和“广明2号”白羽肉鸡B系(广明白鸡,GM)在热应激和正常饲养条件下的脾脏转录组进行分析,鉴定两鸡种在应对热应激时的差异表达基因和信号通路,解析不同鸡种耐热性能差异的分子调控机制。试验动物采用相同饲养条件下的25日龄北京油鸡和广明白鸡,测定异嗜性粒细胞与淋巴细胞的比值(H/L)、超氧化物歧化酶(SOD)和总抗氧化能力(T-AOC)等表型数据,采集脾脏组织进行转录组测序(RNA-Seq)。基于RNA-Seq数据,结合表型进行加权基因共表达网络分析(WGCNA),筛选出与性状相关性较高的模块与基因。脾脏转录组测序结果表明,热应激组相比于对照组,北京油鸡中共鉴定到313个差异表达基因,其中169个上调表达,144个下调表达;广明白鸡中鉴定到235个差异表达基因,其中152个上调表达,83个下调表达。利用WGCNA分析,在北京油鸡中筛选出2个与H/L相关性较高的模块,在广明白鸡中筛选出4个与H/L和T-AOC强相关的模块。通过筛选模块中的Hub基因,发现两品种中均存在TRIM29基因,说明该基因可能在抗热应激方面发挥重要作用。本研究通过转录组分析,揭示了不同鸡种在热应...  相似文献   

玉米转基因在分子农业领域的研究进展     

王良发  郭民华  杨美丽  徐国举  张金奎  王海军  卢瑞乾  李长建  李风章 《中国农学通报》2015,31(9):162-167

植物转基因技术开辟了作物遗传改良的新途径。近年来,随着植物反应器技术的多元化发展以及日趋成熟,以玉米为分子工厂合成一些高价值产品成为研究热点。笔者就以玉米为植物反应器,用其生产糖类、必需氨基酸、不饱和脂肪酸、维生素、微量元素、生物酶、疫苗、抗体等各种高价值分子代谢物进行了综述,以期为中国分子农业领域的研究与应用提供参考。  相似文献   

低能离子注入后小麦苗期损伤效应研究   总被引：7，自引：2，他引：7  

王卫东  闻捷  苏明杰  秦广雍  霍裕平 《华北农学报》2005,20(2):80-83

以鉴54、豫农118及豫麦18号为材料,研究了不同剂量率、剂量离子注入对小麦幼苗生长的影响。结果表明,随着剂量率和剂量的增加小麦幼苗损伤程度逐渐加剧,具体表现在苗高降低、第一叶长变短。剂量率间差异显著,品种间有辐射敏感性差异。另外苗期还发现了一些变异,主要表现为主叶脉失绿和形态畸形。离子束诱变的合适剂量在6×1017ions/cm2以上。  相似文献   

河西走廊戈壁植物特征及其与沙漠植物的差异     

杜娟 《农业工程》2020,10(3):106-111

戈壁与沙漠同属于荒漠土地类型，其植物生长互相交叉。为揭示戈壁植物与沙漠植物的差异，以甘肃河西走廊为例，运用戈壁调查资料和沙漠调查资料做了初步分析。结果表明:河西走廊戈壁分布的有15个科47种，其中以藜科、蒺藜科、豆科和菊科较多。典型戈壁植物主要有红砂、骆驼刺、戈壁藜、珍珠猪毛菜、松叶猪毛菜和膜果麻黄等。戈壁植物与沙漠植物的区别:典型戈壁植物的垂直根系十分发达，水平根系相对较弱，且一般不具备根蘖能力；典型沙漠植物的水平根系十分发达，一般都具有很强的根蘖能力，且喜欢风蚀沙埋，沙埋后能产生不定根，风蚀的根茎可产生枝叶。该文不仅为研究荒漠植物的土壤生态类型和植物的迁地保护以及引种驯化研究提供理论基础，而且在荒漠植被保护中具有现实意义。   相似文献   

无瓣海桑根响应盐胁迫的转录组分析          下载免费PDF全文

梁锐涛  韩维栋  杨少瑕  陈蓓蓓 《林业科学研究》2023,(1):68-78

[目的]初步探究无瓣海桑的耐盐分子机制,筛选出无瓣海桑抗盐候选基因,为后续功能验证实验及林木抗盐性遗传育种奠定分子基础。[方法]以1年生无瓣海桑幼苗为材料,用500 mmol·L^-1 NaCl分别处理0 d(对照组)和10 d(处理组),取不同条件下的根部组织进行转录组测序,并结合三代全长转录组数据进行后续生物信息学分析。[结果](1)与对照组相比,NaCl处理10 d后,无瓣海桑幼苗根系中共有14 401个差异表达基因,其中,7 153个上调,7 248个下调。(2)GO分析发现,共有11 068个差异基因在47个GO条目得到注释。(3)在KEGG富集分析中,共有6 189个差异基因富集到134条通路,其中,共有14条通路显著富集(P值<0.01,Q值<0.05)。(4)通过进一步对差异基因进行功能注释分析,共筛选出抗盐候选基因89个,其中,抗氧化基因24个,渗透调节物质基因22个,植物激素基因19个,蛋白激酶基因10个,转录因子基因14个。[结论]活性氧清除、渗透调节、植物激素、蛋白激酶及转录因子相关基因参与调控无瓣海桑盐逆境适应过程。  相似文献   

南方丘陵山区水稻机插秧技术推广的制约因素与对策   总被引：2，自引：0，他引：2  

胡俊平 《南方农机》2007,(4)

我国南方产粮区主要以水稻种植为主,这些地区地理环境以丘陵山区为主,地理环境差异,很大程度上约束了插秧机效率的发挥,影响了水稻机插秧技术在该地区的推广。笔者根据多年在该  相似文献   

外包服务对中老年劳动力参与水稻生产的影响     

唐若迪  陈超 《中国水稻科学》2022,36(6):647-655

【目的】随着中国社会老龄化的加速,农业劳动者高龄化的趋势进一步凸显。本研究以水稻生产为例,分析并检验农业生产外包服务对中老年劳动力参与生产的影响,为理解和适应农业部门老龄化提供一个新的视角。【方法】从提高老年人自我养老能力的角度,分析外包服务对农业劳动力年龄水平和年龄结构的影响,并将生产外包服务的环节差异纳入分析框架,采用内生转换模型(EndogenousSwitchModel,ESM)检验农业生产外包服务对老年劳动力参与生产的影响。【结果】水稻生产外包服务显著提高了低龄老年劳动力生产参与率,对中龄老年劳动力生产参与率则无显著影响。在水稻种植的不同生产环节中,采用耕地、育种和收割环节外包服务对老年人农业参与起到促进作用,而采用移栽和病虫害防治环节外包服务表现出抑制作用。【结论】水稻生产外包服务总体上能放松老年人进行农业生产的约束,有利于老年劳动力参与生产,但仍需加强移栽和病虫害防治环节的生产社会化服务建设。  相似文献