微卫星分析中样本量和性别对群体遗传多样性的影响   总被引：1，自引：0，他引：1  

张跟喜  丁馥香  赵秀华  王金玉  金崇富  张丽 《畜牧与兽医》2011,43(6)

以边鸡29个微卫星标记的遗传多样性分析数据为例,分析样本量和性别对群体遗传多样性指标的影响。结果表明:当样本量超过30时,平均期望杂合度趋于稳定,样本量与平均期望杂合度无显著相关,与平均多态信息含量和平均等位基因数呈正相关。在微卫星分析中性别对遗传多样性指标无显著影响。在运用微卫星标记进行群体遗传遗传多样性研究时以30～40个样本较为合适。  相似文献   

基于SSR标记技术的南丰柑橘种质资源亲缘关系研究     

《果树学报》2017,(6)

【目的】从分子水平探究南丰柑橘种质间的亲缘关系。【方法】应用SSR技术对28份南丰柑橘种质进行基因组的多态性分析。【结果】从91对引物中筛选得到13对SSR引物,可区分全部供试材料。共扩增得到64个等位基因,平均每个位点4.92个等位基因。以遗传相似系数0.18为界,金柑属金柑单独聚为1类,柑橘属27份供试样品聚为1类。以相似系数0.59为阈值,27份柑橘属供试种质分为5个类群,其中南丰蜜橘品种群(包含小果系、大果系、桂花蒂系、早熟系)所有20份供试种质与‘蜜广’聚为一类,‘小叶广’‘火广’‘火橘’聚为一类,‘红广’‘红橘’‘本地早橘’各为一类。【结论】南丰广橘品种群中‘蜜广’与南丰蜜橘品种群有较近的亲缘关系,而‘红广’与亲本南丰蜜橘和‘红橘’的亲缘关系均较远。‘小叶广’‘火广’和‘火橘’亲缘关系较近。  相似文献   

新西兰白兔、福建黄兔遗传多样性分析     

刘春  王生存  吴信生 《湖北畜牧兽医》2013,34(4):8-11

利用经筛选多态性较好的18对微卫星引物,对新西兰白兔、福建黄兔进行遗传多样性检测。研究结果表明,2个兔品种在18个微卫星座位上的基因频率存在一定的差异;新西兰白兔群体的基因杂合度和多态信息含量分别为0.593和0.533;福建黄兔群体的基因杂合度和多态信息含量分别为0.613和0.560。福建黄兔群体基因平均杂合度和平均多态信息含量较新西兰白兔高;说明福建黄兔的遗传多样性较新西兰白兔丰富。  相似文献   

孙女设计中影响微卫星信息配子数的因素分析   总被引：2，自引：1，他引：1  

徐宁迎  E.Kalm 《农业生物技术学报》2000,8(3):263-266

分析了６２个微卫星在参考群中的杂合程度、等位基因数、等位基因范围和信息配子数与实验群中相应微卫星的父本观察杂合度、最大半同胞信息酱比例、观察半同胞信息酱比例和信息配子数的相关程度，其中父本观察杂合度与最大半同胞信息２酱比例相关系数最高为０．９７６１有显著水平，结果表明为在实验群体中测定物微卫星具有较多的信息配子数，可采用二步法选择微卫星，首先从参考文献中根据微卫星的杂合程度和等位基因数进行初选，然  相似文献   

家畜基因组遗传多态标记—微卫星标记研究进展(上)     

吴登俊  马丁·费尔斯特 《中国畜牧兽医》1999,(1)

对家畜核基因组中多态遗传标记—ＤＮＡ微卫星标记的研究进展及其应用进行综述。主要涉及以下两大方面：首先是家畜基因组中分子遗传标记，主要是ＤＮＡ微卫星标记的研究发现及有关该标记的定义、特性等；其次是ＤＮＡ分子标记在家畜基因组分析研究、家畜遗传连锁图制作、基因诊断、家畜品种进化演变和个体系谱确证等方面的应用概况。  相似文献   

安卡纯系肉鸡六个微卫星位点遗传多样性研究     

韩太鑫  杨长锁  孟和  黄启忠 《中国家禽》2006,28(24):121-124

安卡肉鸡是生长速度最快的有色羽肉鸡之一,具有适应性强、耐应激、饲料报酬高等特点。为了了解其群体遗传结构,实验利用6个微卫星标记对3个品系共150只个体进行遗传多样性检测。结果表明3个品系都具有较高的多态性,反映了群体基本的遗传特征,为安卡肉鸡的育种和利用提供了基本的研究数据。  相似文献   

无特定病原体HBK-B和HBK—Q种鸭的遗传多样性分析     

肖兵兵  韩凌霞  于海波  司昌德  徐佳  曲连东  韩建林 《中国家禽》2008,30(18)

利用18个微卫星标记对国家实验禽类种子中心保存的HBK-B和HBK-Q两个封闭鸭群进行遗传分析.试验结果表明:两个群体中各有7个位点的多态信息含量(PIC)大于0.5,18个微卫星标记的平均PIC分别为0.474和0.480,呈中度多态;校正后的等位基因丰富度分别为3.56和3.54,表明这两个群体的遗传多样性基本相同.等位基因频率差异的卡方检验和两个群体间的遗传分化系数FST值显著水平的检验均证明这两个群体间的遗传分化已经达到了极显著水平(P<0.01),趋于形成两个不同的品系,但在今后的选育过程中应该对已经存在的近交加以控制.  相似文献   

家鹑与野生日本鸣鹑群体微卫星DNA标记的遗传学分析   总被引：14，自引：6，他引：8  

王惠影  常洪  徐伟  常国斌 《畜牧兽医学报》2004,35(4):367-371

选择10个微卫星标记位点，合成引物对微山湖野生日本鸣鹑和家鹌鹑各40只进行PCR扩增，变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测分型，并对其品种内和品种间的遗传变异进行群体遗传学分析，从分子水平上揭示这两个鹌鹁群体的遗传结构关系、亲缘关系和遗传分化程度，为鹌鹑的遗传资源研究提供新资料。  相似文献   

鲍分子遗传学研究进展          下载免费PDF全文

黎中宝 《中国生态农业学报》2006,14(1):16-20

阐述了近年来鲍分子遗传学方面的研究进展,总结了核型分析、等位酶、微卫星和小卫星、随机扩增多态性DNA、限制性片断长度多态性、线粒体DNA、表达序列标签研究和基因序列等技术在鲍种群遗传多样性、遗传分化、遗传结构及种质鉴定等方面的应用。并指出今后应加强鲍蛋白质组学、功能基因组学、遗传连锁图谱、数量性状基因座和标记辅助选择等方面研究。  相似文献   

江苏省杂草稻遗传多样性及其起源分析     

邵菁  戴伟民  张连举  宋小玲  强胜 《作物学报》2011,37(8):1324-1332

前期调查研究表明江苏是中国杂草稻危害最严重的省份之一,尤其以苏中地区最甚。因此,本文利用具有多态性的33个共显性SSR标记,分析苏中地区的11个杂草稻种群以及苏南苏北部分杂草稻样品,以揭示江苏省主要杂草稻的遗传多样性及其来源。结果表明苏中地区11个杂草稻群体总的遗传多样性(He)为0.1661,Shannon指数(I)为0.2872;多态位点百分率达到87.88%,等位基因数(Na)为2.1515,有效等位基因数(Ne)为1.2887。其中,泰州的遗传多样性最高而南通地区的最低。杂草稻在地区之间的遗传分化(1%)显著小于杂草稻种群之间的遗传分化(39%),更小于种群内的遗传分化(60%)。聚类分析和主成分分析结果表明苏中和苏南地区杂草稻以籼型为主,苏北地区存在少量粳型杂草稻;苏中地区的杂草稻与现有栽培稻品种和普通野生稻没有明显的亲缘关系,但与曾经栽培过的杂交水稻品种有关。因此,本研究相对支持江苏省杂草稻可能主要来自栽培稻的基因重组或回复突变等产生野生性状即返祖遗传的假说。苏北地区的杂草稻可能来源于穞稻与现今栽培稻杂交的后代。  相似文献