利用优化的SSR分子标记技术检测杂交水稻万优481纯度     

黄成志雷树凡  胡景涛等 《安徽农业科学》2014,(22):7321-7322

[目的]通过降低试验药剂、减少PCR循环时间、提高琼脂糖利用指数等,建立经济、快速、低污染的杂交水稻纯度鉴定体系。[方法]将杂交水稻万优481、亲本万3A和万恢481在光照培养箱内温度发芽(30℃,长到5 cm左右),用CTAB法提取DNA;按优化的PCR体系和电泳方法,用亲本万3A和万恢481的DNA从24对引物中筛选出多态性好的引物P18,用引物P18对杂交水稻万优481样本进行纯度鉴定。[结果]利用优化的SSR分子标记技术准确鉴定出万优481的纯度为98.5%,与田间鉴定结果相符,凝胶电泳成像带谱清晰,同时,与常用方法相比,酶等试验药品使用量减少20%~25%,试验所用时间较常用方法减少了50%以上。[结论]利用优化的SSR分子标记技术体系鉴定杂交水稻种子纯度,经济、快速且鉴定的结果清晰、可靠,同时大大减少琼脂糖等试验残渣的产生,降低了对环境污染,值得推广、应用。  相似文献   

101份糯玉米自交系的遗传多样性   总被引：1，自引：0，他引：1  

马鹏  王国琴  谷静丛 《贵州农业科学》2014,(12)

为筛选出形态学表现好、遗传距离较远的糯玉米自交系类群,利用 SSR分子标记技术对表型不同的101份糯玉米自交系进行 SSR 分子标记遗传多样性分析。结果表明,30对 SSR 引物筛选出23对多态性好、带型稳定的引物,分布在玉米所有染色体上;共检测出128个条带,108个等位基因,平均每个引物检测出4．7个等位基因;23对引物多态性信息量为0．59～0．94,平均为0．85;SSR 聚类结果将101份糯玉米自交系分为10大类群。  相似文献   

麻核桃遗传多样性的SSR分析     

贾建云  陈新  刘洪对  徐丽  张力思  刘庆忠 《山东农业科学》2014,(1):15-18

本试验利用SSR标记技术对20个麻核桃品种的遗传多样性进行研究。从12对引物中筛选出6对用于正式PCR扩增,共检测到52个遗传位点,其中多态性遗传位点50个,多态位点百分率为96%。遗传相似性分析结果显示麻核桃种质间具有丰富的遗传多样性,遗传相似系数变幅为0.17~0.90,说明SSR标记能将20份种质完全区分开。UPGMA聚类结果显示,供试材料在相似系数为0.61处聚为4类。  相似文献   

基于白木香ESTs的沉香属SSR分子标记引物筛选     

杨云  张争  陈波等 《江西农业学报》2014,(5):76-79

通过对白木香样品的454GS FLX Titanium高通量测序,获取了大量白木香EST序列,从中搜索出956个SSR,根据引物设计标准,设计了44对EST-SSR引物。在合适的PCR反应体系下,以海南白木香样品的DNA为模板,对设计的EST-SSR引物进行筛选,发现有22对EST-SSR引物能较好地扩增出产物。在沉香属3个种9份样品中进一步对这些可扩增的引物进行多态性初步验证,所筛选引物均可在所有沉香属样品中使用,为后续白木香居群及沉香属植物遗传多样性分析奠定基础。  相似文献   

基于NCBI 数据库的油棕EST-SSR 标记的开发与应用     

夏薇肖勇  杨耀东沈雁雷新涛  马子龙 《广东农业科学》2014,41(2):144-148

应用NCBI 网站上释放的41 977 条油棕EST 序列,从中挖掘SSR 位点3 946 个,根据27 个SSR 位点的 侧翼序列设计引物,并对18 份油棕DNA 样品进行扩增,扩增结果显示10 个标记具有多态性。根据这些标记信息, 对这18 份油棕资源进行主成分分析,18 份油棕资源被分成两个遗传群体,一个为文昌高隆湾和文昌椰子研究所的 油棕资源,另一个群体为10 份引自马来西亚的油棕资源。这些研究显示,开发的标记可用于油棕资源遗传多样性评 估、遗传结构评估,并可用于油棕遗传图谱的构建。  相似文献   

SSR分子标记在玉米品种真实性鉴定上的应用   总被引：1，自引：0，他引：1  

郭奕生  何德银 《广东农业科学》2014,41(12):12-15

跟田间种植鉴定相比,SSR 分子标记鉴定品种真实性具有快速、准确、不受环境影响等特点,是打击套 牌侵权、维护品种权人合法权益的有效途径。利用20 对核心引物对玉米品种进行真实性鉴定,有9 对核心引物扩增 产物出现明显差异,11 对核心引物扩增产物没差异,表明利用SSR 分子标记鉴定玉米品种真实性是可行的。  相似文献   

甘蓝SSR标记在近缘种青花菜的通用性及其应用     

荆赞革  唐征  罗天宽  张小玲  楼珏  刘庆  朱世杨  叶珍 《广西农业生物科学》2010,(4):685-690

本研究对50条甘蓝SSR引物在其近缘种青花菜中的通用性进行了分析,结果表明,38对引物在青花菜上可有效扩增,扩增产物分子量在100～1500bp,有效扩增比率为76%,其中18%具有较好的多态性,揭示了两种作物基因组间存在一定的相似性。同时利用获得的多态性较好的9对引物对青花菜进行基因型鉴定和遗传多样性分析,20份青花菜基因型中共检测到51个基因位点,平均每个引物组合可扩增出5.67个条带,多态性为66.7%。多引物组合可鉴别出所有青花菜基因型。聚类分析结果表明同一来源的基因型间具有相近的遗传基础,且聚类与熟性具有一定的相关性。本研究为今后青花菜种质资源的收集、利用及分子标记辅助育种提供了新的SSR标记和参考。  相似文献   

黄花苜蓿SSR-PCR反应体系的优化   总被引：1，自引：0，他引：1  

吴宗怀  王俊杰  云锦凤  杨青川 《内蒙古农业大学学报(自然科学版)》2010,31(2):124-128

对黄花苜蓿SSR-PCR扩增体系的反应条件进行了优化,分析了Mg2+浓度、dNTP浓度、DNA模板浓度、引物浓度、TaqDNA聚合酶浓度对PCR扩增结果的影响.结果表明:在25μL的反应体系中,dNTPs的最佳浓度为0.2mmol/L,Mgcl2的最佳浓度为2.0mmol/L,DNA模版最适加入量80ng,引物的最佳浓度为0.16gmol/L,TaqDNA聚合酶的最佳用量为1U.  相似文献   

Detection of Allelic Variation in Chinese Wheat (Triticum aestivum L.) Germplasm with Drought Tolerance Using SSR Markers   总被引：2，自引：0，他引：2  

JING Rui-lian  CHANG Xiao-ping  Marcello Broggio  JIA Ji-zeng 《中国农业科学(英文版)》2002,1(10):1083-1088

Allelic variation in two domestic wheat landraces, Pingyaobaimai and Mazhamai, two cornerstone breeding materials and their derived cultivars with drought tolerance was detected by SSR (simple sequence repeat) markers. The clustering of 25 accessions showed that the similarity between Pingyaobaimai and Yanda1817, the latter was developed from the former, was 0.71, the highest one of all accessions, but the similarities were very low between these two accessions and other accessions including their derived cultivars. A similar situation was revealed between Mazhamai and its derived cultivars. Pingyaobaimai and its three derived cultivars shared three alleles at loci Xgwm526, Xgwm538 and Xgwm126 on chromosome arms 2BL, 4BL and 5AL, respectively. There were six shared alleles in Mazhamai and its derived cultivars, in order of Xgwm157,Xgwm126, Xgwm212, Xgwm626, Xgwm471 and Xgwm44 on chromosome arms 2DL, 5AL, 5DL, 6BL, 7AS and 7DC, respectively. Only one shared allele was detected between the pedigrees of Pingyaobaimai and Mazhamai. The difference of shared alleles in two cornerstone breeding materials and their derived cultivars revealed the diversity in Chinese wheat germplasm with drought tolerance and the complication in genetic basis of drought tolerance in wheat.  相似文献   

新疆野苹果叶形性状变异及其与SSR标记关联分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

左力辉  张文林  邱彤  张军  杨敏生 《园艺学报》2015,42(4):759-763

以从新疆天山地区新疆野苹果600个无性系中筛选得到的18个优系为研究对象,调查其叶形性状变异,并进行了SSR分子标记分析,探究叶形性状与SSR标记间的相关关系。结果表明,调查的15个叶形性状在无性系间均存在极显著差异;平均变异系数最大的为叶尖角α(达到25.39%),叶形指数L1/L3最小(仅为10.31%);叶片长的重复力最大(达到0.967),叶形指数L1/L3最小(仅为0.495)。以15个叶片性状为依据,可将各无性系完全区分开,并分为3类,各无性系间的遗传距离变化在1.293~7.235间。用均匀分布在17个染色体连锁群上的30对多态性SSR引物对18个无性系进行聚类分析,可将各无性系完全区分开,并可分为4类,各无性系间的遗传距离为0.089~0.689,平均遗传距离为0.433。所有叶形性状聚类结果与所有SSR标记聚类结果不相关。以单一叶形性状聚类结果与经过筛选的部分SSR标记聚类结果进行相关分析,绝大部分达到极显著相关,且大部分引物组合表现为累积效应,表明叶形性状与部分SSR位点具有紧密关联。  相似文献