海鞘(Ciona intestinalis)新microRNA基因的识别及其靶标预测     

张伟  金萍  侯林  马飞 《安徽农业大学学报》2010,37(4)

microRNAs(miRNAs)是一类长度约22 nt的非编码小RNA,通过碱基互补配对的方式调控靶基因的表达.本文采用同源搜索的方法,以线虫、果蝇、文昌鱼和人类的miRNA为探针,与海鞘的基因组序列进行比对,同时结合miRNA二级结构特征及SVM假阳性分析共发现10个新的miRNA基因.通过靶基因预测,共找出225个潜在靶基因,这些靶基因主要参与细胞代谢、转录调节、结合活性等功能.新miRNA基因的识别为海鞘miRNA功能研究奠定了基础,并为更进一步揭示脊椎动物miRNA的起源与进化提供了理论依据.  相似文献   

MicroRNAs Involved in the Pathogenesis of Phytophthora Root Rot of Soybean （Glycine max）   总被引：1，自引：0，他引：1  

WANG Jing  LIU Chun-yan  ZHANG Li-wei  WANG Jia-lin  HU Guo-hua  DING Jun-jie  CHEN Qing-shan 《中国农业科学(英文版)》2011,10(8):1159-1167

  相似文献   

microRNA与植物花发育调控的研究进展     

徐妙云  王磊 《中国农业科技导报》2011,13(2):9-16

microRNAs(miRNAs)是约21nt的非编码RNA,主要在转录后水平调节基因的活性。miRNAs通过与靶基因的互补位点结合从而降解靶基因mRNA或抑制其翻译。miRNAs 参与调控植物生长发育的多个方面,包括生长、开花、代谢、激素应答、生物与非生物胁迫。综述了miRNAs在植物花发育中的研究进展,以期为更好地了解miRNA在此过程中的作用机制,并应用于改良植物的农艺性状及培育优良品种奠定基础。  相似文献   

牦牛BoLA-I基因mRNA及其相关miRNAs在牦牛不同组织器官中表达分析     

徐业芬  孙宏宇  索朗斯珠  牛家强  贡嘎  郭敏  王玉恒  张鹏宇  张雷  旦巴次仁  王刚  罗润波 《中国农业大学学报》2019,24(5):47-56

为了解牦牛BoLA-I基因mRNA组织表达谱,并探索可能靶定BoLA-I基因的miRNAs,利用RT-PCR技术对牦牛BoLA-I基因mRNA在牦牛肝、脾、肺、肾、肌肉、卵巢、小肠、下颌淋巴结、大肠和肠系膜淋巴结等10种组织的表达谱进行分析,再通过Targetscan和miRBase软件来预测可能靶定BoLA-I基因的miRNAs,检测其在10种牦牛组织中的表达情况。结果表明:BoLA-I基因mRNA在检测的10种牦牛组织中均有表达,尤其在免疫器官组织中广泛表达,在牦牛的肠系膜淋巴结组织表达水平极显著高于小肠和大肠组织(P0.01);预测到的可能靶定牦牛BoLA-I基因的miRNA共有28个,从中选择了6个进行组织表达谱分析,发现bta-miR-759、bta-miR-142-5p、bta-miR-665、bta-miR-2322-5p、bta-miR-199a-3p与牦牛BoLA-I基因共表达;除卵巢外,bta-miR-219-5p在其他组织中均有表达,且在肝脏组织中的表达水平极显著高于其他组织(P0.01)。bta-miR-142-5p在肠系膜淋巴结中表达量极显著高于其他组织(P0.01)。由此推测,牦牛BoLA-I基因及其预测的miRNA可能在牦牛组织中起重要作用。  相似文献   

猪CA5B基因的序列特征和表达分析     

郭晋  范新浩  杨亚岚  梁国明  唐中林 《畜牧兽医学报》2021,52(2):322-330

旨在通过分析猪CA5B(线粒体碳酸酐酶 VB,carbonic anhydrase 5b,mitochondria;CA5B/CA VB/Car5b)基因的序列特征和时空表达,解析CA5B对猪组织器官发育和代谢的影响.本研究采集6头240日龄贵州猪(公、母各3头)的心、肝、脾、肺、肾、皮下脂肪、背最长肌、睾丸、卵巢,采...  相似文献   

miRNA调控畜禽剩余采食量的研究进展     

白皓  杨宝龙  董钊绮  李潇凡  江勇  常国斌  陈国宏 《中国农业科技导报》2020,22(11):63-68

剩余采食量（residual feed intake, RFI）是评价畜禽饲料利用率的重要指标。microRNA（miRNA）是一类通过转录后抑制基因表达的内源性非编码单链RNAs,长度约为22 nt,是基因表达的重要调控因子。miRNA与动物机体的采食及能量代谢密切相关,参与调控牛、猪、鸡等动物的RFI。针对近年来畜禽RFI的研究现状,特别是miRNA调控畜禽剩余采食量的研究进展进行总结,有助于揭示畜禽RFI性状的分子调控机理,为畜禽饲料利用率的改良与高效生产提供新思路,为优质畜禽的分子选育工作提供理论依据。  相似文献   

微小RNA功能与癌症形成的关联分析     

包阿东  刘长青  吴宏梅  刘帅  关伟军  马月辉 《中国畜牧兽医》2008,35(2):49-54

微小RNA（microRNA,miRNA）是长度约16~29 nt的非编码RNA。其功能是通过特异性基因沉默导致靶mRNA降解,抑制蛋白质的合成或在细胞分化、发育和凋亡等关键时期调控转录后的基因表达水平。大量研究结果表明,miRNA既可作为诱癌基因参与恶性肿瘤发生和发育过程,又可作为抑癌基因参与控制恶性肿瘤的形成。迄今,试图以治疗癌症为宗旨进行miRNA的功能与癌症形成的关联性研究已成为国内外的热点课题之一。因此,作者就miRNA产生机制、miRNA的生物学功能、与癌症相关的主要miRNA和癌症治疗的展望等问题进行了概括性的论述,其目的在于为从事miRNA的功能与癌症形成关联性研究的同行提供重要的参考资料,促进该项研究取得新进展。  相似文献   

季节对民猪CSDE1表达的影响及其分子调节网络     

马红  刘宇  汪亮  刘娣 《中国兽医学报》2019,(10):2061-2066

民猪是具有抗寒特性的地方猪种,研究民猪对环境温度的适应机制对于理解其抗寒特性具有重要意义。本试验通过检测4个季节民猪外周血单核细胞中含CSD结构域的E1蛋白(cold shock domain-containing protein E1,CSDE1)、miR-1和miR-331-3p表达情况,并通过在PK15细胞中过表达CSDE1基因,检测细胞中7种干扰小RNA和8种基因,研究CSDE1在民猪环境温度适应中的作用和分子调控网络。结果表明,CSDE1在春、秋季表达量较低,而在夏、冬季表达量较高,而RNA miR-1和miR-133-3p的表达规律则相反;过表达CSDE1后细胞中小RNA miR-1、miR-101、miR-1307和基因HDAC3、BTF3、HSF2、TCEA1 mRNA的相对表达量明显上升,miR-143-3p和CHD7mRNA的相对表达量明显下降,各试验组差异显著(P<0.05)。结果表明,CSDE1的表达受到民猪所处环境温度的影响,可以被干扰小RNA调节,并进一步影响其他基因的表达。  相似文献   

Differentially expressed microRNAs,including a large microRNA cluster on chromosome 24, are associated with equine sarcoid and squamous cell carcinoma     

Kirsten Bogedale  Vidhya Jagannathan  Vinzenz Gerber  Lucia Unger 《Veterinary and comparative oncology》2019,17(2):155-164

  相似文献   

家蚕miRNA及其在抗病毒机制中的作用     

王雅婷  蒋彩英 《蚕桑通报》2016,(2):1-6

miRNA广泛存在于真核生物中,并在多种生理过程中发挥着重要的作用。本文简要介绍了家蚕miRNA及其在抗病毒机制中功能作用的研究进展。开展家蚕miRNA在家蚕抗病毒作用机制的研究,不仅有助于全面了解家蚕miRNA的功能及其调控机制,而且对于促进家蚕病毒病的早期诊断、防治和抗病育种具有重要意义。  相似文献